EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000018676 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: REXO4
Alias: XPMC2H|hPMC2
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9060 bases
Position: chrLZNR01001231.1:293472-302531
Accession: 12820
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000023881	RNase_T	PF00929.24	5.2e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000026662	REXO4-201	2419	-	ENSUAMP00000023881	425 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	72.471	ENSG00000148300	REXO4	99	72.471	Homo_sapiens
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	50.833	ENSAPOG00000019264	rexo4	81	50.833	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	94.940	ENSAMEG00000011649	REXO4	100	94.940	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	51.124	ENSAOCG00000004087	rexo4	81	51.124	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	50.843	ENSAPEG00000009106	rexo4	81	50.843	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000018676	REXO4	82	51.247	ENSATEG00000017662	rexo4	81	51.247	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000018676	REXO4	80	57.627	ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.627	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	71.059	ENSANAG00000028404	REXO4	99	71.529	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	52.381	ENSACLG00000006007	rexo4	81	52.381	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000018676	REXO4	82	49.865	ENSAMXG00000013291	rexo4	81	50.681	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	72.460	ENSBTAG00000019721	REXO4	90	71.958	Bos_taurus
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	71.294	ENSCJAG00000009774	REXO4	99	71.529	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000018676	REXO4	96	81.995	ENSCAFG00000019767	REXO4	100	81.995	Canis_familiaris
ENSUAMG00000018676	REXO4	99	82.436	ENSCAFG00020000983	-	99	82.436	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	72.559	ENSCHIG00000009517	REXO4	91	72.368	Capra_hircus
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	71.734	ENSTSYG00000027492	REXO4	99	71.734	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	70.725	ENSCAPG00000014583	REXO4	99	70.725	Cavia_aperea
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	67.347	ENSCPOG00000001386	REXO4	90	66.584	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	65.412	ENSCCAG00000027049	REXO4	98	65.640	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	71.897	ENSCATG00000028646	REXO4	99	71.897	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000018676	REXO4	76	74.462	ENSCLAG00000006919	REXO4	98	74.462	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	75.584	ENSCSAG00000015280	REXO4	91	75.448	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000018676	REXO4	92	56.750	ENSCPBG00000021152	REXO4	90	57.368	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000018676	REXO4	50	56.132	ENSCING00000010751	-	77	56.132	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	75.718	ENSCANG00000029855	REXO4	99	72.235	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000018676	REXO4	86	70.572	ENSCGRG00001013126	Rexo4	88	69.393	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000018676	REXO4	86	70.572	ENSCGRG00000009819	Rexo4	91	69.393	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000018676	REXO4	87	45.178	ENSCSEG00000019343	rexo4	85	47.493	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000018676	REXO4	86	47.619	ENSDARG00000088619	rexo4	82	64.706	Danio_rerio
ENSUAMG00000018676	REXO4	94	60.917	ENSDNOG00000002429	REXO4	99	60.759	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000018676	REXO4	79	72.189	ENSDORG00000006190	Rexo4	98	72.189	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000018676	REXO4	58	71.429	ENSEASG00005009915	-	78	71.429	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000018676	REXO4	90	74.674	ENSECAG00000007896	REXO4	89	73.464	Equus_caballus
ENSUAMG00000018676	REXO4	74	61.635	ENSEEUG00000012135	-	98	63.208	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	49.465	ENSELUG00000003539	rexo4	81	50.000	Esox_lucius
ENSUAMG00000018676	REXO4	99	76.415	ENSFCAG00000011652	REXO4	97	76.596	Felis_catus
ENSUAMG00000018676	REXO4	83	58.904	ENSFALG00000001520	REXO4	92	57.106	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000018676	REXO4	97	70.560	ENSFDAG00000016050	REXO4	98	71.117	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	47.792	ENSFHEG00000002413	rexo4	83	50.992	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000018676	REXO4	72	40.964	ENSGAFG00000015404	-	83	44.483	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	52.299	ENSGACG00000008065	rexo4	79	52.011	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000018676	REXO4	85	58.824	ENSGAGG00000010260	REXO4	90	58.268	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	72.706	ENSGGOG00000014508	REXO4	99	72.706	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	51.397	ENSHBUG00000000542	rexo4	81	51.397	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000018676	REXO4	97	68.765	ENSHGLG00000016901	REXO4	98	68.765	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000018676	REXO4	97	68.765	ENSHGLG00100017444	REXO4	98	68.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000018676	REXO4	82	48.747	ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.753	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000018676	REXO4	92	76.350	ENSSTOG00000003754	REXO4	91	76.702	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000018676	REXO4	87	72.900	ENSJJAG00000013002	Rexo4	84	72.900	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	49.858	ENSKMAG00000015039	rexo4	81	49.858	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000018676	REXO4	82	50.970	ENSLBEG00000025570	rexo4	81	50.970	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	51.399	ENSLACG00000012399	REXO4	90	51.399	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000018676	REXO4	85	51.047	ENSLOCG00000003577	rexo4	84	50.660	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000018676	REXO4	90	68.798	ENSLAFG00000011274	REXO4	93	68.974	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	75.325	ENSMFAG00000042425	REXO4	99	71.663	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	75.844	ENSMMUG00000000935	REXO4	99	72.131	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	75.844	ENSMNEG00000031604	REXO4	99	72.131	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	72.131	ENSMLEG00000037716	REXO4	99	72.131	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000018676	REXO4	83	50.275	ENSMAMG00000011251	rexo4	85	48.421	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	50.815	ENSMZEG00005012336	rexo4	81	50.815	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000018676	REXO4	82	60.446	ENSMGAG00000006521	REXO4	99	60.446	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000018676	REXO4	86	68.392	ENSMAUG00000015137	Rexo4	88	67.282	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	71.703	ENSMICG00000008422	REXO4	99	71.703	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	68.548	ENSMOCG00000020607	Rexo4	87	67.454	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000018676	REXO4	83	60.714	ENSMODG00000012817	REXO4	83	59.563	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000018676	REXO4	82	52.422	ENSMALG00000019705	rexo4	80	52.422	Monopterus_albus
ENSUAMG00000018676	REXO4	86	70.137	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	90	69.251	Mus_caroli
ENSUAMG00000018676	REXO4	87	68.564	ENSMUSG00000052406	Rexo4	92	67.454	Mus_musculus
ENSUAMG00000018676	REXO4	86	68.033	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	90	67.380	Mus_pahari
ENSUAMG00000018676	REXO4	87	69.189	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	91	68.338	Mus_spretus
ENSUAMG00000018676	REXO4	83	80.682	ENSMPUG00000012315	REXO4	100	80.682	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000018676	REXO4	91	65.561	ENSNGAG00000010700	Rexo4	88	67.575	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	52.101	ENSNBRG00000011712	rexo4	81	52.101	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	65.176	ENSNLEG00000007556	-	99	64.706	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	75.979	ENSNLEG00000013130	-	99	72.535	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000018676	REXO4	86	46.524	ENSMEUG00000006513	-	91	45.833	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000018676	REXO4	80	68.129	ENSODEG00000015721	REXO4	98	68.129	Octodon_degus
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	51.397	ENSONIG00000020052	rexo4	81	51.397	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	57.772	ENSOANG00000002453	REXO4	99	57.289	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	50.259	ENSORLG00000006904	rexo4	86	50.943	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	49.622	ENSORLG00020013768	rexo4	86	50.262	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	50.754	ENSORLG00015012070	rexo4	84	52.128	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000018676	REXO4	91	50.000	ENSOMEG00000018327	rexo4	84	50.923	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	68.750	ENSOGAG00000014040	REXO4	99	68.990	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	72.706	ENSPPAG00000027911	REXO4	99	72.706	Pan_paniscus
ENSUAMG00000018676	REXO4	97	78.398	ENSPPRG00000002894	REXO4	99	78.398	Panthera_pardus
ENSUAMG00000018676	REXO4	93	69.270	ENSPTIG00000012007	REXO4	94	69.270	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	72.706	ENSPTRG00000023363	REXO4	99	72.706	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	72.131	ENSPANG00000026040	REXO4	99	72.131	Papio_anubis
ENSUAMG00000018676	REXO4	84	50.398	ENSPKIG00000024761	rexo4	86	50.398	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000018676	REXO4	87	56.201	ENSPSIG00000016908	REXO4	89	56.201	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000018676	REXO4	83	47.200	ENSPMGG00000005312	rexo4	86	45.918	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000018676	REXO4	90	68.325	ENSPEMG00000017982	Rexo4	93	68.217	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000018676	REXO4	93	56.897	ENSPCIG00000017379	REXO4	89	56.919	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	49.721	ENSPFOG00000017751	rexo4	82	50.000	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	49.153	ENSPLAG00000010487	rexo4	81	49.577	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	49.721	ENSPMEG00000020767	rexo4	82	49.577	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	49.718	ENSPREG00000021841	rexo4	82	50.847	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	75.718	ENSPPYG00000019735	REXO4	99	72.000	Pongo_abelii
ENSUAMG00000018676	REXO4	96	64.320	ENSPCAG00000010581	REXO4	98	63.835	Procavia_capensis
ENSUAMG00000018676	REXO4	98	71.394	ENSPCOG00000025466	REXO4	99	71.394	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000018676	REXO4	97	68.765	ENSPVAG00000001429	REXO4	98	68.765	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	51.821	ENSPNYG00000013712	rexo4	81	51.821	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000018676	REXO4	81	48.626	ENSPNAG00000019227	rexo4	79	49.304	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	68.011	ENSRNOG00000027867	Rexo4	92	67.192	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000018676	REXO4	91	76.093	ENSRBIG00000037515	REXO4	99	72.471	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000018676	REXO4	91	75.835	ENSRROG00000028864	REXO4	99	72.235	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000018676	REXO4	89	62.924	ENSSBOG00000032587	REXO4	98	60.427	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000018676	REXO4	88	58.201	ENSSHAG00000005827	REXO4	95	58.201	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000018676	REXO4	87	49.357	ENSSMAG00000015441	rexo4	84	49.357	Scophthalmus_maximus
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ENSUAMG00000018676	REXO4	92	54.926	ENSSPUG00000015868	REXO4	89	54.872	Sphenodon_punctatus
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ENSUAMG00000018676	REXO4	98	72.577	ENSSSCG00000023173	REXO4	99	72.577	Sus_scrofa
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ENSUAMG00000018676	REXO4	76	49.544	ENSXETG00000023096	rexo4	90	50.152	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000018676	REXO4	83	48.493	ENSXMAG00000013686	rexo4	86	48.493	Xiphophorus_maculatus