EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000012801 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PUSL1
Alias: FLJ90811
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2695 bases
Position: chrLZNR01006728.1:32833-35527
Accession: 26914
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000016031	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1e-32	1	2
ENSUAMP00000016031	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1e-32	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000017969	PUSL1-201	1337	-	ENSUAMP00000016031	301 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	82.470	ENSG00000169972	PUSL1	98	86.066	Homo_sapiens
ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	47.410	ENSAPOG00000016290	pusl1	84	47.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	96.400	ENSAMEG00000013752	PUSL1	83	96.400	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000012801	PUSL1	78	48.523	ENSACIG00000015240	pusl1	90	48.523	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	49.187	ENSAOCG00000019419	pusl1	76	50.213	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	47.809	ENSAPEG00000005452	pusl1	83	47.809	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	50.826	ENSATEG00000024154	pusl1	80	50.826	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	55.602	ENSAPLG00000004946	PUSL1	81	55.602	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	54.086	ENSACAG00000014111	PUSL1	97	54.086	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	80.876	ENSANAG00000037456	PUSL1	83	80.876	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	48.387	ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.387	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	48.133	ENSAMXG00000044007	pusl1	88	48.133	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	85.246	ENSBTAG00000007619	PUSL1	84	85.246	Bos_taurus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	83.539	ENSCJAG00000010972	PUSL1	80	83.539	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	92.829	ENSCAFG00000019291	PUSL1	86	90.458	Canis_familiaris
ENSUAMG00000012801	PUSL1	93	87.413	ENSCAFG00020011568	PUSL1	86	90.458	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	85.246	ENSCHIG00000012615	PUSL1	85	85.246	Capra_hircus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	79.098	ENSCPOG00000005149	PUSL1	79	79.098	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	81.275	ENSCCAG00000027475	PUSL1	83	81.275	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	83.665	ENSCATG00000018260	PUSL1	83	83.665	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	81.557	ENSCLAG00000005232	PUSL1	80	81.557	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	83.665	ENSCSAG00000000680	PUSL1	83	83.665	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	64	30.876	ENSCHOG00000008442	PUS3	50	30.876	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000012801	PUSL1	85	53.101	ENSCPBG00000022621	PUSL1	87	53.101	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	83.665	ENSCANG00000034373	PUSL1	83	83.665	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	75.410	ENSCGRG00001012429	Pusl1	84	75.410	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	75.820	ENSCGRG00000006466	Pusl1	84	75.820	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000012801	PUSL1	85	46.992	ENSCSEG00000005159	pusl1	83	48.016	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	85	42.353	ENSCVAG00000012923	pusl1	93	42.353	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	49.597	ENSDARG00000074565	pusl1	94	48.276	Danio_rerio
ENSUAMG00000012801	PUSL1	74	32.258	FBgn0083976	CG34140	80	32.258	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	88.115	ENSECAG00000006248	PUSL1	80	88.115	Equus_caballus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	78.689	ENSEEUG00000000837	PUSL1	82	78.689	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	46.899	ENSELUG00000015945	pusl1	87	46.899	Esox_lucius
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	91.600	ENSFCAG00000007617	PUSL1	83	91.600	Felis_catus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	52.479	ENSFHEG00000006370	pusl1	80	52.479	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	49.796	ENSGMOG00000019388	pusl1	86	49.796	Gadus_morhua
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	52.675	ENSGALG00000001714	PUSL1	90	52.675	Gallus_gallus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	86	47.388	ENSGAFG00000007546	pusl1	90	47.388	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	49.383	ENSGACG00000007848	pusl1	80	49.383	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	85	54.264	ENSGAGG00000004730	PUSL1	87	54.264	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	82.000	ENSGGOG00000005364	PUSL1	97	82.000	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	49.174	ENSHBUG00000001264	pusl1	82	49.174	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	77.689	ENSHGLG00000017570	PUSL1	82	77.689	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	78.367	ENSHGLG00100007641	PUSL1	81	78.367	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	50.000	ENSHCOG00000010077	pusl1	87	51.452	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	46.914	ENSIPUG00000023921	pusl1	83	46.914	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	84.362	ENSSTOG00000001783	PUSL1	76	84.362	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	82.716	ENSJJAG00000020471	Pusl1	82	82.716	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	51.037	ENSKMAG00000005154	pusl1	82	51.037	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	50.826	ENSLBEG00000013469	pusl1	85	50.826	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000012801	PUSL1	63	54.974	ENSLACG00000018795	PUSL1	94	54.974	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	48.971	ENSLOCG00000002210	pusl1	82	48.971	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	84.016	ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	84.016	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	83.267	ENSMFAG00000046288	PUSL1	83	83.267	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	70.518	ENSMMUG00000016279	PUSL1	81	70.518	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	85.306	ENSMNEG00000037989	PUSL1	81	85.306	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	49.174	ENSMAMG00000016538	pusl1	79	49.174	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	47.984	ENSMZEG00005026990	pusl1	94	47.984	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000012801	PUSL1	84	51.181	ENSMGAG00000003037	PUSL1	86	51.181	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	76.639	ENSMAUG00000019924	Pusl1	84	76.639	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	83.534	ENSMICG00000014171	PUSL1	85	83.534	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	76.230	ENSMOCG00000005602	Pusl1	84	76.230	Microtus_ochrogaster
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ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	49.174	ENSMALG00000021686	pusl1	79	49.174	Monopterus_albus
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ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	79.098	ENSMUSG00000051557	Pusl1	84	79.098	Mus_musculus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	79.098	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	84	79.098	Mus_pahari
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	79.098	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	84	79.098	Mus_spretus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	93.004	ENSMPUG00000014313	PUSL1	80	93.004	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	78.367	ENSNGAG00000004647	Pusl1	73	78.367	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	48.387	ENSNBRG00000014762	pusl1	89	48.387	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	80.000	ENSNLEG00000000051	PUSL1	91	80.000	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	64.344	ENSMEUG00000011649	-	86	64.344	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	53.306	ENSMEUG00000005176	-	94	53.306	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	78.689	ENSODEG00000008247	PUSL1	79	78.689	Octodon_degus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	48.996	ENSONIG00000019361	pusl1	83	48.996	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	47.308	ENSORLG00000016228	pusl1	87	47.308	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	48.077	ENSORLG00020013710	pusl1	87	48.077	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000012801	PUSL1	85	47.925	ENSORLG00015008715	pusl1	92	47.925	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	47.934	ENSOMEG00000018897	pusl1	83	47.934	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	83.951	ENSOGAG00000031692	PUSL1	85	83.951	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	84.836	ENSOARG00000004905	PUSL1	92	84.836	Ovis_aries
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	82.072	ENSPPAG00000029283	PUSL1	83	82.072	Pan_paniscus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	93.145	ENSPPRG00000023329	PUSL1	82	93.145	Panthera_pardus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	94.650	ENSPTIG00000018532	PUSL1	90	94.650	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	82.072	ENSPTRG00000000021	PUSL1	83	82.072	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	83.267	ENSPANG00000000591	PUSL1	83	83.267	Papio_anubis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	47.368	ENSPKIG00000002447	pusl1	85	47.368	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000012801	PUSL1	85	54.651	ENSPSIG00000002781	PUSL1	94	54.651	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	45.525	ENSPMGG00000011051	pusl1	93	45.525	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	79.918	ENSPEMG00000013541	Pusl1	84	79.918	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	63.454	ENSPCIG00000007816	-	57	63.454	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	52.479	ENSPFOG00000015448	pusl1	84	52.479	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	52.479	ENSPLAG00000004348	pusl1	81	52.479	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	52.479	ENSPMEG00000000931	pusl1	88	48.571	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	51.667	ENSPREG00000002324	pusl1	81	51.667	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000012801	PUSL1	87	78.707	ENSPPYG00000002014	PUSL1	94	78.707	Pongo_abelii
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	73.663	ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	73.663	Procavia_capensis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	57	86.667	ENSPVAG00000001016	PUSL1	56	86.667	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	66	47.783	ENSPNYG00000006588	pusl1	84	47.783	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	47.809	ENSPNAG00000024441	pusl1	86	47.809	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	79.098	ENSRNOG00000022354	Pusl1	98	83.065	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	83.665	ENSRBIG00000036842	PUSL1	83	83.665	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	83.267	ENSRROG00000030704	PUSL1	83	83.267	Rhinopithecus_roxellana
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ENSUAMG00000012801	PUSL1	56	80.588	ENSSARG00000005323	-	90	80.588	Sorex_araneus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	45.098	ENSSPAG00000002528	pusl1	87	45.098	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	88.048	ENSSSCG00000003338	PUSL1	81	88.048	Sus_scrofa
ENSUAMG00000012801	PUSL1	77	30.041	ENSTGUG00000008068	PUS1	65	30.041	Taeniopygia_guttata
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	54.772	ENSTGUG00000003214	PUSL1	85	54.772	Taeniopygia_guttata
ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	48.148	ENSTRUG00000010102	pusl1	81	48.148	Takifugu_rubripes
ENSUAMG00000012801	PUSL1	59	46.154	ENSTNIG00000005789	pusl1	81	46.154	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	58	80.682	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	80.682	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	80.000	ENSTTRG00000017030	PUSL1	82	80.000	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	100	99.668	ENSUMAG00000002084	PUSL1	100	99.668	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	94	87.805	ENSVVUG00000004320	PUSL1	82	87.805	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000012801	PUSL1	63	50.262	ENSXETG00000011145	pusl1	83	50.262	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	51.220	ENSXCOG00000017748	pusl1	88	51.220	Xiphophorus_couchianus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	60	30.198	ENSXMAG00000025146	pus3	55	30.198	Xiphophorus_maculatus
ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	51.653	ENSXMAG00000018846	pusl1	81	51.653	Xiphophorus_maculatus