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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000020843 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PPARGC1A
Alias: PGC-1alpha|PGC1|PGC1A|PPARGC1
Full Name: PPARG coactivator 1 alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 42111 bases
Position: chrLZNR01004620.1:144476-186586
Accession: 9237
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000027050	RRM_1	PF00076.22	2.2e-07	1	1
ENSUAMP00000027059	RRM_1	PF00076.22	2.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000030171	PPARGC1A-202	2286	-	ENSUAMP00000027059	761 (aa)	-	-
ENSUAMT00000030162	PPARGC1A-201	4265	-	ENSUAMP00000027050	671 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.827	ENSG00000109819	PPARGC1A	100	95.827	Homo_sapiens
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	65	83.429	ENSAPOG00000018632	ppargc1a	50	83.436	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	98.510	ENSAMEG00000010421	PPARGC1A	93	96.231	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	70	59.788	ENSATEG00000016702	ppargc1a	86	81.595	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	87.630	ENSAPLG00000005303	PPARGC1A	93	85.868	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	81.724	ENSACAG00000000741	PPARGC1A	93	80.537	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.380	ENSANAG00000035930	PPARGC1A	97	90.846	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	65	82.081	ENSACLG00000001002	ppargc1a	74	81.595	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	93	57.865	ENSAMXG00000002461	ppargc1a	85	79.755	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	53	51.145	ENSBTAG00000012943	PPARGC1B	50	51.145	Bos_taurus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	92.411	ENSBTAG00000017024	PPARGC1A	95	91.532	Bos_taurus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	94.933	ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	93	92.867	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	97.466	ENSCAFG00000016519	PPARGC1A	93	95.289	Canis_familiaris
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	97.466	ENSCAFG00020027242	PPARGC1A	96	95.289	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.304	ENSCHIG00000015991	PPARGC1A	95	91.532	Capra_hircus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.827	ENSTSYG00000010439	PPARGC1A	100	95.827	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	89.717	ENSCAPG00000005150	PPARGC1A	92	88.156	Cavia_aperea
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.741	ENSCPOG00000001518	PPARGC1A	93	91.790	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.380	ENSCCAG00000024681	PPARGC1A	93	93.271	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.976	ENSCATG00000032575	PPARGC1A	100	95.976	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.443	ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	93	91.521	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.976	ENSCSAG00000016575	PPARGC1A	93	93.809	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	77	50.000	ENSCPBG00000007891	PPARGC1B	64	31.718	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.678	ENSCANG00000033426	PPARGC1A	93	93.540	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	92.101	ENSCGRG00001015534	Ppargc1a	93	90.310	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	92.101	ENSCGRG00000000200	Ppargc1a	93	90.310	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	67	81.714	ENSCSEG00000006884	ppargc1a	50	81.595	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	83	44.874	ENSCVAG00000016547	ppargc1a	64	78.659	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	86	79.775	ENSDARG00000067829	ppargc1a	85	80.982	Danio_rerio
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.380	ENSDNOG00000041106	PPARGC1A	93	93.136	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.592	ENSDORG00000016276	Ppargc1a	93	91.521	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	96.721	ENSEASG00005007984	PPARGC1A	93	94.616	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	78	42.667	ENSEASG00005002826	PPARGC1B	51	42.667	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	96.572	ENSECAG00000009164	PPARGC1A	95	96.528	Equus_caballus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	89.732	ENSEEUG00000009219	PPARGC1A	95	86.425	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	99	46.623	ENSELUG00000017027	ppargc1a	94	48.399	Esox_lucius
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	96.423	ENSFCAG00000000043	PPARGC1A	93	94.347	Felis_catus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	86.289	ENSFALG00000009211	PPARGC1A	94	84.522	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.294	ENSFDAG00000005659	PPARGC1A	93	91.386	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	85	78.409	ENSFHEG00000021990	ppargc1a	60	77.914	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	87.481	ENSGALG00000042851	PPARGC1A	94	85.464	Gallus_gallus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	85	80.114	ENSGAFG00000015514	ppargc1a	60	79.141	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	85.544	ENSGAGG00000007043	PPARGC1A	97	83.984	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	57	47.436	ENSGAGG00000012870	PPARGC1B	59	47.097	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.827	ENSGGOG00000009810	PPARGC1A	93	93.674	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	65	82.081	ENSHBUG00000005269	ppargc1a	82	82.317	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.505	ENSHGLG00000007022	PPARGC1A	95	87.887	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.505	ENSHGLG00100000133	PPARGC1A	93	87.887	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	92	56.417	ENSHCOG00000014886	ppargc1a	86	79.141	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.890	ENSSTOG00000012522	PPARGC1A	93	91.925	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	66	81.143	ENSKMAG00000005390	ppargc1a	86	80.982	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	78	82.286	ENSLBEG00000019562	ppargc1a	84	81.595	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	71.174	ENSLACG00000014054	PPARGC1A	95	70.777	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	58	41.667	ENSLOCG00000012195	ppargc1b	51	41.667	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.741	ENSLAFG00000012981	PPARGC1A	98	93.602	Loxodonta_africana
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ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.976	ENSMLEG00000034233	PPARGC1A	93	93.809	Mandrillus_leucophaeus
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ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	65	82.081	ENSMZEG00005001739	ppargc1a	60	81.595	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	87.183	ENSMGAG00000012485	PPARGC1A	93	85.195	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	92.250	ENSMAUG00000011811	Ppargc1a	93	90.444	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	53	49.635	ENSMAUG00000014191	Ppargc1b	50	49.635	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.082	ENSMICG00000015390	PPARGC1A	97	91.364	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.505	ENSMOCG00000008765	Ppargc1a	93	89.771	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	76	83.636	ENSMMOG00000011847	ppargc1a	92	82.822	Mola_mola
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	90.313	ENSMODG00000000549	PPARGC1A	93	88.291	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	65	78.161	ENSMALG00000004625	ppargc1a	80	77.301	Monopterus_albus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.207	MGP_CAROLIEiJ_G0027213	Ppargc1a	93	89.367	Mus_caroli
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.369	ENSMUSG00000029167	Ppargc1a	93	89.516	Mus_musculus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.058	MGP_PahariEiJ_G0016995	Ppargc1a	93	89.233	Mus_pahari
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.071	MGP_SPRETEiJ_G0028208	Ppargc1a	93	89.247	Mus_spretus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	97.019	ENSMPUG00000016736	PPARGC1A	93	94.886	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	94.635	ENSMLUG00000016307	PPARGC1A	93	92.732	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.654	ENSNGAG00000015090	Ppargc1a	93	89.906	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.827	ENSNLEG00000016760	PPARGC1A	100	95.827	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	92.250	ENSOPRG00000012899	PPARGC1A	93	90.310	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	87.928	ENSOANG00000006680	PPARGC1A	93	86.137	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	92.548	ENSOCUG00000014668	PPARGC1A	93	90.579	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	68	77.778	ENSORLG00000004788	ppargc1a	93	51.266	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	68	77.249	ENSORLG00015012206	ppargc1a	93	51.008	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	68	78.307	ENSOMEG00000000670	ppargc1a	89	80.368	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.443	ENSOGAG00000014559	PPARGC1A	93	91.521	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	93.452	ENSOARG00000005581	PPARGC1A	94	90.482	Ovis_aries
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.827	ENSPPAG00000034694	PPARGC1A	100	95.827	Pan_paniscus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	96.423	ENSPPRG00000001711	PPARGC1A	93	94.347	Panthera_pardus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	96.423	ENSPTIG00000007378	PPARGC1A	93	94.347	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	95.827	ENSPTRG00000015954	PPARGC1A	100	95.827	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	94.643	ENSPANG00000005420	PPARGC1A	93	92.608	Papio_anubis
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	56	46.795	ENSPSIG00000008358	PPARGC1B	54	45.570	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	87.481	ENSPSIG00000011790	PPARGC1A	93	85.464	Pelodiscus_sinensis
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	62	40.702	ENSPMGG00000019204	ppargc1a	94	46.968	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	91.815	ENSPEMG00000010892	Ppargc1a	93	90.054	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	70	45.455	ENSPEMG00000018822	Ppargc1b	52	48.175	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	100	89.419	ENSPCIG00000015835	PPARGC1A	93	87.483	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	87	80.114	ENSPFOG00000001263	ppargc1a	86	79.141	Poecilia_formosa
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ENSUAMG00000020843	PPARGC1A	86	80.114	ENSPREG00000019171	ppargc1a	68	79.141	Poecilia_reticulata
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