EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000002897 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5586 bases
Position: chrLZNR01020027.1:8875-14460
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000003168	SYF2	PF08231.12	7.5e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000003609	SYF2-201	741	-	ENSUAMP00000003168	246 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSUAMG00000002897's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSUAMG00000002897's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.623	ENSG00000117614	SYF2	99	93.033	Homo_sapiens
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	82.960	ENSAPOG00000001174	syf2	98	80.342	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000002897	SYF2	97	98.319	ENSAMEG00000010115	-	98	98.319	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000002897	SYF2	79	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000002897	SYF2	93	77.682	ENSACIG00000023688	syf2	93	77.682	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	83.408	ENSAOCG00000022046	syf2	95	83.408	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000002897	SYF2	83	82.039	ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.039	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	83.408	ENSAPEG00000018858	syf2	86	83.408	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000002897	SYF2	88	82.028	ENSATEG00000007745	syf2	95	79.825	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000002897	SYF2	81	87.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.000	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000002897	SYF2	83	84.804	ENSACAG00000013653	-	100	84.804	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000002897	SYF2	67	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.213	ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.213	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.821	ENSACLG00000019916	syf2	98	77.350	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000002897	SYF2	95	77.966	ENSAMXG00000004051	syf2	99	77.966	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	94.309	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.937	Bos_taurus
ENSUAMG00000002897	SYF2	85	50.476	WBGene00019402	syf-2	99	47.009	Caenorhabditis_elegans
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.623	ENSCJAG00000046570	SYF2	99	92.623	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	97.561	ENSCAFG00000012895	-	100	97.561	Canis_familiaris
ENSUAMG00000002897	SYF2	98	82.645	ENSCAFG00000030331	-	99	82.645	Canis_familiaris
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	97.561	ENSCAFG00020021091	-	100	97.561	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000002897	SYF2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	83	96.154	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	92.683	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.683	Capra_hircus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.870	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.870	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000002897	SYF2	80	97.475	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	Cavia_aperea
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.463	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.463	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.623	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	92.623	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.803	ENSCATG00000026917	SYF2	99	91.803	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.057	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.057	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.393	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	91.393	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000002897	SYF2	74	76.923	ENSCHOG00000005273	-	100	76.923	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000002897	SYF2	92	87.611	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	85.837	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000002897	SYF2	86	52.582	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000002897	SYF2	86	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	79.098	ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.098	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	89.431	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.431	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000002897	SYF2	80	94.388	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	93.970	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	77.064	ENSCSEG00000000117	syf2	100	70.325	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.279	ENSCVAG00000019543	syf2	98	77.872	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	96	76.793	ENSDARG00000004706	syf2	97	76.793	Danio_rerio
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	93.089	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.089	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	90.244	ENSDORG00000001274	Syf2	100	90.244	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	55.909	FBgn0033556	CG12343	97	55.909	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000002897	SYF2	91	75.785	ENSETEG00000015729	SYF2	100	75.431	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000002897	SYF2	80	60.914	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	81.301	ENSEASG00005004232	-	100	81.301	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	93.089	ENSEASG00005004224	-	100	93.089	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000002897	SYF2	96	94.068	ENSECAG00000010440	-	98	94.068	Equus_caballus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	93.089	ENSECAG00000012023	-	100	93.089	Equus_caballus
ENSUAMG00000002897	SYF2	75	80.541	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.541	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	85.321	ENSELUG00000003465	syf2	92	85.321	Esox_lucius
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.870	ENSFCAG00000010324	-	85	91.870	Felis_catus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	96.748	ENSFCAG00000043095	-	100	96.748	Felis_catus
ENSUAMG00000002897	SYF2	83	84.804	ENSFALG00000000460	SYF2	98	78.423	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	90.650	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	90.650	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	67.273	ENSFHEG00000007238	syf2	97	67.273	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000002897	SYF2	87	82.791	ENSGMOG00000019138	syf2	96	82.791	Gadus_morhua
ENSUAMG00000002897	SYF2	92	85.903	ENSGALG00000013639	SYF2	100	79.842	Gallus_gallus
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	78.924	ENSGAFG00000019435	syf2	94	78.924	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.193	ENSGACG00000007305	syf2	96	78.112	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	92	88.053	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	86.266	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	93.033	ENSGGOG00000012796	SYF2	99	93.443	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000002897	SYF2	96	76.793	ENSHBUG00000020477	syf2	99	76.793	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	84.018	ENSHGLG00000004304	-	99	79.747	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.057	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.057	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.057	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.057	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000002897	SYF2	98	76.132	ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.132	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	82.432	ENSIPUG00000019859	syf2	93	82.432	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	59	95.890	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	81	95.980	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.980	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000002897	SYF2	95	77.350	ENSKMAG00000013856	syf2	97	77.350	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.192	ENSLBEG00000014425	syf2	92	82.192	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	85.321	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.321	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	77.236	ENSLOCG00000002728	syf2	95	77.236	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	74	64.130	ENSLAFG00000030814	-	100	64.130	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	92.276	ENSLAFG00000023150	-	100	92.276	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.803	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	91.803	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.393	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	91.803	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.803	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	91.803	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.803	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	91.803	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000002897	SYF2	88	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	93	80.717	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.821	ENSMZEG00005006429	syf2	94	79.821	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000002897	SYF2	81	87.437	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.437	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	88.934	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	88.934	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000002897	SYF2	81	95.980	ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	90.244	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.244	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	79.909	ENSMMOG00000002396	syf2	92	79.909	Mola_mola
ENSUAMG00000002897	SYF2	92	86.207	ENSMODG00000013951	-	99	86.580	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	82.143	ENSMALG00000010706	syf2	93	82.589	Monopterus_albus
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	89.754	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	99	89.754	Mus_caroli
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	89.754	ENSMUSG00000028821	Syf2	99	89.754	Mus_musculus
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	89.754	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	99	89.754	Mus_pahari
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	89.754	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	99	89.754	Mus_spretus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	98.374	ENSMPUG00000015802	-	100	98.374	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	92.683	ENSMPUG00000015801	-	100	92.683	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000002897	SYF2	95	94.421	ENSMLUG00000001885	SYF2	95	94.421	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	90.244	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	90.244	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000002897	SYF2	98	68.724	ENSNBRG00000010720	syf2	98	71.489	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.623	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.033	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	89.431	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	89.431	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	79.675	ENSODEG00000014338	-	99	81.013	Octodon_degus
ENSUAMG00000002897	SYF2	96	91.489	ENSODEG00000017664	-	98	91.489	Octodon_degus
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.821	ENSONIG00000008213	syf2	98	77.350	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000002897	SYF2	82	89.109	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.109	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	92.276	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.683	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.735	ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.735	ENSORLG00020018333	syf2	92	81.735	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.651	ENSORLG00015014665	syf2	92	81.651	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.648	ENSOMEG00000013911	syf2	92	82.648	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.463	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	91.463	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000002897	SYF2	79	66.154	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	93.145	ENSOARG00000006348	-	100	93.145	Ovis_aries
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	93.033	ENSPPAG00000036579	SYF2	99	93.443	Pan_paniscus
ENSUAMG00000002897	SYF2	96	94.515	ENSPPRG00000001638	-	96	94.515	Panthera_pardus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	96.748	ENSPPRG00000001651	-	100	96.748	Panthera_pardus
ENSUAMG00000002897	SYF2	88	97.222	ENSPTIG00000005711	-	83	94.323	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	96.341	ENSPTIG00000007036	-	100	96.341	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	93.033	ENSPTRG00000000352	SYF2	99	93.443	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.803	ENSPANG00000008139	SYF2	99	91.803	Papio_anubis
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	76.423	ENSPKIG00000008130	syf2	100	76.423	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000002897	SYF2	95	84.979	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	84.979	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.735	ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.735	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	89.837	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	89.837	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000002897	SYF2	91	91.111	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	86.000	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	73.171	ENSPFOG00000004116	syf2	99	73.171	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000002897	SYF2	93	77.253	ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.253	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000002897	SYF2	95	73.529	ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.529	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000002897	SYF2	88	80.093	ENSPREG00000003009	syf2	99	75.000	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.623	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	92.623	Pongo_abelii
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	64.228	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.821	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	82.114	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.114	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.821	ENSPNYG00000004979	syf2	98	77.350	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000002897	SYF2	96	80.169	ENSPNAG00000015570	syf2	97	80.169	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	89.754	ENSRNOG00000060597	Syf2	99	89.754	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	89.754	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	89.754	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.803	ENSRROG00000001347	SYF2	99	91.803	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.393	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.393	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000002897	SYF2	83	91.748	ENSSHAG00000007152	-	100	91.748	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	83.936	ENSSHAG00000015630	-	100	84.337	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000002897	SYF2	91	82.222	ENSSFOG00015023647	syf2	95	82.222	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.569	ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	Scophthalmus_maximus
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.110	ENSSDUG00000013072	syf2	100	75.934	Seriola_dumerili
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.110	ENSSLDG00000012677	syf2	100	75.934	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	72.764	ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.764	Sorex_araneus
ENSUAMG00000002897	SYF2	95	83.761	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	83.761	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.192	ENSSPAG00000009626	syf2	92	82.192	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	93.496	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.496	Sus_scrofa
ENSUAMG00000002897	SYF2	61	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.500	Taeniopygia_guttata
ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.372	ENSTRUG00000001499	syf2	90	79.372	Takifugu_rubripes
ENSUAMG00000002897	SYF2	89	79.817	ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.817	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	69.512	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.106	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	93.496	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.496	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	99.593	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	99.593	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	92.683	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.683	Vicugna_pacos
ENSUAMG00000002897	SYF2	97	93.305	ENSVVUG00000027181	-	96	93.305	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000002897	SYF2	100	97.561	ENSVVUG00000027175	-	100	97.561	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000002897	SYF2	94	82.328	ENSXETG00000022797	syf2	92	83.406	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000002897	SYF2	87	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	94	79.372	Xiphophorus_maculatus