EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000027527 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2153 bases
Position: chrLZNR01005846.1:141657-143809
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000036323	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-05	1	1
ENSUAMP00000036324	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000040421	-	1179	-	ENSUAMP00000036324	189 (aa)	-	UPI0001C100FF
ENSUAMT00000040420	-	1261	-	ENSUAMP00000036323	170 (aa)	-	UPI0002256967

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUAMG00000027527	-	92	37.017	ENSUAMG00000022667	RAB33B	79	37.017
ENSUAMG00000027527	-	85	58.621	ENSUAMG00000008388	MRAS	80	56.287
ENSUAMG00000027527	-	89	94.702	ENSUAMG00000016388	KRAS	99	85.106
ENSUAMG00000027527	-	84	35.862	ENSUAMG00000013367	RAB23	63	31.579
ENSUAMG00000027527	-	92	34.807	ENSUAMG00000009326	RAB30	89	34.807
ENSUAMG00000027527	-	96	30.808	ENSUAMG00000018967	RAB7A	66	32.117
ENSUAMG00000027527	-	85	32.886	ENSUAMG00000021018	-	76	31.373
ENSUAMG00000027527	-	87	34.667	ENSUAMG00000024343	RAB5C	77	32.335
ENSUAMG00000027527	-	95	34.615	ENSUAMG00000021114	RAB1B	85	34.615
ENSUAMG00000027527	-	97	37.097	ENSUAMG00000023026	RAB39B	87	37.097
ENSUAMG00000027527	-	86	31.395	ENSUAMG00000016809	RASL11A	70	31.765
ENSUAMG00000027527	-	97	30.151	ENSUAMG00000027471	RAB5A	86	33.333
ENSUAMG00000027527	-	86	32.121	ENSUAMG00000003164	RAB14	71	31.373
ENSUAMG00000027527	-	88	41.071	ENSUAMG00000010578	RERG	84	41.071
ENSUAMG00000027527	-	84	33.129	ENSUAMG00000015697	RAB25	71	32.000
ENSUAMG00000027527	-	85	37.037	ENSUAMG00000026548	RAB11A	71	36.667
ENSUAMG00000027527	-	84	34.459	ENSUAMG00000018451	RAB9B	76	32.680
ENSUAMG00000027527	-	96	33.333	ENSUAMG00000014651	RAB5B	82	33.333
ENSUAMG00000027527	-	85	32.886	ENSUAMG00000028103	-	76	31.373
ENSUAMG00000027527	-	84	36.552	ENSUAMG00000006639	-	81	34.694
ENSUAMG00000027527	-	97	32.178	ENSUAMG00000023005	RAB33A	85	32.178

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000027527	-	99	99.408	ENSG00000174775	HRAS	99	99.408	Homo_sapiens
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSAPOG00000023684	hrasb	100	93.651	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000027527	-	100	100.000	ENSAMEG00000010515	HRAS	75	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSACIG00000000699	hrasb	100	93.651	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSAOCG00000011843	hrasb	100	93.651	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSAPEG00000009546	hrasb	100	93.651	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSATEG00000020001	hrasb	100	93.651	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000027527	-	89	98.675	ENSAPLG00000012248	HRAS	100	98.780	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000027527	-	100	94.180	ENSACAG00000014920	HRAS	100	94.180	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSANAG00000034201	HRAS	99	100.000	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSACLG00000001181	hrasb	100	93.122	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSAMXG00000035885	hrasa	100	93.122	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000027527	-	100	92.593	ENSAMXG00000033907	hrasb	100	92.593	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000027527	-	100	98.942	ENSBTAG00000046644	HRAS	100	98.942	Bos_taurus
ENSUAMG00000027527	-	89	82.119	WBGene00002335	let-60	92	81.065	Caenorhabditis_elegans
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSCJAG00000012199	HRAS	99	100.000	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000027527	-	99	92.899	ENSCAFG00000031029	HRAS	60	100.000	Canis_familiaris
ENSUAMG00000027527	-	100	100.000	ENSCAFG00020007059	HRAS	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000027527	-	100	98.942	ENSCHIG00000004808	HRAS	100	98.942	Capra_hircus
ENSUAMG00000027527	-	99	99.408	ENSTSYG00000003745	HRAS	99	99.408	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000027527	-	100	96.296	ENSCAPG00000000745	HRAS	100	96.296	Cavia_aperea
ENSUAMG00000027527	-	100	96.296	ENSCPOG00000000101	HRAS	100	96.296	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSCCAG00000031453	HRAS	99	100.000	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSCATG00000031194	HRAS	99	100.000	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000027527	-	100	96.296	ENSCLAG00000002823	HRAS	100	96.296	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000027527	-	100	96.825	ENSCSAG00000011033	HRAS	100	96.825	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000027527	-	100	94.180	ENSCPBG00000013941	-	100	94.180	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSCANG00000017827	HRAS	99	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSCGRG00001018735	Hras	100	96.825	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSCGRG00000010918	Hras	100	96.825	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSCSEG00000007927	hrasb	100	93.651	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSCVAG00000008670	hrasb	100	93.122	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000027527	-	89	90.728	ENSDARG00000013161	zgc:55558	89	89.222	Danio_rerio
ENSUAMG00000027527	-	100	92.593	ENSDARG00000005651	hrasb	100	97.222	Danio_rerio
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSDARG00000098497	hrasa	100	93.122	Danio_rerio
ENSUAMG00000027527	-	99	92.899	ENSDNOG00000015293	HRAS	99	92.899	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000027527	-	100	96.825	ENSDORG00000028079	Hras	100	96.825	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000027527	-	89	86.093	FBgn0003205	Ras85D	96	80.663	Drosophila_melanogaster
ENSUAMG00000027527	-	100	94.180	ENSETEG00000019899	HRAS	100	94.180	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000027527	-	100	89.947	ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	Eptatretus_burgeri
ENSUAMG00000027527	-	100	98.942	ENSECAG00000008473	HRAS	100	98.942	Equus_caballus
ENSUAMG00000027527	-	91	96.774	ENSEEUG00000014548	HRAS	90	96.774	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSELUG00000004712	HRAS	100	93.651	Esox_lucius
ENSUAMG00000027527	-	100	100.000	ENSFCAG00000002990	HRAS	100	100.000	Felis_catus
ENSUAMG00000027527	-	100	94.709	ENSFALG00000012145	HRAS	100	94.709	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000027527	-	100	99.412	ENSFDAG00000006760	HRAS	100	96.825	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000027527	-	100	92.593	ENSFHEG00000010055	hrasb	100	92.593	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000027527	-	94	94.944	ENSGMOG00000010196	hrasb	96	94.944	Gadus_morhua
ENSUAMG00000027527	-	100	94.709	ENSGALG00000029260	H-RAS	100	94.709	Gallus_gallus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSGAFG00000021814	hrasb	100	93.651	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSGACG00000011340	hrasb	100	93.651	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000027527	-	100	94.180	ENSGAGG00000019886	-	100	94.180	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000027527	-	99	98.817	ENSGGOG00000015438	HRAS	99	98.817	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSHBUG00000011998	hrasb	100	93.122	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000027527	-	100	96.296	ENSHGLG00000004508	HRAS	100	96.296	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000027527	-	100	96.296	ENSHGLG00100012888	HRAS	100	96.296	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000027527	-	100	92.593	ENSIPUG00000022502	hrasb	100	92.593	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSIPUG00000006053	hras	100	93.122	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000027527	-	99	98.214	ENSSTOG00000021206	HRAS	100	96.825	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000027527	-	99	99.405	ENSJJAG00000022529	-	100	96.825	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000027527	-	100	87.831	ENSJJAG00000011743	-	100	87.831	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSKMAG00000001922	Ha-ras	100	93.651	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSLBEG00000001905	hrasb	100	93.651	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSLACG00000018427	HRAS	100	93.122	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000027527	-	100	92.593	ENSLOCG00000000684	hrasb	100	92.593	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSMFAG00000039003	HRAS	99	100.000	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSMMUG00000021659	HRAS	99	100.000	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSMNEG00000039358	HRAS	99	100.000	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000027527	-	99	100.000	ENSMLEG00000042070	HRAS	99	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSMAMG00000004359	hrasb	100	93.651	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSMZEG00005017583	hrasb	100	93.122	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000027527	-	99	99.405	ENSMAUG00000020006	Hras	100	96.825	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000027527	-	99	99.408	ENSMICG00000006472	HRAS	99	99.408	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000027527	-	99	98.810	ENSMOCG00000000744	Hras	100	96.825	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000027527	-	88	98.000	ENSMODG00000016580	HRAS	71	98.000	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSMALG00000011273	hrasb	100	93.651	Monopterus_albus
ENSUAMG00000027527	-	100	96.296	MGP_CAROLIEiJ_G0030681	Hras	100	96.296	Mus_caroli
ENSUAMG00000027527	-	99	98.225	ENSMUSG00000025499	Hras	100	96.825	Mus_musculus
ENSUAMG00000027527	-	99	99.405	MGP_PahariEiJ_G0013880	Hras	100	96.296	Mus_pahari
ENSUAMG00000027527	-	100	86.243	MGP_SPRETEiJ_G0031792	-	100	86.243	Mus_spretus
ENSUAMG00000027527	-	99	99.408	ENSNGAG00000022044	Hras	100	96.825	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000027527	-	100	96.825	ENSNLEG00000008300	HRAS	100	96.825	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000027527	-	99	98.810	ENSODEG00000015703	HRAS	100	96.296	Octodon_degus
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSONIG00000014560	hrasb	100	93.651	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000027527	-	96	85.976	ENSORLG00000024443	zgc:55558	90	89.820	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSORLG00000018912	hrasb	100	93.122	Oryzias_latipes
ENSUAMG00000027527	-	100	93.122	ENSORLG00020008129	hras	100	93.122	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000027527	-	89	91.391	ENSORLG00020013690	zgc:55558	90	89.820	Oryzias_latipes_hni
ENSUAMG00000027527	-	89	91.391	ENSORLG00015003353	zgc:55558	90	89.820	Oryzias_latipes_hsok
ENSUAMG00000027527	-	100	93.651	ENSOMEG00000018719	hrasb	100	93.651	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000027527	-	89	92.053	ENSOMEG00000016685	zgc:55558	90	90.419	Oryzias_melastigma
ENSUAMG00000027527	-	100	95.238	ENSOGAG00000024846	HRAS	100	95.238	Otolemur_garnettii
ENSUAMG00000027527	-	88	99.333	ENSOARG00000007365	HRAS	99	99.333	Ovis_aries
ENSUAMG00000027527	-	99	99.408	ENSPPAG00000028620	HRAS	99	99.408	Pan_paniscus
ENSUAMG00000027527	-	88	100.000	ENSPPRG00000008185	HRAS	88	100.000	Panthera_pardus
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