EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUMAG00000002480 (Gene tree)
Gene ID: 103666390
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_maritimus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30089 bases
Position: chrKK498615.1:2945927-2976015
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUMAP00000007980	PAZ	PF02170.22	1.1e-28	1	1
ENSUMAP00000008016	PAZ	PF02170.22	1.1e-28	1	1
ENSUMAP00000007713	PAZ	PF02170.22	1.2e-28	1	1
ENSUMAP00000007761	PAZ	PF02170.22	2.4e-28	1	1
ENSUMAP00000007984	PAZ	PF02170.22	2.5e-28	1	1
ENSUMAP00000007912	PAZ	PF02170.22	2.5e-28	1	1
ENSUMAP00000008000	PAZ	PF02170.22	2.5e-28	1	1
ENSUMAP00000008007	PAZ	PF02170.22	2.5e-28	1	1
ENSUMAP00000007921	PAZ	PF02170.22	2.5e-28	1	1
ENSUMAP00000008013	PAZ	PF02170.22	2.5e-28	1	1
ENSUMAP00000007980	Piwi	PF02171.17	4.4e-91	1	1
ENSUMAP00000007984	Piwi	PF02171.17	5.5e-91	1	1
ENSUMAP00000007912	Piwi	PF02171.17	5.6e-91	1	1
ENSUMAP00000007761	Piwi	PF02171.17	5.9e-91	1	2
ENSUMAP00000007761	Piwi	PF02171.17	5.9e-91	2	2
ENSUMAP00000008000	Piwi	PF02171.17	5.9e-91	1	2
ENSUMAP00000008000	Piwi	PF02171.17	5.9e-91	2	2
ENSUMAP00000008007	Piwi	PF02171.17	6e-91	1	2
ENSUMAP00000008007	Piwi	PF02171.17	6e-91	2	2
ENSUMAP00000008013	Piwi	PF02171.17	6.1e-91	1	2
ENSUMAP00000008013	Piwi	PF02171.17	6.1e-91	2	2
ENSUMAP00000007921	Piwi	PF02171.17	6.1e-91	1	2
ENSUMAP00000007921	Piwi	PF02171.17	6.1e-91	2	2
ENSUMAP00000007713	Piwi	PF02171.17	6.6e-91	1	2
ENSUMAP00000007713	Piwi	PF02171.17	6.6e-91	2	2
ENSUMAP00000008016	Piwi	PF02171.17	1.2e-86	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUMAT00000009594	AGO1-210	2562	-	ENSUMAP00000008016	853 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009238	AGO1-201	2610	-	ENSUMAP00000007713	869 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009297	AGO1-202	2514	-	ENSUMAP00000007761	837 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009562	AGO1-206	2517	-	ENSUMAP00000007984	838 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009491	AGO1-204	2547	-	ENSUMAP00000007921	848 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009591	AGO1-209	2547	-	ENSUMAP00000008013	848 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009482	AGO1-203	2520	-	ENSUMAP00000007912	839 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009578	AGO1-207	2529	-	ENSUMAP00000008000	842 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009558	AGO1-205	2565	-	ENSUMAP00000007980	854 (aa)	-	-
ENSUMAT00000009585	AGO1-208	2538	-	ENSUMAP00000008007	845 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	73.903	ENSUMAG00000019572	AGO2	99	75.325
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	78.136	ENSUMAG00000006297	AGO4	100	78.447

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSG00000092847	AGO1	100	96.292	Homo_sapiens
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSAPOG00000024299	ago1	100	92.191	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSAMEG00000000504	AGO1	99	96.475	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUMAG00000002480	AGO1	82	94.161	ENSACIG00000005298	ago1	98	95.000	Amphilophus_citrinellus
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSAOCG00000017727	ago1	100	92.191	Amphiprion_ocellaris
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSAPEG00000004458	ago1	99	93.270	Amphiprion_percula
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSATEG00000008523	ago1	100	92.191	Anabas_testudineus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	90.023	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.389	Anas_platyrhynchos
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	95.178	ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.164	Anolis_carolinensis
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.231	ENSANAG00000037711	AGO1	99	96.475	Aotus_nancymaae
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	91.958	ENSACLG00000000890	ago1	100	91.958	Astatotilapia_calliptera
ENSUMAG00000002480	AGO1	80	94.023	ENSAMXG00000001917	ago1	98	94.461	Astyanax_mexicanus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.108	ENSBTAG00000012253	AGO1	99	96.357	Bos_taurus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCJAG00000032023	AGO1	99	96.584	Callithrix_jacchus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCAFG00000003443	AGO1	99	96.475	Canis_familiaris
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	95.498	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	96.498	Canis_lupus_dingo
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	95.755	ENSCHIG00000011848	-	99	95.561	Capra_hircus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSTSYG00000009767	-	99	96.475	Carlito_syrichta
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	75.059	ENSTSYG00000032426	-	99	76.162	Carlito_syrichta
ENSUMAG00000002480	AGO1	89	94.503	ENSCAPG00000010228	AGO1	100	93.617	Cavia_aperea
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.916	Cavia_porcellus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCCAG00000011823	AGO1	99	96.475	Cebus_capucinus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCATG00000031521	AGO1	100	96.292	Cercocebus_atys
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.479	Chinchilla_lanigera
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCSAG00000001091	AGO1	99	96.475	Chlorocebus_sabaeus
ENSUMAG00000002480	AGO1	84	100.000	ENSCHOG00000011591	AGO1	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	95.991	ENSCPBG00000018594	AGO1	99	96.240	Chrysemys_picta_bellii
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCANG00000039798	AGO1	99	96.475	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCGRG00001022708	Ago1	99	96.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	96.580	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	91.183	ENSCSEG00000001051	ago1	99	91.569	Cynoglossus_semilaevis
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSCVAG00000018173	ago1	100	92.191	Cyprinodon_variegatus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	92.840	ENSDARG00000092644	ago1	99	92.974	Danio_rerio
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	95.305	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	96.292	Dasypus_novemcinctus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	93.020	ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	Dipodomys_ordii
ENSUMAG00000002480	AGO1	85	93.007	ENSETEG00000007626	AGO1	99	93.007	Echinops_telfairi
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSEASG00005012086	AGO1	99	96.475	Equus_asinus_asinus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSECAG00000024353	AGO1	99	96.475	Equus_caballus
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	87.548	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	87.929	Erinaceus_europaeus
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	92.513	ENSELUG00000016803	ago1	100	93.478	Esox_lucius
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	97.714	ENSFCAG00000000746	AGO1	99	98.432	Felis_catus
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	87.959	ENSFALG00000000790	AGO1	100	88.520	Ficedula_albicollis
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.108	ENSFDAG00000017210	AGO1	99	96.357	Fukomys_damarensis
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	89.020	ENSFHEG00000017927	ago1	99	90.012	Fundulus_heteroclitus
ENSUMAG00000002480	AGO1	87	80.507	ENSGMOG00000019413	ago1	100	80.908	Gadus_morhua
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.108	ENSGALG00000002249	AGO1	99	96.357	Gallus_gallus
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.308	ENSGAFG00000009775	ago1	100	92.308	Gambusia_affinis
ENSUMAG00000002480	AGO1	87	93.076	ENSGACG00000012443	ago1	100	93.475	Gasterosteus_aculeatus
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	95.178	ENSGAGG00000012893	-	100	96.164	Gopherus_agassizii
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSGGOG00000003316	AGO1	99	96.475	Gorilla_gorilla
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	91.958	ENSHBUG00000010459	ago1	100	91.958	Haplochromis_burtoni
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSHGLG00000011540	AGO1	99	96.475	Heterocephalus_glaber_female
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSHGLG00100005568	AGO1	99	96.475	Heterocephalus_glaber_male
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	92.916	ENSHCOG00000005708	ago1	99	93.270	Hippocampus_comes
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSIPUG00000023216	ago1	100	95.052	Ictalurus_punctatus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSSTOG00000010857	AGO1	99	96.475	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.108	ENSJJAG00000019449	Ago1	99	96.357	Jaculus_jaculus
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSKMAG00000019464	ago1	100	92.191	Kryptolebias_marmoratus
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.308	ENSLBEG00000007694	ago1	97	97.293	Labrus_bergylta
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	89.753	ENSLACG00000017009	AGO1	100	89.252	Latimeria_chalumnae
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	90.326	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	90.326	Lepisosteus_oculatus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.122	Loxodonta_africana
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSMFAG00000002846	AGO1	99	96.475	Macaca_fascicularis
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	91.637	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	91.815	Macaca_mulatta
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	92.807	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	96.292	Macaca_nemestrina
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSMLEG00000038388	AGO1	99	96.475	Mandrillus_leucophaeus
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSMAMG00000008381	ago1	100	92.191	Mastacembelus_armatus
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	91.958	ENSMZEG00005007996	ago1	100	91.958	Maylandia_zebra
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	90.760	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	91.121	Meleagris_gallopavo
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSMAUG00000015189	Ago1	99	96.475	Mesocricetus_auratus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.231	ENSMICG00000016147	AGO1	99	96.475	Microcebus_murinus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.108	ENSMOCG00000000537	Ago1	99	96.357	Microtus_ochrogaster
ENSUMAG00000002480	AGO1	78	94.030	ENSMMOG00000018459	ago1	93	94.478	Mola_mola
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	95.873	ENSMODG00000023335	AGO1	99	96.122	Monodelphis_domestica
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	92.798	ENSMALG00000011057	ago1	99	93.198	Monopterus_albus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	99	96.475	Mus_caroli
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSMUSG00000041530	Ago1	99	96.475	Mus_musculus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	99	96.475	Mus_pahari
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	99	96.475	Mus_spretus
ENSUMAG00000002480	AGO1	84	95.543	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	95.961	Mustela_putorius_furo
ENSUMAG00000002480	AGO1	62	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	100	99.048	Myotis_lucifugus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.108	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	95.550	Nannospalax_galili
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	92.513	ENSNBRG00000010867	ago1	100	93.478	Neolamprologus_brichardi
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSNLEG00000011181	AGO1	99	96.475	Nomascus_leucogenys
ENSUMAG00000002480	AGO1	77	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	81	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	91.185	ENSOPRG00000012325	AGO1	92	91.185	Ochotona_princeps
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSODEG00000005321	AGO1	99	96.475	Octodon_degus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	92.680	ENSONIG00000016345	ago1	100	92.479	Oreochromis_niloticus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	88.132	ENSOANG00000002080	AGO1	99	88.407	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.108	ENSOCUG00000023116	AGO1	99	96.357	Oryctolagus_cuniculus
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSORLG00000014965	ago1	100	92.191	Oryzias_latipes
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.191	ENSORLG00020018253	ago1	100	92.191	Oryzias_latipes_hni
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ENSUMAG00000002480	AGO1	84	95.007	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	95.423	Tupaia_belangeri
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ENSUMAG00000002480	AGO1	86	100.000	ENSVPAG00000006663	AGO1	92	100.000	Vicugna_pacos
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	ENSVVUG00000000405	AGO1	99	100.000	Vulpes_vulpes
ENSUMAG00000002480	AGO1	99	94.477	ENSXETG00000004364	ago1	99	94.601	Xenopus_tropicalis
ENSUMAG00000002480	AGO1	92	92.259	ENSXCOG00000007669	ago1	100	92.848	Xiphophorus_couchianus
ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.308	ENSXMAG00000021899	ago1	100	92.308	Xiphophorus_maculatus