EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000015022 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: URB2
Alias: KIAA0133|NET10|NPA2
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24775 bases
Position: chrLZNR01008446.1:70008-94782
Accession: 28967
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000018987	Urb2	PF10441.9	6.9e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000021235	URB2-201	4566	-	ENSUAMP00000018987	1521 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000015022	URB2	99	82.863	ENSG00000135763	URB2	99	89.157	Homo_sapiens
ENSUAMG00000015022	URB2	89	36.200	ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.338	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	98.159	ENSAMEG00000009206	URB2	100	98.159	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000015022	URB2	99	53.125	ENSAOCG00000019961	urb2	96	53.125	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000015022	URB2	99	53.125	ENSAPEG00000005263	urb2	96	53.125	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.344	ENSATEG00000020930	urb2	100	34.247	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000015022	URB2	97	50.299	ENSAPLG00000002998	URB2	99	50.166	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000015022	URB2	99	48.870	ENSACAG00000001285	URB2	99	48.741	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.454	ENSANAG00000033963	URB2	99	83.322	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000015022	URB2	89	35.577	ENSACLG00000009254	urb2	95	35.371	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000015022	URB2	99	36.052	ENSAMXG00000003474	urb2	99	36.052	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	74.803	ENSBTAG00000010180	URB2	100	74.803	Bos_taurus
ENSUAMG00000015022	URB2	95	87.857	ENSCJAG00000010968	URB2	99	83.125	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	90.461	ENSCAFG00000012118	URB2	99	90.461	Canis_familiaris
ENSUAMG00000015022	URB2	93	89.859	ENSCAFG00020027217	URB2	99	89.859	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000015022	URB2	100	74.738	ENSCHIG00000014513	URB2	100	74.738	Capra_hircus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	80.906	ENSTSYG00000006924	URB2	100	80.906	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000015022	URB2	64	82.716	ENSCPOG00000020777	-	99	79.885	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.454	ENSCCAG00000023932	URB2	99	83.322	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.651	ENSCATG00000043366	URB2	99	83.651	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000015022	URB2	99	75.427	ENSCLAG00000006268	URB2	99	75.427	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.388	ENSCSAG00000010599	URB2	99	83.388	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000015022	URB2	69	83.401	ENSCHOG00000010163	URB2	71	83.401	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000015022	URB2	99	55.334	ENSCPBG00000006191	URB2	99	55.334	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.125	ENSCANG00000023711	URB2	99	83.125	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	71.898	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	71.898	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000015022	URB2	99	71.898	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	71.898	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000015022	URB2	100	33.274	ENSCSEG00000000299	urb2	100	33.254	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.436	ENSCVAG00000011011	urb2	100	34.457	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	36.593	ENSDARG00000003217	urb2	98	56.522	Danio_rerio
ENSUAMG00000015022	URB2	97	60.027	ENSDNOG00000043064	URB2	99	60.095	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	73.788	ENSDORG00000014975	Urb2	99	73.788	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000015022	URB2	95	74.771	ENSETEG00000002869	URB2	95	74.771	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000015022	URB2	100	84.843	ENSEASG00005012060	URB2	100	84.843	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	84.974	ENSECAG00000012338	URB2	100	91.549	Equus_caballus
ENSUAMG00000015022	URB2	92	84.286	ENSEEUG00000002669	URB2	92	84.286	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	39.871	ENSELUG00000014647	urb2	100	39.806	Esox_lucius
ENSUAMG00000015022	URB2	99	86.053	ENSFCAG00000007662	URB2	99	86.053	Felis_catus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	49.935	ENSFALG00000003385	URB2	99	49.935	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000015022	URB2	99	75.443	ENSFDAG00000021079	URB2	99	75.443	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.613	ENSFHEG00000010357	urb2	100	34.695	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000015022	URB2	91	39.227	ENSGMOG00000012459	urb2	100	35.365	Gadus_morhua
ENSUAMG00000015022	URB2	99	51.058	ENSGALG00000011101	URB2	99	50.801	Gallus_gallus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	37.356	ENSGACG00000016179	urb2	100	37.580	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	54.727	ENSGAGG00000021879	URB2	99	54.727	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.060	ENSGGOG00000025643	URB2	99	83.060	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000015022	URB2	99	51.553	ENSHBUG00000018469	urb2	96	51.553	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000015022	URB2	97	76.113	ENSHGLG00000016561	URB2	99	76.113	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000015022	URB2	99	74.196	ENSHGLG00100001838	URB2	99	74.196	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.714	ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.696	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	74.244	ENSSTOG00000025323	URB2	99	74.244	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	73.425	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	73.360	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	33.115	ENSKMAG00000020129	urb2	100	33.294	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	46.015	ENSLACG00000002038	URB2	99	46.649	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000015022	URB2	99	40.736	ENSLOCG00000015462	urb2	99	40.710	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	78.858	ENSLAFG00000012484	URB2	100	78.858	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.388	ENSMFAG00000039905	URB2	99	83.388	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.454	ENSMMUG00000009509	URB2	99	83.454	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.388	ENSMNEG00000038762	URB2	99	83.388	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.585	ENSMLEG00000043252	URB2	99	83.585	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.638	ENSMAMG00000020365	urb2	100	34.561	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	51.553	ENSMZEG00005011027	urb2	96	51.553	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000015022	URB2	94	48.292	ENSMGAG00000012073	URB2	99	48.022	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000015022	URB2	95	80.714	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	80.714	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	80.906	ENSMICG00000033302	URB2	100	80.906	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	70.735	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	70.735	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.404	ENSMALG00000006529	urb2	100	35.170	Monopterus_albus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	70.295	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	70.295	Mus_musculus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	90.718	ENSMPUG00000012438	URB2	99	90.586	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000015022	URB2	99	71.982	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	71.982	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000015022	URB2	99	82.928	ENSNLEG00000014450	URB2	99	82.928	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000015022	URB2	91	63.216	ENSMEUG00000016434	URB2	94	63.216	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000015022	URB2	92	76.079	ENSOPRG00000009906	URB2	92	75.956	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000015022	URB2	99	74.836	ENSODEG00000005593	URB2	99	74.836	Octodon_degus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	38.205	ENSONIG00000017078	urb2	100	38.132	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	49.674	ENSOANG00000013732	URB2	100	50.196	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	79.724	ENSOCUG00000010700	URB2	100	79.724	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.562	ENSORLG00000010915	urb2	100	35.523	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.498	ENSORLG00020003361	urb2	100	35.523	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.376	ENSORLG00015001534	urb2	100	35.398	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.735	ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.756	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000015022	URB2	100	77.967	ENSOGAG00000003021	URB2	100	77.967	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000015022	URB2	100	74.606	ENSOARG00000003102	URB2	100	74.606	Ovis_aries
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.257	ENSPPAG00000040629	URB2	99	83.257	Pan_paniscus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	85.395	ENSPPRG00000012767	URB2	99	85.395	Panthera_pardus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	85.855	ENSPTIG00000012577	URB2	100	89.394	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000015022	URB2	99	83.125	ENSPTRG00000002092	URB2	99	83.125	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000015022	URB2	99	81.353	ENSPANG00000002245	URB2	99	81.353	Papio_anubis
ENSUAMG00000015022	URB2	99	39.626	ENSPKIG00000005787	urb2	99	39.626	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000015022	URB2	99	54.540	ENSPSIG00000002690	URB2	99	54.540	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000015022	URB2	96	71.918	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.918	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000015022	URB2	99	64.571	ENSPCIG00000030071	URB2	99	64.571	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.123	ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.283	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.233	ENSPLAG00000014654	urb2	100	34.608	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.131	ENSPMEG00000012356	urb2	100	34.527	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.570	ENSPREG00000010268	urb2	100	34.468	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000015022	URB2	100	82.808	ENSPPYG00000000123	URB2	100	82.808	Pongo_abelii
ENSUAMG00000015022	URB2	100	82.152	ENSPCOG00000023537	URB2	100	82.152	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000015022	URB2	100	66.295	ENSPVAG00000002108	URB2	100	66.295	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000015022	URB2	89	35.616	ENSPNYG00000016840	urb2	95	35.411	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000015022	URB2	99	36.992	ENSPNAG00000013684	urb2	99	36.992	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000015022	URB2	99	70.773	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	70.773	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	82.600	ENSRBIG00000037937	URB2	99	82.600	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000015022	URB2	99	82.534	ENSRROG00000039854	URB2	99	82.534	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000015022	URB2	99	82.797	ENSSBOG00000023055	URB2	99	82.666	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000015022	URB2	99	64.898	ENSSHAG00000014735	URB2	99	64.702	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000015022	URB2	97	39.248	ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.356	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000015022	URB2	90	34.644	ENSSMAG00000004984	urb2	96	34.510	Scophthalmus_maximus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	51.875	ENSSDUG00000000902	urb2	96	51.875	Seriola_dumerili
ENSUAMG00000015022	URB2	99	52.692	ENSSPUG00000018549	URB2	99	52.692	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000015022	URB2	99	53.416	ENSSPAG00000013632	urb2	96	53.416	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	76.115	ENSSSCG00000010186	URB2	100	76.115	Sus_scrofa
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ENSUAMG00000015022	URB2	100	36.067	ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.003	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000015022	URB2	100	69.074	ENSTTRG00000014864	URB2	100	68.812	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000015022	URB2	100	99.408	ENSUMAG00000004728	URB2	100	99.408	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000015022	URB2	63	89.362	ENSVPAG00000001750	-	63	89.362	Vicugna_pacos
ENSUAMG00000015022	URB2	99	90.197	ENSVVUG00000006747	URB2	99	90.197	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000015022	URB2	99	41.596	ENSXETG00000023331	urb2	99	41.337	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.219	ENSXMAG00000015059	urb2	100	34.155	Xiphophorus_maculatus