EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000007024 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 39592 bases
Position: chrGeneScaffold_167:172900-212491
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000006533	ResIII	PF04851.15	4.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000007024	SBNO1-201	4167	-	ENSVPAP00000006533	1389 (aa)	-	UPI00018BE001

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSG00000139697	SBNO1	95	93.478	Homo_sapiens
ENSVPAG00000007024	SBNO1	77	78.846	ENSAPOG00000003196	sbno1	92	78.942	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	ENSAMEG00000015151	SBNO1	95	97.826	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSACIG00000008088	sbno1	95	73.333	Amphilophus_citrinellus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	71.111	ENSAOCG00000014859	sbno1	94	71.111	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	71.111	ENSAPEG00000006069	sbno1	94	71.111	Amphiprion_percula
ENSVPAG00000007024	SBNO1	90	78.654	ENSATEG00000006667	sbno1	95	73.333	Anabas_testudineus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	86.953	ENSAPLG00000015674	SBNO1	95	86.963	Anas_platyrhynchos
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	81.931	ENSACAG00000015441	SBNO1	84	84.783	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSANAG00000029958	-	98	91.550	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	76.190	ENSACLG00000024913	sbno1	90	78.089	Astatotilapia_calliptera
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	73.977	ENSAMXG00000019473	sbno1	95	74.286	Astyanax_mexicanus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.556	ENSBTAG00000020505	SBNO1	95	95.556	Bos_taurus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSCJAG00000016599	SBNO1	95	93.478	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	ENSCAFG00000007503	SBNO1	95	97.826	Canis_familiaris
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	ENSCAFG00020015363	SBNO1	95	97.826	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.556	ENSCHIG00000008382	SBNO1	95	95.556	Capra_hircus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSTSYG00000012749	SBNO1	95	93.478	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000007024	SBNO1	91	95.652	ENSCAPG00000000384	SBNO1	95	95.652	Cavia_aperea
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.652	ENSCPOG00000008109	SBNO1	95	95.652	Cavia_porcellus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSCCAG00000035316	SBNO1	95	93.478	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSCATG00000008239	SBNO1	95	93.478	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.652	ENSCLAG00000008995	SBNO1	95	95.652	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000007024	SBNO1	77	96.390	ENSCSAG00000002064	SBNO1	92	96.390	Chlorocebus_sabaeus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	86	98.352	ENSCHOG00000008814	SBNO1	86	98.352	Choloepus_hoffmanni
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	87.432	ENSCPBG00000025968	SBNO1	96	87.198	Chrysemys_picta_bellii
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	91.304	ENSCANG00000042688	-	95	91.304	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	92.350	ENSCGRG00001017470	Sbno1	95	92.350	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	92.350	ENSCGRG00000004756	Sbno1	95	92.350	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	70.297	ENSCSEG00000011919	sbno1	95	71.005	Cynoglossus_semilaevis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSCVAG00000007038	sbno1	95	73.333	Cyprinodon_variegatus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	74.206	ENSDARG00000099080	sbno1	95	76.190	Danio_rerio
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.715	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	91.572	Dasypus_novemcinctus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	90	94.489	ENSDORG00000015261	Sbno1	95	94.489	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000007024	SBNO1	87	93.478	ENSETEG00000005620	SBNO1	87	93.478	Echinops_telfairi
ENSVPAG00000007024	SBNO1	75	57.689	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	57.130	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000007024	SBNO1	51	89.124	ENSEASG00005012595	-	92	89.124	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	ENSECAG00000006127	SBNO1	95	97.826	Equus_caballus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	72	100.000	ENSEEUG00000003793	SBNO1	72	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	72.824	ENSELUG00000002886	sbno1	95	73.333	Esox_lucius
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.778	ENSFCAG00000015331	SBNO1	95	97.778	Felis_catus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	86.719	ENSFALG00000009273	SBNO1	95	86.957	Ficedula_albicollis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.556	ENSFDAG00000014232	SBNO1	95	95.556	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSFHEG00000007360	sbno1	95	73.333	Fundulus_heteroclitus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	89	75.000	ENSGMOG00000018229	sbno1	94	75.000	Gadus_morhua
ENSVPAG00000007024	SBNO1	88	87.327	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	87.084	Gallus_gallus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSGAFG00000003960	sbno1	95	73.333	Gambusia_affinis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	89	77.500	ENSGACG00000015633	sbno1	94	77.500	Gasterosteus_aculeatus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	86.495	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	85.984	Gopherus_agassizii
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSGGOG00000015000	SBNO1	95	93.478	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	76.190	ENSHBUG00000011910	sbno1	90	76.190	Haplochromis_burtoni
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.652	ENSHGLG00000014165	-	95	95.652	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000007024	SBNO1	89	77.427	ENSHCOG00000003246	sbno1	89	77.727	Hippocampus_comes
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	73.380	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	73.105	Ictalurus_punctatus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	ENSSTOG00000023221	SBNO1	95	97.826	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSJJAG00000001741	Sbno1	95	93.478	Jaculus_jaculus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	76.190	ENSKMAG00000009696	sbno1	95	76.190	Kryptolebias_marmoratus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSLBEG00000007623	sbno1	95	73.333	Labrus_bergylta
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	76.187	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	78.930	Latimeria_chalumnae
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	76.793	ENSLOCG00000005725	sbno1	93	80.000	Lepisosteus_oculatus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	92.116	ENSLAFG00000002135	SBNO1	95	92.116	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	92.434	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSMMUG00000011496	SBNO1	95	93.478	Macaca_mulatta
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSMLEG00000033260	SBNO1	98	90.759	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	71.111	ENSMAMG00000005473	sbno1	95	71.111	Mastacembelus_armatus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	86.953	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	87.002	Meleagris_gallopavo
ENSVPAG00000007024	SBNO1	50	87.536	ENSMAUG00000004834	-	100	87.536	Mesocricetus_auratus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSMICG00000006573	-	95	93.478	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	91.304	ENSMOCG00000009390	Sbno1	95	91.304	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	68.889	ENSMMOG00000008691	sbno1	94	68.889	Mola_mola
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	89.774	ENSMODG00000012470	SBNO1	94	89.774	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSMALG00000001056	sbno1	95	73.333	Monopterus_albus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.333	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	100	91.741	Mus_caroli
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.333	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	92.503	Mus_musculus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.556	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	92.503	Mus_pahari
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.333	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	100	92.122	Mus_spretus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	ENSMPUG00000001658	SBNO1	95	97.826	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSMLUG00000017159	SBNO1	95	93.478	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSNGAG00000012620	Sbno1	95	93.478	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	76.190	ENSNBRG00000019189	sbno1	95	76.190	Neolamprologus_brichardi
ENSVPAG00000007024	SBNO1	94	90.632	ENSNLEG00000001502	SBNO1	96	90.632	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000007024	SBNO1	62	84.177	ENSMEUG00000008768	-	93	88.608	Notamacropus_eugenii
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSOPRG00000011054	SBNO1	95	93.478	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	ENSODEG00000009997	SBNO1	95	97.826	Octodon_degus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	76.190	ENSONIG00000015348	sbno1	95	76.190	Oreochromis_niloticus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	92.578	ENSOCUG00000002441	SBNO1	89	92.578	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	75.556	ENSORLG00000001593	sbno1	95	75.556	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	75.556	ENSORLG00020015216	sbno1	95	75.556	Oryzias_latipes_hni
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	75.556	ENSORLG00015002726	sbno1	95	75.556	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	76.744	ENSOMEG00000019313	sbno1	95	76.744	Oryzias_melastigma
ENSVPAG00000007024	SBNO1	50	84.957	ENSOGAG00000010781	-	100	84.957	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.556	ENSOARG00000004404	SBNO1	95	95.556	Ovis_aries
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.130	ENSPPAG00000024635	SBNO1	95	93.130	Pan_paniscus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.778	ENSPPRG00000022092	SBNO1	95	97.778	Panthera_pardus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	ENSPTIG00000017803	SBNO1	95	97.826	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSPTRG00000005597	SBNO1	95	93.478	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSPANG00000011640	SBNO1	98	92.816	Papio_anubis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	75.640	ENSPKIG00000001441	sbno1	95	75.891	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	82.802	ENSPSIG00000009256	-	99	82.802	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	86.413	ENSPSIG00000009572	-	95	86.314	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	92.037	ENSPEMG00000016087	Sbno1	95	92.037	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	89.080	ENSPCIG00000010985	SBNO1	95	89.314	Phascolarctos_cinereus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSPFOG00000005069	sbno1	95	73.333	Poecilia_formosa
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSPLAG00000015015	sbno1	95	73.333	Poecilia_latipinna
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSPMEG00000021212	sbno1	95	73.333	Poecilia_mexicana
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	ENSPREG00000017746	sbno1	95	73.333	Poecilia_reticulata
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSPPYG00000005084	SBNO1	95	93.478	Pongo_abelii
ENSVPAG00000007024	SBNO1	84	93.478	ENSPCAG00000008634	SBNO1	84	93.478	Procavia_capensis
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSPCOG00000024277	SBNO1	95	93.478	Propithecus_coquereli
ENSVPAG00000007024	SBNO1	82	97.826	ENSPVAG00000015304	SBNO1	82	97.826	Pteropus_vampyrus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	76.190	ENSPNYG00000004291	sbno1	95	76.190	Pundamilia_nyererei
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	73.554	ENSPNAG00000015622	sbno1	95	75.556	Pygocentrus_nattereri
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.333	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	91.102	Rattus_norvegicus
ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	93.478	ENSRROG00000034230	SBNO1	95	93.478	Rhinopithecus_roxellana
ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	93.478	ENSSBOG00000015422	SBNO1	91	94.815	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSVPAG00000007024	SBNO1	88	69.489	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	67.095	Xiphophorus_couchianus
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