EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSUMAG00000013108 (Gene tree)
Gene ID: 103666537
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: pre-mRNA-splicing factor SYF2
Gene Type: protein_coding
Species: Ursus_maritimus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5690 bases
Position: chrKK498615.1:11357678-11363367
Accession: 103666537
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSUMAP00000017830	SYF2	PF08231.12	7.7e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSUMAT00000021065	SYF2-201	978	-	ENSUMAP00000017830	246 (aa)	XP_008692808	UPI0004E02B79

Gene Model

Click here to download ENSUMAG00000013108's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
umr03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSUMAG00000013108's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.033	ENSG00000117614	SYF2	99	93.443	Homo_sapiens
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	82.511	ENSAPOG00000001174	syf2	91	83.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSUMAG00000013108	SYF2	79	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUMAG00000013108	SYF2	97	98.739	ENSAMEG00000010115	-	98	98.739	Ailuropoda_melanoleuca
ENSUMAG00000013108	SYF2	93	77.253	ENSACIG00000023688	syf2	86	80.930	Amphilophus_citrinellus
ENSUMAG00000013108	SYF2	83	81.553	ENSAOCG00000010912	syf2	62	82.412	Amphiprion_ocellaris
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	82.960	ENSAOCG00000022046	syf2	92	83.796	Amphiprion_ocellaris
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	82.960	ENSAPEG00000018858	syf2	83	83.796	Amphiprion_percula
ENSUMAG00000013108	SYF2	88	81.567	ENSATEG00000007745	syf2	91	81.944	Anabas_testudineus
ENSUMAG00000013108	SYF2	81	87.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.000	Anas_platyrhynchos
ENSUMAG00000013108	SYF2	83	84.804	ENSACAG00000013653	-	100	84.804	Anolis_carolinensis
ENSUMAG00000013108	SYF2	67	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	92.623	ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.623	Aotus_nancymaae
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	ENSACLG00000019916	syf2	91	81.019	Astatotilapia_calliptera
ENSUMAG00000013108	SYF2	95	77.966	ENSAMXG00000004051	syf2	91	81.944	Astyanax_mexicanus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.902	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.515	Bos_taurus
ENSUMAG00000013108	SYF2	85	50.476	WBGene00019402	syf-2	90	50.237	Caenorhabditis_elegans
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.033	ENSCJAG00000046570	SYF2	99	93.033	Callithrix_jacchus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	97.967	ENSCAFG00000012895	-	100	97.967	Canis_familiaris
ENSUMAG00000013108	SYF2	98	82.645	ENSCAFG00000030331	-	99	82.645	Canis_familiaris
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	97.967	ENSCAFG00020021091	-	100	97.967	Canis_lupus_dingo
ENSUMAG00000013108	SYF2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	83	96.154	Canis_lupus_dingo
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.089	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.089	Capra_hircus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.870	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.870	Carlito_syrichta
ENSUMAG00000013108	SYF2	80	97.475	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	Cavia_aperea
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.057	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.057	Cavia_porcellus
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.033	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	93.033	Cebus_capucinus
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	ENSCATG00000026917	SYF2	99	91.803	Cercocebus_atys
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.463	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.463	Chinchilla_lanigera
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	91.803	Chlorocebus_sabaeus
ENSUMAG00000013108	SYF2	74	77.473	ENSCHOG00000005273	-	100	77.473	Choloepus_hoffmanni
ENSUMAG00000013108	SYF2	92	88.053	ENSCPBG00000025073	SYF2	87	88.889	Chrysemys_picta_bellii
ENSUMAG00000013108	SYF2	86	52.582	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSUMAG00000013108	SYF2	86	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	79.508	ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.508	Colobus_angolensis_palliatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	89.837	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.024	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSUMAG00000013108	SYF2	80	94.388	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	93.970	Cricetulus_griseus_crigri
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	76.606	ENSCSEG00000000117	syf2	90	77.209	Cynoglossus_semilaevis
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	80.822	ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.019	Cyprinodon_variegatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	96	77.215	ENSDARG00000004706	syf2	91	81.944	Danio_rerio
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.496	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.496	Dasypus_novemcinctus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	90.650	ENSDORG00000001274	Syf2	100	90.650	Dipodomys_ordii
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	56.364	FBgn0033556	CG12343	92	57.971	Drosophila_melanogaster
ENSUMAG00000013108	SYF2	91	76.233	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.724	Echinops_telfairi
ENSUMAG00000013108	SYF2	80	60.914	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	Eptatretus_burgeri
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.496	ENSEASG00005004224	-	100	93.496	Equus_asinus_asinus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	81.707	ENSEASG00005004232	-	100	78.175	Equus_asinus_asinus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.496	ENSECAG00000012023	-	100	93.496	Equus_caballus
ENSUMAG00000013108	SYF2	96	94.492	ENSECAG00000010440	-	98	94.492	Equus_caballus
ENSUMAG00000013108	SYF2	75	81.081	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	Erinaceus_europaeus
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	84.862	ENSELUG00000003465	syf2	91	85.185	Esox_lucius
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	97.154	ENSFCAG00000043095	-	100	97.154	Felis_catus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	92.276	ENSFCAG00000010324	-	85	92.276	Felis_catus
ENSUMAG00000013108	SYF2	83	84.804	ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.259	Ficedula_albicollis
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.057	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.057	Fukomys_damarensis
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	66.818	ENSFHEG00000007238	syf2	96	66.820	Fundulus_heteroclitus
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.651	ENSGMOG00000019138	syf2	96	82.791	Gadus_morhua
ENSUMAG00000013108	SYF2	92	86.344	ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.159	Gallus_gallus
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	78.475	ENSGAFG00000019435	syf2	91	79.630	Gambusia_affinis
ENSUMAG00000013108	SYF2	87	81.860	ENSGACG00000007305	syf2	90	81.860	Gasterosteus_aculeatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	92	88.496	ENSGAGG00000010670	SYF2	87	89.352	Gopherus_agassizii
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.443	ENSGGOG00000012796	SYF2	99	93.852	Gorilla_gorilla
ENSUMAG00000013108	SYF2	96	76.371	ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.019	Haplochromis_burtoni
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	84.018	ENSHGLG00000004304	-	99	79.747	Heterocephalus_glaber_female
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.463	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.244	Heterocephalus_glaber_female
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.463	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.244	Heterocephalus_glaber_male
ENSUMAG00000013108	SYF2	98	75.720	ENSHCOG00000012904	syf2	70	82.791	Hippocampus_comes
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	81.982	ENSIPUG00000019859	syf2	91	83.333	Ictalurus_punctatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	59	95.890	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	81	95.980	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.980	Jaculus_jaculus
ENSUMAG00000013108	SYF2	95	76.923	ENSKMAG00000013856	syf2	91	81.019	Kryptolebias_marmoratus
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.735	ENSLBEG00000014425	syf2	91	82.407	Labrus_bergylta
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	85.321	ENSLACG00000012064	SYF2	91	85.648	Latimeria_chalumnae
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	76.096	ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.259	Lepisosteus_oculatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	92.683	ENSLAFG00000023150	-	100	92.683	Loxodonta_africana
ENSUMAG00000013108	SYF2	74	64.130	ENSLAFG00000030814	-	100	64.130	Loxodonta_africana
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	92.213	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	92.213	Macaca_fascicularis
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	92.213	Macaca_mulatta
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	92.213	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	92.213	Macaca_nemestrina
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	91.803	Mandrillus_leucophaeus
ENSUMAG00000013108	SYF2	88	81.106	ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.481	Mastacembelus_armatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	ENSMZEG00005006429	syf2	91	81.019	Maylandia_zebra
ENSUMAG00000013108	SYF2	81	87.437	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.437	Meleagris_gallopavo
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	89.344	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	88.525	Mesocricetus_auratus
ENSUMAG00000013108	SYF2	81	95.980	ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	Microcebus_murinus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	90.650	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	89.837	Microtus_ochrogaster
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	79.452	ENSMMOG00000002396	syf2	90	79.630	Mola_mola
ENSUMAG00000013108	SYF2	92	86.638	ENSMODG00000013951	-	95	88.235	Monodelphis_domestica
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	81.696	ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	Monopterus_albus
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	90.164	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	99	88.934	Mus_caroli
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	90.164	ENSMUSG00000028821	Syf2	99	88.934	Mus_musculus
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	90.164	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	99	88.934	Mus_pahari
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	90.164	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	99	88.934	Mus_spretus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	98.780	ENSMPUG00000015802	-	100	98.780	Mustela_putorius_furo
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.089	ENSMPUG00000015801	-	100	93.089	Mustela_putorius_furo
ENSUMAG00000013108	SYF2	95	94.850	ENSMLUG00000001885	SYF2	95	94.850	Myotis_lucifugus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	90.650	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	90.650	Nannospalax_galili
ENSUMAG00000013108	SYF2	98	68.313	ENSNBRG00000010720	syf2	91	72.770	Neolamprologus_brichardi
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.033	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.443	Nomascus_leucogenys
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	89.837	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	89.431	Ochotona_princeps
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	80.081	ENSODEG00000014338	-	99	81.435	Octodon_degus
ENSUMAG00000013108	SYF2	96	91.915	ENSODEG00000017664	-	99	88.980	Octodon_degus
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	ENSONIG00000008213	syf2	91	80.556	Oreochromis_niloticus
ENSUMAG00000013108	SYF2	82	89.109	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.109	Ornithorhynchus_anatinus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	92.683	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.089	Oryctolagus_cuniculus
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.279	ENSORLG00000028820	syf2	93	81.944	Oryzias_latipes
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.279	ENSORLG00020018333	syf2	91	81.944	Oryzias_latipes_hni
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.193	ENSORLG00015014665	syf2	91	81.944	Oryzias_latipes_hsok
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	82.192	ENSOMEG00000013911	syf2	91	82.407	Oryzias_melastigma
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.870	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	91.870	Otolemur_garnettii
ENSUMAG00000013108	SYF2	79	66.154	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.548	ENSOARG00000006348	-	100	93.548	Ovis_aries
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.443	ENSPPAG00000036579	SYF2	99	93.852	Pan_paniscus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	97.154	ENSPPRG00000001651	-	100	97.154	Panthera_pardus
ENSUMAG00000013108	SYF2	96	94.937	ENSPPRG00000001638	-	96	94.937	Panthera_pardus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	96.748	ENSPTIG00000007036	-	100	96.748	Panthera_tigris_altaica
ENSUMAG00000013108	SYF2	88	97.222	ENSPTIG00000005711	-	79	97.222	Panthera_tigris_altaica
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.443	ENSPTRG00000000352	SYF2	99	93.852	Pan_troglodytes
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	92.213	ENSPANG00000008139	SYF2	99	92.213	Papio_anubis
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	76.016	ENSPKIG00000008130	syf2	92	83.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSUMAG00000013108	SYF2	95	85.408	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	88.426	Pelodiscus_sinensis
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.279	ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.481	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	90.244	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	89.431	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSUMAG00000013108	SYF2	91	91.556	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	86.000	Phascolarctos_cinereus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	73.279	ENSPFOG00000004116	syf2	99	72.358	Poecilia_formosa
ENSUMAG00000013108	SYF2	93	77.253	ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.000	Poecilia_latipinna
ENSUMAG00000013108	SYF2	95	73.529	ENSPMEG00000011684	syf2	92	76.852	Poecilia_mexicana
ENSUMAG00000013108	SYF2	88	80.093	ENSPREG00000003009	syf2	99	74.167	Poecilia_reticulata
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.033	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.033	Pongo_abelii
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	63.821	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.415	Propithecus_coquereli
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	81.707	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.707	Pteropus_vampyrus
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	ENSPNYG00000004979	syf2	91	81.019	Pundamilia_nyererei
ENSUMAG00000013108	SYF2	96	79.747	ENSPNAG00000015570	syf2	97	79.747	Pygocentrus_nattereri
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	90.164	ENSRNOG00000060597	Syf2	99	88.934	Rattus_norvegicus
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	90.164	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.164	Rhinopithecus_bieti
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	92.213	ENSRROG00000001347	SYF2	99	92.213	Rhinopithecus_roxellana
ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.803	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSUMAG00000013108	SYF2	83	91.748	ENSSHAG00000007152	-	100	91.748	Sarcophilus_harrisii
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	84.337	ENSSHAG00000015630	-	100	84.739	Sarcophilus_harrisii
ENSUMAG00000013108	SYF2	91	81.778	ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.259	Scleropages_formosus
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	82.110	ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.407	Scophthalmus_maximus
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.651	ENSSDUG00000013072	syf2	91	81.944	Seriola_dumerili
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.651	ENSSLDG00000012677	syf2	91	81.944	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	73.171	ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.171	Sorex_araneus
ENSUMAG00000013108	SYF2	95	84.188	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	84.188	Sphenodon_punctatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.735	ENSSPAG00000009626	syf2	91	81.944	Stegastes_partitus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.902	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.902	Sus_scrofa
ENSUMAG00000013108	SYF2	61	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.000	Taeniopygia_guttata
ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	ENSTRUG00000001499	syf2	86	80.465	Takifugu_rubripes
ENSUMAG00000013108	SYF2	89	79.358	ENSTNIG00000016912	syf2	97	79.630	Tetraodon_nigroviridis
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	69.919	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.512	Tupaia_belangeri
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.902	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.902	Tursiops_truncatus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	99.593	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	99.593	Ursus_americanus
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.089	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	Vicugna_pacos
ENSUMAG00000013108	SYF2	100	97.967	ENSVVUG00000027175	-	100	97.967	Vulpes_vulpes
ENSUMAG00000013108	SYF2	97	93.724	ENSVVUG00000027181	-	96	93.724	Vulpes_vulpes
ENSUMAG00000013108	SYF2	94	82.759	ENSXETG00000022797	syf2	87	85.648	Xenopus_tropicalis
ENSUMAG00000013108	SYF2	87	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	Xiphophorus_maculatus