EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000005208 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9786 bases
Position: chrKQ557214.1:6662320-6672105
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000006753	IBN_N	PF03810.19	9.4e-16	1	1
ENSXCOP00000006748	IBN_N	PF03810.19	7e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000006831	-	3222	-	ENSXCOP00000006748	1073 (aa)	-	-
ENSXCOT00000006836	-	3204	-	ENSXCOP00000006753	1067 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSXCOG00000005208's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXCOG00000005208's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.057	ENSG00000196497	IPO4	99	42.857	Homo_sapiens
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	76.004	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	77.185	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.461	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	42.530	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	75.872	ENSACIG00000004246	ipo4	100	76.217	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	78.162	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	79.174	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	78.253	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	79.266	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000005208	ipo4	92	80.632	ENSATEG00000017082	ipo4	99	81.755	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000005208	ipo4	84	44.637	ENSACAG00000003973	-	97	44.672	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.684	ENSANAG00000037973	IPO4	99	42.766	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	75.137	ENSACLG00000019742	ipo4	100	75.482	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	70.583	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.398	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.593	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	42.241	Bos_taurus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.964	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	43.040	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	44.019	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	43.842	Canis_familiaris
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	43.616	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	42.368	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.710	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	42.424	Capra_hircus
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.978	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	42.989	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.121	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	42.844	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.964	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	43.040	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.243	ENSCATG00000040395	IPO4	99	43.132	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.201	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	43.223	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000005208	ipo4	91	43.719	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	41.101	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000005208	ipo4	92	35.652	ENSCING00000008639	-	99	35.749	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000005208	ipo4	93	36.081	ENSCSAVG00000011482	-	99	36.178	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.057	ENSCANG00000029513	IPO4	99	42.949	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	41.891	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	40.967	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	41.891	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	40.967	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	73.224	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	73.829	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	78.480	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	79.672	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	72.080	ENSDARG00000041493	ipo4	100	72.953	Danio_rerio
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.361	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	43.107	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.897	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	42.883	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000005208	ipo4	96	30.000	FBgn0042177	CG32164	96	30.112	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000005208	ipo4	96	30.776	FBgn0042178	CG32165	96	30.639	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	41.871	ENSETEG00000018381	IPO4	99	41.788	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000005208	ipo4	90	44.964	ENSEASG00005011954	IPO4	96	44.200	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.704	ENSECAG00000009909	IPO4	99	43.026	Equus_caballus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	72.536	ENSELUG00000020628	ipo4	100	72.844	Esox_lucius
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	44.022	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	43.698	Felis_catus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	39.391	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	39.635	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000005208	ipo4	89	86.104	ENSFHEG00000009351	ipo4	97	86.649	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	72.694	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	73.665	Gadus_morhua
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	92.636	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	93.401	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	76.874	ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.993	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.870	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	42.766	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	75.777	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	76.125	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.553	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	42.491	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.276	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	42.216	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	72.760	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	73.889	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	69.991	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	69.780	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.519	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	43.434	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	43.592	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	43.211	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	78.237	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	78.237	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	76.937	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	77.849	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	47.756	ENSLACG00000001428	IPO4	100	47.846	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000005208	ipo4	80	62.660	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	62.660	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.715	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	43.715	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.243	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	43.132	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.336	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	43.223	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.150	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	43.040	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.243	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	43.132	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	76.965	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	77.482	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	75.868	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	76.217	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.699	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	42.726	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.804	ENSMICG00000001719	IPO4	99	42.975	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.991	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	42.350	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	75.549	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	76.077	Mola_mola
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.130	ENSMODG00000003337	IPO4	96	41.826	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	75.543	ENSMALG00000001587	ipo4	100	77.298	Monopterus_albus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.407	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	43.410	Mus_caroli
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	41.944	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	42.805	Mus_musculus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.076	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	43.118	Mus_pahari
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.222	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	43.047	Mus_spretus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.704	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	43.710	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.672	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	42.883	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.108	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	43.315	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	79.487	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	79.688	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.796	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	43.813	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.386	ENSODEG00000002609	IPO4	99	43.040	Octodon_degus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	79.087	ENSONIG00000014574	ipo4	100	79.522	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.539	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	42.279	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	75.114	ENSORLG00000006457	ipo4	99	78.892	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	77.343	ENSORLG00020004286	ipo4	100	77.982	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	77.434	ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.073	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	77.230	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	76.838	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.115	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	42.018	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	41.932	ENSOARG00000019188	IPO4	98	41.581	Ovis_aries
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.324	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	43.201	Pan_paniscus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	44.208	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	43.882	Panthera_pardus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	44.115	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	43.790	Panthera_tigris_altaica
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.777	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	42.582	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.336	ENSPANG00000026278	IPO4	99	43.223	Papio_anubis
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	64.808	ENSPKIG00000007683	-	99	64.991	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	64.371	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	63.934	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	69.301	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	69.789	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	41.781	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	41.636	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000005208	ipo4	93	44.892	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	44.135	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	91.758	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	93.034	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	92.308	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	93.126	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	91.941	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	93.217	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	92.942	ENSPREG00000017605	ipo4	100	92.942	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.777	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	42.857	Pongo_abelii
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	44.030	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	44.271	Procavia_capensis
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.308	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	42.304	Propithecus_coquereli
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.777	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	42.870	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	77.514	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	77.870	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	71.952	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	71.402	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.606	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	41.971	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.150	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	42.949	Rhinopithecus_bieti
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.057	ENSRROG00000011492	IPO4	99	42.949	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	41.938	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	42.033	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	43.698	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	43.562	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	64.991	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	64.808	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	63.703	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	63.336	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	77.717	ENSSMAG00000019912	ipo4	100	78.134	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	74.472	ENSSDUG00000017513	ipo4	100	75.578	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	76.867	ENSSLDG00000003869	ipo4	100	78.125	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000005208	ipo4	81	44.059	ENSSARG00000010701	IPO4	81	44.240	Sorex_araneus
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	78.851	ENSSPAG00000008486	ipo4	100	79.963	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.790	ENSSSCG00000002000	IPO4	99	42.634	Sus_scrofa
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	72.860	ENSTRUG00000012832	ipo4	100	73.529	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	71.219	ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.207	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	41.258	ENSTBEG00000009781	IPO4	99	41.026	Tupaia_belangeri
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.672	ENSTTRG00000008626	IPO4	99	42.516	Tursiops_truncatus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	42.699	ENSUAMG00000024037	IPO4	99	42.360	Ursus_americanus
ENSXCOG00000005208	ipo4	99	44.506	ENSXETG00000014621	ipo4	99	44.322	Xenopus_tropicalis
ENSXCOG00000005208	ipo4	100	95.692	ENSXMAG00000006041	ipo4	100	95.692	Xiphophorus_maculatus