EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000002477 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10139 bases
Position: chrKQ557223.1:10542335-10552473
Accession: ZDB-GENE-130530-1003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000003131	MIF4G	PF02854.19	1.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000003168	-	1326	-	ENSXCOP00000003131	441 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSXCOG00000002477's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXCOG00000002477's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.057	ENSG00000134030	CTIF	63	57.828	Homo_sapiens
ENSXCOG00000002477	ctif	81	79.508	ENSAPOG00000020192	ctif	71	76.675	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000002477	ctif	87	55.087	ENSAMEG00000006759	CTIF	57	56.878	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000002477	ctif	98	73.016	ENSACIG00000017099	ctif	57	74.390	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000002477	ctif	63	82.578	ENSAOCG00000014275	ctif	56	65.860	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000002477	ctif	87	78.316	ENSAPEG00000016975	ctif	62	76.271	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000002477	ctif	98	75.113	ENSATEG00000016752	ctif	60	75.862	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000002477	ctif	57	60.223	ENSAPLG00000014486	-	99	60.223	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000002477	ctif	83	60.212	ENSACAG00000018006	CTIF	57	60.212	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.295	ENSANAG00000024925	CTIF	63	58.081	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000002477	ctif	98	74.150	ENSACLG00000005956	ctif	61	75.122	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000002477	ctif	80	59.239	ENSAMXG00000015964	ctif	55	55.981	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.567	ENSBTAG00000018901	CTIF	66	56.522	Bos_taurus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.687	ENSCJAG00000004729	CTIF	63	57.431	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.660	ENSCAFG00000019076	CTIF	63	57.393	Canis_familiaris
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.660	ENSCAFG00020026482	CTIF	63	57.393	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000002477	ctif	91	53.938	ENSCHIG00000014455	CTIF	63	55.584	Capra_hircus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	53.919	ENSTSYG00000030461	CTIF	70	55.556	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.028	ENSCAPG00000011865	CTIF	68	55.556	Cavia_aperea
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.253	ENSCPOG00000001049	CTIF	64	55.854	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.028	ENSCCAG00000022758	CTIF	63	57.789	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.057	ENSCATG00000038134	CTIF	65	57.538	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.450	ENSCLAG00000008174	CTIF	63	57.179	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.057	ENSCSAG00000018021	CTIF	62	57.828	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000002477	ctif	67	44.625	ENSCHOG00000009041	-	59	48.387	Choloepus_hoffmanni
ENSXCOG00000002477	ctif	92	55.609	ENSCPBG00000025654	CTIF	64	58.421	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000002477	ctif	85	57.828	ENSCANG00000030916	CTIF	75	57.828	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	57.647	ENSCGRG00001020158	Ctif	63	59.500	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.691	ENSCGRG00000000052	Ctif	64	56.311	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000002477	ctif	88	71.178	ENSCSEG00000019857	ctif	60	71.290	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000002477	ctif	91	82.927	ENSCVAG00000017158	ctif	61	82.927	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000002477	ctif	85	60.358	ENSDARG00000090617	ctif	57	59.705	Danio_rerio
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.924	ENSDNOG00000037310	CTIF	88	58.056	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.490	ENSDORG00000003221	Ctif	63	58.312	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.399	ENSEASG00005016094	CTIF	63	57.107	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.869	ENSECAG00000020473	CTIF	63	57.606	Equus_caballus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.924	ENSEEUG00000012451	CTIF	70	58.122	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000002477	ctif	89	58.277	ENSELUG00000008733	ctif	71	60.093	Esox_lucius
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.057	ENSFCAG00000000664	CTIF	66	57.538	Felis_catus
ENSXCOG00000002477	ctif	85	58.824	ENSFALG00000008943	CTIF	62	58.824	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.378	ENSFDAG00000017379	CTIF	64	55.422	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000002477	ctif	89	84.864	ENSFHEG00000004334	ctif	67	80.357	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000002477	ctif	57	78.077	ENSGMOG00000003452	ctif	99	78.077	Gadus_morhua
ENSXCOG00000002477	ctif	85	58.779	ENSGALG00000035912	-	66	57.320	Gallus_gallus
ENSXCOG00000002477	ctif	98	91.051	ENSGAFG00000011896	ctif	70	93.932	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000002477	ctif	57	81.132	ENSGACG00000016514	ctif	99	81.132	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000002477	ctif	98	55.581	ENSGAGG00000020663	CTIF	89	59.726	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.792	ENSGGOG00000015204	CTIF	65	57.538	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000002477	ctif	98	74.150	ENSHBUG00000018092	ctif	61	75.122	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.867	ENSHGLG00000005663	CTIF	63	58.718	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.867	ENSHGLG00100006976	CTIF	63	58.718	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000002477	ctif	84	62.857	ENSHCOG00000011784	ctif	64	64.175	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000002477	ctif	90	58.637	ENSIPUG00000014050	ctif	55	58.637	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000002477	ctif	97	54.751	ENSSTOG00000001967	CTIF	63	57.868	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.000	ENSJJAG00000013706	Ctif	64	57.855	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000002477	ctif	97	74.032	ENSKMAG00000014651	ctif	61	75.426	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000002477	ctif	84	74.346	ENSLBEG00000018277	ctif	68	75.703	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000002477	ctif	83	60.519	ENSLOCG00000011697	ctif	59	58.213	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	52.135	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	71.321	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.057	ENSMFAG00000037903	CTIF	65	57.538	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.057	ENSMMUG00000020898	CTIF	65	57.538	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.057	ENSMNEG00000039395	CTIF	65	57.538	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.792	ENSMLEG00000041132	CTIF	65	57.538	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000002477	ctif	98	74.545	ENSMAMG00000014741	ctif	61	74.878	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000002477	ctif	81	68.835	ENSMZEG00005019767	ctif	51	70.414	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.706	ENSMAUG00000000656	Ctif	63	58.291	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.532	ENSMICG00000010167	CTIF	63	58.543	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	57.512	ENSMOCG00000020507	Ctif	63	59.352	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000002477	ctif	98	73.182	ENSMMOG00000000831	ctif	58	72.439	Mola_mola
ENSXCOG00000002477	ctif	85	57.143	ENSMODG00000003464	CTIF	67	57.143	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000002477	ctif	98	73.303	ENSMALG00000020553	ctif	89	74.209	Monopterus_albus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.484	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	65	55.819	Mus_caroli
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.241	ENSMUSG00000052928	Ctif	65	55.792	Mus_musculus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	57.210	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	63	58.794	Mus_pahari
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.343	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	65	55.896	Mus_spretus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.660	ENSMPUG00000000844	CTIF	63	57.393	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.399	ENSMLUG00000003025	CTIF	63	57.107	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.941	ENSNGAG00000011452	Ctif	63	58.750	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000002477	ctif	94	74.413	ENSNBRG00000008679	ctif	61	75.366	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.028	ENSNLEG00000011503	CTIF	64	57.789	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000002477	ctif	85	56.888	ENSMEUG00000000218	CTIF	63	56.888	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000002477	ctif	86	58.897	ENSOPRG00000003558	CTIF	63	58.897	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000002477	ctif	83	55.122	ENSODEG00000018390	CTIF	64	55.366	Octodon_degus
ENSXCOG00000002477	ctif	80	77.473	ENSONIG00000007750	ctif	63	77.249	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000002477	ctif	83	44.749	ENSOANG00000001337	CTIF	76	45.205	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.971	ENSOCUG00000024842	CTIF	63	58.824	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000002477	ctif	98	68.834	ENSORLG00000005786	ctif	68	69.007	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000002477	ctif	98	69.388	ENSORLG00020005385	ctif	66	68.765	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000002477	ctif	98	69.683	ENSORLG00015011872	ctif	68	69.007	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000002477	ctif	91	68.127	ENSOMEG00000007917	ctif	60	68.127	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.924	ENSOGAG00000013927	CTIF	63	57.683	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.785	ENSOARG00000003754	CTIF	63	55.980	Ovis_aries
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.792	ENSPPAG00000023554	CTIF	65	57.538	Pan_paniscus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.189	ENSPPRG00000002265	CTIF	63	56.892	Panthera_pardus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.765	ENSPTIG00000013761	CTIF	63	57.500	Panthera_tigris_altaica
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.792	ENSPTRG00000010009	CTIF	65	57.538	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.057	ENSPANG00000017087	CTIF	65	57.538	Papio_anubis
ENSXCOG00000002477	ctif	86	59.033	ENSPKIG00000011234	ctif	73	62.881	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000002477	ctif	94	54.861	ENSPSIG00000006508	CTIF	66	55.854	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000002477	ctif	94	64.554	ENSPMGG00000022958	ctif	55	64.563	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	57.311	ENSPEMG00000022746	Ctif	63	59.148	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000002477	ctif	85	56.391	ENSPCIG00000026247	CTIF	99	60.000	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000002477	ctif	98	92.825	ENSPFOG00000009243	ctif	68	91.283	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000002477	ctif	98	93.049	ENSPLAG00000019171	ctif	70	94.159	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000002477	ctif	98	92.825	ENSPMEG00000020089	ctif	65	92.825	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000002477	ctif	88	89.975	ENSPREG00000017326	ctif	58	90.049	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.398	ENSPPYG00000009147	CTIF	75	58.186	Pongo_abelii
ENSXCOG00000002477	ctif	91	53.461	ENSPCOG00000013391	CTIF	63	54.937	Propithecus_coquereli
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.502	ENSPVAG00000001965	CTIF	63	57.252	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000002477	ctif	98	74.150	ENSPNYG00000007879	ctif	67	76.142	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000002477	ctif	80	61.433	ENSPNAG00000029174	ctif	58	57.794	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000002477	ctif	91	57.683	ENSRNOG00000018342	Ctif	88	68.667	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000002477	ctif	85	56.927	ENSRBIG00000043937	CTIF	64	56.642	Rhinopithecus_bieti
ENSXCOG00000002477	ctif	85	56.927	ENSRROG00000006039	CTIF	64	56.642	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.952	ENSSBOG00000028468	CTIF	66	57.722	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000002477	ctif	85	57.614	ENSSHAG00000016321	CTIF	67	57.614	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000002477	ctif	84	60.724	ENSSFOG00015022594	ctif	60	59.124	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000002477	ctif	88	75.567	ENSSMAG00000005707	ctif	73	75.610	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000002477	ctif	95	74.014	ENSSDUG00000016033	ctif	64	69.595	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000002477	ctif	95	74.014	ENSSLDG00000007282	ctif	64	71.332	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000002477	ctif	83	59.259	ENSSPUG00000014734	CTIF	63	59.259	Sphenodon_punctatus
ENSXCOG00000002477	ctif	88	78.283	ENSSPAG00000003721	ctif	70	77.995	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	54.976	ENSSSCG00000004506	CTIF	64	56.675	Sus_scrofa
ENSXCOG00000002477	ctif	85	53.589	ENSTGUG00000000030	CTIF	64	53.589	Taeniopygia_guttata
ENSXCOG00000002477	ctif	76	71.598	ENSTRUG00000002320	ctif	99	71.598	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000002477	ctif	79	68.715	ENSTNIG00000018763	ctif	64	66.408	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000002477	ctif	91	49.038	ENSTBEG00000002613	CTIF	63	50.384	Tupaia_belangeri
ENSXCOG00000002477	ctif	91	52.123	ENSTTRG00000004347	CTIF	63	53.634	Tursiops_truncatus
ENSXCOG00000002477	ctif	71	50.154	ENSUAMG00000007299	CTIF	50	49.524	Ursus_americanus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.190	ENSUMAG00000002735	CTIF	66	57.975	Ursus_maritimus
ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.660	ENSVVUG00000014347	CTIF	66	57.393	Vulpes_vulpes
ENSXCOG00000002477	ctif	98	97.273	ENSXMAG00000004236	ctif	73	95.701	Xiphophorus_maculatus