EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000024037 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: IPO4
Alias: FLJ23338|Imp4
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9554 bases
Position: chrLZNR01002663.1:132593-142146
Accession: 19426
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000031842	IBN_N	PF03810.19	4.8e-08	1	1
ENSUAMP00000031840	IBN_N	PF03810.19	5.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000035505	IPO4-202	3228	-	ENSUAMP00000031840	1075 (aa)	-	-
ENSUAMT00000035507	IPO4-203	3213	-	ENSUAMP00000031842	1070 (aa)	-	-
ENSUAMT00000035508	IPO4-204	3210	-	ENSUAMP00000031843	1069 (aa)	-	-
ENSUAMT00000035538	IPO4-205	2991	-	ENSUAMP00000031872	996 (aa)	-	-
ENSUAMT00000035466	IPO4-201	2451	-	ENSUAMP00000031806	816 (aa)	-	-
ENSUAMT00000035548	IPO4-206	2607	-	ENSUAMP00000031880	868 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	90.203	ENSG00000196497	IPO4	99	90.676	Homo_sapiens
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	43.715	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	43.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.002	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	88.355	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.414	ENSACIG00000004246	ipo4	99	44.169	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.210	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	44.485	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.118	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	44.393	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000024037	IPO4	92	45.104	ENSATEG00000017082	ipo4	99	45.302	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000024037	IPO4	86	53.033	ENSACAG00000003973	-	99	53.684	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	88.344	ENSANAG00000037973	IPO4	99	88.714	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	43.434	ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.142	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.321	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.952	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.094	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	89.372	Bos_taurus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	88.714	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	88.899	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	93.241	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	93.241	Canis_familiaris
ENSUAMG00000024037	IPO4	98	92.308	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	91.182	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	88.725	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	89.094	Capra_hircus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	88.909	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	89.002	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.303	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	87.303	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.362	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	89.732	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.926	ENSCATG00000040395	IPO4	99	90.203	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	88.611	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	88.611	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000024037	IPO4	90	56.983	ENSCPBG00000025757	IPO4	94	56.779	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000024037	IPO4	92	36.852	ENSCING00000008639	-	97	35.984	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000024037	IPO4	94	35.543	ENSCSAVG00000011482	-	100	35.130	Ciona_savignyi
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.372	ENSCANG00000029513	IPO4	99	89.741	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	81.885	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	82.070	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	81.885	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	82.070	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	42.594	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	42.541	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000024037	IPO4	98	43.186	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.288	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	46.083	ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.175	Danio_rerio
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.352	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	89.259	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.870	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	87.870	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	85.148	ENSETEG00000018381	IPO4	99	85.332	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000024037	IPO4	91	91.131	ENSEASG00005011954	IPO4	96	91.131	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	90.926	ENSECAG00000009909	IPO4	99	90.926	Equus_caballus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	46.097	ENSELUG00000020628	ipo4	99	46.097	Esox_lucius
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	93.056	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	92.963	Felis_catus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	81.533	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	81.034	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	39.062	ENSFHEG00000009351	ipo4	96	45.935	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	45.488	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.580	Gadus_morhua
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	43.721	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.761	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	45.120	ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.253	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	90.018	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	90.296	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.373	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	44.096	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.593	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	87.593	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.222	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	87.222	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	42.831	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.650	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	46.133	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.083	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.269	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	89.639	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	85.873	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	85.873	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.055	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	43.837	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	43.842	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.923	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	48.288	ENSLACG00000001428	IPO4	99	48.639	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000024037	IPO4	75	44.845	ENSLOCG00000001149	ipo4	82	44.845	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	86.679	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	86.494	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.926	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	90.203	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.926	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	90.203	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.926	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	90.203	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.926	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	90.203	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.649	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.834	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.199	ENSMZEG00005017273	ipo4	99	44.096	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	81.163	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	81.533	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.419	ENSMICG00000001719	IPO4	99	87.789	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	79.871	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	80.425	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.169	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	44.353	Mola_mola
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	71.667	ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.667	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	43.583	ENSMALG00000001587	ipo4	99	43.386	Monopterus_albus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	79.409	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	80.240	Mus_caroli
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	79.132	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	79.963	Mus_musculus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	79.390	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	99	80.222	Mus_pahari
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	79.686	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	79.871	Mus_spretus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	93.056	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	93.056	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	86.667	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	86.667	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	86.864	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	87.142	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	45.111	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.287	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.165	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	87.258	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.130	ENSODEG00000002609	IPO4	99	87.130	Octodon_degus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	45.111	ENSONIG00000014574	ipo4	99	45.111	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.638	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	88.100	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	43.790	ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.955	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.147	ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.963	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.332	ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.147	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000024037	IPO4	98	43.959	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	44.015	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	86.772	ENSOGAG00000010642	IPO4	100	87.049	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	86.981	ENSOARG00000019188	IPO4	99	87.350	Ovis_aries
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	88.540	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	88.909	Pan_paniscus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	92.870	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	92.778	Panthera_pardus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	92.963	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	92.870	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.926	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	90.203	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.926	ENSPANG00000026278	IPO4	99	90.203	Papio_anubis
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	45.505	ENSPKIG00000007683	-	99	45.505	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	47.470	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	47.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	43.640	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	43.640	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	81.499	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	81.869	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000024037	IPO4	94	74.975	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	75.074	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.271	ENSPFOG00000009255	ipo4	99	44.210	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.363	ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.301	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.363	ENSPMEG00000013102	ipo4	99	44.301	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.271	ENSPREG00000017605	ipo4	99	44.301	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.454	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	89.824	Pongo_abelii
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.708	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	87.800	Procavia_capensis
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.049	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	87.419	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	90.194	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	90.379	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.107	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	44.280	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	45.983	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	46.076	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	81.146	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	81.423	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.556	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	89.834	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.372	ENSRROG00000011492	IPO4	99	89.649	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	87.604	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	87.974	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	72.576	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	72.669	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000024037	IPO4	99	47.978	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.794	Scleropages_formosus
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