EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000005638 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1%2C soluble
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9891 bases
Position: chrKQ557225.1:37371526-37381416
Accession: ZDB-GENE-031118-76
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000007288	Aconitase	PF00330.20	1.7e-133	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000007382	-	1386	-	ENSXCOP00000007288	461 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000005638	aco1	96	82.086	ENSG00000122729	ACO1	50	82.086	Homo_sapiens
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.769	ENSAMEG00000003746	ACO1	50	80.769	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.769	ENSAPLG00000015490	ACO1	50	80.769	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.910	ENSACAG00000001541	ACO1	51	79.910	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.272	ENSANAG00000003359	ACO1	50	80.272	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000005638	aco1	96	84.842	ENSAMXG00000002499	aco1	50	84.842	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.638	ENSBTAG00000000555	ACO1	50	79.638	Bos_taurus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.952	ENSCJAG00000007687	ACO1	50	80.952	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.638	ENSCAFG00000001786	ACO1	59	79.638	Canis_familiaris
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.638	ENSCAFG00020014553	ACO1	50	79.638	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.864	ENSCHIG00000007667	ACO1	50	79.864	Capra_hircus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.272	ENSCPOG00000003768	ACO1	50	80.272	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.272	ENSCCAG00000022465	ACO1	50	80.272	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSCATG00000045333	ACO1	50	81.406	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.819	ENSCLAG00000002487	ACO1	50	79.819	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSCPBG00000008077	ACO1	50	81.406	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.633	ENSCANG00000014847	ACO1	50	81.633	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSCGRG00001024337	Aco1	50	81.406	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000005638	aco1	96	88.462	ENSCSEG00000018262	aco1	50	88.462	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	90.498	ENSCVAG00000020264	aco1	52	90.498	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	85.294	ENSDARG00000026376	aco1	50	85.294	Danio_rerio
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.995	ENSDNOG00000003951	ACO1	50	80.995	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.769	ENSDORG00000014246	Aco1	50	80.769	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000005638	aco1	96	54.291	ENSEBUG00000015441	aco1	51	54.691	Eptatretus_burgeri
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.819	ENSEASG00005004602	ACO1	50	79.819	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.819	ENSECAG00000014846	ACO1	50	79.819	Equus_caballus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	78.912	ENSEEUG00000015174	ACO1	50	78.912	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.317	ENSFCAG00000001293	ACO1	50	80.317	Felis_catus
ENSXCOG00000005638	aco1	97	80.493	ENSFALG00000001167	ACO1	50	80.493	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.045	ENSFDAG00000016058	ACO1	50	80.045	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	93.213	ENSFHEG00000005619	aco1	50	93.213	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.090	ENSGMOG00000005514	aco1	50	80.090	Gadus_morhua
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.769	ENSGALG00000002162	ACO1	50	80.769	Gallus_gallus
ENSXCOG00000005638	aco1	80	97.035	ENSGAFG00000005897	aco1	92	97.035	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.952	ENSGAGG00000023315	ACO1	50	80.952	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000005638	aco1	96	82.086	ENSGGOG00000016306	ACO1	50	82.086	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000005638	aco1	96	89.140	ENSHBUG00000008952	aco1	97	78.319	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.819	ENSHGLG00000018922	Aco1	50	79.819	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.819	ENSHGLG00100000149	Aco1	50	79.819	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000005638	aco1	96	84.389	ENSIPUG00000020088	ACO1	50	84.389	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSJJAG00000013824	Aco1	50	81.406	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	83.710	ENSLOCG00000011082	aco1	50	83.710	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	77.778	ENSLAFG00000013470	ACO1	50	77.778	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.633	ENSMFAG00000001702	ACO1	50	81.633	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.633	ENSMMUG00000008196	ACO1	50	81.633	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSMNEG00000045040	ACO1	50	81.406	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSMLEG00000005636	ACO1	50	81.406	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.769	ENSMGAG00000008851	ACO1	50	80.769	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.179	ENSMAUG00000021408	Aco1	50	81.179	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	82.086	ENSMICG00000006540	ACO1	50	82.086	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.222	ENSMOCG00000015393	Aco1	50	81.222	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000005638	aco1	96	88.688	ENSMMOG00000020282	aco1	50	88.688	Mola_mola
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.952	ENSMODG00000004463	ACO1	50	80.952	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	50	81.406	Mus_caroli
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSMUSG00000028405	Aco1	50	81.406	Mus_musculus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	50	81.406	Mus_pahari
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	50	81.406	Mus_spretus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.090	ENSMPUG00000004340	ACO1	50	80.090	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.952	ENSMLUG00000003029	ACO1	50	80.952	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.272	ENSNGAG00000005703	Aco1	50	80.272	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000005638	aco1	96	72.172	ENSNBRG00000008973	aco1	51	75.339	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.633	ENSNLEG00000003409	ACO1	50	81.633	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.499	ENSOPRG00000016791	ACO1	50	80.499	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.365	ENSODEG00000001240	-	51	79.365	Octodon_degus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	78.714	ENSOCUG00000015960	ACO1	50	78.271	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	90.498	ENSORLG00000020656	aco1	50	90.498	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000005638	aco1	96	90.724	ENSORLG00020010991	aco1	50	90.724	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000005638	aco1	96	90.045	ENSOMEG00000000660	aco1	50	90.045	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSOGAG00000010522	ACO1	50	81.406	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000005638	aco1	96	82.086	ENSPPAG00000033498	ACO1	50	82.086	Pan_paniscus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.543	ENSPPRG00000009875	ACO1	50	80.543	Panthera_pardus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	82.086	ENSPTRG00000020843	ACO1	50	82.086	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSPANG00000025270	ACO1	50	81.406	Papio_anubis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.952	ENSPSIG00000008030	ACO1	50	80.952	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.633	ENSPEMG00000018464	Aco1	51	81.633	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.592	ENSPCIG00000029321	ACO1	50	79.592	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	98.190	ENSPFOG00000013405	aco1	53	98.190	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000005638	aco1	90	81.055	ENSPCAG00000013222	ACO1	55	81.055	Procavia_capensis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	89.140	ENSPNYG00000009425	aco1	97	78.319	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000005638	aco1	96	84.842	ENSPNAG00000017918	aco1	50	84.842	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSRNOG00000005849	Aco1	50	81.406	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.179	ENSRBIG00000034592	ACO1	50	81.179	Rhinopithecus_bieti
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	ENSRROG00000042672	ACO1	50	81.406	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.726	ENSSBOG00000026008	ACO1	50	80.726	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.317	ENSSHAG00000008924	ACO1	50	80.317	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000005638	aco1	96	83.258	ENSSFOG00015018941	aco1	50	83.258	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.179	ENSSPUG00000002916	ACO1	50	81.179	Sphenodon_punctatus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.726	ENSSSCG00000023807	ACO1	50	80.726	Sus_scrofa
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.769	ENSTGUG00000001505	ACO1	50	80.769	Taeniopygia_guttata
ENSXCOG00000005638	aco1	96	86.456	ENSTRUG00000006888	aco1	50	86.230	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000005638	aco1	96	84.163	ENSTNIG00000005288	aco1	50	84.163	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000005638	aco1	96	76.190	ENSTBEG00000012369	ACO1	50	76.190	Tupaia_belangeri
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.995	ENSUAMG00000020699	ACO1	50	80.995	Ursus_americanus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.995	ENSUMAG00000005807	ACO1	50	80.995	Ursus_maritimus
ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.952	ENSVPAG00000009876	ACO1	52	80.952	Vicugna_pacos