EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000019616 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLRMT
Alias: APOLMT|MTRNAP|MTRPOL|h-mtRPOL
Full Name: RNA polymerase mitochondrial
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12957 bases
Position: chrLZNR01009924.1:7745-20701
Accession: 9200
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000025167	RNA_pol	PF00940.19	7.8e-163	1	1
ENSUAMP00000025164	RNA_pol	PF00940.19	4.2e-144	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000028112	POLRMT-202	3814	-	ENSUAMP00000025167	1227 (aa)	-	-
ENSUAMT00000028109	POLRMT-201	4168	-	ENSUAMP00000025164	1172 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSUAMG00000019616's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSUAMG00000019616's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	70.574	ENSG00000099821	POLRMT	100	70.493	Homo_sapiens
ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	52.103	ENSAPOG00000003942	polrmt	78	52.103	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	94.656	ENSAMEG00000002745	POLRMT	100	94.656	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000019616	POLRMT	92	48.395	ENSACIG00000016078	polrmt	99	48.390	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	94	46.713	ENSAOCG00000020208	polrmt	94	46.628	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000019616	POLRMT	94	46.875	ENSAPEG00000007949	polrmt	92	46.782	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	46.700	ENSATEG00000024025	polrmt	94	46.689	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	53.405	ENSAPLG00000003051	POLRMT	100	53.089	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	68.895	ENSANAG00000032916	POLRMT	100	68.689	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	51.096	ENSACLG00000003766	polrmt	80	51.100	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000019616	POLRMT	96	59.463	ENSAMXG00000018258	polrmt	98	58.079	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	74.293	ENSBTAG00000015051	POLRMT	100	74.293	Bos_taurus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	68.412	ENSCJAG00000012913	POLRMT	100	68.233	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	85.098	ENSCAFG00000019711	POLRMT	100	85.098	Canis_familiaris
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	85.098	ENSCAFG00020016843	POLRMT	100	85.098	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	74.392	ENSCHIG00000013267	POLRMT	100	74.392	Capra_hircus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	87	75.174	ENSCAPG00000016900	POLRMT	100	72.430	Cavia_aperea
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	62.298	ENSCPOG00000023061	POLRMT	100	62.055	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	67.825	ENSCCAG00000025014	POLRMT	100	67.825	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	70.000	ENSCATG00000040393	POLRMT	100	69.839	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	67.094	ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	67.094	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	67.903	ENSCSAG00000012942	POLRMT	100	67.903	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	97	52.239	ENSCPBG00000009869	POLRMT	99	52.023	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000019616	POLRMT	65	44.756	ENSCSAVG00000000440	-	99	44.756	Ciona_savignyi
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	69.758	ENSCANG00000038011	POLRMT	100	69.597	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	81.159	ENSCGRG00001021311	Polrmt	100	79.388	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	66.829	ENSCGRG00000011134	Polrmt	100	66.829	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000019616	POLRMT	97	44.792	ENSCSEG00000002734	polrmt	96	44.619	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	96	46.240	ENSCVAG00000005949	polrmt	99	46.325	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	97	47.676	ENSDARG00000101220	polrmt	96	47.795	Danio_rerio
ENSUAMG00000019616	POLRMT	94	80.536	ENSDORG00000014125	Polrmt	99	78.664	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000019616	POLRMT	82	41.830	FBgn0261938	mtRNApol	77	41.854	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	68.149	ENSETEG00000003476	POLRMT	100	68.149	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000019616	POLRMT	75	49.570	ENSEBUG00000013453	-	99	49.462	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	81.515	ENSEASG00005021493	POLRMT	100	81.515	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	81.515	ENSECAG00000032711	POLRMT	100	81.515	Equus_caballus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	85	52.552	ENSELUG00000019319	polrmt	79	52.552	Esox_lucius
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	85.493	ENSFCAG00000018808	POLRMT	100	85.493	Felis_catus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	88	48.757	ENSFALG00000013910	POLRMT	98	48.757	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	61.051	ENSFDAG00000020312	POLRMT	100	60.819	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	50.771	ENSFHEG00000021239	polrmt	87	50.391	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	46.750	ENSGMOG00000011829	polrmt	100	46.595	Gadus_morhua
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	53.988	ENSGALG00000001377	POLRMT	98	49.387	Gallus_gallus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	51.009	ENSGAFG00000003953	polrmt	79	50.817	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	46.064	ENSGACG00000012957	polrmt	100	46.147	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	52.115	ENSGAGG00000005522	POLRMT	100	52.030	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	85.424	ENSGGOG00000023264	-	97	85.714	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	51.096	ENSHBUG00000010005	polrmt	78	51.100	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	67.130	ENSHGLG00000019286	POLRMT	92	66.729	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	63.783	ENSHGLG00100005762	POLRMT	100	63.783	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000019616	POLRMT	97	45.933	ENSHCOG00000001565	polrmt	96	46.435	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000019616	POLRMT	98	48.066	ENSIPUG00000000789	polrmt	97	48.066	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	86.157	ENSSTOG00000003431	POLRMT	98	86.135	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	94	76.651	ENSJJAG00000012916	Polrmt	100	76.651	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	45.933	ENSKMAG00000004426	polrmt	94	46.160	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	51.758	ENSLBEG00000016529	polrmt	79	50.849	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000019616	POLRMT	97	48.371	ENSLACG00000011518	POLRMT	99	48.371	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000019616	POLRMT	82	47.461	ENSLOCG00000005222	polrmt	77	47.461	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	72.991	ENSLAFG00000001860	POLRMT	100	73.366	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	70.403	ENSMFAG00000031466	POLRMT	100	70.323	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	69.919	ENSMNEG00000039129	POLRMT	100	69.919	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000019616	POLRMT	86	85.315	ENSMLEG00000037404	POLRMT	100	81.461	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	51.981	ENSMAMG00000019284	polrmt	78	51.691	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	51.096	ENSMZEG00005009932	polrmt	80	51.100	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	49.748	ENSMGAG00000003243	POLRMT	99	50.084	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	81.056	ENSMAUG00000019392	Polrmt	100	79.126	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	73.867	ENSMICG00000016701	POLRMT	100	73.786	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	65.638	ENSMOCG00000008868	Polrmt	100	65.719	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000019616	POLRMT	82	48.152	ENSMMOG00000000705	polrmt	78	47.817	Mola_mola
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	52.438	ENSMODG00000006478	POLRMT	99	52.358	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000019616	POLRMT	82	51.566	ENSMALG00000021224	polrmt	77	51.566	Monopterus_albus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	81.785	MGP_CAROLIEiJ_G0015538	Polrmt	100	79.454	Mus_caroli
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	81.967	ENSMUSG00000020329	Polrmt	100	79.839	Mus_musculus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	81.884	MGP_PahariEiJ_G0030951	Polrmt	100	79.775	Mus_pahari
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	82.149	MGP_SPRETEiJ_G0016356	Polrmt	100	79.839	Mus_spretus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	84.728	ENSMPUG00000009910	POLRMT	100	84.728	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	76.140	ENSMLUG00000009223	POLRMT	100	76.140	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	83.242	ENSNGAG00000005498	Polrmt	100	81.129	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	50.916	ENSNBRG00000023530	polrmt	77	50.920	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	70.493	ENSNLEG00000000718	POLRMT	100	70.412	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000019616	POLRMT	72	79.566	ENSOPRG00000013579	POLRMT	73	79.445	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	47.811	ENSONIG00000002405	polrmt	100	47.889	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	52.089	ENSORLG00000004329	polrmt	76	52.144	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000019616	POLRMT	97	46.322	ENSORLG00020003896	polrmt	96	46.748	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000019616	POLRMT	94	48.246	ENSORLG00015022238	polrmt	83	48.246	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000019616	POLRMT	85	52.476	ENSOMEG00000008292	polrmt	97	47.087	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	74.919	ENSOGAG00000007912	POLRMT	100	74.838	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000019616	POLRMT	87	85.149	ENSOARG00000008898	POLRMT	92	81.988	Ovis_aries
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	68.425	ENSPPAG00000043321	-	99	68.344	Pan_paniscus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	69.442	ENSPPAG00000030853	POLRMT	99	69.361	Pan_paniscus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	87	91.511	ENSPPRG00000001547	POLRMT	93	91.511	Panthera_pardus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	70.976	ENSPTRG00000010157	POLRMT	96	69.766	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	69.075	ENSPTRG00000039638	-	99	68.994	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	70.056	ENSPANG00000006649	POLRMT	100	69.895	Papio_anubis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	53.794	ENSPKIG00000024580	polrmt	95	48.708	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	51.124	ENSPMGG00000014627	polrmt	85	51.124	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	93	81.056	ENSPEMG00000011671	Polrmt	100	79.194	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000019616	POLRMT	74	51.023	ENSPMAG00000005070	-	99	50.909	Petromyzon_marinus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	53.035	ENSPCIG00000006103	POLRMT	99	53.195	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	51.250	ENSPFOG00000003911	polrmt	100	44.835	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000019616	POLRMT	89	44.565	ENSPLAG00000005743	polrmt	95	44.565	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000019616	POLRMT	97	46.498	ENSPMEG00000008947	polrmt	99	46.336	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000019616	POLRMT	73	39.706	ENSPMEG00000011484	polrmt	95	39.706	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000019616	POLRMT	83	51.459	ENSPREG00000007650	polrmt	77	51.562	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000019616	POLRMT	92	84.615	ENSPPYG00000009282	POLRMT	100	78.992	Pongo_abelii
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	65.428	ENSPCAG00000010816	POLRMT	100	65.347	Procavia_capensis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	71.208	ENSPCOG00000014539	POLRMT	100	71.046	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	77.705	ENSPVAG00000008403	POLRMT	100	77.787	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	84	51.001	ENSPNYG00000020790	polrmt	78	51.005	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000019616	POLRMT	97	46.508	ENSPNAG00000019790	polrmt	96	47.303	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	66.125	ENSRNOG00000024879	Polrmt	100	66.044	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	69.758	ENSRBIG00000006728	POLRMT	100	69.572	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	69.734	ENSRROG00000040809	POLRMT	100	69.548	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000019616	POLRMT	99	67.866	ENSSBOG00000025388	POLRMT	100	67.395	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	65	59.926	ENSSHAG00000009387	-	100	59.926	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000019616	POLRMT	96	48.387	ENSSFOG00015005074	polrmt	99	48.387	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	85	50.942	ENSSMAG00000011851	polrmt	79	50.942	Scophthalmus_maximus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	46.295	ENSSDUG00000004410	polrmt	96	46.533	Seriola_dumerili
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	46.282	ENSSLDG00000010643	polrmt	96	46.617	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	82	52.699	ENSSPAG00000018740	polrmt	78	52.601	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	76.437	ENSSSCG00000035693	POLRMT	100	76.437	Sus_scrofa
ENSUAMG00000019616	POLRMT	79	56.256	ENSTGUG00000000621	POLRMT	100	56.460	Taeniopygia_guttata
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	45.875	ENSTRUG00000018040	polrmt	94	45.830	Takifugu_rubripes
ENSUAMG00000019616	POLRMT	82	51.961	ENSTNIG00000010642	polrmt	100	51.961	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	55	71.250	ENSTBEG00000001819	-	100	71.094	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000019616	POLRMT	79	84.235	ENSTTRG00000011329	POLRMT	75	84.235	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000019616	POLRMT	96	82.780	ENSVVUG00000022627	POLRMT	100	79.934	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000019616	POLRMT	98	48.949	ENSXETG00000006545	polrmt	95	50.622	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000019616	POLRMT	95	46.757	ENSXMAG00000012464	polrmt	96	45.388	Xiphophorus_maculatus