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Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000024701 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 125215 bases
Position: chrLZNR01002694.1:5137-130351
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000033256	ResIII	PF04851.15	1.8e-08	1	1
ENSUAMP00000033147	ResIII	PF04851.15	1.8e-08	1	1
ENSUAMP00000033521	ResIII	PF04851.15	1.9e-08	1	1
ENSUAMP00000033426	ResIII	PF04851.15	1.9e-08	1	1
ENSUAMP00000033156	ResIII	PF04851.15	1.9e-08	1	1
ENSUAMP00000033155	ResIII	PF04851.15	1.9e-08	1	1
ENSUAMP00000033166	ResIII	PF04851.15	2e-08	1	1
ENSUAMP00000033148	ResIII	PF04851.15	2e-08	1	1
ENSUAMP00000033406	ResIII	PF04851.15	2.2e-08	1	1
ENSUAMP00000033405	ResIII	PF04851.15	2.2e-08	1	1
ENSUAMP00000033166	BRK	PF07533.16	2.5e-17	1	1
ENSUAMP00000033147	BRK	PF07533.16	2.5e-17	1	1
ENSUAMP00000033148	BRK	PF07533.16	2.5e-17	1	1
ENSUAMP00000033256	BRK	PF07533.16	2.6e-17	1	1
ENSUAMP00000033156	BRK	PF07533.16	2.6e-17	1	1
ENSUAMP00000033155	BRK	PF07533.16	2.6e-17	1	1
ENSUAMP00000033426	BRK	PF07533.16	2.6e-17	1	1
ENSUAMP00000033406	BRK	PF07533.16	2.6e-17	1	1
ENSUAMP00000033405	BRK	PF07533.16	2.6e-17	1	1
ENSUAMP00000033521	BRK	PF07533.16	2.9e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000037054	SMARCA2-206	4179	-	ENSUAMP00000033256	1392 (aa)	-	-
ENSUAMT00000036935	SMARCA2-201	4185	-	ENSUAMP00000033147	1394 (aa)	-	-
ENSUAMT00000036936	SMARCA2-202	4158	-	ENSUAMP00000033148	1385 (aa)	-	-
ENSUAMT00000037337	SMARCA2-210	4083	-	ENSUAMP00000033521	1360 (aa)	-	-
ENSUAMT00000036945	SMARCA2-204	4245	-	ENSUAMP00000033156	1414 (aa)	-	-
ENSUAMT00000036944	SMARCA2-203	4266	-	ENSUAMP00000033155	1421 (aa)	-	-
ENSUAMT00000037214	SMARCA2-208	4239	-	ENSUAMP00000033406	1412 (aa)	-	-
ENSUAMT00000036955	SMARCA2-205	4095	-	ENSUAMP00000033166	1364 (aa)	-	-
ENSUAMT00000037213	SMARCA2-207	4251	-	ENSUAMP00000033405	1416 (aa)	-	-
ENSUAMT00000037236	SMARCA2-209	4233	-	ENSUAMP00000033426	1410 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	93	83.723	ENSUAMG00000014661	SMARCA4	87	75.745
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	59	32.836	ENSUAMG00000024036	CHD6	73	37.410

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.150	ENSG00000080503	SMARCA2	99	100.000	Homo_sapiens
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	79.756	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	81.319	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	91.730	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	91.804	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	80.257	ENSACIG00000015607	SMARCA2	87	80.924	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	80.403	ENSAOCG00000009647	-	87	81.440	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	80.794	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	96	81.481	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	79.845	ENSATEG00000006916	SMARCA2	86	80.638	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	89.787	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	96	87.908	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	90.079	ENSACAG00000002423	SMARCA2	89	90.288	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.143	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	93.879	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	81.746	ENSACLG00000004248	SMARCA2	87	82.467	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	82.436	ENSAMXG00000012404	smarca2	90	82.390	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	96.165	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	89	96.165	Bos_taurus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.007	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	94.875	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	97.327	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	89	97.325	Canis_familiaris
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	79	96.365	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	87	97.178	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	96.168	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	89	96.165	Capra_hircus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.026	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	92	93.544	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	90.473	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	89	90.251	Cavia_aperea
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.126	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	89	94.194	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.289	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	99	94.026	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	96.534	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	94.536	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.218	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	89	94.214	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.696	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	95	95.696	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	88	89.286	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	79	89.286	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	96	94.273	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	89	91.214	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.634	ENSCANG00000039597	SMARCA2	98	95.634	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	88.889	ENSCGRG00001002323	Smarca2	89	89.034	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	76.824	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	86	77.443	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	94	78.310	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	96	79.061	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	82.006	ENSDARG00000008904	smarca2	87	82.331	Danio_rerio
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.591	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	89	94.306	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.353	ENSDORG00000014832	Smarca2	89	94.206	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	78	62.759	FBgn0000212	brm	85	53.841	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	98	73.082	ENSEBUG00000011442	-	90	73.488	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	88	62.891	ENSEBUG00000002449	-	89	63.137	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	96.674	ENSEASG00005010312	SMARCA2	89	96.674	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	68	98.611	ENSEEUG00000015540	-	63	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	97	79.899	ENSELUG00000010318	smarca2	96	76.768	Esox_lucius
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	96.821	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	89	96.819	Felis_catus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	90.422	ENSFALG00000010416	SMARCA2	89	90.987	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.391	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	89	93.238	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	80.312	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	87	80.758	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	98	78.406	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	88	78.998	Gadus_morhua
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	91.351	ENSGALG00000010164	SMARCA2	89	91.130	Gallus_gallus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	95	76.523	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	84	77.991	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	78.184	ENSGACG00000014488	SMARCA2	88	77.697	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	90.838	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	89	91.124	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.514	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	88	94.510	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	81.497	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	86	82.209	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.106	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	90	91.725	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.714	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	89	94.783	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	77.053	ENSHCOG00000015348	-	88	86.337	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	82.293	ENSIPUG00000011060	smarca2	95	81.886	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.579	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	89	94.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.782	ENSJJAG00000010867	Smarca2	89	94.278	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	79.024	ENSKMAG00000015844	-	89	78.200	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	53	68.025	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	71.718	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	97	84.448	ENSLOCG00000011499	smarca2	86	84.964	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.546	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	89	93.692	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	96.296	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	98	95.815	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.637	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	95	95.103	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.143	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	94.850	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	96.350	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	96.280	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	79.721	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.175	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	81.746	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	86	82.467	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	85	77.689	ENSMGAG00000005160	-	100	77.291	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.549	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	94.505	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.714	ENSMOCG00000001611	Smarca2	89	93.710	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	79.544	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	89	79.956	Mola_mola
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	91.926	ENSMODG00000003578	SMARCA2	89	92.638	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	80.678	ENSMALG00000009611	SMARCA2	87	80.977	Monopterus_albus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.585	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	95	91.678	Mus_caroli
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.551	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.603	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	97	90.041	Mus_pahari
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.343	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	89.733	Mus_spretus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	80	99.817	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	81	99.452	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	88.655	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	89	88.850	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.813	ENSNGAG00000000108	Smarca2	90	91.890	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	95	70.781	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	95.900	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	93.818	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	88.462	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	88	88.743	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	88.239	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	89	88.311	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	93.116	ENSODEG00000005452	SMARCA2	88	93.116	Octodon_degus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	79.387	ENSONIG00000014163	SMARCA2	87	80.458	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	57	94.352	ENSOANG00000008299	-	95	98.113	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	94.729	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	89	94.729	Oryctolagus_cuniculus
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	79.605	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	79.019	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	79.802	ENSORLG00015006289	SMARCA2	97	91.436	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	81.667	ENSOMEG00000009736	-	90	81.716	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	86.744	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	89	92.611	Otolemur_garnettii
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