EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000005088 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC4
Alias: C1orf169|FLJ25691|MGC26594|RP1-127C7.4
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1104 bases
Position: chrLZNR01005940.1:174232-175335
Accession: 32152
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000005745	APOBEC_N	PF08210.11	2.8e-30	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000006512	APOBEC4-201	1104	-	ENSUAMP00000005745	367 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	83.565	ENSG00000173627	APOBEC4	96	83.523	Homo_sapiens
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	97.003	ENSAMEG00000002503	APOBEC4	96	97.003	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	95	53.803	ENSACAG00000015192	APOBEC4	98	52.394	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	96	82.768	ENSBTAG00000047395	APOBEC4	96	82.670	Bos_taurus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	81.894	ENSCJAG00000040026	APOBEC4	95	81.818	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	89.136	ENSCAFG00000013349	APOBEC4	96	89.489	Canis_familiaris
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	89.136	ENSCAFG00020015526	APOBEC4	96	89.489	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	96	80.791	ENSCHIG00000011987	APOBEC4	91	79.830	Capra_hircus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	79.387	ENSCSAG00000000243	APOBEC4	96	79.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	83.379	ENSCHOG00000012387	APOBEC4	96	83.807	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	99	54.645	ENSCPBG00000015714	APOBEC4	93	54.701	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	93	67.544	ENSCGRG00001004553	Apobec4	96	67.544	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	96	84.181	ENSDNOG00000044664	APOBEC4	96	84.091	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	68.524	ENSDORG00000007335	Apobec4	97	68.966	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	99	88.674	ENSEASG00005006513	APOBEC4	99	87.637	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	99	88.398	ENSECAG00000019734	APOBEC4	99	87.363	Equus_caballus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	87.187	ENSFCAG00000010909	APOBEC4	96	87.500	Felis_catus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	85	79.808	ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	79.808	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	90	49.550	ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.810	Gallus_gallus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	83.008	ENSGGOG00000042217	APOBEC4	96	82.955	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	99	52.304	ENSLACG00000014504	APOBEC4	95	52.661	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	80.223	ENSMMUG00000031303	APOBEC4	96	80.398	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	93	47.839	ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	47.384	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	63.859	MGP_CAROLIEiJ_G0014701	Apobec4	92	65.439	Mus_caroli
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	63.315	ENSMUSG00000055547	Apobec4	92	64.873	Mus_musculus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	62.772	MGP_PahariEiJ_G0027937	Apobec4	92	64.306	Mus_pahari
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	63.315	MGP_SPRETEiJ_G0015508	Apobec4	92	64.873	Mus_spretus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	96	87.571	ENSMPUG00000011756	APOBEC4	94	87.784	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	97	81.127	ENSMLUG00000002458	APOBEC4	95	81.714	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	60.724	ENSNGAG00000017599	Apobec4	95	59.270	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	83.565	ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	83.523	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	89	77.370	ENSODEG00000009778	APOBEC4	95	73.952	Octodon_degus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	95	58.239	ENSOANG00000001000	APOBEC4	95	58.239	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	81.894	ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	81.818	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	96	81.921	ENSOARG00000005287	APOBEC4	96	81.818	Ovis_aries
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	80.780	ENSPPAG00000038272	APOBEC4	96	80.682	Pan_paniscus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	87.465	ENSPPRG00000014706	APOBEC4	96	87.784	Panthera_pardus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	87.465	ENSPTIG00000005518	APOBEC4	96	87.784	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	83.008	ENSPTRG00000047181	APOBEC4	96	82.955	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	96	69.859	ENSPEMG00000019164	Apobec4	95	70.085	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	59	35.565	ENSPMAG00000006156	APOBEC4	74	33.579	Petromyzon_marinus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	67.318	ENSPCIG00000003817	APOBEC4	93	67.330	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	82.451	ENSPPYG00000000424	APOBEC4	96	82.386	Pongo_abelii
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	62.953	ENSPCAG00000015174	APOBEC4	96	63.456	Procavia_capensis
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	86.630	ENSPVAG00000001100	APOBEC4	96	86.648	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	63.957	ENSRNOG00000028089	Apobec4	87	65.805	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	96	65.819	ENSSHAG00000013804	APOBEC4	96	65.722	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	99	53.552	ENSSPUG00000010884	APOBEC4	93	53.652	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	85.014	ENSSSCG00000015561	APOBEC4	96	85.511	Sus_scrofa
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	81.616	ENSTBEG00000006476	APOBEC4	96	81.818	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	86.313	ENSTTRG00000014784	APOBEC4	96	86.364	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	100	99.455	ENSUMAG00000016285	APOBEC4	100	99.455	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	89.136	ENSVVUG00000009054	APOBEC4	96	89.489	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000005088	APOBEC4	99	46.400	ENSXETG00000017441	apobec4	84	48.476	Xenopus_tropicalis