EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000006912 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4900 bases
Position: chrKQ557203.1:4519681-4524580
Accession: ZDB-GENE-040426-1578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000009072	RRM_1	PF00076.22	5e-16	1	2
ENSXCOP00000009072	RRM_1	PF00076.22	5e-16	2	2
ENSXCOP00000009074	RRM_1	PF00076.22	7e-16	1	2
ENSXCOP00000009074	RRM_1	PF00076.22	7e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000009185	-	1407	-	ENSXCOP00000009074	468 (aa)	-	-
ENSXCOT00000009182	-	1278	-	ENSXCOP00000009072	425 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.840	ENSG00000102241	HTATSF1	100	61.039	Homo_sapiens
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	80.046	ENSAPOG00000009823	htatsf1	97	80.046	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	81.340	ENSACIG00000020459	htatsf1	97	80.090	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	78.125	ENSAOCG00000020994	htatsf1	97	78.571	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	78.652	ENSAPEG00000016432	htatsf1	97	79.551	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	80.622	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	80.622	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	92	58.202	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	59.685	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000006912	htatsf1	81	62.849	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	54.009	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	80.569	ENSACLG00000008096	htatsf1	97	78.959	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	69.111	ENSAMXG00000008387	htatsf1	98	69.778	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	59.155	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	51	64.116	Bos_taurus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	79	40.469	WBGene00022025	Y65B4A.1	77	39.535	Caenorhabditis_elegans
ENSXCOG00000006912	htatsf1	81	65.156	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	65.684	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	66.402	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	66.227	Canis_familiaris
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	67.196	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	50	67.282	Capra_hircus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	86	65.617	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	50	65.796	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000006912	htatsf1	81	65.537	ENSCCAG00000022701	-	50	66.220	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	81	64.607	ENSCCAG00000025329	-	55	64.815	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSCATG00000029963	HTATSF1	50	66.230	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000006912	htatsf1	93	61.916	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.916	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	50	66.230	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	88	69.713	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	58.125	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	45.161	ENSCING00000005914	-	90	40.049	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	83	44.959	ENSCSAVG00000000371	-	98	36.939	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSCANG00000028495	HTATSF1	50	66.230	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	85.548	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	81.838	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	70.546	ENSDARG00000056649	htatsf1	96	69.053	Danio_rerio
ENSXCOG00000006912	htatsf1	88	45.736	FBgn0037081	barc	69	45.736	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000006912	htatsf1	62	48.872	ENSETEG00000006377	-	51	39.295	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000006912	htatsf1	90	54.722	ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.257	Eptatretus_burgeri
ENSXCOG00000006912	htatsf1	90	64.031	ENSEASG00005003440	HTATSF1	50	64.051	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	90	64.031	ENSECAG00000009156	HTATSF1	50	64.051	Equus_caballus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	66.351	ENSELUG00000005486	htatsf1	84	68.646	Esox_lucius
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	65.608	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	65.435	Felis_catus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	93	63.571	ENSFALG00000003728	HTATSF1	92	64.029	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	62.559	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	63.680	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	88.028	ENSFHEG00000020286	htatsf1	96	88.028	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	77.247	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	77.247	Gadus_morhua
ENSXCOG00000006912	htatsf1	89	67.532	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	58.299	Gallus_gallus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	92.075	ENSGAFG00000003041	htatsf1	95	92.075	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	76.798	ENSGACG00000020459	htatsf1	97	76.798	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.840	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	50	66.492	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000006912	htatsf1	100	74.686	ENSHBUG00000004392	htatsf1	97	78.959	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	78.010	ENSHCOG00000009056	htatsf1	93	75.309	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	71.845	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	60.887	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	66.111	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	66.579	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	82.719	ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	82.719	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	99	76.524	ENSLBEG00000001154	htatsf1	98	77.252	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	62.381	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	57.563	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	48.485	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	42.944	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	65.435	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.061	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	50	66.230	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	50	66.230	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	66.057	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	50	66.230	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	95	77.990	ENSMAMG00000021225	htatsf1	96	77.518	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	80.806	ENSMZEG00005000485	htatsf1	97	79.186	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000006912	htatsf1	95	57.952	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	99	58.824	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	66.295	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	65.375	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	60.373	ENSMICG00000009348	HTATSF1	53	62.871	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	66.295	ENSMOCG00000023007	-	50	66.755	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.460	ENSMOCG00000022370	-	50	66.053	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	76.552	ENSMMOG00000011013	htatsf1	97	76.552	Mola_mola
ENSXCOG00000006912	htatsf1	99	63.218	ENSMODG00000014087	-	96	63.218	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000006912	htatsf1	56	63.710	ENSMODG00000000199	-	91	61.674	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	76.620	ENSMALG00000019977	htatsf1	96	76.620	Monopterus_albus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	66.389	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	66.227	Mus_caroli
ENSXCOG00000006912	htatsf1	95	59.806	ENSMLUG00000009234	-	57	59.806	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	64.033	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.026	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	80.476	ENSNBRG00000003818	htatsf1	97	78.864	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.385	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	50	66.057	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000006912	htatsf1	89	67.268	ENSMEUG00000004133	-	93	67.268	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	81.991	ENSONIG00000008638	htatsf1	97	80.543	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	84	64.754	ENSOANG00000011674	-	89	64.754	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	77.103	ENSORLG00000002356	htatsf1	96	76.498	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	77.336	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	72.083	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	77.176	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	72.269	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	78.111	ENSOMEG00000007564	htatsf1	96	78.111	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.840	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	50	66.492	Pan_paniscus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	65.699	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	65.699	Panthera_pardus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.840	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	50	66.492	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	69.811	ENSPKIG00000024852	htatsf1	95	69.811	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000006912	htatsf1	66	77.660	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	96	62.228	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	73.333	ENSPMGG00000006172	htatsf1	96	73.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	66.295	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	66.580	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	61.827	ENSPCIG00000030173	-	98	61.827	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	99	53.766	ENSPCIG00000018896	-	99	53.766	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	93.240	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	89.957	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	93.007	ENSPLAG00000007532	htatsf1	97	93.007	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	93.240	ENSPMEG00000000352	htatsf1	97	93.240	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	94.172	ENSPREG00000007811	htatsf1	97	94.172	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	50	66.057	Pongo_abelii
ENSXCOG00000006912	htatsf1	89	58.442	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	53	58.442	Procavia_capensis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.460	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	66.313	Propithecus_coquereli
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	64.456	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	64.456	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	80.569	ENSPNYG00000016693	htatsf1	97	78.959	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	70.258	ENSPNAG00000006166	htatsf1	97	70.258	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	65.565	ENSRROG00000021939	HTATSF1	50	66.230	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000006912	htatsf1	50	31.278	YNL286W	-	76	31.250	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXCOG00000006912	htatsf1	81	65.537	ENSSBOG00000027186	-	50	66.043	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	68.182	ENSSHAG00000006440	-	97	68.182	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000006912	htatsf1	89	66.753	ENSSHAG00000018908	-	98	56.108	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	70.712	ENSSFOG00015012002	htatsf1	91	65.493	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	76.697	ENSSMAG00000002970	htatsf1	97	76.244	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	100	71.762	ENSSDUG00000020002	htatsf1	96	76.047	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000006912	htatsf1	100	75.476	ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	80.324	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	92	60.945	ENSSARG00000005193	HTATSF1	55	60.697	Sorex_araneus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	95	62.774	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	55.419	Sphenodon_punctatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	79.279	ENSSPAG00000000732	htatsf1	97	80.180	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	66.111	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	66.053	Sus_scrofa
ENSXCOG00000006912	htatsf1	93	63.636	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	56.612	Taeniopygia_guttata
ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	73.441	ENSTRUG00000013383	htatsf1	96	74.704	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000006912	htatsf1	100	69.872	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	70.426	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	79	64.723	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	64.723	Tursiops_truncatus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	65.517	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	65.344	Ursus_americanus
ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	63.235	ENSXETG00000019749	htatsf1	76	63.235	Xenopus_tropicalis
ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	95.227	ENSXMAG00000000490	htatsf1	97	95.227	Xiphophorus_maculatus