EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000000399 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41521 bases
Position: chrLZNR01000763.1:77651-119171
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000001067	GTP_EFTU	PF00009.27	1.1e-40	1	1
ENSUAMP00000000821	GTP_EFTU	PF00009.27	4.4e-40	1	1
ENSUAMP00000000921	GTP_EFTU	PF00009.27	7.1e-32	1	1
ENSUAMP00000000921	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.2e-12	1	1
ENSUAMP00000001067	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.2e-12	1	1
ENSUAMP00000000821	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.2e-12	1	1
ENSUAMP00000000921	EFG_IV	PF03764.18	2.7e-23	1	1
ENSUAMP00000000821	EFG_IV	PF03764.18	2.7e-23	1	1
ENSUAMP00000001067	EFG_IV	PF03764.18	2.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000001055	EFTUD2-202	2874	-	ENSUAMP00000000921	957 (aa)	-	-
ENSUAMT00000001236	EFTUD2-203	2913	-	ENSUAMP00000001067	970 (aa)	-	-
ENSUAMT00000000940	EFTUD2-201	2910	-	ENSUAMP00000000821	969 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSUAMG00000000399's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSUAMG00000000399's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	51	31.469	ENSUAMG00000026381	GFM1	58	31.469
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	73	34.507	ENSUAMG00000022106	EFL1	69	34.507
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	87	38.426	ENSUAMG00000022409	EEF2	99	40.334

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.768	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	90.844	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	98.871	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	87.551	ENSACIG00000009096	eftud2	100	87.346	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	88	87.176	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	87.176	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.152	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	90.947	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.461	ENSATEG00000000457	eftud2	100	91.255	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	99	93.320	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	93.320	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	96.509	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.509	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.665	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSACLG00000001296	eftud2	100	90.844	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.993	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.993	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	98.563	Bos_taurus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	99	69.628	WBGene00001166	eftu-2	99	69.525	Caenorhabditis_elegans
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.665	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	98.871	Canis_familiaris
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.871	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.563	Capra_hircus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.867	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.867	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.455	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.455	Cavia_aperea
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.455	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.455	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	99.381	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.381	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.665	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.947	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.947	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.665	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	91	85.811	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.811	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.536	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.536	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	76.718	ENSCING00000009372	-	100	76.718	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	99	77.291	ENSCSAVG00000004985	-	99	78.892	Ciona_savignyi
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	98.665	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.357	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.357	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.357	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	98.357	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.638	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	90.432	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.255	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	90.947	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.442	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.319	Danio_rerio
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.049	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.049	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.762	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.762	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	74.359	FBgn0039566	CG4849	100	74.359	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	75	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	98.871	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.768	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	98.768	Equus_caballus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.216	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.113	Esox_lucius
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.768	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.768	Felis_catus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	96.920	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	96.920	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.255	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	98.255	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.358	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.049	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.422	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	90.432	Gadus_morhua
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.023	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	97.737	Gallus_gallus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	90.844	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.741	ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.329	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	98.665	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.947	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	90.741	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.844	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	97.844	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.844	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.844	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.021	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.021	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.731	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	90.947	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	92.482	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	92.482	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	96	98.504	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.504	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.741	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	90.329	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	95	90.723	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	91.765	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	93.121	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.641	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	91.555	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.947	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.947	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	98.665	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	98.665	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	98.665	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.461	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	91.255	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	90.844	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.029	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.029	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.357	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	98.357	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	98.665	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.460	ENSMOCG00000009039	-	100	98.460	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	81	93.396	ENSMOCG00000017653	-	85	93.396	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	88	92.941	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	92.941	Mola_mola
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.357	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.357	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	88	91.176	ENSMALG00000014501	eftud2	100	91.176	Monopterus_albus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.152	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	98.152	Mus_caroli
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.152	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	98.152	Mus_musculus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.152	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.152	Mus_pahari
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.152	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	98.152	Mus_spretus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	97	98.626	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	98.626	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	98.871	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.563	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.947	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	90.741	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	97	96.819	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.819	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	94.661	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.661	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.349	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.349	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.536	ENSODEG00000018041	-	100	97.536	Octodon_degus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSONIG00000000912	eftud2	100	90.844	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.665	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.638	ENSORLG00000003109	eftud2	100	90.638	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.535	ENSORLG00020009865	eftud2	100	90.535	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.535	ENSORLG00015002611	eftud2	100	92.702	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	96.407	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	96.407	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	98.563	Ovis_aries
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.768	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	98.768	Pan_paniscus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	98.871	Panthera_pardus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	98.871	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.768	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.768	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	98.665	Papio_anubis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	93	96.150	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.150	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	83.539	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	83.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.357	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	98.357	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.357	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.357	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	90.844	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	90.844	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	90.844	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.228	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.228	Pongo_abelii
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	94.353	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.353	Procavia_capensis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.563	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	95	99.477	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.943	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.947	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	90.741	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.143	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.461	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.152	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.152	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	98.563	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.563	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	97	33.793	YKL173W	SNU114	97	33.531	Saccharomyces_cerevisiae
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.665	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	97	98.507	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.507	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.937	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	90.834	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.844	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.222	Scophthalmus_maximus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.152	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	90.947	Seriola_dumerili
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.255	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.049	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.041	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.041	Sorex_araneus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	96.407	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.407	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.255	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.049	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.665	Sus_scrofa
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	84	96.350	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.350	Taeniopygia_guttata
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.329	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.226	Takifugu_rubripes
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	86.515	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.307	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	93.018	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.018	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	89.836	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.836	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	98.871	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	98.871	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	97	93.817	ENSXETG00000003394	eftud2	98	94.886	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	81	92.474	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	92.474	Xiphophorus_couchianus
ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	90.844	Xiphophorus_maculatus