EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUAMG00000027667 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: ARCD1|ARP1
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_americanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11267 bases
Position: chrLZNR01002730.1:213213-224479
Accession: 605
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUAMP00000036527	APOBEC_N	PF08210.11	1e-48	1	1
ENSUAMP00000036527	APOBEC_C	PF05240.14	2.3e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUAMT00000040642	APOBEC2-201	687	-	ENSUAMP00000036527	228 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	75	35.593	ENSUAMG00000011642	AICDA	90	32.558
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	65	35.526	ENSUAMG00000004433	-	83	34.211

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	88.571	ENSG00000124701	APOBEC2	100	85.965	Homo_sapiens
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	52.863	ENSAPOG00000019390	apobec2b	69	59.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	92.188	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	76	92.188	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	53.982	ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.162	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	54.167	ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.167	Amphilophus_citrinellus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	97	53.153	ENSAOCG00000003291	apobec2a	77	57.216	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	52.423	ENSAOCG00000023355	apobec2b	69	59.162	Amphiprion_ocellaris
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	97	53.153	ENSAPEG00000003630	apobec2a	77	57.216	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	52.423	ENSAPEG00000004591	apobec2b	69	59.162	Amphiprion_percula
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	93	57.277	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	59.669	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	59.162	ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.162	Anabas_testudineus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	93	69.585	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	93	69.953	Anas_platyrhynchos
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	59.912	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	70.556	Anolis_carolinensis
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	88.571	ENSANAG00000026993	APOBEC2	100	85.965	Aotus_nancymaae
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	59.162	ENSACLG00000007634	APOBEC2	69	59.162	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	79	51.667	ENSACLG00000026736	-	97	51.667	Astatotilapia_calliptera
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	95	57.407	ENSAMXG00000015966	apobec2b	75	57.477	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	98	50.655	ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.330	Astyanax_mexicanus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	84.286	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	72	81.579	Bos_taurus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	93	87.678	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	85.088	Callithrix_jacchus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	90.476	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	100	87.281	Canis_familiaris
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	90.952	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	100	87.719	Canis_lupus_dingo
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	86.667	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	100	83.772	Capra_hircus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	87.619	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	100	85.526	Carlito_syrichta
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	85.153	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	100	85.590	Cavia_aperea
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	85.153	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	100	85.590	Cavia_porcellus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	93	88.152	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	100	85.526	Cebus_capucinus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	91	88.942	ENSCATG00000010691	APOBEC2	100	84.649	Cercocebus_atys
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	84.716	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	100	84.716	Chinchilla_lanigera
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	89.048	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	100	86.404	Chlorocebus_sabaeus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	79	86.111	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	86.111	Choloepus_hoffmanni
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	82	74.332	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	95	71.090	Chrysemys_picta_bellii
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	88.571	ENSCANG00000035072	APOBEC2	100	85.965	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	83.772	ENSCGRG00001014983	Apobec2	100	83.772	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	83.772	ENSCGRG00000007835	Apobec2	100	83.772	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	59.162	ENSCSEG00000000690	-	69	59.162	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	53.947	ENSCSEG00000020201	apobec2a	75	58.031	Cynoglossus_semilaevis
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	55.752	ENSCVAG00000012342	apobec2b	75	58.454	Cyprinodon_variegatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	91	57.547	ENSDARG00000113992	apobec2b	77	57.547	Danio_rerio
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	85	59.585	ENSDARG00000018881	apobec2a	76	57.895	Danio_rerio
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	55.172	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	100	54.506	Dasypus_novemcinctus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	82.969	ENSDORG00000006447	Apobec2	100	82.969	Dipodomys_ordii
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	81.223	ENSETEG00000000624	APOBEC2	100	81.223	Echinops_telfairi
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	86	83.163	ENSEASG00005002937	APOBEC2	100	83.163	Equus_asinus_asinus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	84.211	ENSECAG00000006576	APOBEC2	100	84.211	Equus_caballus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	83.333	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	100	80.702	Erinaceus_europaeus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	55.208	ENSELUG00000003736	apobec2a	69	53.731	Esox_lucius
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	89.912	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	100	89.912	Felis_catus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	96	57.466	ENSFALG00000003910	APOBEC2	94	58.685	Ficedula_albicollis
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	83.406	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	100	83.406	Fukomys_damarensis
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	61.257	ENSFHEG00000005492	apobec2b	79	61.257	Fundulus_heteroclitus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	76	58.382	ENSGMOG00000007028	apobec2a	96	58.382	Gadus_morhua
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	56.021	ENSGMOG00000006819	apobec2b	76	56.021	Gadus_morhua
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	94	68.807	ENSGALG00000003226	APOBEC2	95	70.093	Gallus_gallus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	98	54.018	ENSGAFG00000007634	apobec2b	60	60.209	Gambusia_affinis
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	85	58.031	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	58.031	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	85	58.549	ENSGACG00000009663	apobec2b	83	58.549	Gasterosteus_aculeatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	82	73.797	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	70.283	Gopherus_agassizii
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	88.571	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	100	86.087	Gorilla_gorilla
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	58.549	ENSHBUG00000015890	apobec2a	75	58.549	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	54.222	ENSHBUG00000005993	apobec2b	69	59.686	Haplochromis_burtoni
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	81.140	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	100	82.533	Heterocephalus_glaber_female
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	81.140	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	100	82.533	Heterocephalus_glaber_male
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	98	56.054	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	71	60.622	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	87	54.271	ENSHCOG00000020319	apobec2a	78	54.271	Hippocampus_comes
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	91	56.132	ENSIPUG00000013784	Apobec2	78	56.132	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	53.744	ENSIPUG00000017355	apobec2a	64	52.632	Ictalurus_punctatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	83.333	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	100	83.333	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	87.143	ENSJJAG00000009733	Apobec2	100	84.649	Jaculus_jaculus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	53.778	ENSKMAG00000020631	apobec2b	69	60.526	Kryptolebias_marmoratus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	97	54.751	ENSLBEG00000009422	-	66	59.162	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	93	54.460	ENSLBEG00000025214	apobec2a	83	54.028	Labrus_bergylta
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	96	58.850	ENSLACG00000015985	APOBEC2	89	62.201	Latimeria_chalumnae
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	88	62.189	ENSLOCG00000012415	apobec2b	71	62.189	Lepisosteus_oculatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	93	86.730	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	100	83.772	Loxodonta_africana
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	89.048	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	100	86.404	Macaca_fascicularis
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	89.048	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	100	86.404	Macaca_mulatta
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	89.048	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	100	86.404	Macaca_nemestrina
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	89.048	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	100	86.404	Mandrillus_leucophaeus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	98	56.502	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	68	62.304	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	85	59.585	ENSMAMG00000023685	apobec2a	74	59.794	Mastacembelus_armatus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	58.031	ENSMZEG00005005240	-	94	54.651	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	59.162	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	69	59.162	Maylandia_zebra
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	94	68.807	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	73.481	Meleagris_gallopavo
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	83.772	ENSMAUG00000011016	Apobec2	100	83.772	Mesocricetus_auratus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	84.211	ENSMICG00000043339	APOBEC2	100	84.211	Microcebus_murinus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	85.714	ENSMOCG00000001904	Apobec2	100	82.895	Microtus_ochrogaster
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	52.889	ENSMMOG00000008681	apobec2b	76	54.808	Mola_mola
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	78.070	ENSMODG00000013090	APOBEC2	95	81.818	Monodelphis_domestica
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	58.462	ENSMALG00000013779	APOBEC2	72	58.462	Monopterus_albus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	85	57.216	ENSMALG00000020523	apobec2a	76	57.216	Monopterus_albus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	84.762	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	100	82.018	Mus_caroli
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	84.762	ENSMUSG00000040694	Apobec2	100	82.018	Mus_musculus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	85.238	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	82.456	Mus_pahari
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	93	88.152	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	100	84.120	Mustela_putorius_furo
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	93	85.308	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	100	82.174	Myotis_lucifugus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	86.667	ENSNGAG00000013717	Apobec2	100	83.772	Nannospalax_galili
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	54.222	ENSNBRG00000018806	apobec2b	66	56.522	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	59.896	ENSNBRG00000021776	apobec2a	75	59.896	Neolamprologus_brichardi
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	88.571	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	86.404	Nomascus_leucogenys
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	78.947	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	95	82.775	Notamacropus_eugenii
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	84.649	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	100	84.649	Ochotona_princeps
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	83.406	ENSODEG00000016183	APOBEC2	100	83.406	Octodon_degus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	84	60.622	ENSONIG00000004644	-	75	60.622	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	54.667	ENSONIG00000012289	apobec2b	74	57.005	Oreochromis_niloticus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	75	80.000	ENSOANG00000000824	APOBEC2	98	76.796	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	86.842	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	100	86.842	Oryctolagus_cuniculus
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