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Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000000700 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI2
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 398757 bases
Position: chrLZNR01000885.1:94705-493461
Accession: 18585
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000000717	RRM_1	PF00076.22	1.7e-34	1	2
ENSUAMP00000000717	RRM_1	PF00076.22	1.7e-34	2	2
ENSUAMP00000000710	RRM_1	PF00076.22	3.3e-34	1	2
ENSUAMP00000000710	RRM_1	PF00076.22	3.3e-34	2	2
ENSUAMP00000000698	RRM_1	PF00076.22	3.8e-34	1	2
ENSUAMP00000000698	RRM_1	PF00076.22	3.8e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000000823	MSI2-203	2250	-	ENSUAMP00000000717	251 (aa)	-	UPI0002256482
ENSUAMT00000000803	MSI2-201	1791	-	ENSUAMP00000000698	324 (aa)	-	UPI0000E249B3
ENSUAMT00000000816	MSI2-202	1728	-	ENSUAMP00000000710	303 (aa)	-	UPI000947A981

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUAMG00000000700	MSI2	71	42.857	ENSUAMG00000013289	RBM3	95	42.857
ENSUAMG00000000700	MSI2	92	82.741	ENSUAMG00000015514	MSI1	87	82.741
ENSUAMG00000000700	MSI2	74	47.568	ENSUAMG00000011358	HNRNPDL	68	39.189
ENSUAMG00000000700	MSI2	67	49.689	ENSUAMG00000003337	HNRNPAB	56	49.689
ENSUAMG00000000700	MSI2	70	41.279	ENSUAMG00000025628	HNRNPA2B1	85	40.230
ENSUAMG00000000700	MSI2	60	53.571	ENSUAMG00000014659	CIRBP	89	42.857
ENSUAMG00000000700	MSI2	68	32.558	ENSUAMG00000012355	TARDBP	53	30.556
ENSUAMG00000000700	MSI2	64	35.616	ENSUAMG00000009532	TIAL1	59	35.616
ENSUAMG00000000700	MSI2	73	47.872	ENSUAMG00000011374	HNRNPD	58	47.872
ENSUAMG00000000700	MSI2	55	45.283	ENSUAMG00000018608	-	73	44.444

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	99.602	ENSG00000153944	MSI2	100	99.602	Homo_sapiens
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.595	ENSAPOG00000001658	msi2a	98	89.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.479	ENSAMEG00000002697	MSI2	100	94.479	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000000700	MSI2	95	89.062	ENSACIG00000009475	msi2a	90	89.062	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000000700	MSI2	68	77.692	ENSAOCG00000014822	msi2a	67	77.692	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000000700	MSI2	91	93.722	ENSAPEG00000007706	msi2a	98	89.286	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	93.165	ENSATEG00000003301	-	100	93.165	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.595	ENSATEG00000010498	msi2a	98	89.286	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	97.312	ENSACAG00000005452	MSI2	77	96.923	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSANAG00000037827	MSI2	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.144	ENSACLG00000007752	msi2a	98	88.961	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	94.753	ENSAMXG00000010474	msi2b	100	94.753	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	97.297	ENSAMXG00000032796	msi2a	94	93.182	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	99.691	ENSBTAG00000004406	MSI2	100	99.691	Bos_taurus
ENSUAMG00000000700	MSI2	87	63.158	WBGene00003423	msi-1	74	61.250	Caenorhabditis_elegans
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSCJAG00000013998	MSI2	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	98.246	ENSCAFG00020025620	MSI2	81	93.103	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	99.674	ENSCHIG00000016580	MSI2	94	99.674	Capra_hircus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	95.390	ENSCPOG00000034042	MSI2	99	95.390	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSCCAG00000033927	MSI2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSCATG00000040879	MSI2	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.462	ENSCLAG00000014325	MSI2	94	94.462	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	100.000	ENSCSAG00000005633	MSI2	94	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000000700	MSI2	83	100.000	ENSCHOG00000008660	MSI2	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	99.015	ENSCPBG00000009942	MSI2	95	92.045	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000000700	MSI2	85	72.222	ENSCING00000018579	-	97	53.125	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000000700	MSI2	87	66.216	ENSCSAVG00000010397	-	76	63.750	Ciona_savignyi
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSCANG00000036414	MSI2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	99.675	ENSCGRG00001013330	Msi2	94	99.675	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.277	ENSCGRG00000003141	Msi2	100	94.277	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000000700	MSI2	67	73.006	ENSCSEG00000013549	msi2a	88	73.006	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000000700	MSI2	79	75.258	ENSCSEG00000013557	msi2a	83	74.603	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	83.502	ENSCSEG00000003266	-	92	83.502	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	93.007	ENSCVAG00000017075	msi2a	93	93.007	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.144	ENSDARG00000033901	msi2a	95	77.112	Danio_rerio
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	97.297	ENSDARG00000032614	msi2b	100	98.020	Danio_rerio
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	100.000	ENSDNOG00000014501	MSI2	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000000700	MSI2	79	88.832	ENSDORG00000005394	Msi2	84	87.817	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000000700	MSI2	67	100.000	ENSDORG00000028440	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000000700	MSI2	90	71.366	FBgn0260943	Rbp6	90	67.347	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000000700	MSI2	90	76.316	ENSETEG00000012450	-	64	76.316	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000000700	MSI2	84	81.221	ENSEBUG00000006732	msi2a	87	65.273	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSEASG00005002965	MSI2	100	95.793	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	98.696	ENSECAG00000011435	MSI2	94	91.892	Equus_caballus
ENSUAMG00000000700	MSI2	83	85.375	ENSEEUG00000007810	MSI2	100	85.375	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	95.946	ENSELUG00000001361	msi2b	93	88.179	Esox_lucius
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.521	ENSELUG00000011747	msi2a	93	94.521	Esox_lucius
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSFCAG00000041686	MSI2	100	100.000	Felis_catus
ENSUAMG00000000700	MSI2	65	82.308	ENSFCAG00000033787	-	70	83.465	Felis_catus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.462	ENSFDAG00000016118	MSI2	100	94.462	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.595	ENSFHEG00000000084	msi2a	98	88.961	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000000700	MSI2	64	96.386	ENSGMOG00000007596	-	80	96.386	Gadus_morhua
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	92.923	ENSGALG00000005567	MSI2	94	92.923	Gallus_gallus
ENSUAMG00000000700	MSI2	89	81.973	ENSGAFG00000006974	msi2a	97	80.936	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	99.015	ENSGAGG00000016542	MSI2	100	90.132	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	99.602	ENSGGOG00000013182	MSI2	100	99.602	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.144	ENSHBUG00000020800	msi2a	98	88.961	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000000700	MSI2	95	84.923	ENSHGLG00000012444	MSI2	93	84.923	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000000700	MSI2	76	91.304	ENSHGLG00100003744	MSI2	100	91.304	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000000700	MSI2	67	100.000	ENSHGLG00100004028	-	87	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.144	ENSHCOG00000000266	msi2a	91	85.174	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000000700	MSI2	92	87.619	ENSHCOG00000017241	-	66	87.619	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	96.396	ENSIPUG00000021097	msi2a	93	95.105	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	97.748	ENSIPUG00000003732	msi2b	93	91.781	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	95.390	ENSSTOG00000007884	MSI2	99	95.390	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000000700	MSI2	67	100.000	ENSJJAG00000009467	-	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000000700	MSI2	76	85.930	ENSJJAG00000006292	-	100	85.427	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000000700	MSI2	93	92.177	ENSKMAG00000009494	msi2a	89	92.491	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.595	ENSLBEG00000007061	msi2a	98	89.286	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	86.010	ENSLBEG00000026223	-	100	65.982	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000000700	MSI2	73	97.030	ENSLACG00000016798	MSI2	100	97.030	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	97.297	ENSLOCG00000004675	msi2b	90	89.855	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSMFAG00000003775	MSI2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSMMUG00000002069	MSI2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSMNEG00000045275	MSI2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSMLEG00000033888	MSI2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.595	ENSMAMG00000010503	msi2a	93	93.357	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	95.045	ENSMAMG00000002488	-	85	96.154	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	93.160	ENSMZEG00005007676	msi2a	94	93.160	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.172	ENSMAUG00000003862	Msi2	94	94.172	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSMICG00000013598	-	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	77.564	ENSMICG00000032913	-	93	78.526	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.462	ENSMOCG00000005820	Msi2	94	94.462	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000000700	MSI2	99	88.492	ENSMMOG00000008348	msi2a	95	85.065	Mola_mola
ENSUAMG00000000700	MSI2	76	89.855	ENSMODG00000014790	MSI2	100	89.855	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.595	ENSMALG00000000071	msi2a	93	95.455	Monopterus_albus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016948	Msi2	100	100.000	Mus_caroli
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	100.000	ENSMUSG00000069769	Msi2	100	100.000	Mus_musculus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	100.000	MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	Mus_pahari
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0017795	Msi2	100	100.000	Mus_spretus
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	100.000	ENSMPUG00000015377	MSI2	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	99.383	ENSMLUG00000007865	MSI2	100	99.383	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.462	ENSNGAG00000017807	Msi2	94	94.462	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000000700	MSI2	91	93.274	ENSNBRG00000014596	msi2a	98	88.961	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	99.556	ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000000700	MSI2	90	88.816	ENSOPRG00000000872	-	64	88.816	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	94.462	ENSODEG00000011974	MSI2	94	94.462	Octodon_degus
ENSUAMG00000000700	MSI2	67	96.154	ENSONIG00000001972	msi2a	72	96.154	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	98.673	ENSOANG00000005667	MSI2	70	98.678	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	99.691	ENSOCUG00000010440	MSI2	100	99.691	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	93.151	ENSORLG00000009671	msi2a	94	93.151	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000000700	MSI2	100	93.305	ENSORLG00020021556	msi2a	100	87.464	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000000700	MSI2	97	93.151	ENSORLG00015004592	msi2a	94	93.151	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	93.357	ENSOMEG00000000146	msi2a	98	91.694	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000000700	MSI2	95	95.455	ENSOGAG00000005621	MSI2	100	95.455	Otolemur_garnettii
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ENSUAMG00000000700	MSI2	100	98.671	ENSVVUG00000011783	MSI2	100	98.671	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	93.213	ENSXCOG00000006113	msi2a	98	73.156	Xiphophorus_couchianus
ENSUAMG00000000700	MSI2	96	94.595	ENSXMAG00000000608	msi2a	93	93.007	Xiphophorus_maculatus