EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000012231 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: URB1
Alias: C21orf108|KIAA0539|NPA1
Full Name: URB1 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 69206 bases
Position: chrLZNR01003471.1:7579-76784
Accession: 17344
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000015342	Npa1	PF11707.8	6.4e-86	1	1
ENSUAMP00000015344	Npa1	PF11707.8	8.1e-86	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000017197	URB1-201	6822	-	ENSUAMP00000015342	2273 (aa)	-	-
ENSUAMT00000017199	URB1-202	6801	-	ENSUAMP00000015344	2266 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000012231	URB1	99	82.103	ENSG00000142207	URB1	100	81.954	Homo_sapiens
ENSUAMG00000012231	URB1	99	42.758	ENSAPOG00000020308	urb1	99	42.758	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	96.347	ENSAMEG00000011998	URB1	100	96.347	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000012231	URB1	94	45.039	ENSACIG00000003248	urb1	97	44.818	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	40.755	ENSAOCG00000010364	urb1	99	40.755	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000012231	URB1	96	52.576	ENSAPEG00000010758	urb1	99	52.576	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000012231	URB1	97	44.676	ENSATEG00000011790	urb1	96	44.676	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000012231	URB1	97	56.117	ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.117	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000012231	URB1	99	51.963	ENSACAG00000002817	URB1	99	52.028	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.126	ENSANAG00000024617	URB1	100	81.126	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000012231	URB1	99	44.405	ENSACLG00000024865	urb1	99	44.086	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000012231	URB1	99	39.570	ENSAMXG00000012306	urb1	99	39.209	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	79.860	ENSBTAG00000012412	URB1	99	79.947	Bos_taurus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.151	ENSCJAG00000009118	URB1	100	81.151	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	88.669	ENSCAFG00000008892	URB1	100	88.669	Canis_familiaris
ENSUAMG00000012231	URB1	99	88.331	ENSCAFG00020025987	-	100	88.331	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000012231	URB1	99	87.450	ENSCAFG00020025994	-	100	87.406	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000012231	URB1	99	79.289	ENSCHIG00000015645	URB1	99	79.289	Capra_hircus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	80.502	ENSTSYG00000013286	URB1	100	80.546	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000012231	URB1	98	75.484	ENSCAPG00000015589	URB1	99	75.484	Cavia_aperea
ENSUAMG00000012231	URB1	99	76.761	ENSCPOG00000006748	URB1	99	76.761	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.470	ENSCCAG00000021299	URB1	100	81.558	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.558	ENSCATG00000042630	URB1	100	81.558	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000012231	URB1	99	78.198	ENSCLAG00000005262	URB1	100	78.198	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000012231	URB1	99	79.623	ENSCSAG00000009584	URB1	100	79.623	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	58.562	ENSCPBG00000006454	URB1	99	58.562	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.382	ENSCANG00000031088	URB1	100	81.382	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000012231	URB1	98	74.788	ENSCGRG00001010616	Urb1	99	74.537	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000012231	URB1	97	74.414	ENSCGRG00000015840	Urb1	99	74.414	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000012231	URB1	99	42.057	ENSCSEG00000012616	urb1	99	42.243	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000012231	URB1	96	55.300	ENSCVAG00000009076	urb1	97	55.300	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	43.478	ENSDARG00000060308	urb1	99	43.522	Danio_rerio
ENSUAMG00000012231	URB1	85	80.114	ENSDNOG00000015586	URB1	99	80.114	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	77.485	ENSDORG00000006735	Urb1	100	77.485	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000012231	URB1	92	80.545	ENSETEG00000009080	URB1	92	80.545	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000012231	URB1	99	83.612	ENSEASG00005007711	URB1	100	83.612	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000012231	URB1	97	91.714	ENSECAG00000013206	URB1	100	91.714	Equus_caballus
ENSUAMG00000012231	URB1	57	85.668	ENSEEUG00000003626	-	58	84.985	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	44.328	ENSELUG00000020516	urb1	99	44.396	Esox_lucius
ENSUAMG00000012231	URB1	99	86.432	ENSFCAG00000002177	URB1	100	86.432	Felis_catus
ENSUAMG00000012231	URB1	97	50.706	ENSFALG00000004636	URB1	99	50.861	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000012231	URB1	99	77.734	ENSFDAG00000007288	URB1	95	77.734	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000012231	URB1	99	41.812	ENSFHEG00000000202	urb1	99	42.622	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000012231	URB1	92	47.745	ENSGMOG00000001838	urb1	93	47.745	Gadus_morhua
ENSUAMG00000012231	URB1	99	55.898	ENSGALG00000015887	URB1	99	55.854	Gallus_gallus
ENSUAMG00000012231	URB1	93	52.391	ENSGAFG00000020694	urb1	97	52.391	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000012231	URB1	98	45.020	ENSGACG00000011703	urb1	99	44.932	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	57.815	ENSGAGG00000022544	URB1	99	57.815	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.910	ENSGGOG00000000285	URB1	100	81.910	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000012231	URB1	99	44.449	ENSHBUG00000001904	urb1	99	44.129	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000012231	URB1	99	76.863	ENSHGLG00000004907	URB1	99	76.863	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000012231	URB1	99	77.480	ENSHGLG00100010749	URB1	99	77.480	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000012231	URB1	72	51.451	ENSHCOG00000018683	urb1	99	52.418	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000012231	URB1	99	40.589	ENSIPUG00000014721	urb1	99	40.413	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	79.604	ENSSTOG00000004539	URB1	100	79.604	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	41.143	ENSKMAG00000006001	urb1	98	47.335	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000012231	URB1	97	42.105	ENSLBEG00000027208	urb1	99	52.004	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000012231	URB1	99	48.012	ENSLACG00000017059	URB1	100	48.012	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000012231	URB1	98	46.332	ENSLOCG00000009190	urb1	99	46.261	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	77.875	ENSLAFG00000010407	URB1	99	77.875	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.470	ENSMFAG00000034391	URB1	97	81.470	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.206	ENSMMUG00000010295	URB1	100	81.206	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000012231	URB1	99	80.062	ENSMNEG00000032981	URB1	100	80.062	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.514	ENSMLEG00000041435	URB1	100	81.514	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	42.627	ENSMAMG00000011238	urb1	99	42.308	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	39.982	ENSMZEG00005011862	urb1	99	39.791	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000012231	URB1	98	56.208	ENSMGAG00000014512	URB1	99	56.164	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000012231	URB1	93	79.708	ENSMAUG00000010516	Urb1	99	80.000	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	80.625	ENSMICG00000016424	URB1	99	80.625	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	72.487	ENSMOCG00000012613	Urb1	99	72.487	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000012231	URB1	99	63.449	ENSMODG00000021076	URB1	99	63.449	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000012231	URB1	99	42.495	ENSMALG00000017411	urb1	99	52.266	Monopterus_albus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	73.548	MGP_CAROLIEiJ_G0020948	Urb1	99	73.548	Mus_caroli
ENSUAMG00000012231	URB1	99	73.636	ENSMUSG00000039929	Urb1	99	73.636	Mus_musculus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	73.504	MGP_PahariEiJ_G0016653	Urb1	99	73.504	Mus_pahari
ENSUAMG00000012231	URB1	99	73.339	MGP_SPRETEiJ_G0021854	Urb1	99	73.371	Mus_spretus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	88.414	ENSMPUG00000001123	URB1	100	88.414	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000012231	URB1	99	73.911	ENSNGAG00000001905	Urb1	99	73.911	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000012231	URB1	82	44.832	ENSNBRG00000001049	urb1	99	44.932	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000012231	URB1	99	79.673	ENSNLEG00000026872	URB1	100	79.621	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000012231	URB1	96	58.456	ENSMEUG00000010828	URB1	96	58.519	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000012231	URB1	99	73.143	ENSOPRG00000013482	URB1	99	73.143	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000012231	URB1	99	76.967	ENSODEG00000002587	URB1	99	76.967	Octodon_degus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	44.702	ENSONIG00000005599	urb1	99	44.702	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	78.722	ENSOCUG00000009381	URB1	99	78.722	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	43.644	ENSORLG00000003429	urb1	99	43.619	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000012231	URB1	99	43.510	ENSORLG00020013785	urb1	99	43.399	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000012231	URB1	99	42.383	ENSORLG00015019421	urb1	98	48.459	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000012231	URB1	76	51.765	ENSOMEG00000002094	urb1	98	51.647	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000012231	URB1	99	80.220	ENSOGAG00000017140	URB1	100	80.220	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000012231	URB1	96	80.289	ENSOARG00000013679	URB1	99	80.204	Ovis_aries
ENSUAMG00000012231	URB1	99	82.130	ENSPPAG00000003423	URB1	100	82.130	Pan_paniscus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	86.784	ENSPPRG00000023131	URB1	100	86.784	Panthera_pardus
ENSUAMG00000012231	URB1	92	85.249	ENSPTIG00000016125	URB1	97	85.303	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000012231	URB1	99	82.042	ENSPTRG00000013852	URB1	100	82.042	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.602	ENSPANG00000021964	URB1	100	81.602	Papio_anubis
ENSUAMG00000012231	URB1	98	46.280	ENSPKIG00000003683	urb1	98	46.345	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000012231	URB1	99	73.936	ENSPEMG00000021205	Urb1	99	73.936	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000012231	URB1	79	34.215	ENSPMAG00000009733	URB1	99	34.890	Petromyzon_marinus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	63.393	ENSPCIG00000016350	URB1	99	63.809	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000012231	URB1	96	43.232	ENSPLAG00000004371	urb1	99	43.135	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000012231	URB1	99	43.684	ENSPMEG00000006634	urb1	99	43.591	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000012231	URB1	99	43.816	ENSPREG00000013453	urb1	99	43.723	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.441	ENSPPYG00000011359	URB1	100	81.294	Pongo_abelii
ENSUAMG00000012231	URB1	99	67.550	ENSPCAG00000007430	URB1	99	67.550	Procavia_capensis
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.638	ENSPCOG00000022695	URB1	100	81.726	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.410	ENSPVAG00000000889	URB1	100	81.410	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	43.274	ENSPNYG00000010589	urb1	99	43.051	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000012231	URB1	99	40.184	ENSPNAG00000019324	urb1	99	39.974	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000012231	URB1	99	73.119	ENSRNOG00000002080	Urb1	99	73.295	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000012231	URB1	99	80.810	ENSRBIG00000033122	URB1	100	80.810	Rhinopithecus_bieti
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ENSUAMG00000012231	URB1	99	81.302	ENSSBOG00000027672	URB1	100	81.302	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000012231	URB1	99	63.084	ENSSHAG00000005140	URB1	100	63.059	Sarcophilus_harrisii
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