EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSVVUG00000025499 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Vulpes_vulpes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1456 bases
Position: chrNBDQ01000132.1:4383283-4384738
Accession: 112933777
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSVVUP00000035437	eRF1_2	PF03464.15	2.3e-37	1	1
ENSVVUP00000035437	eRF1_3	PF03465.15	9.9e-27	1	1
ENSVVUP00000035437	eRF1_1	PF03463.15	2.3e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSVVUT00000046688	PELO-201	1158	-	ENSVVUP00000035437	385 (aa)	XP_025872819	UPI00004A43F7

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.442	ENSG00000152684	PELO	100	98.442	Homo_sapiens
ENSVVUG00000025499	PELO	64	81.377	ENSAPOG00000000616	pelo	90	81.377	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.260	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVVUG00000025499	PELO	64	81.377	ENSAPOG00000023700	-	90	81.377	Acanthochromis_polyacanthus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	99.740	ENSAMEG00000007734	PELO	100	99.740	Ailuropoda_melanoleuca
ENSVVUG00000025499	PELO	97	77.212	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	Amphilophus_citrinellus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.519	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.519	Amphiprion_ocellaris
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.519	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.519	Amphiprion_percula
ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.558	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	Anabas_testudineus
ENSVVUG00000025499	PELO	77	85.570	ENSAPLG00000013265	PELO	100	85.570	Anas_platyrhynchos
ENSVVUG00000025499	PELO	98	90.426	ENSACAG00000004352	PELO	100	90.130	Anolis_carolinensis
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.701	Aotus_nancymaae
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.260	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	Astatotilapia_calliptera
ENSVVUG00000025499	PELO	97	81.233	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	Astyanax_mexicanus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.182	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.182	Bos_taurus
ENSVVUG00000025499	PELO	99	58.005	WBGene00011280	pelo-1	100	58.005	Caenorhabditis_elegans
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.701	Callithrix_jacchus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	100.000	ENSCAFG00020023234	PELO	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.922	ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.922	Capra_hircus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.701	Carlito_syrichta
ENSVVUG00000025499	PELO	100	99.221	ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	Cavia_porcellus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.701	Cebus_capucinus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.961	Cercocebus_atys
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.701	Chinchilla_lanigera
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.961	Chlorocebus_sabaeus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.922	ENSCHOG00000000523	PELO	100	97.922	Choloepus_hoffmanni
ENSVVUG00000025499	PELO	98	93.883	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	Chrysemys_picta_bellii
ENSVVUG00000025499	PELO	97	69.437	ENSCING00000001979	-	100	69.870	Ciona_intestinalis
ENSVVUG00000025499	PELO	100	70.390	ENSCSAVG00000006158	-	100	70.390	Ciona_savignyi
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.961	Colobus_angolensis_palliatus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	95.325	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.325	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSVVUG00000025499	PELO	100	96.623	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	Cricetulus_griseus_crigri
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.000	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.818	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	Cyprinodon_variegatus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	82.078	ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	Danio_rerio
ENSVVUG00000025499	PELO	100	95.596	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.596	Dasypus_novemcinctus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.442	ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.442	Dipodomys_ordii
ENSVVUG00000025499	PELO	96	67.655	FBgn0011207	pelo	96	67.546	Drosophila_melanogaster
ENSVVUG00000025499	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.961	Equus_asinus_asinus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.779	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	Esox_lucius
ENSVVUG00000025499	PELO	100	99.481	ENSFCAG00000032341	PELO	100	99.481	Felis_catus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	95.325	ENSFALG00000004559	PELO	100	95.325	Ficedula_albicollis
ENSVVUG00000025499	PELO	74	97.887	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.887	Fukomys_damarensis
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.000	ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	Fundulus_heteroclitus
ENSVVUG00000025499	PELO	98	79.576	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.481	Gadus_morhua
ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.039	ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	Gambusia_affinis
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.779	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	Gasterosteus_aculeatus
ENSVVUG00000025499	PELO	98	94.149	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	Gopherus_agassizii
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.961	Gorilla_gorilla
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.260	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	Haplochromis_burtoni
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.182	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.182	Heterocephalus_glaber_female
ENSVVUG00000025499	PELO	100	95.844	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.844	Heterocephalus_glaber_male
ENSVVUG00000025499	PELO	100	77.662	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	Hippocampus_comes
ENSVVUG00000025499	PELO	100	79.740	ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	Ictalurus_punctatus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	94.805	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	94.805	Jaculus_jaculus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.299	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	Kryptolebias_marmoratus
ENSVVUG00000025499	PELO	99	80.208	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	Labrus_bergylta
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.442	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.442	Loxodonta_africana
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSMFAG00000000651	PELO	100	98.961	Macaca_fascicularis
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSMMUG00000039101	PELO	100	98.961	Macaca_mulatta
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.961	Macaca_nemestrina
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSMLEG00000039113	PELO	100	98.961	Mandrillus_leucophaeus
ENSVVUG00000025499	PELO	97	82.842	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	Mastacembelus_armatus
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ENSVVUG00000025499	PELO	100	96.623	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	96.623	Mesocricetus_auratus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.701	Microcebus_murinus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.403	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.403	Microtus_ochrogaster
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ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.403	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.403	Mus_musculus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.662	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.662	Mus_pahari
ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.403	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.403	Mus_spretus
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ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.922	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.922	Nannospalax_galili
ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.260	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	Neolamprologus_brichardi
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSNLEG00000035970	PELO	100	98.961	Nomascus_leucogenys
ENSVVUG00000025499	PELO	100	94.805	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.805	Notamacropus_eugenii
ENSVVUG00000025499	PELO	98	97.625	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.625	Ochotona_princeps
ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.662	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	Octodon_degus
ENSVVUG00000025499	PELO	96	80.541	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.260	Oreochromis_niloticus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	Oryctolagus_cuniculus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.558	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes
ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.818	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hni
ENSVVUG00000025499	PELO	100	82.078	ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	Oryzias_latipes_hsok
ENSVVUG00000025499	PELO	100	82.078	ENSOMEG00000021567	pelo	100	82.078	Oryzias_melastigma
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.442	ENSOGAG00000027940	PELO	100	98.442	Otolemur_garnettii
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.182	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.182	Ovis_aries
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.961	Pan_paniscus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	99.481	ENSPPRG00000018800	PELO	100	99.481	Panthera_pardus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	99.481	ENSPTIG00000019988	PELO	100	99.481	Panthera_tigris_altaica
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.701	ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.701	Pan_troglodytes
ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.961	Papio_anubis
ENSVVUG00000025499	PELO	100	82.857	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	Paramormyrops_kingsleyae
ENSVVUG00000025499	PELO	98	93.617	ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	Pelodiscus_sinensis
ENSVVUG00000025499	PELO	67	79.070	ENSPMGG00000014561	pelo	95	79.070	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	97.143	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSVVUG00000025499	PELO	100	96.623	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.623	Phascolarctos_cinereus
ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.818	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	Poecilia_formosa
ENSVVUG00000025499	PELO	100	82.078	ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	Poecilia_latipinna
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ENSVVUG00000025499	PELO	100	98.961	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.961	Rhinopithecus_roxellana
ENSVVUG00000025499	PELO	98	35.325	YNL001W	-	98	35.325	Saccharomyces_cerevisiae
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