EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000006663 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31533 bases
Position: chrGeneScaffold_1460:93123-124655
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000006189	PAZ	PF02170.22	5e-29	1	1
ENSVPAP00000006189	Piwi	PF02171.17	8.4e-108	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000006663	AGO1-201	2451	-	ENSVPAP00000006189	817 (aa)	-	UPI00018BCE77

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	77.601	ENSVPAG00000007631	AGO3	95	77.601
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	83.516	ENSVPAG00000006662	AGO4	95	83.516

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSG00000092847	AGO1	91	98.743	Homo_sapiens
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSAPOG00000024299	ago1	91	97.579	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSAMEG00000000504	AGO1	95	92.289	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000006663	AGO1	82	91.356	ENSACIG00000005298	ago1	93	91.356	Amphilophus_citrinellus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSAOCG00000017727	ago1	95	89.828	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSAPEG00000004458	ago1	96	89.828	Amphiprion_percula
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSATEG00000008523	ago1	95	89.828	Anabas_testudineus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	85.871	ENSAPLG00000010440	AGO1	94	85.871	Anas_platyrhynchos
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	98.603	ENSACAG00000029174	AGO1	91	98.603	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSANAG00000037711	AGO1	95	92.289	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.583	ENSACLG00000000890	ago1	95	89.583	Astatotilapia_calliptera
ENSVPAG00000006663	AGO1	80	98.168	ENSAMXG00000001917	ago1	92	98.168	Astyanax_mexicanus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	ENSBTAG00000012253	AGO1	95	92.166	Bos_taurus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCJAG00000032023	AGO1	95	92.289	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCAFG00000003443	AGO1	95	92.289	Canis_familiaris
ENSVPAG00000006663	AGO1	92	100.000	ENSCAFG00020009251	AGO1	90	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	91.799	ENSCHIG00000011848	-	95	91.363	Capra_hircus
ENSVPAG00000006663	AGO1	97	74.497	ENSTSYG00000032426	-	94	80.670	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSTSYG00000009767	-	95	92.289	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000006663	AGO1	76	100.000	ENSCAPG00000010228	AGO1	85	100.000	Cavia_aperea
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCPOG00000011568	AGO1	95	92.289	Cavia_porcellus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCCAG00000011823	AGO1	95	92.289	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCATG00000031521	AGO1	91	98.743	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCLAG00000011507	AGO1	95	92.289	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCSAG00000001091	AGO1	95	92.289	Chlorocebus_sabaeus
ENSVPAG00000006663	AGO1	85	92.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	82	92.473	Choloepus_hoffmanni
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.044	ENSCPBG00000018594	AGO1	95	92.044	Chrysemys_picta_bellii
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCANG00000039798	AGO1	95	92.289	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCGRG00001022708	Ago1	95	92.289	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSCGRG00000010386	Ago1	96	92.289	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	87.966	ENSCSEG00000001051	ago1	96	87.966	Cynoglossus_semilaevis
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSCVAG00000018173	ago1	95	89.828	Cyprinodon_variegatus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	90.196	ENSDARG00000092644	ago1	95	90.196	Danio_rerio
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	98.743	ENSDNOG00000008077	AGO1	91	98.743	Dasypus_novemcinctus
ENSVPAG00000006663	AGO1	90	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	94	100.000	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000006663	AGO1	81	100.000	ENSETEG00000007626	AGO1	92	100.000	Echinops_telfairi
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSEASG00005012086	AGO1	95	92.289	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSECAG00000024353	AGO1	95	92.289	Equus_caballus
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	89.525	ENSEEUG00000005349	AGO1	83	89.525	Erinaceus_europaeus
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	96.788	ENSELUG00000016803	ago1	91	96.788	Esox_lucius
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSFCAG00000000746	AGO1	95	92.289	Felis_catus
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	92.201	ENSFALG00000000790	AGO1	91	92.201	Ficedula_albicollis
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	ENSFDAG00000017210	AGO1	95	92.166	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000006663	AGO1	93	96.927	ENSFHEG00000017927	ago1	91	96.927	Fundulus_heteroclitus
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	83.403	ENSGMOG00000019413	ago1	95	83.403	Gadus_morhua
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	ENSGALG00000002249	AGO1	95	92.166	Gallus_gallus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.951	ENSGAFG00000009775	ago1	95	89.951	Gambusia_affinis
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	96.662	ENSGACG00000012443	ago1	95	96.662	Gasterosteus_aculeatus
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	98.603	ENSGAGG00000012893	-	91	98.603	Gopherus_agassizii
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSGGOG00000003316	AGO1	95	92.289	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.583	ENSHBUG00000010459	ago1	95	89.583	Haplochromis_burtoni
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSHGLG00000011540	AGO1	95	92.289	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSHGLG00100005568	AGO1	95	92.289	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSHCOG00000005708	ago1	96	89.828	Hippocampus_comes
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSIPUG00000023216	ago1	95	89.828	Ictalurus_punctatus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSSTOG00000010857	AGO1	95	92.289	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	ENSJJAG00000019449	Ago1	95	92.166	Jaculus_jaculus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSKMAG00000019464	ago1	95	89.828	Kryptolebias_marmoratus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.951	ENSLBEG00000007694	ago1	92	93.445	Labrus_bergylta
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	85.819	ENSLACG00000017009	AGO1	95	85.819	Latimeria_chalumnae
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	87.148	ENSLOCG00000000504	AGO1	95	87.148	Lepisosteus_oculatus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSLAFG00000010835	AGO1	96	92.289	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSMFAG00000002846	AGO1	95	92.289	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	87.515	ENSMMUG00000006251	AGO1	96	87.315	Macaca_mulatta
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	88.739	ENSMNEG00000028881	AGO1	91	98.743	Macaca_nemestrina
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSMLEG00000038388	AGO1	95	92.289	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSMAMG00000008381	ago1	94	94.825	Mastacembelus_armatus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.583	ENSMZEG00005007996	ago1	95	89.583	Maylandia_zebra
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	86.861	ENSMGAG00000003822	AGO1	95	86.861	Meleagris_gallopavo
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSMAUG00000015189	Ago1	95	92.289	Mesocricetus_auratus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSMICG00000016147	AGO1	95	92.289	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	ENSMOCG00000000537	Ago1	95	92.166	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000006663	AGO1	81	98.027	ENSMMOG00000018459	ago1	91	98.027	Mola_mola
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	91.922	ENSMODG00000023335	AGO1	95	91.922	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.715	ENSMALG00000011057	ago1	96	89.715	Monopterus_albus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	93	98.467	Mus_caroli
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSMUSG00000041530	Ago1	93	98.467	Mus_musculus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	93	98.467	Mus_pahari
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	93	98.467	Mus_spretus
ENSVPAG00000006663	AGO1	84	98.981	ENSMPUG00000014872	AGO1	95	98.981	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000006663	AGO1	64	88.484	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	88.484	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	ENSNGAG00000017448	Ago1	95	92.166	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	96.788	ENSNBRG00000010867	ago1	91	96.788	Neolamprologus_brichardi
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSNLEG00000011181	AGO1	95	92.289	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000006663	AGO1	80	86.769	ENSMEUG00000013429	AGO1	82	86.769	Notamacropus_eugenii
ENSVPAG00000006663	AGO1	78	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	74	100.000	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSODEG00000005321	AGO1	95	92.289	Octodon_degus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.583	ENSONIG00000016345	ago1	95	89.583	Oreochromis_niloticus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	82.950	ENSOANG00000002080	AGO1	95	83.902	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	ENSOCUG00000023116	AGO1	95	92.166	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSORLG00000014965	ago1	95	89.828	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSORLG00020018253	ago1	95	89.828	Oryzias_latipes_hni
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSORLG00015003287	ago1	95	89.828	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.828	ENSOMEG00000020528	ago1	95	89.828	Oryzias_melastigma
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSOGAG00000010279	AGO1	95	92.289	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	ENSOARG00000019591	AGO1	95	92.166	Ovis_aries
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSPPAG00000034838	AGO1	95	92.289	Pan_paniscus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSPPRG00000006475	AGO1	95	92.289	Panthera_pardus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.044	ENSPTIG00000020991	AGO1	95	92.044	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSPTRG00000000528	AGO1	95	92.289	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSPANG00000009060	AGO1	95	92.289	Papio_anubis
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	91.471	ENSPSIG00000017482	AGO1	95	91.471	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000006663	AGO1	80	97.252	ENSPMGG00000024099	ago1	93	97.252	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSPEMG00000023313	Ago1	95	92.289	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	91.922	ENSPCIG00000000172	AGO1	95	91.922	Phascolarctos_cinereus
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.951	ENSPFOG00000005867	ago1	95	89.951	Poecilia_formosa
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.951	ENSPLAG00000002824	ago1	94	97.727	Poecilia_latipinna
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.951	ENSPMEG00000001787	ago1	94	97.727	Poecilia_mexicana
ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.951	ENSPREG00000006534	ago1	95	89.951	Poecilia_reticulata
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSPPYG00000001551	AGO1	95	92.289	Pongo_abelii
ENSVPAG00000006663	AGO1	57	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	61	100.000	Procavia_capensis
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSPCOG00000022061	AGO1	91	98.743	Propithecus_coquereli
ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	ENSPVAG00000005082	AGO1	95	92.289	Pteropus_vampyrus
ENSVPAG00000006663	AGO1	88	91.760	ENSPNYG00000012586	ago1	90	91.760	Pundamilia_nyererei
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