EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000005425 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PRPF3
Alias: Prp3|RP18|SNRNP90|hPrp3
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14882 bases
Position: chrGeneScaffold_2986:314777-329658
Accession: 17348
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000005039	PRP3	PF08572.10	8.2e-80	1	1
ENSVPAP00000005039	PWI	PF01480.17	1.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000005424	PRPF3-201	2049	-	ENSVPAP00000005039	682 (aa)	-	UPI00018BDFA4

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSG00000117360	PRPF3	89	100.000	Homo_sapiens
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	78.005	ENSAPOG00000015584	prpf3	87	78.231	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSAMEG00000001630	PRPF3	89	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.500	ENSACIG00000007876	prpf3	87	76.591	Amphilophus_citrinellus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.551	ENSAOCG00000011449	prpf3	87	77.778	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.871	ENSATEG00000023583	prpf3	87	77.098	Anabas_testudineus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	97.024	ENSAPLG00000002440	PRPF3	89	97.024	Anas_platyrhynchos
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	95.122	ENSACAG00000003176	PRPF3	89	94.643	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSANAG00000026138	PRPF3	92	100.000	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.471	ENSACLG00000020127	prpf3	88	76.697	Astatotilapia_calliptera
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	79.138	ENSAMXG00000007306	prpf3	86	79.138	Astyanax_mexicanus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSBTAG00000013946	PRPF3	89	100.000	Bos_taurus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	57	47.315	WBGene00010844	prp-3	62	47.059	Caenorhabditis_elegans
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSCJAG00000009926	PRPF3	92	100.000	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSCAFG00000011820	PRPF3	89	100.000	Canis_familiaris
ENSVPAG00000005425	PRPF3	69	100.000	ENSCAFG00020019653	PRPF3	86	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSCHIG00000015434	PRPF3	89	100.000	Capra_hircus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.405	ENSTSYG00000001383	PRPF3	89	99.405	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000005425	PRPF3	78	91.591	ENSCAPG00000017812	PRPF3	84	92.273	Cavia_aperea
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.773	ENSCPOG00000008068	PRPF3	89	99.773	Cavia_porcellus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSCCAG00000026380	PRPF3	89	100.000	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	88	99.405	ENSCATG00000041778	PRPF3	89	99.405	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSCLAG00000015009	PRPF3	89	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000005425	PRPF3	66	100.000	ENSCHOG00000011645	PRPF3	66	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	97.024	ENSCPBG00000008216	PRPF3	89	97.024	Chrysemys_picta_bellii
ENSVPAG00000005425	PRPF3	61	59.189	ENSCING00000003312	-	99	58.711	Ciona_intestinalis
ENSVPAG00000005425	PRPF3	64	59.318	ENSCSAVG00000008720	-	76	59.318	Ciona_savignyi
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSCANG00000036769	PRPF3	89	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSCGRG00001019100	Prpf3	89	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSCGRG00000007322	Prpf3	89	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	78.005	ENSCSEG00000002532	prpf3	87	77.273	Cynoglossus_semilaevis
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.551	ENSCVAG00000009318	prpf3	88	77.778	Cyprinodon_variegatus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.778	ENSDARG00000086425	prpf3	100	66.667	Danio_rerio
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.318	ENSDNOG00000005904	PRPF3	88	99.318	Dasypus_novemcinctus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	82	100.000	ENSDORG00000008664	Prpf3	88	100.000	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000005425	PRPF3	63	58.371	FBgn0036915	Prp3	82	58.333	Drosophila_melanogaster
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.405	ENSETEG00000019124	PRPF3	89	99.405	Echinops_telfairi
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	71.591	ENSEBUG00000011680	prpf3	84	71.591	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSEASG00005001566	PRPF3	89	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSECAG00000019840	PRPF3	89	100.000	Equus_caballus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	85	99.291	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	99.291	Erinaceus_europaeus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	88	69.512	ENSELUG00000013624	prpf3	86	67.836	Esox_lucius
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSFCAG00000013940	PRPF3	89	100.000	Felis_catus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSFDAG00000010365	PRPF3	89	100.000	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.098	ENSFHEG00000021746	prpf3	88	77.324	Fundulus_heteroclitus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.324	ENSGMOG00000008535	prpf3	87	76.644	Gadus_morhua
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	96.429	ENSGALG00000028205	PRPF3	89	96.429	Gallus_gallus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.098	ENSGAFG00000012671	prpf3	88	77.324	Gambusia_affinis
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.644	ENSGACG00000011792	prpf3	87	76.871	Gasterosteus_aculeatus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	97.024	ENSGAGG00000013765	PRPF3	87	97.024	Gopherus_agassizii
ENSVPAG00000005425	PRPF3	74	100.000	ENSGGOG00000013174	PRPF3	87	100.000	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.923	ENSHBUG00000003493	prpf3	88	76.871	Haplochromis_burtoni
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSHGLG00000016569	PRPF3	89	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	72.727	ENSHGLG00000016033	-	86	73.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	73.182	ENSHGLG00100008951	-	86	73.182	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSHGLG00100007590	PRPF3	89	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	75.737	ENSHCOG00000014058	prpf3	88	75.964	Hippocampus_comes
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	80.090	ENSIPUG00000000902	PRPF3	90	78.842	Ictalurus_punctatus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSSTOG00000001889	PRPF3	89	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	88	76.417	ENSKMAG00000001390	prpf3	88	75.510	Kryptolebias_marmoratus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.697	ENSLBEG00000026310	prpf3	88	77.149	Labrus_bergylta
ENSVPAG00000005425	PRPF3	82	86.982	ENSLACG00000010541	PRPF3	88	86.391	Latimeria_chalumnae
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSLAFG00000004713	PRPF3	89	100.000	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSMFAG00000039791	PRPF3	89	100.000	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000005425	PRPF3	79	100.000	ENSMMUG00000016301	PRPF3	86	100.000	Macaca_mulatta
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSMNEG00000038161	PRPF3	89	100.000	Macaca_nemestrina
ENSVPAG00000005425	PRPF3	88	67.879	ENSMLEG00000041065	-	84	66.061	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	74	100.000	ENSMLEG00000040609	PRPF3	87	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.551	ENSMAMG00000014968	prpf3	87	76.871	Mastacembelus_armatus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.644	ENSMZEG00005015970	prpf3	89	76.471	Maylandia_zebra
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	96.429	ENSMGAG00000000707	PRPF3	89	96.429	Meleagris_gallopavo
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSMAUG00000017112	Prpf3	89	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.773	ENSMICG00000015386	PRPF3	89	99.773	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSMOCG00000000242	Prpf3	89	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	70.270	ENSMMOG00000016131	prpf3	87	70.179	Mola_mola
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSMODG00000018774	PRPF3	89	100.000	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	75.909	ENSMALG00000007257	prpf3	88	75.455	Monopterus_albus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.545	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	92	100.000	Mus_caroli
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.545	ENSMUSG00000015748	Prpf3	92	100.000	Mus_musculus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.545	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	92	100.000	Mus_pahari
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.545	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	92	100.000	Mus_spretus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSMPUG00000005080	PRPF3	89	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.318	ENSMLUG00000004646	-	89	99.318	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSNGAG00000000910	Prpf3	89	100.000	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.697	ENSNBRG00000003462	prpf3	86	76.644	Neolamprologus_brichardi
ENSVPAG00000005425	PRPF3	79	100.000	ENSNLEG00000009841	PRPF3	88	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000005425	PRPF3	72	100.000	ENSMEUG00000008733	PRPF3	77	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSOPRG00000010139	PRPF3	89	100.000	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	75.901	ENSODEG00000014412	-	89	75.901	Octodon_degus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.401	ENSODEG00000011363	-	89	99.401	Octodon_degus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.871	ENSONIG00000006394	prpf3	87	77.098	Oreochromis_niloticus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	71.789	ENSOANG00000015441	PRPF3	88	71.789	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSOCUG00000011760	PRPF3	89	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.098	ENSORLG00000010330	prpf3	88	76.417	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.098	ENSORLG00020009054	prpf3	88	76.417	Oryzias_latipes_hni
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	76.975	ENSORLG00015015016	prpf3	88	76.298	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	75.964	ENSOMEG00000000940	prpf3	88	76.190	Oryzias_melastigma
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	99.405	ENSOGAG00000005352	PRPF3	89	99.405	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSOARG00000020798	PRPF3	89	100.000	Ovis_aries
ENSVPAG00000005425	PRPF3	88	79.724	ENSPPAG00000043769	-	87	79.263	Pan_paniscus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSPPAG00000030983	PRPF3	89	100.000	Pan_paniscus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSPPRG00000000731	PRPF3	89	100.000	Panthera_pardus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSPTIG00000005516	PRPF3	89	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000005425	PRPF3	88	78.111	ENSPTRG00000047819	-	87	77.650	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSPTRG00000001254	PRPF3	89	100.000	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSPANG00000000499	PRPF3	89	100.000	Papio_anubis
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	80.135	ENSPKIG00000010501	prpf3	89	80.135	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	97.024	ENSPSIG00000014877	PRPF3	89	97.024	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	75.455	ENSPMGG00000007776	prpf3	87	75.682	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSPEMG00000011672	Prpf3	89	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000005425	PRPF3	63	72.146	ENSPMAG00000005588	prpf3	97	70.843	Petromyzon_marinus
ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	100.000	ENSPCIG00000008795	PRPF3	89	100.000	Phascolarctos_cinereus
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