EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000005705 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5939 bases
Position: chrGeneScaffold_1027:191068-197006
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000005301	SYF2	PF08231.12	1.6e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000005705	SYF2-201	735	-	ENSVPAP00000005301	244 (aa)	-	UPI00018BD663

Gene Model

Click here to download ENSVPAG00000005705's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSVPAG00000005705's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.213	ENSG00000117614	SYF2	100	92.623	Homo_sapiens
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	83.333	ENSAPOG00000001174	syf2	98	80.769	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	92.149	ENSAMEG00000010115	-	99	92.149	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000005705	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	75.502	ENSACIG00000023688	syf2	99	75.502	Amphilophus_citrinellus
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	79.668	ENSAOCG00000022046	syf2	94	83.784	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000005705	SYF2	92	78.125	ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.125	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	79.668	ENSAPEG00000018858	syf2	92	79.668	Amphiprion_percula
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	82.488	ENSATEG00000007745	syf2	98	79.060	Anabas_testudineus
ENSVPAG00000005705	SYF2	82	88.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSVPAG00000005705	SYF2	68	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000005705	SYF2	84	84.804	ENSACAG00000013653	-	100	84.804	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.033	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.180	ENSACLG00000019916	syf2	99	76.349	Astatotilapia_calliptera
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	76.230	ENSAMXG00000004051	syf2	100	76.230	Astyanax_mexicanus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	94.694	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	95.763	Bos_taurus
ENSVPAG00000005705	SYF2	85	50.952	WBGene00019402	syf-2	99	47.210	Caenorhabditis_elegans
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.033	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	81.967	ENSCAFG00000030331	-	100	81.967	Canis_familiaris
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	ENSCAFG00000012895	-	100	93.089	Canis_familiaris
ENSVPAG00000005705	SYF2	74	87.363	ENSCAFG00020021094	-	83	95.513	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	ENSCAFG00020021091	-	100	93.089	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	94.262	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	95.378	Capra_hircus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.803	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000005705	SYF2	81	96.465	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.465	Cavia_aperea
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.164	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.164	Cavia_porcellus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.033	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.443	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	ENSCATG00000026917	SYF2	100	91.393	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.245	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.245	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.393	Chlorocebus_sabaeus
ENSVPAG00000005705	SYF2	74	77.348	ENSCHOG00000005273	-	100	77.348	Choloepus_hoffmanni
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	88.288	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	86.522	Chrysemys_picta_bellii
ENSVPAG00000005705	SYF2	86	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.991	Ciona_intestinalis
ENSVPAG00000005705	SYF2	86	52.113	ENSCSAVG00000006627	-	97	52.113	Ciona_savignyi
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	79.098	ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.098	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.984	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.984	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000005705	SYF2	80	94.388	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	93.970	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	77.523	ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.311	Cynoglossus_semilaevis
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.995	ENSCVAG00000019543	syf2	99	76.349	Cyprinodon_variegatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	81.982	ENSDARG00000004706	syf2	93	81.982	Danio_rerio
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.061	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.061	Dasypus_novemcinctus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	89.754	ENSDORG00000001274	Syf2	100	89.754	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000005705	SYF2	92	55.310	FBgn0033556	CG12343	100	55.310	Drosophila_melanogaster
ENSVPAG00000005705	SYF2	94	76.957	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.826	Echinops_telfairi
ENSVPAG00000005705	SYF2	81	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.653	ENSEASG00005004224	-	100	92.653	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	81.967	ENSEASG00005004232	-	100	81.967	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.878	ENSECAG00000012023	-	100	93.878	Equus_caballus
ENSVPAG00000005705	SYF2	98	93.305	ENSECAG00000010440	-	100	93.305	Equus_caballus
ENSVPAG00000005705	SYF2	75	80.328	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	Erinaceus_europaeus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	78.776	ENSELUG00000003465	syf2	99	78.776	Esox_lucius
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.245	ENSFCAG00000010324	-	85	92.245	Felis_catus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000043095	-	100	93.089	Felis_catus
ENSVPAG00000005705	SYF2	84	85.784	ENSFALG00000000460	SYF2	99	79.508	Ficedula_albicollis
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.623	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	66.368	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.368	Fundulus_heteroclitus
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	82.569	ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	Gadus_morhua
ENSVPAG00000005705	SYF2	93	87.225	ENSGALG00000013639	SYF2	95	84.167	Gallus_gallus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	73.361	ENSGAFG00000019435	syf2	100	73.361	Gambusia_affinis
ENSVPAG00000005705	SYF2	88	83.721	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	Gasterosteus_aculeatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	88.739	ENSGAGG00000010670	SYF2	99	82.661	Gopherus_agassizii
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	93.033	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000005705	SYF2	93	78.448	ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.448	Haplochromis_burtoni
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.653	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	83.333	ENSHGLG00000004304	-	100	76.639	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.653	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000005705	SYF2	98	77.178	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	Hippocampus_comes
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	83.408	ENSIPUG00000019859	syf2	94	83.408	Ictalurus_punctatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	60	95.205	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.205	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	82	95.980	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.980	Jaculus_jaculus
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.631	ENSKMAG00000013856	syf2	94	80.631	Kryptolebias_marmoratus
ENSVPAG00000005705	SYF2	90	82.648	ENSLBEG00000014425	syf2	99	77.178	Labrus_bergylta
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	85.321	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.321	Latimeria_chalumnae
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	83.784	ENSLOCG00000002728	syf2	88	83.784	Lepisosteus_oculatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	75	64.674	ENSLAFG00000030814	-	100	64.674	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.245	ENSLAFG00000023150	-	100	92.245	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	91.803	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.803	Macaca_mulatta
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	91.803	Macaca_nemestrina
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.393	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	81.106	ENSMAMG00000010403	syf2	92	80.180	Mastacembelus_armatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	76.349	ENSMZEG00005006429	syf2	99	76.349	Maylandia_zebra
ENSVPAG00000005705	SYF2	82	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.164	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.164	Mesocricetus_auratus
ENSVPAG00000005705	SYF2	82	95.980	ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.393	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000005705	SYF2	96	76.496	ENSMMOG00000002396	syf2	96	76.496	Mola_mola
ENSVPAG00000005705	SYF2	93	86.026	ENSMODG00000013951	-	100	86.026	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	75.918	ENSMALG00000010706	syf2	100	76.327	Monopterus_albus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.393	Mus_caroli
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.393	Mus_musculus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.393	Mus_pahari
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.393	Mus_spretus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.902	ENSMPUG00000015802	-	100	93.902	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000005705	SYF2	98	92.469	ENSMPUG00000015801	-	97	92.469	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000005705	SYF2	98	90.833	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	90.833	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.463	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.463	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	69.512	ENSNBRG00000010720	syf2	99	69.512	Neolamprologus_brichardi
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.033	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.164	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.164	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	81.818	ENSODEG00000014338	-	99	82.773	Octodon_degus
ENSVPAG00000005705	SYF2	96	93.590	ENSODEG00000017664	-	99	90.456	Octodon_degus
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.180	ENSONIG00000008213	syf2	99	76.349	Oreochromis_niloticus
ENSVPAG00000005705	SYF2	83	89.109	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.109	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.061	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.061	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	81.614	ENSORLG00000028820	syf2	96	81.614	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	81.614	ENSORLG00020018333	syf2	94	81.614	Oryzias_latipes_hni
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	76.763	ENSORLG00015014665	syf2	96	76.763	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000005705	SYF2	96	78.298	ENSOMEG00000013911	syf2	99	78.298	Oryzias_melastigma
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.061	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.061	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	94.737	ENSOARG00000006348	-	100	94.737	Ovis_aries
ENSVPAG00000005705	SYF2	80	66.154	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	93.033	Pan_paniscus
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	92.213	ENSPPRG00000001638	-	99	92.213	Panthera_pardus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001651	-	100	93.089	Panthera_pardus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	97.248	ENSPTIG00000005711	-	80	97.248	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	93.033	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	ENSPANG00000008139	SYF2	100	91.803	Papio_anubis
ENSVPAG00000005705	SYF2	92	81.778	ENSPKIG00000008130	syf2	96	81.778	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVPAG00000005705	SYF2	96	84.255	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.255	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	81.448	ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.448	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.393	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	92.793	ENSPCIG00000014235	SYF2	98	86.992	Phascolarctos_cinereus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	74.180	ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.180	Poecilia_formosa
ENSVPAG00000005705	SYF2	97	76.371	ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.371	Poecilia_latipinna
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	72.614	ENSPMEG00000011684	syf2	99	72.614	Poecilia_mexicana
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	80.556	ENSPREG00000003009	syf2	99	74.689	Poecilia_reticulata
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.033	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.033	Pongo_abelii
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	63.115	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.705	Propithecus_coquereli
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	80.816	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.816	Pteropus_vampyrus
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.180	ENSPNYG00000004979	syf2	99	76.349	Pundamilia_nyererei
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	79.098	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.098	Pygocentrus_nattereri
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.393	Rattus_norvegicus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.164	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.164	Rhinopithecus_bieti
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.803	Rhinopithecus_roxellana
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.213	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSVPAG00000005705	SYF2	93	90.308	ENSSHAG00000015630	-	91	90.308	Sarcophilus_harrisii
ENSVPAG00000005705	SYF2	84	91.748	ENSSHAG00000007152	-	100	91.748	Sarcophilus_harrisii
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	83.945	ENSSFOG00015023647	syf2	92	83.945	Scleropages_formosus
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	76.763	ENSSMAG00000009867	syf2	99	76.763	Scophthalmus_maximus
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	82.569	ENSSDUG00000013072	syf2	92	82.569	Seriola_dumerili
ENSVPAG00000005705	SYF2	89	82.569	ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.569	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	74.180	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.180	Sorex_araneus
ENSVPAG00000005705	SYF2	99	80.992	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	80.992	Sphenodon_punctatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	76.230	ENSSPAG00000009626	syf2	100	76.230	Stegastes_partitus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	94.694	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	94.694	Sus_scrofa
ENSVPAG00000005705	SYF2	61	60.265	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	60.234	Taeniopygia_guttata
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	79.730	ENSTRUG00000001499	syf2	89	79.730	Takifugu_rubripes
ENSVPAG00000005705	SYF2	91	78.829	ENSTNIG00000016912	syf2	99	78.829	Tetraodon_nigroviridis
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	71.311	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.902	Tupaia_belangeri
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	95.492	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	95.492	Tursiops_truncatus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.683	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	92.683	Ursus_americanus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.089	Ursus_maritimus
ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	ENSVVUG00000027175	-	100	93.089	Vulpes_vulpes
ENSVPAG00000005705	SYF2	84	96.098	ENSVVUG00000027181	-	100	88.306	Vulpes_vulpes
ENSVPAG00000005705	SYF2	93	83.186	ENSXETG00000022797	syf2	91	83.186	Xenopus_tropicalis
ENSVPAG00000005705	SYF2	88	80.465	ENSXMAG00000022698	syf2	93	78.378	Xiphophorus_maculatus