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Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000020201 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA1
Alias: ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SWI|hSNF2L
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 71143 bases
Position: chrLZNR01007325.1:33461-104603
Accession: 11097
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000026015	ResIII	PF04851.15	1.4e-12	1	1
ENSUAMP00000026017	ResIII	PF04851.15	1.9e-12	1	1
ENSUAMP00000026017	DEAD	PF00270.29	1.3e-06	1	1
ENSUAMP00000026015	DEAD	PF00270.29	1.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000029026	SMARCA1-202	3252	-	ENSUAMP00000026017	1018 (aa)	-	-
ENSUAMT00000029024	SMARCA1-201	3372	-	ENSUAMP00000026015	1058 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	55	42.589	ENSUAMG00000021991	CHD1L	63	44.133
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	91	85.965	ENSUAMG00000023495	SMARCA5	93	85.965
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	54	41.248	ENSUAMG00000004198	CHD8	55	41.877
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	51	42.058	ENSUAMG00000024036	CHD6	71	40.816
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	50	49.004	ENSUAMG00000003343	HELLS	66	49.004

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.110	ENSG00000102038	SMARCA1	100	98.110	Homo_sapiens
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.504	ENSAPOG00000016035	smarca5	98	84.026	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.318	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	100	98.318	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	85	84.164	ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.263	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.504	ENSAOCG00000015578	smarca5	95	82.644	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.504	ENSAPEG00000011117	smarca5	99	84.080	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	83.096	ENSATEG00000012894	smarca5	93	84.583	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	92.770	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.770	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	97	89.126	ENSACAG00000011376	SMARCA1	95	90.991	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	93.256	ENSANAG00000023098	SMARCA1	100	93.100	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	96	81.060	ENSACLG00000025356	smarca5	95	83.065	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	80.386	ENSAMXG00000005709	smarca5	94	83.795	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	88	88.065	ENSAMXG00000011227	smarca1	99	89.818	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	99	97.545	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	99	96.476	Bos_taurus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	63.434	WBGene00002169	isw-1	97	63.434	Caenorhabditis_elegans
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	97.921	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	100	97.921	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	89.209	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	100	89.209	Canis_familiaris
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	99.433	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	100	99.433	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	97.649	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	100	97.644	Capra_hircus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	98.000	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	98	97.352	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	94.643	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	95	96.617	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	94.896	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	100	94.896	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	97.009	ENSCATG00000015921	SMARCA1	99	98.068	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	96.125	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	100	96.125	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.015	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	100	98.015	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	92.308	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	94	92.392	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	73.158	ENSCING00000004110	swi/snf	98	73.158	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	72.462	ENSCSAVG00000004620	-	100	74.165	Ciona_savignyi
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.015	ENSCANG00000007183	SMARCA1	100	98.015	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	94.240	ENSCGRG00001010776	Smarca1	100	94.618	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	94.939	ENSCGRG00000015301	Smarca1	98	95.413	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.504	ENSCSEG00000000328	smarca5	95	82.929	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	82.892	ENSCVAG00000008668	smarca5	99	83.628	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	81.070	ENSDARG00000052348	smarca5	96	82.175	Danio_rerio
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	88.889	ENSDARG00000012776	smarca1	97	84.965	Danio_rerio
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	95.942	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	99	95.942	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	95.362	ENSDORG00000009270	Smarca1	99	95.169	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	73.081	FBgn0011604	Iswi	98	72.315	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	77	92.857	ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.857	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	94	80.121	ENSEBUG00000001239	smarca5	97	80.121	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	97	92.115	ENSEASG00005008218	SMARCA1	100	93.636	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.586	ENSECAG00000012106	SMARCA1	100	98.586	Equus_caballus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	75	97.682	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	82	97.682	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	86.754	ENSELUG00000010515	smarca1	97	86.754	Esox_lucius
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	99.055	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	100	99.055	Felis_catus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	86	92.771	ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.873	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	96.367	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	97	96.367	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	83.299	ENSFHEG00000007687	smarca5	94	82.727	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	94	90.332	ENSGALG00000008431	SMARCA1	96	92.300	Gallus_gallus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	83.401	ENSGAFG00000017731	smarca5	95	82.828	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	93.210	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	100	93.210	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	69	96.000	ENSGGOG00000012841	-	95	96.000	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	96.314	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	100	96.314	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	94	96.104	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	100	96.104	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.333	ENSHCOG00000005458	smarca5	95	82.626	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	97	80.509	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	96	83.179	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	84.851	ENSIPUG00000016905	Smarca1	99	86.823	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	97.353	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	100	97.353	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	95.202	ENSJJAG00000002593	Smarca1	100	95.108	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.845	ENSKMAG00000003777	smarca5	95	83.131	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	88	83.781	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	100	84.956	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	82.525	ENSLBEG00000018112	smarca5	95	82.525	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	89.908	ENSLACG00000016697	SMARCA1	98	89.590	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	94	88.454	ENSLOCG00000014591	smarca1	97	88.454	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	96.223	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	100	96.223	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.110	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	99	98.068	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	97.009	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	99	98.115	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	97.009	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	99	98.068	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.015	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	100	98.015	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	83.503	ENSMAMG00000014294	smarca5	96	82.482	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	96	81.060	ENSMZEG00005009369	smarca5	95	83.065	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	90.542	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	99	90.702	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	95.385	ENSMAUG00000008133	Smarca1	99	95.385	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	97.543	ENSMICG00000015768	SMARCA1	100	97.543	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	95.202	ENSMOCG00000009464	Smarca1	100	95.202	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	81.029	ENSMMOG00000005547	smarca5	99	81.029	Mola_mola
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	89.265	ENSMODG00000013187	-	99	89.158	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.129	ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.716	Monopterus_albus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	95.202	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	100	95.014	Mus_caroli
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	95.202	ENSMUSG00000031099	Smarca1	100	95.014	Mus_musculus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	95.202	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	100	95.014	Mus_pahari
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	95.296	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	100	95.108	Mus_spretus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.131	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	95	98.131	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	94.872	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	100	93.843	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	95.865	ENSNGAG00000006492	Smarca1	99	95.865	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	83.605	ENSNBRG00000004463	smarca5	99	83.030	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	96.355	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	96.355	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	89	81.618	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	99	81.598	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	96	95.131	ENSODEG00000012163	SMARCA1	99	94.651	Octodon_degus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	96	81.158	ENSONIG00000009993	smarca5	95	83.165	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	93.313	ENSOANG00000002862	SMARCA1	100	93.313	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	95.085	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	100	94.707	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.538	ENSORLG00000021998	smarca5	95	82.828	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.538	ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.828	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.538	ENSORLG00015017210	smarca5	95	82.727	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.538	ENSOMEG00000000086	smarca5	95	82.727	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	98	96.562	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	96.562	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	97.335	ENSOARG00000014638	SMARCA1	100	98.980	Ovis_aries
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.110	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	100	98.110	Pan_paniscus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	99.244	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	100	99.244	Panthera_pardus
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	95	97.345	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	98	97.345	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.110	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	99	98.068	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	100	98.110	ENSPANG00000003871	SMARCA1	100	98.110	Papio_anubis
ENSUAMG00000020201	SMARCA1	89	86.695	ENSPKIG00000013411	smarca1	98	86.515	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	83.299	ENSXMAG00000009678	smarca5	97	84.868	Xiphophorus_maculatus