EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSVPAG00000009601 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Vicugna_pacos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 79373 bases
Position: chrGeneScaffold_1332:894147-973519
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVPAP00000008935	IBN_N	PF03810.19	3.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVPAT00000009601	TNPO1-201	2688	-	ENSVPAP00000008935	895 (aa)	-	UPI00018BE9FD

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSG00000083312	TNPO1	100	97.927	Homo_sapiens
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.888	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	89.888	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	95.011	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.011	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVPAG00000009601	TNPO1	86	88.372	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	88.372	Amphilophus_citrinellus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	90.000	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	90.000	Amphiprion_ocellaris
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	90.000	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	90.000	Amphiprion_percula
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.551	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	89.551	Anabas_testudineus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	98	88.613	ENSAPLG00000009619	-	97	89.540	Anas_platyrhynchos
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	92.697	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.697	Anolis_carolinensis
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.657	ENSANAG00000022453	-	100	95.657	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	84.521	ENSANAG00000025351	-	100	84.521	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	60.773	ENSANAG00000027118	-	99	60.442	Aotus_nancymaae
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	87.991	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	87.991	Astatotilapia_calliptera
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.013	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	88.565	Astyanax_mexicanus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.768	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	95.768	Bos_taurus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.768	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	95.768	Callithrix_jacchus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	95	95.566	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	95.566	Canis_familiaris
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	92.809	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	92.809	Canis_lupus_dingo
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.657	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	95.657	Capra_hircus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	91.638	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	94.035	Carlito_syrichta
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.657	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	95.657	Cebus_capucinus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	95.991	Cercocebus_atys
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.546	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	95.546	Chinchilla_lanigera
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.880	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	95.880	Chlorocebus_sabaeus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	94	89.728	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	89.728	Choloepus_hoffmanni
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	93.715	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.715	Chrysemys_picta_bellii
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	72.166	ENSCSAVG00000010981	-	99	72.166	Ciona_savignyi
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	95.991	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.657	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	95.657	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVPAG00000009601	TNPO1	95	95.439	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	95.439	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.315	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	88.315	Cynoglossus_semilaevis
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.326	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	89.326	Cyprinodon_variegatus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.777	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	88.664	Danio_rerio
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.621	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	89.621	Dasypus_novemcinctus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	92	95.422	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	95.416	Dipodomys_ordii
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	55.530	FBgn0035693	CG8219	99	55.079	Drosophila_melanogaster
ENSVPAG00000009601	TNPO1	86	97.004	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	97.004	Echinops_telfairi
ENSVPAG00000009601	TNPO1	94	81.190	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	80.952	Eptatretus_burgeri
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	95.991	Equus_asinus_asinus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.768	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	95.768	Equus_caballus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	84.699	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	84.262	Esox_lucius
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	95.991	Felis_catus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	93.371	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.371	Ficedula_albicollis
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.657	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	95.657	Fukomys_damarensis
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.001	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	89.001	Fundulus_heteroclitus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	86.511	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	86.511	Gadus_morhua
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	92.428	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.809	Gallus_gallus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.341	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	88.789	Gambusia_affinis
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.038	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	89.038	Gasterosteus_aculeatus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	93.483	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.483	Gopherus_agassizii
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	79.553	ENSGGOG00000022535	-	99	79.553	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	95.991	Gorilla_gorilla
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.213	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	89.213	Haplochromis_burtoni
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.323	ENSHGLG00000000970	-	100	95.323	Heterocephalus_glaber_female
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	72.383	ENSHGLG00100000963	-	100	71.826	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000009601	TNPO1	95	94.977	ENSHGLG00100017090	-	99	94.977	Heterocephalus_glaber_male
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	95.638	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	95.638	Jaculus_jaculus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.663	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	89.663	Kryptolebias_marmoratus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	90	85.820	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	85.327	Labrus_bergylta
ENSVPAG00000009601	TNPO1	95	85.000	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.000	Latimeria_chalumnae
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	91.499	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	91.499	Lepisosteus_oculatus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	96	95.035	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	95.035	Loxodonta_africana
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	95.991	Macaca_fascicularis
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.880	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	95.880	Macaca_mulatta
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	95.991	Macaca_nemestrina
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	95.991	Mandrillus_leucophaeus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.551	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	89.551	Mastacembelus_armatus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.989	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	88.989	Maylandia_zebra
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	95.536	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	91.825	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	91.825	Microcebus_murinus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	95.526	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	95.526	Microtus_ochrogaster
ENSVPAG00000009601	TNPO1	86	87.371	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	87.629	Mola_mola
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	90.213	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	90.213	Monodelphis_domestica
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.427	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	88.427	Monopterus_albus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.434	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.657	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.546	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.434	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.880	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	95.880	Mustela_putorius_furo
ENSVPAG00000009601	TNPO1	95	95.111	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	95.111	Myotis_lucifugus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.657	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	95.657	Nannospalax_galili
ENSVPAG00000009601	TNPO1	86	88.243	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	88.243	Neolamprologus_brichardi
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	95.991	Nomascus_leucogenys
ENSVPAG00000009601	TNPO1	91	93.272	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	Ochotona_princeps
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.323	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	95.323	Octodon_degus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.333	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	88.333	Oreochromis_niloticus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	91	93.537	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.537	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	95	89.136	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	89.136	Oryctolagus_cuniculus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	86	88.197	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	88.197	Oryzias_latipes
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.064	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	89.064	Oryzias_latipes_hni
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.177	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	89.177	Oryzias_latipes_hsok
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.064	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	89.064	Oryzias_melastigma
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.880	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	95.880	Otolemur_garnettii
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.768	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	95.768	Ovis_aries
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	95.991	Pan_paniscus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	95.991	Panthera_pardus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	95.991	Panthera_tigris_altaica
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	95.991	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000009601	TNPO1	93	82.735	ENSPTRG00000047731	-	100	82.735	Pan_troglodytes
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.991	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	95.991	Papio_anubis
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	86.742	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	86.742	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	92.984	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	92.984	Pelodiscus_sinensis
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	86.644	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	86.644	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	95	95.439	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	95.439	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	94.270	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.270	Phascolarctos_cinereus
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.690	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	88.914	Poecilia_formosa
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.690	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	88.914	Poecilia_latipinna
ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.438	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	89.438	Poecilia_mexicana
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ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.880	ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	95.880	Propithecus_coquereli
ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	95.657	ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	95.657	Pteropus_vampyrus
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ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.026	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	88.789	Pygocentrus_nattereri
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