EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000009166 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2E
Alias: RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5019 bases
Position: chrLZNR01002135.1:182007-187025
Accession: 9192
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000011198	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	7.7e-35	1	1
ENSUAMP00000011197	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	2.2e-34	1	1
ENSUAMP00000011198	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	1.7e-27	1	1
ENSUAMP00000011197	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	1.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000012596	POLR2E-201	885	-	ENSUAMP00000011197	294 (aa)	-	-
ENSUAMT00000012597	POLR2E-202	549	-	ENSUAMP00000011198	182 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSUAMG00000009166's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSUAMG00000009166's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.361	ENSG00000099817	POLR2E	99	98.361	Homo_sapiens
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSAPOG00000002935	polr2eb	100	94.536	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSAMEG00000003159	POLR2E	92	96.907	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSACIG00000024371	polr2eb	100	95.082	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSAOCG00000018166	polr2eb	100	94.536	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.381	ENSAPEG00000009000	polr2eb	92	92.268	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSATEG00000023760	polr2eb	100	94.536	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSANAG00000038488	POLR2E	99	98.907	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSACLG00000005254	polr2eb	100	95.082	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.857	ENSAMXG00000018915	POLR2E	92	92.784	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSBTAG00000020776	POLR2E	92	96.907	Bos_taurus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	99	68.269	WBGene00019246	rpb-5	99	68.269	Caenorhabditis_elegans
ENSUAMG00000009166	POLR2E	62	75.714	ENSCJAG00000007666	-	68	90.323	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	83.333	ENSCAFG00000019546	POLR2E	92	93.299	Canis_familiaris
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSCAFG00020017111	POLR2E	92	96.907	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSCHIG00000014151	POLR2E	92	96.907	Capra_hircus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	78.571	ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.571	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000009166	POLR2E	90	85.417	ENSCAPG00000010843	POLR2E	85	96.591	Cavia_aperea
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSCPOG00000001542	POLR2E	92	96.907	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSCCAG00000025658	POLR2E	99	98.907	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSCATG00000008926	POLR2E	99	98.907	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000009166	POLR2E	97	63.902	ENSCLAG00000009238	-	93	73.575	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSCLAG00000014874	-	92	96.392	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSCSAG00000012336	POLR2E	92	96.907	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSCPBG00000009702	POLR2E	92	96.392	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	73.810	ENSCING00000024933	-	92	82.990	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSCANG00000025560	POLR2E	99	98.907	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSCGRG00001022927	Polr2e	92	95.876	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	80.930	ENSCGRG00000016441	Polr2e	93	89.950	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	93.443	ENSCSEG00000007107	polr2eb	100	93.443	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSCVAG00000019940	polr2eb	100	94.536	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	81.429	ENSDARG00000026183	polr2eb	92	91.237	Danio_rerio
ENSUAMG00000009166	POLR2E	89	85.263	ENSDNOG00000044994	POLR2E	83	99.471	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSDORG00000001154	Polr2e	92	96.907	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000009166	POLR2E	99	73.206	FBgn0033571	Rpb5	94	81.218	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000009166	POLR2E	71	75.159	ENSEBUG00000010159	-	76	91.720	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000009166	POLR2E	64	74.483	ENSEASG00005021615	POLR2E	52	91.935	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	99.454	ENSECAG00000011124	POLR2E	100	99.454	Equus_caballus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	92.896	ENSELUG00000005815	POLR2E	100	92.896	Esox_lucius
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	91.803	ENSELUG00000020646	polr2e	100	91.803	Esox_lucius
ENSUAMG00000009166	POLR2E	99	99.451	ENSFCAG00000007318	POLR2E	100	99.451	Felis_catus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	90	84.896	ENSFALG00000013986	POLR2E	91	96.023	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSFDAG00000014539	POLR2E	92	96.907	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSFHEG00000022398	polr2eb	100	94.536	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	80.952	ENSGMOG00000007615	polr2eb	94	89.848	Gadus_morhua
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSGALG00000002591	POLR2E	92	96.392	Gallus_gallus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSGAFG00000005087	polr2eb	100	95.082	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	80.952	ENSGACG00000013247	polr2eb	92	90.722	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSGAGG00000008356	POLR2E	92	96.392	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSGGOG00000011267	POLR2E	99	98.907	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000009166	POLR2E	63	86.957	ENSHBUG00000011099	polr2eb	100	86.957	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	85.714	ENSHGLG00000013330	POLR2E	92	95.876	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	85.714	ENSHGLG00100011014	POLR2E	92	95.876	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	92.896	ENSHCOG00000000906	polr2eb	100	92.896	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000009166	POLR2E	50	81.053	ENSHCOG00000012099	-	88	91.964	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.381	ENSIPUG00000019801	polr2e	92	92.268	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSSTOG00000002853	POLR2E	92	96.907	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSJJAG00000016595	-	92	95.876	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	91.257	ENSJJAG00000003145	-	100	91.257	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	74	72.185	ENSJJAG00000015812	-	100	81.366	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.381	ENSKMAG00000005954	polr2eb	92	92.268	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSLBEG00000024802	polr2eb	100	94.536	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.381	ENSLACG00000013686	POLR2E	92	92.268	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000009166	POLR2E	74	80.247	ENSLOCG00000004599	POLR2E	100	96.914	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	66.981	ENSLAFG00000025587	POLR2E	92	75.510	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSMFAG00000002884	POLR2E	99	98.907	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSMMUG00000013927	POLR2E	99	98.907	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSMNEG00000034046	-	99	98.907	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	54.286	ENSMNEG00000033452	-	94	66.495	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000009166	POLR2E	91	78.313	ENSMLEG00000012405	POLR2E	93	78.313	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSMAMG00000018703	polr2eb	100	94.536	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSMZEG00005010796	polr2eb	100	95.082	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	84.834	ENSMGAG00000003769	POLR2E	92	94.872	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000009166	POLR2E	91	84.456	ENSMAUG00000010125	-	92	95.429	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	55.714	ENSMAUG00000011003	-	100	55.714	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	99.454	ENSMICG00000013063	POLR2E	99	99.454	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSMOCG00000013414	Polr2e	92	95.876	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000009166	POLR2E	90	72.251	ENSMMOG00000001167	polr2eb	82	82.022	Mola_mola
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	92.896	ENSMMOG00000001161	polr2eb	100	92.896	Mola_mola
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSMODG00000005494	POLR2E	92	96.392	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.857	ENSMALG00000021888	polr2eb	92	92.784	Monopterus_albus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	92	95.876	Mus_caroli
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSMUSG00000004667	Polr2e	92	95.876	Mus_musculus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	92	95.876	Mus_pahari
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	92	95.876	Mus_spretus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSMPUG00000008953	POLR2E	92	96.392	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000009166	POLR2E	68	86.614	ENSMLUG00000006376	-	100	82.716	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSMLUG00000013193	POLR2E	92	96.907	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSNGAG00000001147	Polr2e	92	95.876	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000009166	POLR2E	83	60.894	ENSNGAG00000017344	-	96	73.743	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSNBRG00000022772	polr2eb	100	95.082	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	71.357	ENSNLEG00000031364	-	100	71.357	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.109	ENSNLEG00000001207	-	100	95.109	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	74.762	ENSOPRG00000008331	POLR2E	92	82.990	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSODEG00000013230	-	92	96.907	Octodon_degus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	87	74.194	ENSODEG00000007985	-	100	88.172	Octodon_degus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	74.869	ENSODEG00000011490	-	100	74.869	Octodon_degus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.381	ENSONIG00000002519	polr2eb	92	92.268	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSORLG00000015346	polr2eb	100	95.082	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSORLG00020020700	polr2e	100	95.082	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSORLG00015016842	polr2e	100	95.082	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.381	ENSOMEG00000002709	polr2eb	92	92.268	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSOGAG00000012311	POLR2E	92	96.907	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSOARG00000010994	POLR2E	92	96.907	Ovis_aries
ENSUAMG00000009166	POLR2E	90	98.780	ENSPPAG00000003145	POLR2E	99	98.780	Pan_paniscus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	99	99.451	ENSPPRG00000000777	POLR2E	100	99.451	Panthera_pardus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	90	89.697	ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSPTRG00000010183	POLR2E	99	98.907	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSPANG00000018011	POLR2E	99	98.907	Papio_anubis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	93.443	ENSPKIG00000009607	POLR2E	100	93.443	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	93.443	ENSPKIG00000024123	POLR2E	100	93.443	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000009166	POLR2E	97	81.951	ENSPSIG00000002870	POLR2E	91	92.063	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSPMGG00000014354	polr2eb	100	94.536	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSPEMG00000023261	Polr2e	92	95.876	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000009166	POLR2E	88	84.656	ENSPCIG00000007312	POLR2E	96	78.656	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.857	ENSPFOG00000005734	polr2eb	92	92.784	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSPLAG00000014496	polr2eb	100	95.082	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSPMEG00000008053	polr2eb	100	95.082	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSPREG00000006489	polr2eb	100	95.082	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	79.621	ENSPPYG00000009305	POLR2E	92	89.231	Pongo_abelii
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSPCOG00000014491	POLR2E	98	98.907	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000009166	POLR2E	75	100.000	ENSPVAG00000007718	-	65	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	89	81.053	ENSPNYG00000019797	polr2eb	97	93.782	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSPNAG00000026263	POLR2E	100	94.536	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSRNOG00000013545	Polr2e	92	95.876	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSRBIG00000028726	-	99	98.907	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	61.905	ENSRBIG00000027259	-	94	74.742	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSRROG00000043763	POLR2E	99	98.907	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000009166	POLR2E	99	39.091	YBR154C	RPB5	99	39.091	Saccharomyces_cerevisiae
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	98.907	ENSSBOG00000027241	POLR2E	99	98.907	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSSHAG00000010690	POLR2E	92	96.392	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSSFOG00015006073	polr2e	100	94.536	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.264	ENSSMAG00000012782	polr2eb	100	86.264	Scophthalmus_maximus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSSDUG00000003352	polr2eb	100	94.536	Seriola_dumerili
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSSLDG00000004965	polr2eb	100	94.536	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	84.762	ENSSPUG00000006114	POLR2E	92	94.845	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSSPAG00000017556	polr2eb	100	94.536	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSSSCG00000021472	POLR2E	92	96.907	Sus_scrofa
ENSUAMG00000009166	POLR2E	70	91.339	ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	Taeniopygia_guttata
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	94.536	ENSTRUG00000018238	polr2eb	100	94.536	Takifugu_rubripes
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.381	ENSTNIG00000013187	polr2eb	92	92.268	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	ENSTTRG00000001484	POLR2E	92	96.392	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.667	ENSVVUG00000022818	POLR2E	54	86.667	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	84.286	ENSXETG00000003291	polr2e	92	94.330	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSXCOG00000009197	polr2eb	100	95.082	Xiphophorus_couchianus
ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	95.082	ENSXMAG00000026495	polr2eb	100	95.082	Xiphophorus_maculatus