EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000012048 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16118 bases
Position: chrLZNR01013851.1:72845-88962
Accession: 5276
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000015008	RRM_1	PF00076.22	1.9e-16	1	2
ENSUAMP00000015008	RRM_1	PF00076.22	1.9e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000016825	HTATSF1-201	2253	-	ENSUAMP00000015008	750 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	83.533	ENSG00000102241	HTATSF1	100	90.984	Homo_sapiens
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	55	60.471	ENSAPOG00000009823	htatsf1	92	60.235	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	100	96.610	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	100	96.610	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.317	ENSACIG00000020459	htatsf1	95	58.998	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	62.595	ENSAOCG00000020994	htatsf1	92	59.165	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	62.341	ENSAPEG00000016432	htatsf1	89	60.241	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	93	78.592	ENSANAG00000025458	-	99	77.465	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	95	70.483	ENSANAG00000027986	-	97	70.069	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	54	59.535	ENSACLG00000008096	htatsf1	96	58.239	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.959	ENSAMXG00000008387	htatsf1	83	64.051	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	80.624	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	81.701	Bos_taurus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	75.995	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	78.013	Bos_taurus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	80.624	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	81.701	Bos_taurus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	80.978	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	80.449	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	94.631	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	94.541	Canis_familiaris
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	93.176	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	93.099	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	81.516	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	82.718	Capra_hircus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	82.736	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	99	82.609	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	78.610	ENSCCAG00000025329	-	100	78.610	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	81.481	ENSCCAG00000022701	-	99	80.952	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	83.089	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	83.113	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	100	73.987	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	100	74.084	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	83.089	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	83.113	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	70.649	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	93	65.734	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	82.956	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	82.982	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	82	79.048	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	99	74.682	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	74	71.958	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	68.603	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.939	ENSCVAG00000014070	htatsf1	90	61.446	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	52	59.250	ENSDARG00000056649	htatsf1	98	54.705	Danio_rerio
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	79.481	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	100	81.510	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	82	50.000	ENSETEG00000006377	-	73	49.353	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	83.420	ENSEASG00005003440	HTATSF1	99	83.290	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	83.420	ENSECAG00000009156	HTATSF1	99	83.290	Equus_caballus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	100	68.531	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	100	68.791	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	93.191	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	93.191	Felis_catus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	51	68.193	ENSFALG00000003728	HTATSF1	87	67.990	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	75.231	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.489	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.104	ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	63.104	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	68.992	ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	66.184	Gallus_gallus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.939	ENSGAFG00000003041	htatsf1	85	63.939	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	54	58.588	ENSGACG00000020459	htatsf1	97	57.437	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	83.400	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	100	83.289	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	54	59.535	ENSHBUG00000004392	htatsf1	96	58.239	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	98	75.701	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	99	75.821	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	61.069	ENSHCOG00000009056	htatsf1	90	60.705	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.852	ENSIPUG00000017828	htatsf1	80	64.211	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	81.842	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	81.984	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	56	59.775	ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.459	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	62.887	ENSLBEG00000001154	htatsf1	84	63.144	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	66.053	ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	66.053	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	54	41.259	ENSLOCG00000015118	htatsf1	89	40.802	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	72.349	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	70.839	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	82.956	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	99	82.982	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	82.956	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	99	82.982	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	75.766	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	99	76.781	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	82.956	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	99	82.982	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	62.720	ENSMAMG00000021225	htatsf1	87	62.690	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	54	59.535	ENSMZEG00005000485	htatsf1	96	58.239	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	74.118	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.674	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	80.845	ENSMICG00000009348	HTATSF1	100	79.659	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	72.868	ENSMOCG00000023007	-	99	72.610	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	72.617	ENSMOCG00000022370	-	96	70.839	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.265	ENSMMOG00000011013	htatsf1	86	63.265	Mola_mola
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	51	71.279	ENSMODG00000014087	-	84	71.279	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	55	57.870	ENSMALG00000019977	htatsf1	94	57.870	Monopterus_albus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	71.134	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	71.778	Mus_caroli
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	98	72.229	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	74.089	Mus_musculus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	98	72.441	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	73.958	Mus_spretus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	100	91.927	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	100	92.188	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	74.069	ENSMLUG00000009234	-	100	73.368	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	76.963	ENSMLUG00000028418	-	99	76.783	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	98	74.631	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	74.934	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.409	ENSNBRG00000003818	htatsf1	96	58.559	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	82.869	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	99	82.740	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	53	69.521	ENSMEUG00000004133	-	95	69.270	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	54	60.460	ENSONIG00000008638	htatsf1	96	59.101	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	77.620	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	100	79.554	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	55	58.542	ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	58.636	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	98	77.837	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	100	78.534	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	77.532	ENSOARG00000000481	-	99	77.403	Ovis_aries
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	80.364	ENSOARG00000011215	-	99	81.548	Ovis_aries
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	83.533	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	100	83.421	Pan_paniscus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	93.858	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	99	93.858	Panthera_pardus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	93	93.228	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	93.228	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	83.533	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	100	83.421	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	71.638	ENSPANG00000010946	HTATSF1	99	71.260	Papio_anubis
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	67.553	ENSPKIG00000024852	htatsf1	83	67.553	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	62.690	ENSPMGG00000006172	htatsf1	86	62.312	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	98	74.668	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.316	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	52	65.990	ENSPCIG00000018896	-	88	65.990	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	70.079	ENSPCIG00000030173	-	87	70.079	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.613	ENSPFOG00000007871	htatsf1	84	63.776	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	52	61.728	ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	61.728	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.613	ENSPMEG00000000352	htatsf1	86	63.776	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.613	ENSPREG00000007811	htatsf1	86	63.776	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	88	83.915	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	82	85.346	Pongo_abelii
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	98	67.881	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	99	68.091	Procavia_capensis
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	82.384	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	99	82.252	Propithecus_coquereli
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ENSUAMG00000012048	HTATSF1	54	59.767	ENSPNYG00000016693	htatsf1	96	58.465	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	57	59.624	ENSPNAG00000006166	htatsf1	95	59.624	Pygocentrus_nattereri
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ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	82.423	ENSRROG00000021939	HTATSF1	99	82.454	Rhinopithecus_roxellana
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ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	77.646	ENSSBOG00000017914	-	100	77.116	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	51	68.123	ENSSHAG00000006440	-	99	68.123	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	51	62.663	ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	62.663	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	55	57.931	ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.124	Scophthalmus_maximus
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ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	65.344	ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	65.517	Xiphophorus_couchianus
ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	65.104	ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	65.104	Xiphophorus_maculatus