EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000015088 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 29753 bases
Position: chrGeneScaffold_1665:140153-169905
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000014304	PAZ	PF02170.22	5.5e-29	1	1
ENSTTRP00000014304	Piwi	PF02171.17	1.2e-103	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000015089	AGO1-201	2565	-	ENSTTRP00000014304	854 (aa)	-	UPI00018B7F98

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTTRG00000015088	AGO1	98	82.578	ENSTTRG00000002872	AGO2	98	82.578
ENSTTRG00000015088	AGO1	98	78.806	ENSTTRG00000015086	AGO4	100	78.806
ENSTTRG00000015088	AGO1	91	88.484	ENSTTRG00000015092	AGO3	91	88.484

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSG00000092847	AGO1	100	98.338	Homo_sapiens
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.406	ENSAPOG00000024299	ago1	100	94.406	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	98.250	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000015088	AGO1	82	90.171	ENSACIG00000005298	ago1	98	90.171	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.406	ENSAOCG00000017727	ago1	100	94.406	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.406	ENSAPEG00000004458	ago1	100	94.406	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.406	ENSATEG00000008523	ago1	100	94.406	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000015088	AGO1	99	92.037	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	92.037	Anas_platyrhynchos
ENSTTRG00000015088	AGO1	91	98.210	ENSACAG00000029174	AGO1	100	98.210	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSANAG00000037711	AGO1	100	98.250	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.172	ENSACLG00000000890	ago1	100	94.172	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000015088	AGO1	80	96.647	ENSAMXG00000001917	ago1	98	96.647	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.133	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	98.133	Bos_taurus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	98.250	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	98.250	Canis_familiaris
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	96.729	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	97.979	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	97.332	ENSCHIG00000011848	-	100	97.332	Capra_hircus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	77.336	ENSTSYG00000032426	-	100	77.336	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSTSYG00000009767	-	100	98.250	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000015088	AGO1	89	91.286	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	90.397	Cavia_aperea
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	98.250	Cavia_porcellus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	98.250	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	97.552	ENSCATG00000031521	AGO1	100	98.338	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	98.250	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	98.250	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000015088	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	98.250	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCANG00000039798	AGO1	100	98.250	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	98.250	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000015088	AGO1	99	98.233	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	98.231	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTTRG00000015088	AGO1	98	93.582	ENSCSEG00000001051	ago1	99	93.582	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.289	ENSCVAG00000018173	ago1	100	94.289	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.872	ENSDARG00000092644	ago1	100	94.872	Danio_rerio
ENSTTRG00000015088	AGO1	91	98.338	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	98.338	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000015088	AGO1	91	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000015088	AGO1	84	91.123	ENSETEG00000007626	AGO1	100	91.123	Echinops_telfairi
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSEASG00005012086	AGO1	100	98.250	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSECAG00000024353	AGO1	100	98.250	Equus_caballus
ENSTTRG00000015088	AGO1	92	89.962	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	89.962	Erinaceus_europaeus
ENSTTRG00000015088	AGO1	91	95.396	ENSELUG00000016803	ago1	100	95.396	Esox_lucius
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	98.250	Felis_catus
ENSTTRG00000015088	AGO1	91	90.561	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.561	Ficedula_albicollis
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	98.250	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000015088	AGO1	98	91.449	ENSFHEG00000017927	ago1	99	91.449	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000015088	AGO1	87	83.044	ENSGMOG00000019413	ago1	100	83.044	Gadus_morhua
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.133	ENSGALG00000002249	AGO1	100	98.133	Gallus_gallus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSGAFG00000009775	ago1	100	94.522	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000015088	AGO1	87	95.473	ENSGACG00000012443	ago1	100	95.473	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000015088	AGO1	91	98.210	ENSGAGG00000012893	-	100	98.210	Gopherus_agassizii
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	98.250	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.172	ENSHBUG00000010459	ago1	100	94.172	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	98.250	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	98.250	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000015088	AGO1	98	95.368	ENSHCOG00000005708	ago1	99	95.368	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSIPUG00000023216	ago1	100	94.522	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	98.250	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.366	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	98.366	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSKMAG00000019464	ago1	100	94.522	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSLBEG00000007694	ago1	100	94.522	Labrus_bergylta
ENSTTRG00000015088	AGO1	99	91.991	ENSLACG00000017009	AGO1	99	91.991	Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	92.657	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	92.657	Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000015088	AGO1	99	98.233	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	98.233	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	98.250	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000015088	AGO1	99	93.450	ENSMMUG00000006251	AGO1	99	94.299	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.982	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	98.338	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	98.250	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.406	ENSMAMG00000008381	ago1	100	94.406	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.172	ENSMZEG00005007996	ago1	100	94.172	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000015088	AGO1	99	92.549	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	92.549	Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	98.250	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSMICG00000016147	AGO1	100	98.250	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.133	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	98.133	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000015088	AGO1	78	96.716	ENSMMOG00000018459	ago1	93	96.716	Mola_mola
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.133	ENSMODG00000023335	AGO1	100	98.133	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000015088	AGO1	98	95.249	ENSMALG00000011057	ago1	99	95.249	Monopterus_albus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.250	Mus_caroli
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.250	Mus_musculus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.250	Mus_pahari
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.250	Mus_spretus
ENSTTRG00000015088	AGO1	84	98.189	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	98.189	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000015088	AGO1	61	99.234	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.234	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	98.250	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000015088	AGO1	91	95.396	ENSNBRG00000010867	ago1	100	95.396	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.133	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	98.133	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000015088	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSTTRG00000015088	AGO1	93	96.049	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	96.049	Ochotona_princeps
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSODEG00000005321	AGO1	100	98.250	Octodon_degus
ENSTTRG00000015088	AGO1	98	95.131	ENSONIG00000016345	ago1	99	95.131	Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	90.465	ENSOANG00000002080	AGO1	100	90.465	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.133	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	98.133	Oryctolagus_cuniculus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSORLG00000014965	ago1	100	94.522	Oryzias_latipes
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSORLG00020018253	ago1	100	94.522	Oryzias_latipes_hni
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSORLG00015003287	ago1	100	94.522	Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSOMEG00000020528	ago1	100	94.522	Oryzias_melastigma
ENSTTRG00000015088	AGO1	99	98.233	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	98.233	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.133	ENSOARG00000019591	AGO1	100	98.133	Ovis_aries
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	98.250	Pan_paniscus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	98.250	Panthera_pardus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	98.250	Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	98.250	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSPANG00000009060	AGO1	100	98.250	Papio_anubis
ENSTTRG00000015088	AGO1	98	97.506	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	97.506	Pelodiscus_sinensis
ENSTTRG00000015088	AGO1	80	95.494	ENSPMGG00000024099	ago1	98	95.494	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	98.250	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.133	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	98.133	Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSPFOG00000005867	ago1	100	94.522	Poecilia_formosa
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSPLAG00000002824	ago1	99	96.237	Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSPMEG00000001787	ago1	99	96.237	Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	ENSPREG00000006534	ago1	100	94.522	Poecilia_reticulata
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