EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000001204 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 191526 bases
Position: chrGeneScaffold_362:348827-540352
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000001111	BRK	PF07533.16	8.7e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000001204	SMARCA2-201	4206	-	ENSVPAP00000001111	1402 (aa)	-	UPI00018BE33A

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.620	ENSG00000080503	SMARCA2	99	100.000	Homo_sapiens
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.554	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	94	72.372	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	84.947	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	95	91.386	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.264	ENSACIG00000015607	SMARCA2	86	77.896	Amphilophus_citrinellus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.554	ENSAOCG00000009647	-	90	73.218	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.724	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	93	73.399	Amphiprion_percula
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.691	ENSATEG00000006916	SMARCA2	84	79.653	Anabas_testudineus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	86	86.897	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	84	87.050	Anas_platyrhynchos
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	85.517	ENSACAG00000002423	SMARCA2	85	86.993	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.877	ENSANAG00000026498	SMARCA2	92	87.877	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.489	ENSACLG00000004248	SMARCA2	90	75.000	Astatotilapia_calliptera
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	74.420	ENSAMXG00000012404	smarca2	84	81.266	Astyanax_mexicanus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.942	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	91	87.942	Bos_taurus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	95.804	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	86	95.804	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.781	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	91	88.781	Canis_familiaris
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	81	86.633	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	86.210	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	89.120	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	91	89.120	Capra_hircus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.040	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	85	95.714	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	92.857	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	91	83.846	Cavia_aperea
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	99	87.956	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	91	87.956	Cavia_porcellus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	97.203	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	86	97.203	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.353	ENSCATG00000031470	SMARCA2	94	86.288	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.363	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	91	87.363	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	97	86.719	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	94	86.492	Chlorocebus_sabaeus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	90	85.913	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	82	85.913	Choloepus_hoffmanni
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	99	83.676	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	91	83.676	Chrysemys_picta_bellii
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.422	ENSCANG00000039597	SMARCA2	93	87.424	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	90.714	ENSCGRG00001002323	Smarca2	86	90.714	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.552	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	90	73.223	Cynoglossus_semilaevis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	80	77.507	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	86	76.826	Cyprinodon_variegatus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	75.365	ENSDARG00000008904	smarca2	84	80.798	Danio_rerio
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.320	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	92	86.320	Dasypus_novemcinctus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.569	ENSDORG00000014832	Smarca2	92	87.569	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	83	55.868	FBgn0000212	brm	71	55.418	Drosophila_melanogaster
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	87	59.918	ENSEBUG00000002449	-	89	60.703	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	99	64.608	ENSEBUG00000011442	-	87	69.244	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.665	ENSEASG00005010312	SMARCA2	91	87.665	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	68	90.698	ENSEEUG00000015540	-	66	90.698	Erinaceus_europaeus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	78.495	ENSELUG00000010318	smarca2	88	76.631	Esox_lucius
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.573	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	91	88.573	Felis_catus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	88.699	ENSFALG00000010416	SMARCA2	89	89.320	Ficedula_albicollis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	91.608	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	87	91.608	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	78.986	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	84	79.818	Fundulus_heteroclitus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	71.598	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	86	76.112	Gadus_morhua
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	88.276	ENSGALG00000010164	SMARCA2	93	83.827	Gallus_gallus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	72.080	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	81	95.556	Gambusia_affinis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	72.414	ENSGACG00000014488	SMARCA2	85	77.732	Gasterosteus_aculeatus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	99	82.124	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	91	82.124	Gopherus_agassizii
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	85.017	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	79	89.259	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.572	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	89	74.773	Haplochromis_burtoni
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	85.878	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	91	85.878	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.803	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	91	87.803	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	79	77.525	ENSHCOG00000015348	-	85	77.525	Hippocampus_comes
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	94	80.972	ENSIPUG00000011060	smarca2	88	78.735	Ictalurus_punctatus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.586	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	92	87.586	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.766	ENSJJAG00000010867	Smarca2	91	87.766	Jaculus_jaculus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	72.442	ENSKMAG00000015844	-	84	78.873	Kryptolebias_marmoratus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	75.921	ENSLOCG00000011499	smarca2	84	83.347	Lepisosteus_oculatus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	85.539	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	92	85.539	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.361	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	94	86.667	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.361	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	86	95.000	Macaca_mulatta
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.361	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	95	86.802	Macaca_nemestrina
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.664	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	94	86.657	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	80.066	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	89	78.182	Mastacembelus_armatus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.862	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	89	75.000	Maylandia_zebra
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	73	88.966	ENSMGAG00000005160	-	86	89.209	Meleagris_gallopavo
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.300	ENSMICG00000005162	SMARCA2	92	88.300	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.721	ENSMOCG00000001611	Smarca2	92	86.721	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	77.164	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	85	78.331	Mola_mola
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	99	76.928	ENSMODG00000003578	SMARCA2	91	76.928	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.773	ENSMALG00000009611	SMARCA2	90	74.123	Monopterus_albus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.512	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	92	86.512	Mus_caroli
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.503	ENSMUSG00000024921	Smarca2	92	86.503	Mus_musculus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.671	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	92	86.671	Mus_pahari
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.308	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	92	86.308	Mus_spretus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	84	91.326	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	90	91.326	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	88.652	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	92	80.741	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.999	ENSNGAG00000000108	Smarca2	91	86.999	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	86	70.223	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	65.174	Neolamprologus_brichardi
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.379	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	91	87.379	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	97	84.113	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	88	84.113	Notamacropus_eugenii
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	89.286	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	91	81.259	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.321	ENSODEG00000005452	SMARCA2	91	87.321	Octodon_degus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.415	ENSONIG00000014163	SMARCA2	84	80.000	Oreochromis_niloticus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	52	82.413	ENSOANG00000008299	-	95	85.580	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	85.988	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	92	85.988	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.209	ENSORLG00000020820	SMARCA2	90	75.453	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.398	ENSORLG00015006289	SMARCA2	90	74.552	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	74.338	ENSOMEG00000009736	-	89	77.992	Oryzias_melastigma
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	97	90.480	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	87	90.480	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.483	ENSOARG00000013265	SMARCA2	91	87.483	Ovis_aries
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	97	90.291	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	90	91.429	Pan_paniscus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	88.643	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	91	88.643	Panthera_pardus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	95.105	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	86	95.105	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	95.000	ENSPANG00000025121	SMARCA2	90	81.958	Papio_anubis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	99	76.676	ENSPKIG00000018469	-	87	81.780	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	99	76.137	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	91	76.137	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	87	84.894	ENSPMGG00000013696	-	83	84.894	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.488	ENSPEMG00000019821	Smarca2	92	86.488	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	94	71.383	ENSPMAG00000005337	-	87	70.467	Petromyzon_marinus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	91.724	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	91	85.144	Phascolarctos_cinereus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.137	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	90	73.411	Poecilia_formosa
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	78.991	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	85	76.179	Poecilia_latipinna
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	98	73.137	ENSPMEG00000001815	-	90	73.411	Poecilia_mexicana
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	79.322	ENSPREG00000013800	SMARCA2	83	79.239	Poecilia_reticulata
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	86.488	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	91	86.488	Pongo_abelii
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	64	99.160	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	57	99.160	Procavia_capensis
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	93	95.000	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	94	84.123	Propithecus_coquereli
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	98.473	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	91	98.473	Pteropus_vampyrus
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	94	87.535	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	88	87.535	Pundamilia_nyererei
ENSVPAG00000001204	SMARCA2	94	82.313	ENSPNAG00000014635	smarca2	83	82.265	Pygocentrus_nattereri
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ENSVPAG00000001204	SMARCA2	100	87.526	ENSRROG00000019271	SMARCA2	94	87.339	Rhinopithecus_roxellana
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