EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSVVUG00000010344 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Vulpes_vulpes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30495 bases
Position: chrNBDQ01000011.1:25601018-25631512
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVVUP00000014112	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	1	2
ENSVVUP00000014112	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	2	2
ENSVVUP00000014137	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.4e-27	1	2
ENSVVUP00000014137	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.4e-27	2	2
ENSVVUP00000014119	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.5e-27	1	2
ENSVVUP00000014119	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.5e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVVUT00000018520	PAPOLG-201	3529	-	ENSVVUP00000014112	744 (aa)	-	-
ENSVVUT00000018549	PAPOLG-203	3054	-	ENSVVUP00000014137	791 (aa)	-	-
ENSVVUT00000018527	PAPOLG-202	3108	-	ENSVVUP00000014119	809 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSVVUG00000010344's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSVVUG00000010344's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	60.215	ENSVVUG00000028340	PAPOLA	98	61.570

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.737	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.170	ENSAPOG00000004798	papolg	99	71.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	98.370	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	98.370	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.437	ENSACIG00000010546	papolg	99	71.053	Amphilophus_citrinellus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	71.979	ENSAOCG00000010254	papolg	89	71.904	Amphiprion_ocellaris
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.112	ENSAPEG00000006944	papolg	89	71.979	Amphiprion_percula
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.872	ENSATEG00000009007	papolg	96	72.739	Anabas_testudineus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	73.635	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.635	Anas_platyrhynchos
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	80	64.145	ENSACAG00000015048	-	100	63.399	Anolis_carolinensis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.007	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	95.007	Aotus_nancymaae
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.082	ENSACLG00000015592	papolg	89	69.599	Astatotilapia_calliptera
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.823	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.823	Astyanax_mexicanus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.166	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	97.166	Bos_taurus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.142	Callithrix_jacchus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	99.593	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	99	99.503	Canis_familiaris
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	98.925	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	98.925	Canis_lupus_dingo
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	96.626	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.626	Capra_hircus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	96.356	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	96.356	Carlito_syrichta
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	51	91.864	ENSCAPG00000014901	-	100	91.864	Cavia_aperea
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.412	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.412	Cavia_porcellus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.142	Cebus_capucinus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	90	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.951	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.951	Chinchilla_lanigera
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	95.142	Chlorocebus_sabaeus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	88	93.769	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.769	Choloepus_hoffmanni
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	67	64.752	ENSCING00000024664	-	90	65.844	Ciona_intestinalis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	65	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.277	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	95.277	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	93.315	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	93.179	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	93.315	ENSCGRG00000005552	-	100	93.179	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.000	ENSCSEG00000000771	papolg	100	69.920	Cynoglossus_semilaevis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	90	81.802	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	Cyprinodon_variegatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	73.087	ENSDARG00000012141	papolg	100	72.427	Danio_rerio
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	93.792	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.657	Dasypus_novemcinctus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	58	99.534	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	Dipodomys_ordii
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	74.119	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	74.054	Echinops_telfairi
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	62	71.094	ENSEBUG00000004020	papolg	94	70.649	Eptatretus_burgeri
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	64	56.695	ENSEBUG00000005042	-	79	57.725	Eptatretus_burgeri
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.166	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	97.166	Equus_asinus_asinus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	100	96.314	ENSECAG00000009859	PAPOLG	100	96.314	Equus_caballus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	84.211	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.211	Erinaceus_europaeus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.727	ENSELUG00000014497	papolg	100	64.388	Esox_lucius
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.436	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	97.436	Felis_catus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	65.526	ENSFALG00000011079	PAPOLG	98	65.526	Ficedula_albicollis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.412	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	95.412	Fukomys_damarensis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	66	61.346	ENSFHEG00000019080	papolg	90	61.914	Fundulus_heteroclitus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	82	83.032	ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	Gadus_morhua
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.400	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	71.235	Gallus_gallus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	68.586	ENSGAFG00000003263	papolg	96	69.525	Gambusia_affinis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	71.353	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.090	Gasterosteus_aculeatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.007	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	95.007	Gorilla_gorilla
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.082	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.091	Haplochromis_burtoni
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.522	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	95.522	Heterocephalus_glaber_female
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.946	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	100	95.816	Heterocephalus_glaber_male
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.839	ENSHCOG00000006782	papolg	89	70.706	Hippocampus_comes
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	73.113	ENSIPUG00000021642	papolg	100	73.289	Ictalurus_punctatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.682	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.682	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	58	99.301	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.301	Jaculus_jaculus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.292	ENSKMAG00000016439	papolg	99	68.975	Kryptolebias_marmoratus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	68.798	ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.286	Labrus_bergylta
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.455	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.241	Latimeria_chalumnae
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.715	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.454	Lepisosteus_oculatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.347	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.682	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	95.682	Macaca_fascicularis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.682	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	95.682	Macaca_mulatta
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	86.729	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	86.729	Macaca_nemestrina
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.277	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	95.277	Mandrillus_leucophaeus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	71.846	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.742	Mastacembelus_armatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	70.315	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.909	Maylandia_zebra
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.683	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.683	Meleagris_gallopavo
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	93.315	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.179	Mesocricetus_auratus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.682	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	95.983	Microcebus_murinus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	93.657	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.522	Microtus_ochrogaster
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	71.391	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.523	Mola_mola
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	87.534	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.534	Monodelphis_domestica
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	71.580	ENSMALG00000007012	papolg	97	71.182	Monopterus_albus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.197	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.766	Mus_caroli
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.332	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	Mus_musculus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	93.927	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.792	Mus_pahari
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	93.927	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	Mus_spretus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	98.512	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	99	98.144	Mustela_putorius_furo
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.851	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	94.038	Myotis_lucifugus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.007	Nannospalax_galili
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	63.193	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.325	Neolamprologus_brichardi
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	58	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	81	78.082	ENSMEUG00000013605	-	87	78.082	Notamacropus_eugenii
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.277	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	94.602	Ochotona_princeps
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	57	94.601	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	Octodon_degus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	65.154	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.287	Oreochromis_niloticus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	86.193	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	86.193	Ornithorhynchus_anatinus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	96.356	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	95.682	Oryctolagus_cuniculus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.053	ENSORLG00000001577	papolg	96	69.789	Oryzias_latipes
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.557	ENSORLG00020002482	papolg	96	70.385	Oryzias_latipes_hni
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.053	ENSORLG00015008836	papolg	96	69.789	Oryzias_latipes_hsok
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.173	ENSOMEG00000001406	papolg	99	69.841	Oryzias_melastigma
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	57	89.070	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	89.538	Otolemur_garnettii
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	96.626	ENSOARG00000001563	PAPOLG	99	94.724	Ovis_aries
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.737	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	94.737	Pan_paniscus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.436	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	97.436	Panthera_pardus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.301	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	97.301	Panthera_tigris_altaica
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.737	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	94.737	Pan_troglodytes
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	91.252	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	91.252	Papio_anubis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.090	ENSPKIG00000003313	papolg	100	71.973	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	94	70.323	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	69.761	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	79.245	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.245	Pelodiscus_sinensis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	92.906	ENSPEMG00000008960	-	100	92.769	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	66	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	53.642	ENSPMAG00000002961	papolg	99	54.083	Petromyzon_marinus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	87.850	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.850	Phascolarctos_cinereus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.110	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.261	Poecilia_formosa
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	68.979	ENSPLAG00000018445	papolg	96	68.930	Poecilia_latipinna
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.150	ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.777	Poecilia_mexicana
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	68.840	ENSPREG00000010358	papolg	96	68.709	Poecilia_reticulata
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.872	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.872	Pongo_abelii
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	81.905	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	Procavia_capensis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	85.135	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	87.258	Propithecus_coquereli
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	88	94.681	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.681	Pteropus_vampyrus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.811	ENSPNYG00000006729	papolg	100	70.081	Pundamilia_nyererei
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	73.635	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.635	Pygocentrus_nattereri
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	93.792	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	93.657	Rattus_norvegicus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	89.204	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	89.204	Rhinopithecus_bieti
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	95.142	Rhinopithecus_roxellana
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.142	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	93	87.943	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.960	Sarcophilus_harrisii
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	63.023	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.699	Scleropages_formosus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.302	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.517	Scleropages_formosus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	71.791	ENSSDUG00000000912	papolg	99	72.466	Seriola_dumerili
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.207	ENSSLDG00000001217	papolg	99	70.745	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	78.000	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.689	Sphenodon_punctatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.175	ENSSPAG00000009004	papolg	99	71.508	Stegastes_partitus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.031	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.091	Sus_scrofa
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	73	76.753	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	100	76.753	Taeniopygia_guttata
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.485	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.485	Takifugu_rubripes
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	66.667	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.667	Tetraodon_nigroviridis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	88.027	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	88.027	Tupaia_belangeri
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	92.443	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	92.443	Tursiops_truncatus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	98.358	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	98.455	Ursus_americanus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.756	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	99	97.756	Ursus_maritimus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	92.925	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.925	Vicugna_pacos
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	74.668	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.668	Xenopus_tropicalis
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	67	85.170	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.170	Xiphophorus_couchianus
ENSVVUG00000010344	PAPOLG	73	82.600	ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.600	Xiphophorus_maculatus