EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSVVUG00000000405 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Vulpes_vulpes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30623 bases
Position: chrNBDQ01000010.1:2937868-2968490
Accession: 112914684
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVVUP00000000435	PAZ	PF02170.22	1.3e-28	1	1
ENSVVUP00000000480	PAZ	PF02170.22	1.5e-28	1	1
ENSVVUP00000000459	PAZ	PF02170.22	1.5e-21	1	1
ENSVVUP00000000480	Piwi	PF02171.17	1.3e-110	1	1
ENSVVUP00000000459	Piwi	PF02171.17	1.6e-110	1	1
ENSVVUP00000000435	Piwi	PF02171.17	1.7e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVVUT00000000782	AGO1-203	2271	-	ENSVVUP00000000480	756 (aa)	-	-
ENSVVUT00000000751	AGO1-202	2454	-	ENSVVUP00000000459	817 (aa)	-	-
ENSVVUT00000000712	AGO1-201	2574	-	ENSVVUP00000000435	857 (aa)	XP_025847543	UPI000012D07D

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSVVUG00000000405	AGO1	94	86.900	ENSVVUG00000014692	AGO2	100	84.644
ENSVVUG00000000405	AGO1	97	89.956	ENSVVUG00000000362	AGO3	99	85.409
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	86.981	ENSVVUG00000000465	-	100	84.131

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSAPOG00000024299	ago1	97	98.268	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	93.732	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSAOCG00000017727	ago1	98	96.916	Amphiprion_ocellaris
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.576	Amphiprion_percula
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSATEG00000008523	ago1	98	96.916	Anabas_testudineus
ENSVVUG00000000405	AGO1	97	100.000	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.794	Anas_platyrhynchos
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	100.000	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.544	ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	Astatotilapia_calliptera
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	Bos_taurus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	100.000	Canis_familiaris
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	Capra_hircus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	79.710	ENSTSYG00000032426	-	87	92.157	Carlito_syrichta
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSVVUG00000000405	AGO1	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSVVUG00000000405	AGO1	83	100.000	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	Chrysemys_picta_bellii
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	96.439	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	Cyprinodon_variegatus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	Danio_rerio
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSVVUG00000000405	AGO1	93	98.820	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSVVUG00000000405	AGO1	82	100.000	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.204	Echinops_telfairi
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	100	100.000	Equus_caballus
ENSVVUG00000000405	AGO1	92	91.614	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	98.690	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	100.000	Felis_catus
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	95.936	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	Fukomys_damarensis
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	98.690	ENSFHEG00000017927	ago1	99	93.001	Fundulus_heteroclitus
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	84.593	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.883	Gallus_gallus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	Gambusia_affinis
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	98.261	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	100.000	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.544	ENSHBUG00000010459	ago1	98	96.679	Haplochromis_burtoni
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	98.690	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.399	ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	Ictalurus_punctatus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.883	Jaculus_jaculus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSKMAG00000019464	ago1	98	96.916	Kryptolebias_marmoratus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSLBEG00000007694	ago1	98	96.916	Labrus_bergylta
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	95.082	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	Latimeria_chalumnae
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	94.905	ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	Lepisosteus_oculatus
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	Loxodonta_africana
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSVVUG00000000405	AGO1	98	100.000	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.255	Macaca_mulatta
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	96.033	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSMAMG00000008381	ago1	98	96.916	Mastacembelus_armatus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.544	ENSMZEG00005007996	ago1	98	96.679	Maylandia_zebra
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	96.923	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	Meleagris_gallopavo
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.883	Microtus_ochrogaster
ENSVVUG00000000405	AGO1	88	98.951	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.951	Mola_mola
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	99.854	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.650	Monodelphis_domestica
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	98.544	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.797	Monopterus_albus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	Mus_caroli
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	100.000	Mus_musculus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	100.000	Mus_pahari
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	100.000	Mus_spretus
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSVVUG00000000405	AGO1	61	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.617	Myotis_lucifugus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.767	Nannospalax_galili
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	98.544	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	Nomascus_leucogenys
ENSVVUG00000000405	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSVVUG00000000405	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	100	100.000	Octodon_degus
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	98.544	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	Oreochromis_niloticus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.571	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.977	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.883	Oryctolagus_cuniculus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSORLG00000014965	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSORLG00020018253	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes_hni
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSORLG00015003287	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes_hsok
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSOMEG00000020528	ago1	98	96.916	Oryzias_melastigma
ENSVVUG00000000405	AGO1	99	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	100.000	Otolemur_garnettii
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.883	Ovis_aries
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	100.000	Pan_paniscus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	100.000	Panthera_pardus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.767	Panthera_tigris_altaica
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	100	100.000	Papio_anubis
ENSVVUG00000000405	AGO1	98	100.000	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSVVUG00000000405	AGO1	92	97.114	ENSPMGG00000024099	ago1	99	97.114	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	99.854	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	Phascolarctos_cinereus
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ENSVVUG00000000405	AGO1	100	99.274	ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	Xenopus_tropicalis
ENSVVUG00000000405	AGO1	91	97.817	ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	Xiphophorus_couchianus
ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	Xiphophorus_maculatus