EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000015086 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35438 bases
Position: chrGeneScaffold_1665:79581-115018
Accession: 18424
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000014300	PAZ	PF02170.22	2.7e-16	1	1
ENSTTRP00000014300	Piwi	PF02171.17	1.9e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000015085	AGO4-201	2565	-	ENSTTRP00000014300	854 (aa)	-	UPI00018B7F97

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	75.383	ENSTTRG00000002872	AGO2	98	75.383
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	78.806	ENSTTRG00000015088	AGO1	98	78.806
ENSTTRG00000015086	AGO4	92	82.235	ENSTTRG00000015092	AGO3	91	82.235

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSG00000134698	AGO4	99	96.136	Homo_sapiens
ENSTTRG00000015086	AGO4	96	92.633	ENSAPOG00000023867	ago4	99	92.633	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSAMEG00000000573	AGO4	99	96.136	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	93.829	ENSACIG00000014548	ago4	100	93.829	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	89.169	ENSAPEG00000022426	ago4	100	89.169	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSATEG00000006717	ago4	100	92.547	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	95.750	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	95.750	Anas_platyrhynchos
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.848	ENSACAG00000017275	AGO4	99	94.848	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.019	ENSANAG00000031428	AGO4	99	96.019	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSACLG00000005181	ago4	99	92.708	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.940	ENSAMXG00000010318	ago4	100	93.829	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.082	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.082	Bos_taurus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	96.136	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	96.096	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.096	Canis_familiaris
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.019	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	96.019	Capra_hircus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.253	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	96.253	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000015086	AGO4	94	91.160	ENSCAPG00000009369	AGO4	99	91.160	Cavia_aperea
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.262	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	94.262	Cavia_porcellus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSCCAG00000001397	AGO4	99	96.136	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.019	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	96.019	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSCSAG00000001090	AGO4	99	96.136	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000015086	AGO4	81	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.667	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	95.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSCANG00000016914	AGO4	99	96.136	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.667	ENSCGRG00001002701	Ago4	99	95.667	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.667	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	95.667	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	87.814	ENSCSEG00000010696	ago4	100	87.814	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	94.138	ENSDARG00000100854	ago4	99	94.138	Danio_rerio
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSDNOG00000015674	AGO4	99	96.136	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.253	ENSDORG00000008933	Ago4	99	96.253	Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000015086	AGO4	60	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSEASG00005012079	AGO4	99	96.136	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSECAG00000024686	AGO4	99	96.136	Equus_caballus
ENSTTRG00000015086	AGO4	76	96.341	ENSEEUG00000000745	AGO4	75	96.341	Erinaceus_europaeus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSELUG00000023873	ago4	98	92.708	Esox_lucius
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSFCAG00000006218	AGO4	99	96.136	Felis_catus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.253	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	96.253	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000015086	AGO4	98	84.928	ENSFHEG00000019658	ago4	100	84.928	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	93.993	ENSGMOG00000009544	ago4	99	93.582	Gadus_morhua
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.667	ENSGALG00000039713	AGO4	100	95.592	Gallus_gallus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSGAFG00000017239	ago4	99	92.708	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	94.021	ENSGACG00000002683	ago4	99	94.021	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	95.592	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	95.592	Gopherus_agassizii
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	92.037	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	92.832	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSHBUG00000001525	ago4	99	92.708	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.253	ENSHGLG00000010241	AGO4	99	96.253	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	96.235	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.235	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.593	ENSHCOG00000003725	ago4	99	92.593	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSIPUG00000015600	ago4	99	92.708	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.253	ENSSTOG00000004725	AGO4	99	96.253	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSKMAG00000018602	ago4	99	92.824	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.184	ENSLBEG00000010670	ago4	99	92.184	Labrus_bergylta
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.731	ENSLACG00000016888	AGO4	99	94.731	Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	92.832	ENSLOCG00000000584	ago4	99	92.832	Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000015086	AGO4	94	95.256	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	95.256	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSMFAG00000035543	AGO4	99	96.136	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.023	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	96.136	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSMAMG00000003874	ago4	100	92.308	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSMZEG00005026346	ago4	99	92.708	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.316	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	95.316	Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000015086	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	91	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.023	ENSMICG00000033507	AGO4	100	96.023	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.667	ENSMOCG00000005772	Ago4	99	95.667	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	92.821	ENSMMOG00000013473	ago4	100	92.821	Mola_mola
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.785	ENSMODG00000017888	AGO4	99	95.785	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.145	ENSMALG00000011797	ago4	96	95.385	Monopterus_albus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.199	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	95.199	Mus_caroli
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.965	ENSMUSG00000042500	Ago4	99	94.965	Mus_musculus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.614	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	94.614	Mus_pahari
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.731	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	99	94.731	Mus_spretus
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	96.096	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	96.096	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.965	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	94.965	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.253	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	96.253	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSNBRG00000013492	ago4	99	92.708	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	96.136	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000015086	AGO4	90	91.928	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	91.928	Notamacropus_eugenii
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.433	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	95.433	Ochotona_princeps
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	95.990	ENSODEG00000006355	AGO4	97	95.990	Octodon_degus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	93.435	ENSONIG00000013603	ago4	99	92.708	Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	95.718	ENSOANG00000002082	AGO4	100	95.718	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSOCUG00000004076	AGO4	99	96.136	Oryctolagus_cuniculus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSORLG00000009865	ago4	91	92.824	Oryzias_latipes
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSORLG00020016978	ago4	91	92.824	Oryzias_latipes_hni
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSORLG00015008800	ago4	91	92.824	Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSOMEG00000006399	ago4	99	92.824	Oryzias_melastigma
ENSTTRG00000015086	AGO4	94	94.618	ENSOGAG00000004233	-	100	94.618	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	88.028	ENSOGAG00000027107	-	99	88.028	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.550	ENSOARG00000019568	AGO4	98	95.550	Ovis_aries
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	96.136	Pan_paniscus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSPPRG00000006520	AGO4	99	96.136	Panthera_pardus
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	96.136	Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSPTRG00000000527	AGO4	99	96.136	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	96.096	ENSPANG00000007232	AGO4	100	96.096	Papio_anubis
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	93.056	ENSPKIG00000022598	ago4	99	93.056	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.667	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	95.667	Pelodiscus_sinensis
ENSTTRG00000015086	AGO4	93	93.703	ENSPMGG00000023325	ago4	100	93.703	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000015086	AGO4	88	100.000	ENSPEMG00000022651	-	96	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.785	ENSPCIG00000000092	AGO4	99	95.785	Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSPFOG00000001935	ago4	99	92.824	Poecilia_formosa
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	94.021	ENSPLAG00000011534	ago4	99	94.021	Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSPMEG00000005049	ago4	99	92.824	Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.824	ENSPREG00000010315	ago4	99	92.824	Poecilia_reticulata
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.136	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	96.136	Pongo_abelii
ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.140	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	96.140	Propithecus_coquereli
ENSTTRG00000015086	AGO4	88	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	ENSPNYG00000002089	ago4	99	92.708	Pundamilia_nyererei
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ENSTTRG00000015086	AGO4	68	98.273	ENSRNOG00000025596	Ago4	97	98.273	Rattus_norvegicus
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