EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000009345 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PRPF3
Alias: Prp3|RP18|SNRNP90|hPrp3
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17011 bases
Position: chrLZNR01014682.1:53561-70571
Accession: 17348
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000011449	PRP3	PF08572.10	1.5e-79	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000012870	PRPF3-201	1647	-	ENSUAMP00000011449	548 (aa)	-	UPI00005A3440

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSG00000117360	PRPF3	80	100.000	Homo_sapiens
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.867	ENSAPOG00000015584	prpf3	80	75.221	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.818	ENSAMEG00000001630	PRPF3	80	99.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.823	ENSACIG00000007876	prpf3	79	74.113	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.159	ENSAOCG00000011449	prpf3	80	75.357	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.643	ENSATEG00000023583	prpf3	80	74.821	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	94.718	ENSAPLG00000002440	PRPF3	80	94.718	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	92.210	ENSACAG00000003176	PRPF3	80	92.572	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSANAG00000026138	PRPF3	80	100.000	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.460	ENSACLG00000020127	prpf3	80	74.640	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	75.482	ENSAMXG00000007306	prpf3	80	75.482	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSBTAG00000013946	PRPF3	80	100.000	Bos_taurus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	99	39.091	WBGene00010844	prp-3	80	39.234	Caenorhabditis_elegans
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSCJAG00000009926	PRPF3	80	100.000	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSCAFG00000011820	PRPF3	80	100.000	Canis_familiaris
ENSUAMG00000009345	PRPF3	75	100.000	ENSCAFG00020019653	PRPF3	75	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSCHIG00000015434	PRPF3	80	100.000	Capra_hircus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.270	ENSTSYG00000001383	PRPF3	80	99.270	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000009345	PRPF3	93	92.505	ENSCAPG00000017812	PRPF3	80	93.097	Cavia_aperea
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.635	ENSCPOG00000008068	PRPF3	80	99.635	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSCCAG00000026380	PRPF3	80	100.000	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	81.013	ENSCATG00000041778	PRPF3	78	81.013	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.818	ENSCLAG00000015009	PRPF3	80	99.818	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000009345	PRPF3	71	100.000	ENSCHOG00000011645	PRPF3	57	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	96.175	ENSCPBG00000008216	PRPF3	80	96.175	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000009345	PRPF3	76	59.189	ENSCING00000003312	-	99	58.711	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000009345	PRPF3	99	55.109	ENSCSAVG00000008720	-	93	55.109	Ciona_savignyi
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.088	ENSCANG00000036769	PRPF3	80	99.088	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSCGRG00001019100	Prpf3	80	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSCGRG00000007322	Prpf3	80	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	75.000	ENSCSEG00000002532	prpf3	86	74.910	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	75.445	ENSCVAG00000009318	prpf3	79	75.623	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.291	ENSDARG00000086425	prpf3	80	74.291	Danio_rerio
ENSUAMG00000009345	PRPF3	99	99.081	ENSDNOG00000005904	PRPF3	86	99.081	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.635	ENSDORG00000008664	Prpf3	86	99.635	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000009345	PRPF3	99	53.191	FBgn0036915	Prp3	99	53.273	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	98.175	ENSETEG00000019124	PRPF3	80	98.175	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	66.044	ENSEBUG00000011680	prpf3	80	66.044	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.818	ENSEASG00005001566	PRPF3	80	99.818	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSECAG00000019840	PRPF3	80	100.000	Equus_caballus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	80	94.773	ENSEEUG00000007338	PRPF3	64	94.773	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	66.844	ENSELUG00000013624	prpf3	79	67.199	Esox_lucius
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSFCAG00000013940	PRPF3	80	100.000	Felis_catus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.270	ENSFDAG00000010365	PRPF3	80	99.270	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.688	ENSFHEG00000021746	prpf3	80	74.866	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	75.132	ENSGMOG00000008535	prpf3	80	74.603	Gadus_morhua
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	94.718	ENSGALG00000028205	PRPF3	80	94.718	Gallus_gallus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.595	ENSGAFG00000012671	prpf3	79	74.775	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.600	ENSGACG00000011792	prpf3	80	74.778	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	95.811	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	95.811	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000009345	PRPF3	82	100.000	ENSGGOG00000013174	PRPF3	77	100.000	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	75.000	ENSHBUG00000003493	prpf3	80	75.180	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	75.365	ENSHGLG00000016033	-	83	76.095	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.453	ENSHGLG00000016569	PRPF3	80	99.453	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	75.730	ENSHGLG00100008951	-	83	75.730	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.453	ENSHGLG00100007590	PRPF3	80	99.453	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	72.302	ENSHCOG00000014058	prpf3	79	72.482	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	76.690	ENSIPUG00000000902	PRPF3	80	76.909	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSSTOG00000001889	PRPF3	80	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	99	74.592	ENSKMAG00000001390	prpf3	85	74.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	99	74.864	ENSLBEG00000026310	prpf3	85	74.819	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000009345	PRPF3	91	81.873	ENSLACG00000010541	PRPF3	79	81.873	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.635	ENSLAFG00000004713	PRPF3	80	99.635	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSMFAG00000039791	PRPF3	80	100.000	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000009345	PRPF3	87	100.000	ENSMMUG00000016301	PRPF3	76	100.000	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSMNEG00000038161	PRPF3	80	100.000	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000009345	PRPF3	82	100.000	ENSMLEG00000040609	PRPF3	77	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	99	67.582	ENSMLEG00000041065	-	80	67.399	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.956	ENSMAMG00000014968	prpf3	86	74.368	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	73.158	ENSMZEG00005015970	prpf3	85	73.188	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	94.718	ENSMGAG00000000707	PRPF3	80	94.718	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.635	ENSMAUG00000017112	Prpf3	80	99.635	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.635	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	99.635	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.818	ENSMOCG00000000242	Prpf3	80	99.818	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	68.056	ENSMMOG00000016131	prpf3	81	68.947	Mola_mola
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	97.993	ENSMODG00000018774	PRPF3	80	97.993	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.327	ENSMALG00000007257	prpf3	79	73.968	Monopterus_albus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.453	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	80	99.453	Mus_caroli
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.453	ENSMUSG00000015748	Prpf3	80	99.453	Mus_musculus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.270	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	80	99.270	Mus_pahari
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.453	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	80	99.453	Mus_spretus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	95.803	ENSMPUG00000005080	PRPF3	80	95.803	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.271	ENSMLUG00000004646	-	80	99.271	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSNGAG00000000910	Prpf3	80	100.000	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	72.949	ENSNBRG00000003462	prpf3	80	73.124	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000009345	PRPF3	87	100.000	ENSNLEG00000009841	PRPF3	78	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000009345	PRPF3	87	100.000	ENSMEUG00000008733	PRPF3	75	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.270	ENSOPRG00000010139	PRPF3	80	99.270	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.775	ENSODEG00000014412	-	82	74.775	Octodon_degus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.088	ENSODEG00000011363	-	80	99.088	Octodon_degus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	73.111	ENSONIG00000006394	prpf3	80	73.462	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	67.631	ENSOANG00000015441	PRPF3	80	67.504	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSOCUG00000011760	PRPF3	80	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.688	ENSORLG00000010330	prpf3	79	74.061	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.688	ENSORLG00020009054	prpf3	79	74.061	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.510	ENSORLG00015015016	prpf3	79	73.975	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	73.694	ENSOMEG00000000940	prpf3	86	73.694	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	92.532	ENSOGAG00000005352	PRPF3	80	92.532	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSOARG00000020798	PRPF3	80	100.000	Ovis_aries
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	99.818	ENSPPAG00000030983	PRPF3	80	99.818	Pan_paniscus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	98	79.926	ENSPPAG00000043769	-	82	79.554	Pan_paniscus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSPPRG00000000731	PRPF3	80	100.000	Panthera_pardus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSPTIG00000005516	PRPF3	80	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000009345	PRPF3	98	78.810	ENSPTRG00000047819	-	82	78.439	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSPTRG00000001254	PRPF3	80	100.000	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSPANG00000000499	PRPF3	80	100.000	Papio_anubis
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	77.362	ENSPKIG00000010501	prpf3	85	77.899	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	95.811	ENSPSIG00000014877	PRPF3	80	95.628	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000009345	PRPF3	99	72.826	ENSPMGG00000007776	prpf3	86	73.007	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	100.000	ENSPEMG00000011672	Prpf3	80	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000009345	PRPF3	79	72.146	ENSPMAG00000005588	prpf3	99	69.757	Petromyzon_marinus
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