EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000001497 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 409573 bases
Position: chrGeneScaffold_1431:194948-604520
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000001380	MIF4G	PF02854.19	1.3e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000001499	-	1578	-	ENSVPAP00000001380	526 (aa)	-	UPI00018BDC47

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000001497	-	75	79.399	ENSG00000134030	CTIF	81	94.048	Homo_sapiens
ENSVPAG00000001497	-	56	63.927	ENSAPOG00000020192	ctif	53	63.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000001497	-	65	78.298	ENSAMEG00000006759	CTIF	54	78.298	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000001497	-	61	91.667	ENSACAG00000018006	CTIF	51	91.667	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000001497	-	75	79.654	ENSANAG00000024925	CTIF	68	79.654	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000001497	-	60	100.000	ENSBTAG00000018901	CTIF	55	100.000	Bos_taurus
ENSVPAG00000001497	-	75	80.519	ENSCJAG00000004729	CTIF	67	80.519	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000001497	-	72	80.087	ENSCAFG00000019076	CTIF	67	80.087	Canis_familiaris
ENSVPAG00000001497	-	72	80.087	ENSCAFG00020026482	CTIF	67	80.087	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000001497	-	75	78.879	ENSCHIG00000014455	CTIF	67	78.879	Capra_hircus
ENSVPAG00000001497	-	65	100.000	ENSCAPG00000011865	CTIF	62	100.000	Cavia_aperea
ENSVPAG00000001497	-	76	74.899	ENSCPOG00000001049	CTIF	68	74.899	Cavia_porcellus
ENSVPAG00000001497	-	75	80.952	ENSCCAG00000022758	CTIF	67	80.952	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSCATG00000038134	CTIF	58	100.000	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000001497	-	75	80.087	ENSCLAG00000008174	CTIF	67	80.087	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000001497	-	75	79.654	ENSCSAG00000018021	CTIF	67	79.654	Chlorocebus_sabaeus
ENSVPAG00000001497	-	63	91.667	ENSCPBG00000025654	CTIF	56	91.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSVPAG00000001497	-	65	100.000	ENSCANG00000030916	CTIF	58	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000001497	-	76	79.149	ENSCGRG00001020158	Ctif	67	79.149	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000001497	-	76	68.627	ENSCGRG00000000052	Ctif	69	68.627	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVPAG00000001497	-	76	77.447	ENSDORG00000003221	Ctif	67	77.447	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000001497	-	59	100.000	ENSEASG00005016094	CTIF	51	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000001497	-	75	79.221	ENSECAG00000020473	CTIF	67	79.221	Equus_caballus
ENSVPAG00000001497	-	64	75.983	ENSEEUG00000012451	CTIF	63	75.983	Erinaceus_europaeus
ENSVPAG00000001497	-	52	72.840	ENSELUG00000008733	ctif	50	72.840	Esox_lucius
ENSVPAG00000001497	-	60	100.000	ENSFCAG00000000664	CTIF	55	100.000	Felis_catus
ENSVPAG00000001497	-	59	90.000	ENSFALG00000008943	CTIF	55	90.000	Ficedula_albicollis
ENSVPAG00000001497	-	76	76.735	ENSFDAG00000017379	CTIF	68	76.735	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000001497	-	64	91.667	ENSGALG00000035912	-	55	93.333	Gallus_gallus
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSGGOG00000015204	CTIF	58	100.000	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000001497	-	75	79.654	ENSHGLG00000005663	CTIF	67	79.654	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000001497	-	75	79.654	ENSHGLG00100006976	CTIF	67	79.654	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000001497	-	72	60.829	ENSHCOG00000011784	ctif	51	61.111	Hippocampus_comes
ENSVPAG00000001497	-	75	80.087	ENSSTOG00000001967	CTIF	58	96.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVPAG00000001497	-	75	74.000	ENSJJAG00000013706	Ctif	53	89.286	Jaculus_jaculus
ENSVPAG00000001497	-	64	96.000	ENSLAFG00000016335	CTIF	73	84.103	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSMFAG00000037903	CTIF	58	100.000	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSMMUG00000020898	CTIF	58	100.000	Macaca_mulatta
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSMNEG00000039395	CTIF	58	100.000	Macaca_nemestrina
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSMLEG00000041132	CTIF	58	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000001497	-	59	91.667	ENSMGAG00000001378	CTIF	59	91.667	Meleagris_gallopavo
ENSVPAG00000001497	-	76	80.426	ENSMAUG00000000656	Ctif	67	80.426	Mesocricetus_auratus
ENSVPAG00000001497	-	75	79.221	ENSMICG00000010167	CTIF	67	80.519	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000001497	-	76	79.149	ENSMOCG00000020507	Ctif	67	79.149	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000001497	-	64	96.000	ENSMODG00000003464	CTIF	60	96.000	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000001497	-	76	73.438	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	69	72.868	Mus_caroli
ENSVPAG00000001497	-	76	70.930	ENSMUSG00000052928	Ctif	69	70.930	Mus_musculus
ENSVPAG00000001497	-	76	78.390	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	67	78.390	Mus_pahari
ENSVPAG00000001497	-	76	70.930	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	64	99.180	Mus_spretus
ENSVPAG00000001497	-	76	80.426	ENSMPUG00000000844	CTIF	67	80.426	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000001497	-	76	77.872	ENSMLUG00000003025	CTIF	67	77.872	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000001497	-	75	80.519	ENSNGAG00000011452	Ctif	67	80.519	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSNLEG00000011503	CTIF	57	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000001497	-	60	96.000	ENSMEUG00000000218	CTIF	53	96.000	Notamacropus_eugenii
ENSVPAG00000001497	-	75	76.623	ENSOPRG00000003558	CTIF	67	76.623	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000001497	-	75	74.104	ENSODEG00000018390	CTIF	68	74.104	Octodon_degus
ENSVPAG00000001497	-	73	80.374	ENSOCUG00000024842	CTIF	64	80.374	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000001497	-	60	62.651	ENSORLG00000005786	ctif	52	62.651	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000001497	-	60	61.446	ENSORLG00020005385	ctif	51	61.446	Oryzias_latipes_hni
ENSVPAG00000001497	-	60	62.651	ENSORLG00015011872	ctif	52	62.651	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000001497	-	75	80.087	ENSOGAG00000013927	CTIF	67	80.087	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000001497	-	75	80.952	ENSOARG00000003754	CTIF	67	80.952	Ovis_aries
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSPPAG00000023554	CTIF	58	100.000	Pan_paniscus
ENSVPAG00000001497	-	75	81.385	ENSPPRG00000002265	CTIF	67	81.385	Panthera_pardus
ENSVPAG00000001497	-	75	80.952	ENSPTIG00000013761	CTIF	67	80.952	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSPTRG00000010009	CTIF	58	100.000	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSPANG00000017087	CTIF	58	100.000	Papio_anubis
ENSVPAG00000001497	-	56	90.000	ENSPSIG00000006508	CTIF	52	90.000	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000001497	-	76	79.574	ENSPEMG00000022746	Ctif	67	79.574	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000001497	-	57	63.095	ENSPFOG00000009243	ctif	51	63.095	Poecilia_formosa
ENSVPAG00000001497	-	72	78.505	ENSPCOG00000013391	CTIF	53	96.000	Propithecus_coquereli
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSPVAG00000001965	CTIF	57	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSVPAG00000001497	-	76	77.447	ENSRNOG00000018342	Ctif	67	77.447	Rattus_norvegicus
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSRBIG00000043937	CTIF	57	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSRROG00000006039	CTIF	57	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSVPAG00000001497	-	60	100.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	55	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSVPAG00000001497	-	64	96.000	ENSSHAG00000016321	CTIF	60	96.000	Sarcophilus_harrisii
ENSVPAG00000001497	-	74	60.714	ENSSMAG00000005707	ctif	54	62.651	Scophthalmus_maximus
ENSVPAG00000001497	-	63	87.500	ENSSPUG00000014734	CTIF	57	87.500	Sphenodon_punctatus
ENSVPAG00000001497	-	56	64.840	ENSSPAG00000003721	ctif	51	64.840	Stegastes_partitus
ENSVPAG00000001497	-	64	100.000	ENSSSCG00000004506	CTIF	58	100.000	Sus_scrofa
ENSVPAG00000001497	-	57	87.500	ENSTGUG00000000030	CTIF	53	87.500	Taeniopygia_guttata
ENSVPAG00000001497	-	75	96.450	ENSTBEG00000002613	CTIF	67	96.450	Tupaia_belangeri
ENSVPAG00000001497	-	73	79.724	ENSTTRG00000004347	CTIF	64	79.724	Tursiops_truncatus
ENSVPAG00000001497	-	73	77.982	ENSUAMG00000007299	CTIF	56	100.000	Ursus_americanus
ENSVPAG00000001497	-	60	100.000	ENSUMAG00000002735	CTIF	55	100.000	Ursus_maritimus
ENSVPAG00000001497	-	57	100.000	ENSVVUG00000014347	CTIF	56	100.000	Vulpes_vulpes
ENSVPAG00000001497	-	60	63.095	ENSXMAG00000004236	ctif	51	61.905	Xiphophorus_maculatus