EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000015209 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ZMAT1
Alias: KIAA1789
Full Name: zinc finger matrin-type 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3637 bases
Position: chrLZNR01025243.1:51492-55128
Accession: 29377
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000019249	zf-met	PF12874.7	1.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000021529	ZMAT1-201	2424	-	ENSUAMP00000019249	471 (aa)	-	UPI0004DFE109

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	83.051	ENSG00000166432	ZMAT1	73	83.051	Homo_sapiens
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	98.089	ENSAMEG00000004976	ZMAT1	78	98.089	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	80.679	ENSANAG00000028725	ZMAT1	78	80.679	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.166	ENSBTAG00000003601	ZMAT1	77	82.166	Bos_taurus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	80.255	ENSCJAG00000019724	ZMAT1	78	80.255	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	93.843	ENSCAFG00000017730	ZMAT1	78	93.843	Canis_familiaris
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	93.843	ENSCAFG00020007319	ZMAT1	100	93.843	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.241	ENSCHIG00000010507	ZMAT1	100	82.241	Capra_hircus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	78.178	ENSTSYG00000007330	ZMAT1	78	78.178	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	99	63.270	ENSCPOG00000000581	ZMAT1	75	63.270	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	80.892	ENSCCAG00000023924	ZMAT1	78	80.892	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.203	ENSCATG00000000551	ZMAT1	76	82.203	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	99	61.146	ENSCLAG00000004197	ZMAT1	75	61.146	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	83.051	ENSCSAG00000009795	ZMAT1	65	83.051	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	70	71.831	ENSCPBG00000001356	ZMAT1	52	64.368	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.839	ENSCANG00000037194	ZMAT1	78	82.839	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	65.962	ENSCGRG00001023697	Zmat1	77	65.962	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	65.962	ENSCGRG00000001964	Zmat1	75	65.962	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	58.471	ENSDNOG00000044924	-	98	57.851	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	73.305	ENSDNOG00000014852	-	83	73.305	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	66.102	ENSDORG00000006821	Zmat1	77	66.314	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	59.534	ENSETEG00000020259	ZMAT1	78	58.898	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	80.467	ENSEASG00005014185	ZMAT1	72	80.467	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	87.049	ENSECAG00000013390	ZMAT1	100	87.049	Equus_caballus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	85.987	ENSFCAG00000023394	ZMAT1	78	85.987	Felis_catus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	65.328	ENSFDAG00000004063	ZMAT1	72	65.328	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	96	41.887	ENSGAGG00000002326	ZMAT1	54	41.887	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	83.051	ENSGGOG00000025784	ZMAT1	74	83.051	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	99	60.852	ENSHGLG00000002494	ZMAT1	88	60.852	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	66.525	ENSHGLG00100004968	ZMAT1	78	66.525	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	79.025	ENSSTOG00000011140	ZMAT1	88	79.025	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	61.311	ENSJJAG00000020188	Zmat1	77	61.311	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	99	64.803	ENSLAFG00000015656	ZMAT1	79	62.887	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	97	76.235	ENSMFAG00000042343	ZMAT1	71	75.294	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.839	ENSMMUG00000002151	ZMAT1	74	82.839	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.627	ENSMNEG00000036310	ZMAT1	74	82.627	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.203	ENSMLEG00000005031	ZMAT1	74	82.203	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	65.116	ENSMAUG00000002941	Zmat1	77	65.116	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	83.898	ENSMICG00000003313	ZMAT1	78	83.898	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	66.173	ENSMOCG00000000169	Zmat1	80	66.173	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	62.526	ENSMUSG00000052676	Zmat1	73	62.526	Mus_musculus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	62.737	MGP_PahariEiJ_G0031943	Zmat1	77	62.737	Mus_pahari
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	62.815	MGP_SPRETEiJ_G0034567	Zmat1	73	62.815	Mus_spretus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	92.781	ENSMPUG00000002130	ZMAT1	68	92.781	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	78.013	ENSMLUG00000004417	ZMAT1	78	76.744	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	67.442	ENSNGAG00000006608	Zmat1	77	67.442	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	76.261	ENSNLEG00000030520	ZMAT1	73	76.681	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	86	61.765	ENSOPRG00000009950	-	99	61.765	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	66.807	ENSOCUG00000004164	ZMAT1	77	67.017	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	80.932	ENSOGAG00000033601	ZMAT1	78	80.932	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.452	ENSOARG00000001897	ZMAT1	78	82.452	Ovis_aries
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.839	ENSPPAG00000039554	ZMAT1	74	82.839	Pan_paniscus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	86.624	ENSPPRG00000005258	ZMAT1	78	86.624	Panthera_pardus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	87.049	ENSPTIG00000019057	ZMAT1	78	87.049	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.839	ENSPTRG00000041840	ZMAT1	74	82.839	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	66.667	ENSPEMG00000009944	Zmat1	77	66.667	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	78.390	ENSPPYG00000020561	ZMAT1	72	78.390	Pongo_abelii
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	93	67.347	ENSPCAG00000010283	ZMAT1	73	67.347	Procavia_capensis
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	99	82.803	ENSPCOG00000021386	ZMAT1	78	82.803	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	99	84.009	ENSPVAG00000013206	ZMAT1	78	84.009	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	62.658	ENSRNOG00000024135	Zmat1	73	62.658	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.839	ENSRBIG00000034121	ZMAT1	75	82.839	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	82.839	ENSRROG00000036747	ZMAT1	73	82.839	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	80.892	ENSSBOG00000029970	ZMAT1	78	80.892	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	99	56.115	ENSSHAG00000011087	-	58	56.115	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	89	81.818	ENSSPUG00000004951	ZMAT1	53	81.818	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	84.713	ENSSSCG00000012512	ZMAT1	100	84.926	Sus_scrofa
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	75.000	ENSTBEG00000012967	ZMAT1	83	75.000	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	83.439	ENSTTRG00000016662	ZMAT1	78	82.590	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	100.000	ENSUMAG00000000627	ZMAT1	100	100.000	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	86.624	ENSVPAG00000006267	ZMAT1	78	86.624	Vicugna_pacos
ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	93.206	ENSVVUG00000005342	ZMAT1	69	93.206	Vulpes_vulpes