EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000000492 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30021 bases
Position: chrGeneScaffold_1069:408957-438977
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000000460	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.3e-28	1	2
ENSVPAP00000000460	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.3e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000000492	PAPOLG-201	2202	-	ENSVPAP00000000460	733 (aa)	-	UPI00018BDF25

Gene Model

Click here to download ENSVPAG00000000492's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSVPAG00000000492's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	56.366	ENSVPAG00000006464	PAPOLA	99	56.308

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	ENSG00000115421	PAPOLG	99	99.571	Homo_sapiens
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	68.942	ENSAPOG00000004798	papolg	99	67.030	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	93.061	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	93.061	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.182	ENSACIG00000010546	papolg	99	65.668	Amphilophus_citrinellus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	68.809	ENSAOCG00000010254	papolg	89	68.675	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	68.942	ENSAPEG00000006944	papolg	89	68.809	Amphiprion_percula
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.437	ENSATEG00000009007	papolg	79	82.164	Anabas_testudineus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	71.028	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	71.162	Anas_platyrhynchos
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	81	60.263	ENSACAG00000015048	-	100	60.263	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.837	ENSANAG00000024627	PAPOLG	99	91.837	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	66.144	ENSACLG00000015592	papolg	88	66.404	Astatotilapia_calliptera
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.786	ENSAMXG00000004611	papolg	99	69.786	Astyanax_mexicanus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	93.197	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	99	93.197	Bos_taurus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.429	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	91.429	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.753	Canis_familiaris
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.038	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	92.038	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	92.653	Capra_hircus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.837	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	99	91.837	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	52	85.039	ENSCAPG00000014901	-	100	85.039	Cavia_aperea
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.020	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	91.020	Cavia_porcellus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.565	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	91.565	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	90	98.222	ENSCATG00000044395	PAPOLG	99	98.222	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	91.293	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.565	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	99	91.565	Chlorocebus_sabaeus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	90	88.923	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	88.923	Choloepus_hoffmanni
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	68	60.000	ENSCING00000024664	-	90	60.905	Ciona_intestinalis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	66	60.619	ENSCSAVG00000009085	-	97	60.619	Ciona_savignyi
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.701	ENSCANG00000038120	PAPOLG	99	91.701	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	89.632	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	89.495	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	89.632	ENSCGRG00000005552	-	100	89.495	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	66.893	ENSCSEG00000000771	papolg	99	66.893	Cynoglossus_semilaevis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	64.605	ENSCVAG00000016602	papolg	89	80.800	Cyprinodon_variegatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	70.321	ENSDARG00000012141	papolg	99	69.652	Danio_rerio
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	89.660	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	99	89.524	Dasypus_novemcinctus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	58	93.381	ENSDORG00000016228	Papolg	99	93.381	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	70.014	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	69.959	Echinops_telfairi
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	61	64.213	ENSEBUG00000004020	papolg	94	63.797	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	65	53.347	ENSEBUG00000005042	-	79	54.292	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	93.469	ENSEASG00005002038	PAPOLG	99	93.469	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	93.333	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	93.333	Equus_caballus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	80.680	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	80.680	Erinaceus_europaeus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	69.198	ENSELUG00000014497	papolg	82	69.452	Esox_lucius
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	99	92.653	Felis_catus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	63.116	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	63.116	Ficedula_albicollis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.612	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	96	90.612	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	67	57.336	ENSFHEG00000019080	papolg	90	57.843	Fundulus_heteroclitus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	87	79.266	ENSGMOG00000018772	papolg	91	79.705	Gadus_morhua
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	68.322	ENSGALG00000007853	PAPOLG	99	68.322	Gallus_gallus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.395	ENSGAFG00000003263	papolg	88	65.390	Gambusia_affinis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	68.414	ENSGACG00000002718	papolg	99	68.850	Gasterosteus_aculeatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.565	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	99	91.565	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	66.144	ENSHBUG00000004882	papolg	89	66.317	Haplochromis_burtoni
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.612	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	90.612	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.612	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	90.612	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	67.295	ENSHCOG00000006782	papolg	88	67.160	Hippocampus_comes
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.170	ENSIPUG00000021642	papolg	100	70.107	Ictalurus_punctatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.837	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	91.837	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	58	93.144	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	93.144	Jaculus_jaculus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	67.517	ENSKMAG00000016439	papolg	95	65.574	Kryptolebias_marmoratus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.032	ENSLBEG00000023218	papolg	97	65.077	Labrus_bergylta
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.973	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.839	Latimeria_chalumnae
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	70.861	ENSLOCG00000016130	papolg	99	70.596	Lepisosteus_oculatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.340	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	92.671	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.109	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	99	92.109	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.109	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	99	92.109	Macaca_mulatta
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	83.243	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	99	83.243	Macaca_nemestrina
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.565	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	99	91.565	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	68.675	ENSMAMG00000010667	papolg	99	66.576	Mastacembelus_armatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	66.144	ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.803	Maylandia_zebra
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	68.243	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	68.243	Meleagris_gallopavo
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	89.359	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	89.222	Mesocricetus_auratus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.565	ENSMICG00000010042	PAPOLG	99	91.565	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	89.660	ENSMOCG00000006857	Papolg	99	89.524	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	68.005	ENSMMOG00000008020	papolg	99	68.139	Mola_mola
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	83.984	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	83.984	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	68.541	ENSMALG00000007012	papolg	88	68.273	Monopterus_albus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.612	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	98	93.602	Mus_caroli
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.476	ENSMUSG00000020273	Papolg	98	93.602	Mus_musculus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.340	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	90.177	Mus_pahari
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.476	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	93.602	Mus_spretus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.789	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	89	92.789	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.884	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	90.884	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	ENSNGAG00000001120	Papolg	99	91.156	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	86	86.090	ENSNBRG00000011943	papolg	91	85.660	Neolamprologus_brichardi
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	58	92.908	ENSNLEG00000009507	-	99	92.908	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	81	77.143	ENSMEUG00000013605	-	86	77.143	Notamacropus_eugenii
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	99	90.612	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	58	89.125	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	89.125	Octodon_degus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	61.943	ENSONIG00000002985	papolg	99	61.538	Oreochromis_niloticus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	82.708	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	82.708	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.381	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	99	92.381	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.828	ENSORLG00000001577	papolg	88	66.223	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	66.312	ENSORLG00020002482	papolg	88	66.533	Oryzias_latipes_hni
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.828	ENSORLG00015008836	papolg	88	66.223	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	66.892	ENSOMEG00000001406	papolg	87	66.265	Oryzias_melastigma
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	58	87.442	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	87.442	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	ENSOARG00000001563	PAPOLG	90	92.653	Ovis_aries
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	99	91.293	Pan_paniscus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	99	92.653	Panthera_pardus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	92.653	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	99	91.293	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	87.653	ENSPANG00000014543	PAPOLG	99	87.653	Papio_anubis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.624	ENSPKIG00000003313	papolg	99	69.220	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	91	69.174	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	68.584	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	75.741	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	75.741	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	89.359	ENSPEMG00000008960	-	100	89.222	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	50.329	ENSPMAG00000002961	papolg	99	50.066	Petromyzon_marinus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	67	58.896	ENSPMAG00000004864	-	96	58.896	Petromyzon_marinus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	83.715	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	83.715	Phascolarctos_cinereus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.960	ENSPFOG00000012909	papolg	99	65.918	Poecilia_formosa
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.915	ENSPLAG00000018445	papolg	88	65.873	Poecilia_latipinna
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.873	ENSPMEG00000003961	papolg	88	65.963	Poecilia_mexicana
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	78	77.018	ENSPREG00000010358	papolg	88	65.000	Poecilia_reticulata
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	91.293	Pongo_abelii
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	77.959	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	77.959	Procavia_capensis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	80.272	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	99	80.272	Propithecus_coquereli
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	89	95.699	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	95.699	Pteropus_vampyrus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	67.711	ENSPNYG00000006729	papolg	99	67.302	Pundamilia_nyererei
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	71.102	ENSPNAG00000015521	papolg	99	71.102	Pygocentrus_nattereri
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.204	ENSRNOG00000006261	Papolg	99	90.068	Rattus_norvegicus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	85.967	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	99	85.967	Rhinopithecus_bieti
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.962	ENSRROG00000035954	PAPOLG	99	91.962	Rhinopithecus_roxellana
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.565	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	91.565	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	95	83.972	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	83.972	Sarcophilus_harrisii
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	61.141	ENSSFOG00015011874	papolg	99	60.734	Scleropages_formosus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	68.011	ENSSFOG00015002383	papolg	98	67.339	Scleropages_formosus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	76	78.393	ENSSMAG00000015598	papolg	96	64.413	Scophthalmus_maximus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.128	ENSSDUG00000000912	papolg	99	66.621	Seriola_dumerili
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.128	ENSSLDG00000001217	papolg	96	68.859	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	75.951	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	98	75.951	Sphenodon_punctatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	67.145	ENSSPAG00000009004	papolg	99	66.621	Stegastes_partitus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	93.197	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	93.197	Sus_scrofa
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	74	73.063	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	100	73.063	Taeniopygia_guttata
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	68.114	ENSTRUG00000006410	papolg	99	68.114	Takifugu_rubripes
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	63.081	ENSTNIG00000017106	papolg	99	63.081	Tetraodon_nigroviridis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	83.537	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	83.537	Tupaia_belangeri
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	88.163	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	99	88.163	Tursiops_truncatus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	92.633	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	92.633	Ursus_americanus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	92.633	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	92.633	Ursus_maritimus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.925	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	92.925	Vulpes_vulpes
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	72.222	ENSXETG00000002208	papolg	98	72.222	Xenopus_tropicalis
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	68	80.561	ENSXCOG00000006611	papolg	73	80.561	Xiphophorus_couchianus
ENSVPAG00000000492	PAPOLG	74	78.000	ENSXMAG00000007383	papolg	95	78.000	Xiphophorus_maculatus