EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000024336 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11547 bases
Position: chrLZNR01006963.1:51499-63045
Accession: 10898
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000031790	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.3e-40	1	1
ENSUAMP00000031789	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.3e-40	1	1
ENSUAMP00000031790	DEAD	PF00270.29	2.5e-16	1	1
ENSUAMP00000031789	DEAD	PF00270.29	2.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000035449	SKIV2L-201	4312	-	ENSUAMP00000031789	1238 (aa)	-	-
ENSUAMT00000035450	SKIV2L-202	4226	-	ENSUAMP00000031790	1246 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSUAMG00000024336's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSUAMG00000024336's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	77	36.724	ENSUAMG00000023061	MTREX	89	36.724

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.265	ENSG00000204351	SKIV2L	100	95.265	Homo_sapiens
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.746	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	62.008	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	99.037	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	99.037	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.288	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.113	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.349	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.545	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.190	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.384	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.244	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	61.089	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	65.255	ENSACAG00000011746	SKIV2L	98	65.924	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.827	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	95.827	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.727	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.625	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	59.808	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.792	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.987	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	95.987	Bos_taurus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	96	39.688	WBGene00008502	skih-2	99	39.515	Caenorhabditis_elegans
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.265	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	95.265	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	97.592	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	97.592	Canis_familiaris
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	97.512	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	97.512	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.907	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	95.907	Capra_hircus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.104	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	95.104	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	92.937	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.937	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.827	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	95.827	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.024	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	95.024	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.660	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.660	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.104	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	95.104	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	87	64.912	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	65.308	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	94	51.269	ENSCING00000005576	-	99	50.843	Ciona_intestinalis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	95.422	ENSCANG00000039709	SKIV2L	98	95.429	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.226	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	94.226	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.262	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	61.111	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.532	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	61.316	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.709	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.654	Danio_rerio
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	89.289	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	89.583	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	93	43.950	FBgn0039117	tst	97	43.960	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	72	94.216	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	94.216	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	90	56.832	ENSEBUG00000013680	-	95	57.483	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	93	96.558	ENSEASG00005015534	SKIV2L	100	96.558	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	93.902	ENSECAG00000021823	SKIV2L	99	93.902	Equus_caballus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	55	99.209	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	99.209	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.285	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.598	Esox_lucius
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	98.234	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	98.234	Felis_catus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	90.297	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.537	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	60.192	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.218	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	59.408	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.431	Gadus_morhua
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	79	60.427	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.443	Gallus_gallus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.472	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.427	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.397	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.516	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.185	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	95.185	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.569	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.464	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	91.346	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	91.667	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	88.862	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	89.183	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	59.723	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.642	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	59.795	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	59.904	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.506	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.506	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	71	60.192	ENSLACG00000002986	-	73	59.446	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.222	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.222	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.265	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	95.265	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.185	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	95.185	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.185	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	95.185	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.024	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	95.024	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.032	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.142	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.569	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.464	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	71	51.363	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	51.363	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.424	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.670	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.185	ENSMICG00000046331	SKIV2L	98	95.347	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	92.221	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.577	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.335	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	60.178	Mola_mola
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	87.910	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.910	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	59.501	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.479	Monopterus_albus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.424	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	93.424	Mus_caroli
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.424	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	93.424	Mus_musculus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.103	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	93.103	Mus_pahari
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.023	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	93.023	Mus_spretus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	97.994	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	97.994	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.185	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	95.185	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.894	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.968	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	91.850	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	92.000	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.222	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.222	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	92.215	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	92.215	Octodon_degus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	62.300	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.510	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.345	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	95.345	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.630	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.526	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.551	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.365	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.362	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.285	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	62.351	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	62.329	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.185	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	95.185	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	90.290	ENSOARG00000002411	-	100	90.290	Ovis_aries
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	94.246	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	94.318	Pan_paniscus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	98.395	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	98.395	Panthera_pardus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	97.913	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	97.913	Panthera_tigris_altaica
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.185	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	95.185	Pan_troglodytes
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	93.998	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	94.070	Papio_anubis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.726	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.797	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.772	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.845	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.905	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	93.905	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	87.920	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	87.920	Phascolarctos_cinereus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.313	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.267	Poecilia_formosa
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.441	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.396	Poecilia_latipinna
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.441	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.396	Poecilia_mexicana
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	59.887	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.708	Poecilia_reticulata
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.543	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.543	Pongo_abelii
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	77	94.730	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	94.730	Procavia_capensis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	96.148	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	96.148	Propithecus_coquereli
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.462	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	94.462	Pteropus_vampyrus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.000	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	59.821	Pundamilia_nyererei
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	61.026	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	61.187	Pygocentrus_nattereri
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.066	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	94.066	Rattus_norvegicus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	92.551	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	92.620	Rhinopithecus_bieti
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.024	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	95.024	Rhinopithecus_roxellana
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	93	37.787	YLR398C	-	93	37.381	Saccharomyces_cerevisiae
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.506	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.506	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	87.590	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.549	Sarcophilus_harrisii
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.181	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.532	Scleropages_formosus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.814	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.754	Scophthalmus_maximus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.362	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.316	Seriola_dumerili
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.177	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.163	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	62.219	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.362	Sphenodon_punctatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	95	61.686	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.610	Stegastes_partitus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.987	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.987	Sus_scrofa
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	74	61.886	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	54.764	Takifugu_rubripes
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	59.602	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.597	Tetraodon_nigroviridis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	94	93.620	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.620	Tupaia_belangeri
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	90.931	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.931	Tursiops_truncatus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	93	99.484	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	100	99.484	Ursus_maritimus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	97.742	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	97.742	Vulpes_vulpes
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	58.763	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.954	Xenopus_tropicalis
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.347	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.314	Xiphophorus_couchianus
ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.966	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.915	Xiphophorus_maculatus