EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000017593 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22294 bases
Position: chrLZNR01004814.1:139907-162200
Accession: 18027
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000022372	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000025006	TWISTNB-201	1111	-	ENSUAMP00000022372	335 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.832	ENSG00000105849	TWISTNB	98	84.132	Homo_sapiens
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	96	42.363	ENSAPOG00000011796	twistnb	51	54.592	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	83.854	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	98	83.854	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	56	55.319	ENSACIG00000020400	twistnb	50	55.319	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	96	40.845	ENSAOCG00000024200	twistnb	51	55.612	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	96	40.845	ENSAPEG00000016750	twistnb	51	55.612	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	50	63.905	ENSACAG00000011817	TWISTNB	86	63.905	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	98	82.530	ENSANAG00000026418	TWISTNB	100	82.544	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	62	54.545	ENSAMXG00000035868	twistnb	61	54.545	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	83.333	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	100	82.440	Bos_taurus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	98	83.183	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	83.186	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	84.682	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	99	86.919	Canis_familiaris
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	86.257	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	88.012	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	82.891	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	100	82.891	Capra_hircus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.383	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	99	83.136	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	83.136	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	100	83.136	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.687	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	99	83.333	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.934	ENSCATG00000035621	TWISTNB	98	83.533	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.440	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	82.196	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.234	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	98	83.832	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	78	90.152	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	77	90.152	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	93	60.952	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	95	60.510	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.533	ENSCANG00000038759	TWISTNB	98	84.132	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	76.946	ENSCGRG00001000499	Twistnb	100	76.946	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	59	57.353	ENSDARG00000024416	twistnb	52	57.353	Danio_rerio
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	84.273	ENSDNOG00000006438	-	100	84.273	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	91	80.844	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	80.844	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	89.286	ENSEASG00005021702	TWISTNB	96	89.286	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	89.583	ENSECAG00000014563	TWISTNB	96	89.583	Equus_caballus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	90	44.904	ENSELUG00000000098	TWISTNB	83	45.667	Esox_lucius
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	90.149	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	100	90.149	Felis_catus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	84	53.115	ENSFALG00000009761	TWISTNB	98	52.303	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	98	82.831	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	100	82.544	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	60	54.286	ENSFHEG00000013318	twistnb	56	54.950	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	93	56.508	ENSGALG00000010863	TWISTNB	77	54.434	Gallus_gallus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	62	50.242	ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.832	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	98	84.132	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.388	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.196	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	98	82.477	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.196	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	93	42.308	ENSIPUG00000004117	twistnb	50	56.593	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.789	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	82.440	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	76.786	ENSJJAG00000015887	Twistnb	100	76.786	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	56	56.614	ENSKMAG00000001591	twistnb	54	55.941	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	92	51.582	ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	51.603	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	58	63.402	ENSLOCG00000011399	twistnb	61	62.439	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	85.970	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	86.269	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.234	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	98	83.832	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.234	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	97	83.832	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.635	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	98	83.234	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.234	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	98	83.832	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	84.024	ENSMICG00000036489	TWISTNB	100	84.024	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	95	78.997	ENSMOCG00000003458	Twistnb	98	78.997	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	87	62.752	ENSMODG00000001402	-	68	61.465	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	75.595	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	100	75.595	Mus_caroli
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	75.224	ENSMUSG00000020561	Twistnb	100	75.821	Mus_musculus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	75.893	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	78.086	Mus_pahari
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	75.224	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	100	75.821	Mus_spretus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	94.030	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	94	94.030	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	93	79.167	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	100	80.769	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	59	87.437	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	87.437	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	58	55.612	ENSNBRG00000008652	twistnb	52	55.612	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	95	84.013	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	94	84.062	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	76.246	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	99	76.540	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	81.361	ENSODEG00000007222	TWISTNB	100	80.178	Octodon_degus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	53	60.112	ENSORLG00020002579	twistnb	51	57.216	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.196	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	99	82.196	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	83.432	ENSOARG00000009803	TWISTNB	99	83.432	Ovis_aries
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.533	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	98	84.132	Pan_paniscus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	89.552	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	100	89.552	Panthera_pardus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	89	89.632	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	89.632	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	84.132	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	98	84.431	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.934	ENSPANG00000015736	TWISTNB	98	83.533	Papio_anubis
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	64	57.919	ENSPKIG00000025635	twistnb	52	63.492	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	93	45.536	ENSPMGG00000019023	twistnb	50	56.345	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	86	59.044	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	97	57.585	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.388	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	98	82.687	Pongo_abelii
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.440	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	83.036	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	80.655	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	98	81.548	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	58	55.612	ENSPNYG00000002674	twistnb	52	55.612	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	61	54.146	ENSPNAG00000011956	twistnb	51	57.754	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	95	78.125	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	78.125	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.234	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	97	83.832	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.234	ENSRROG00000040155	TWISTNB	98	83.832	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	98	81.928	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	100	82.249	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	88	45.513	ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.000	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	61	52.451	ENSSMAG00000012792	twistnb	53	51.980	Scophthalmus_maximus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	89	49.355	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	93	50.169	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	65	51.111	ENSSPAG00000005871	twistnb	52	55.155	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	85.546	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	82.840	Sus_scrofa
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	93	43.731	ENSTNIG00000017778	twistnb	92	44.304	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	83.832	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	98	82.635	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	99.701	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	100	99.701	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	86.550	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	100	88.012	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000017593	TWISTNB	58	56.853	ENSXCOG00000020199	twistnb	50	58.696	Xiphophorus_couchianus