EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000011088 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29463 bases
Position: chrLZNR01005096.1:35292-64754
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000013819	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.7e-28	1	2
ENSUAMP00000013819	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.7e-28	2	2
ENSUAMP00000013809	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.8e-28	1	2
ENSUAMP00000013809	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.8e-28	2	2
ENSUAMP00000013818	PAP_RNA-bind	PF04926.15	9.3e-28	1	2
ENSUAMP00000013818	PAP_RNA-bind	PF04926.15	9.3e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000015511	PAPOLG-203	2139	-	ENSUAMP00000013819	712 (aa)	-	-
ENSUAMT00000015510	PAPOLG-202	2196	-	ENSUAMP00000013818	731 (aa)	-	UPI0004DFE9F7
ENSUAMT00000015496	PAPOLG-201	2154	-	ENSUAMP00000013809	717 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSUAMG00000011088's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSUAMG00000011088's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	58	81.446	ENSUAMG00000025737	PAPOLA	99	80.282

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.270	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.284	ENSAPOG00000004798	papolg	99	71.866	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	99.453	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	99.453	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	71.389	ENSACIG00000010546	papolg	99	71.349	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.140	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.005	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.275	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.140	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.849	ENSATEG00000009007	papolg	97	71.809	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.404	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.404	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	81	64.638	ENSACAG00000015048	-	100	63.980	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.410	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	95.410	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	69.281	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.263	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.253	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.414	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	96.999	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	99	96.999	Bos_taurus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.952	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	94.952	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	98.222	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	97.403	Canis_familiaris
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	97.558	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.801	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	96.453	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	96.453	Capra_hircus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.225	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	99	95.225	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	54	91.864	ENSCAPG00000014901	-	100	91.864	Cavia_aperea
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.952	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	94.952	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.967	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.967	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	90	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.498	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	95.498	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.679	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	99	94.679	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	90	93.323	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.323	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	70	64.752	ENSCING00000024664	-	90	65.844	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	68	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.549	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	95.549	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.588	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	93.452	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.588	ENSCGRG00000005552	-	100	93.452	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.532	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.476	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	67.405	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.908	ENSDARG00000012141	papolg	100	72.244	Danio_rerio
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.315	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	99	93.179	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	60	99.534	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	99	73.842	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.777	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	62	71.094	ENSEBUG00000004020	papolg	90	70.649	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	67	56.695	ENSEBUG00000005042	-	79	57.725	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	97.271	ENSEASG00005002038	PAPOLG	99	97.271	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	97.135	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	97.135	Equus_caballus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	84.584	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	84.584	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	75.259	ENSELUG00000014497	papolg	99	64.806	Esox_lucius
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	98.090	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	99	98.090	Felis_catus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	99	66.531	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	64.675	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.816	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	96	94.816	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	67	61.538	ENSFHEG00000019080	papolg	90	62.109	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	87	83.486	ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	Gadus_morhua
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.565	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	72.565	Gallus_gallus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	68.915	ENSGAFG00000003263	papolg	97	68.146	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	71.448	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.429	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.688	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	95.688	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	69.281	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.526	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.498	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	95.498	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.498	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.498	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.794	ENSHCOG00000006782	papolg	89	69.774	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.470	ENSIPUG00000021642	papolg	100	73.253	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.771	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	95.771	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	60	99.301	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.301	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.769	ENSKMAG00000016439	papolg	97	70.458	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	99	69.481	ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.031	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.755	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.755	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.178	ENSLOCG00000016130	papolg	100	71.916	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.861	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.225	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	99	95.225	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.225	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	99	95.225	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	86.179	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	99	86.179	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.828	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	95.828	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.081	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.742	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	69.281	ENSMZEG00005018140	papolg	99	72.472	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	71.448	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	71.448	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.588	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.452	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	96.245	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	96.245	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.588	ENSMOCG00000006857	Papolg	99	93.452	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	71.754	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.888	Mola_mola
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	88.394	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	88.394	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	71.448	ENSMALG00000007012	papolg	98	71.049	Monopterus_albus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.543	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.766	Mus_caroli
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.407	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	Mus_musculus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.407	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.270	Mus_pahari
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.270	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	Mus_spretus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	98.906	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	89	98.906	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.089	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	95.089	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.225	ENSNGAG00000001120	Papolg	99	95.089	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	99	64.000	ENSNBRG00000011943	papolg	99	62.963	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	60	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	83	78.261	ENSMEUG00000013605	-	86	78.261	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.952	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	99	94.270	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	59	95.249	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	Octodon_degus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	65.317	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.270	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	86.694	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	86.694	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	96.044	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	99	95.362	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.336	ENSORLG00000001577	papolg	97	69.456	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.509	ENSORLG00020002482	papolg	97	69.774	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.336	ENSORLG00015008836	papolg	97	69.456	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	99	70.699	ENSOMEG00000001406	papolg	99	69.241	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	57	93.627	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	93.627	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	96.453	ENSOARG00000001563	PAPOLG	90	96.453	Ovis_aries
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.132	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	95.132	Pan_paniscus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	98.090	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	99	98.090	Panthera_pardus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	97.954	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	97.954	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.132	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	95.132	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	90.748	ENSPANG00000014543	PAPOLG	99	90.748	Papio_anubis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.901	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.489	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	95	71.179	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	70.130	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	79.217	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.217	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.179	ENSPEMG00000008960	-	100	93.042	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	69	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	54.072	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.619	Petromyzon_marinus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	88.259	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	88.259	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	69.444	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.669	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	69.048	ENSPLAG00000018445	papolg	97	68.146	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	69.221	ENSPMEG00000003961	papolg	97	68.586	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	68.775	ENSPREG00000010358	papolg	97	68.010	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.407	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	94.407	Pongo_abelii
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	81.855	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	81.855	Procavia_capensis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	87.761	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	87.761	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	89	94.424	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.326	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.816	ENSPNYG00000006729	papolg	99	72.399	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.720	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.592	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.270	ENSRNOG00000006261	Papolg	99	94.134	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	88.677	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	99	88.677	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.410	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	95.410	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.828	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.828	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	95	88.227	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.227	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	63.896	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.488	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.483	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.793	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.793	ENSSDUG00000000912	papolg	97	73.517	Seriola_dumerili
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.177	ENSSLDG00000001217	papolg	97	71.543	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	80.218	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	80.218	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	71.669	ENSSPAG00000009004	papolg	99	71.528	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	97.271	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	97.271	Sus_scrofa
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	76	76.937	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	100	76.937	Taeniopygia_guttata
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.343	ENSTRUG00000006410	papolg	99	71.935	Takifugu_rubripes
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	66.977	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.140	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	87.722	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	87.722	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	91.951	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	99	91.951	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	100.000	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	100.000	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	92.633	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	92.633	Vicugna_pacos
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	98.455	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	98.358	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	99	76.152	ENSXETG00000002208	papolg	98	76.152	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	70	85.170	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.170	Xiphophorus_couchianus
ENSUAMG00000011088	PAPOLG	76	82.600	ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	Xiphophorus_maculatus