EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000002565 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28639 bases
Position: chrGeneScaffold_1092:58079-86717
Accession: 7469
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000002368	RF-1	PF00472.20	2.7e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000002565	MTRF1-201	1335	-	ENSVPAP00000002368	444 (aa)	-	UPI00018BDEAE

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSVPAG00000002565	MTRF1	73	47.706	ENSVPAG00000001191	MTRF1L	83	47.706

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.696	ENSG00000120662	MTRF1	100	87.696	Homo_sapiens
ENSVPAG00000002565	MTRF1	77	58.739	ENSAPOG00000010181	mtrf1	86	58.739	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	89.933	ENSAMEG00000008696	MTRF1	100	89.933	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000002565	MTRF1	54	66.387	ENSACIG00000001495	mtrf1	96	66.387	Amphilophus_citrinellus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	86	56.555	ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.555	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000002565	MTRF1	86	56.041	ENSAPEG00000014844	mtrf1	87	56.041	Amphiprion_percula
ENSVPAG00000002565	MTRF1	79	57.345	ENSATEG00000017403	mtrf1	84	57.345	Anabas_testudineus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	88	69.797	ENSAPLG00000009317	MTRF1	91	69.797	Anas_platyrhynchos
ENSVPAG00000002565	MTRF1	96	61.395	ENSACAG00000000897	MTRF1	95	61.395	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	89	78.697	ENSANAG00000025310	-	97	84.341	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	80.134	ENSANAG00000023063	-	100	80.134	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	56.171	ENSACLG00000023945	mtrf1	88	56.171	Astatotilapia_calliptera
ENSVPAG00000002565	MTRF1	52	66.957	ENSAMXG00000031859	mtrf1	95	66.957	Astyanax_mexicanus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	91.741	ENSBTAG00000012260	MTRF1	100	91.741	Bos_taurus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	85.682	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	89.655	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.723	ENSCAFG00000004795	MTRF1	100	87.723	Canis_familiaris
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.723	ENSCAFG00020018178	MTRF1	100	87.723	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	90.157	ENSCHIG00000011810	MTRF1	100	90.157	Capra_hircus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	85.682	ENSTSYG00000006976	MTRF1	100	85.682	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000002565	MTRF1	97	84.988	ENSCAPG00000013163	MTRF1	100	84.988	Cavia_aperea
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	84.564	ENSCPOG00000005264	MTRF1	100	84.564	Cavia_porcellus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	85.682	ENSCCAG00000035116	MTRF1	100	85.682	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.472	ENSCATG00000009909	MTRF1	100	87.472	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	84.787	ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	84.787	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.472	ENSCSAG00000017835	MTRF1	100	87.472	Chlorocebus_sabaeus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	92	78.049	ENSCHOG00000011915	-	100	78.049	Choloepus_hoffmanni
ENSVPAG00000002565	MTRF1	91	70.361	ENSCPBG00000007969	MTRF1	91	70.361	Chrysemys_picta_bellii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.025	ENSCANG00000040353	MTRF1	100	87.025	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	81.208	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	100	81.208	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	81.208	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	100	81.208	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVPAG00000002565	MTRF1	90	54.208	ENSCSEG00000005667	mtrf1	90	54.208	Cynoglossus_semilaevis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	93	52.506	ENSCVAG00000021729	mtrf1	96	52.506	Cyprinodon_variegatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	52	60.086	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	60.086	Danio_rerio
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	84.821	ENSDNOG00000034196	MTRF1	100	90.032	Dasypus_novemcinctus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	99	84.978	ENSDORG00000016429	Mtrf1	100	84.978	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	81.208	ENSETEG00000014811	MTRF1	100	81.208	Echinops_telfairi
ENSVPAG00000002565	MTRF1	53	57.021	ENSEBUG00000000778	mtrf1	96	57.021	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	90.828	ENSEASG00005015715	MTRF1	100	90.828	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	90.157	ENSECAG00000014389	MTRF1	97	90.157	Equus_caballus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	64.588	ENSEEUG00000004450	-	100	65.033	Erinaceus_europaeus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	53.927	ENSELUG00000006544	mtrf1	88	53.927	Esox_lucius
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.696	ENSFCAG00000031635	MTRF1	100	87.696	Felis_catus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	89	67.750	ENSFALG00000008036	MTRF1	99	67.750	Ficedula_albicollis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.327	ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.327	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	90	51.582	ENSFHEG00000019043	mtrf1	94	51.582	Fundulus_heteroclitus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	84	51.187	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	51.187	Gadus_morhua
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	71.795	ENSGALG00000016951	MTRF1	85	71.795	Gallus_gallus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	55.381	ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.381	Gambusia_affinis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	84	56.915	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	56.915	Gasterosteus_aculeatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	70	75.962	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	75.962	Gopherus_agassizii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.248	ENSGGOG00000002529	MTRF1	100	87.248	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	84.116	ENSHGLG00000003210	MTRF1	100	84.116	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	84.340	ENSHGLG00100011843	MTRF1	100	84.340	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	54.124	ENSHCOG00000009449	mtrf1	88	54.124	Hippocampus_comes
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	85.459	ENSSTOG00000021682	MTRF1	100	85.459	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.998	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	100	82.998	Jaculus_jaculus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	86	55.699	ENSKMAG00000003231	mtrf1	85	55.699	Kryptolebias_marmoratus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	52	66.234	ENSLBEG00000023151	mtrf1	92	66.234	Labrus_bergylta
ENSVPAG00000002565	MTRF1	52	66.234	ENSLBEG00000027169	-	92	66.234	Labrus_bergylta
ENSVPAG00000002565	MTRF1	98	60.360	ENSLACG00000010582	MTRF1	99	60.899	Latimeria_chalumnae
ENSVPAG00000002565	MTRF1	98	54.054	ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	54.054	Lepisosteus_oculatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	99	70.682	ENSLAFG00000030499	-	99	70.682	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	84.116	ENSLAFG00000022177	-	100	84.116	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.472	ENSMFAG00000037972	MTRF1	100	87.472	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.696	ENSMNEG00000035487	MTRF1	100	87.696	Macaca_nemestrina
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.472	ENSMLEG00000033582	MTRF1	100	87.472	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	83	57.909	ENSMAMG00000022048	mtrf1	83	57.909	Mastacembelus_armatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	56.171	ENSMZEG00005017922	mtrf1	88	56.171	Maylandia_zebra
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	71.208	ENSMGAG00000014971	MTRF1	93	71.208	Meleagris_gallopavo
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.550	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	100	82.550	Mesocricetus_auratus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	88.367	ENSMICG00000033131	MTRF1	100	88.367	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	80.313	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	100	80.313	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000002565	MTRF1	51	59.389	ENSMMOG00000013394	mtrf1	93	59.389	Mola_mola
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	72.284	ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.284	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	55.352	ENSMALG00000013274	mtrf1	87	55.352	Monopterus_albus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	80.537	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	99	80.537	Mus_caroli
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.550	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	100	82.550	Mus_musculus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.327	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	100	82.327	Mus_pahari
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.103	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	100	82.103	Mus_spretus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	99	86.966	ENSMPUG00000001874	MTRF1	99	86.966	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	88.367	ENSMLUG00000017237	MTRF1	100	88.367	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	84.564	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	100	84.564	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000002565	MTRF1	51	67.105	ENSNBRG00000004634	mtrf1	96	67.105	Neolamprologus_brichardi
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.696	ENSNLEG00000001236	MTRF1	100	87.696	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	67.111	ENSMEUG00000001846	MTRF1	100	67.111	Notamacropus_eugenii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	61	92.308	ENSOPRG00000006450	-	82	92.308	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.550	ENSODEG00000005782	MTRF1	100	82.550	Octodon_degus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	56.410	ENSONIG00000012476	mtrf1	100	56.410	Oreochromis_niloticus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	70	72.152	ENSOANG00000003383	-	100	72.152	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.025	ENSOCUG00000025207	MTRF1	100	87.025	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	56.136	ENSORLG00000003225	mtrf1	87	56.136	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	56.136	ENSORLG00020021048	mtrf1	86	56.136	Oryzias_latipes_hni
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	56.136	ENSORLG00015020957	mtrf1	87	56.136	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	57.218	ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.218	Oryzias_melastigma
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	80.313	ENSOGAG00000009719	-	100	80.313	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	73	77.160	ENSOGAG00000026411	-	100	77.160	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	90.157	ENSOARG00000006994	MTRF1	100	90.157	Ovis_aries
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.696	ENSPPAG00000000050	MTRF1	100	87.696	Pan_paniscus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	88.143	ENSPPRG00000009511	MTRF1	100	88.143	Panthera_pardus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	88.367	ENSPTIG00000006673	MTRF1	100	88.367	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.696	ENSPTRG00000005815	MTRF1	100	87.696	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.696	ENSPANG00000010809	MTRF1	100	87.696	Papio_anubis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	53.947	ENSPKIG00000015711	mtrf1	89	53.947	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	71.722	ENSPSIG00000004773	MTRF1	86	71.722	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	53	67.234	ENSPMGG00000006724	mtrf1	95	67.234	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	83.259	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	100	83.259	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	76	51.873	ENSPMAG00000009849	mtrf1	98	52.326	Petromyzon_marinus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	72.222	ENSPCIG00000012940	MTRF1	100	72.222	Phascolarctos_cinereus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	54.856	ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	54.856	Poecilia_formosa
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	55.118	ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.118	Poecilia_latipinna
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	54.856	ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.856	Poecilia_mexicana
ENSVPAG00000002565	MTRF1	52	62.069	ENSPREG00000018619	mtrf1	95	62.069	Poecilia_reticulata
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	86.130	ENSPPYG00000005313	MTRF1	100	86.130	Pongo_abelii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	89.038	ENSPCOG00000018133	MTRF1	100	89.038	Propithecus_coquereli
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	88.143	ENSPVAG00000008573	MTRF1	100	88.143	Pteropus_vampyrus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	54	66.807	ENSPNYG00000004357	mtrf1	96	66.807	Pundamilia_nyererei
ENSVPAG00000002565	MTRF1	96	50.115	ENSPNAG00000010682	mtrf1	98	50.115	Pygocentrus_nattereri
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	81.696	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	92.920	Rattus_norvegicus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.025	ENSRBIG00000007069	MTRF1	100	87.025	Rhinopithecus_bieti
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	87.025	ENSRROG00000035345	MTRF1	100	87.025	Rhinopithecus_roxellana
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	88.391	ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.391	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	92	74.453	ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	74.453	Sarcophilus_harrisii
ENSVPAG00000002565	MTRF1	86	55.844	ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	55.844	Scleropages_formosus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	56.510	ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.510	Scophthalmus_maximus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	56.777	ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.777	Seriola_dumerili
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	57.033	ENSSLDG00000013584	mtrf1	76	57.033	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.998	ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.998	Sorex_araneus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	53	75.214	ENSSPUG00000007354	MTRF1	96	75.214	Sphenodon_punctatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	86	55.814	ENSSPAG00000000881	mtrf1	87	55.814	Stegastes_partitus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	89.709	ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	89.709	Sus_scrofa
ENSVPAG00000002565	MTRF1	87	69.231	ENSTGUG00000012422	MTRF1	93	69.231	Taeniopygia_guttata
ENSVPAG00000002565	MTRF1	89	55.473	ENSTRUG00000000396	mtrf1	89	55.473	Takifugu_rubripes
ENSVPAG00000002565	MTRF1	82	57.568	ENSTNIG00000017149	-	98	57.256	Tetraodon_nigroviridis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	53	77.500	ENSTBEG00000004696	-	100	77.500	Tupaia_belangeri
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	91.946	ENSTTRG00000010370	MTRF1	100	91.946	Tursiops_truncatus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	90.380	ENSUMAG00000014772	MTRF1	100	90.380	Ursus_maritimus
ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	88.170	ENSVVUG00000028755	MTRF1	100	88.170	Vulpes_vulpes
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	67.192	ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.192	Xenopus_tropicalis
ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	53.543	ENSXMAG00000009853	mtrf1	86	53.543	Xiphophorus_maculatus