EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000007669 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9967 bases
Position: chrKQ557218.1:8147185-8157151
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000010111	PAZ	PF02170.22	6.3e-29	1	1
ENSXCOP00000010111	Piwi	PF02171.17	1.1e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000010230	-	2343	-	ENSXCOP00000010111	780 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXCOG00000007669	ago1	96	83.660	ENSXCOG00000000902	-	99	83.660
ENSXCOG00000007669	ago1	88	89.956	ENSXCOG00000007676	ago3a	100	89.956
ENSXCOG00000007669	ago1	100	82.759	ENSXCOG00000000634	ago2	89	82.759

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSG00000092847	AGO1	100	96.419	Homo_sapiens
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSAPOG00000024299	ago1	96	98.121	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSAMEG00000000504	AGO1	91	96.419	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000007669	ago1	90	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSAOCG00000017727	ago1	91	98.977	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSAPEG00000004458	ago1	92	98.977	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSATEG00000008523	ago1	91	98.977	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	89.695	ENSAPLG00000010440	AGO1	90	89.695	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.292	ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.292	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSANAG00000037711	AGO1	91	96.419	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.849	ENSACLG00000000890	ago1	100	95.013	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000007669	ago1	88	98.688	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.688	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSBTAG00000012253	AGO1	91	96.419	Bos_taurus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCJAG00000032023	AGO1	91	96.419	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCAFG00000003443	AGO1	91	96.419	Canis_familiaris
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCAFG00020009251	AGO1	91	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.036	ENSCHIG00000011848	-	92	95.172	Capra_hircus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSTSYG00000009767	-	92	96.419	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000007669	ago1	100	75.448	ENSTSYG00000032426	-	99	77.286	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000007669	ago1	77	98.361	ENSCAPG00000010228	AGO1	84	97.581	Cavia_aperea
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCPOG00000011568	AGO1	91	96.419	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCCAG00000011823	AGO1	91	96.419	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCATG00000031521	AGO1	100	96.419	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCLAG00000011507	AGO1	92	96.419	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCSAG00000001091	AGO1	91	96.419	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000007669	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	78	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.292	ENSCPBG00000018594	AGO1	91	96.292	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCANG00000039798	AGO1	91	96.419	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCGRG00001022708	Ago1	91	96.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSCGRG00000010386	Ago1	92	96.419	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.863	ENSCSEG00000001051	ago1	92	96.863	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSCVAG00000018173	ago1	91	98.977	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.593	ENSDARG00000092644	ago1	91	98.593	Danio_rerio
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	96.419	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000007669	ago1	92	95.159	ENSDORG00000008494	Ago1	92	95.364	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000007669	ago1	83	88.854	ENSETEG00000007626	AGO1	90	88.854	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSEASG00005012086	AGO1	91	96.419	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSECAG00000024353	AGO1	91	96.419	Equus_caballus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	87.980	ENSEEUG00000005349	AGO1	91	87.980	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.721	ENSELUG00000016803	ago1	100	98.721	Esox_lucius
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSFCAG00000000746	AGO1	91	96.419	Felis_catus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	91.071	ENSFALG00000000790	AGO1	100	91.071	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSFDAG00000017210	AGO1	91	96.419	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000007669	ago1	96	98.667	ENSFHEG00000017927	ago1	90	98.667	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000007669	ago1	96	85.581	ENSGMOG00000019413	ago1	100	85.581	Gadus_morhua
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.292	ENSGALG00000002249	AGO1	91	96.292	Gallus_gallus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSGAFG00000009775	ago1	91	98.977	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000007669	ago1	96	98.269	ENSGACG00000012443	ago1	100	98.269	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.292	ENSGAGG00000012893	-	100	96.292	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSGGOG00000003316	AGO1	91	96.419	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.849	ENSHBUG00000010459	ago1	100	95.013	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSHGLG00000011540	AGO1	91	96.419	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSHGLG00100005568	AGO1	91	96.419	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSHCOG00000005708	ago1	92	98.977	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.721	ENSIPUG00000023216	ago1	100	94.636	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSSTOG00000010857	AGO1	91	96.419	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSJJAG00000019449	Ago1	91	96.419	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSKMAG00000019464	ago1	91	98.977	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSLBEG00000007694	ago1	97	94.032	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000007669	ago1	100	90.306	ENSLACG00000017009	AGO1	92	90.306	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000007669	ago1	100	94.118	ENSLOCG00000000504	AGO1	91	94.118	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSLAFG00000010835	AGO1	92	96.419	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSMFAG00000002846	AGO1	91	96.419	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000007669	ago1	100	91.432	ENSMMUG00000006251	AGO1	93	91.304	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	96.419	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSMLEG00000038388	AGO1	91	96.419	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSMAMG00000008381	ago1	99	95.494	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.849	ENSMZEG00005007996	ago1	100	95.013	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000007669	ago1	100	90.494	ENSMGAG00000003822	AGO1	92	90.494	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSMAUG00000015189	Ago1	91	96.419	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSMICG00000016147	AGO1	91	96.419	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.292	ENSMOCG00000000537	Ago1	91	96.292	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000007669	ago1	86	98.507	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.507	Mola_mola
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.164	ENSMODG00000023335	AGO1	91	96.164	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.849	ENSMALG00000011057	ago1	93	98.593	Monopterus_albus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	96.926	Mus_caroli
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	96.926	Mus_musculus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	96.926	Mus_pahari
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	96.926	Mus_spretus
ENSXCOG00000007669	ago1	92	96.936	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	96.936	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000007669	ago1	58	94.505	ENSMLUG00000009628	AGO1	87	94.505	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSNGAG00000017448	Ago1	92	96.419	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.849	ENSNBRG00000010867	ago1	100	98.849	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSNLEG00000011181	AGO1	91	96.419	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000007669	ago1	91	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000007669	ago1	92	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	84	98.480	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSODEG00000005321	AGO1	91	96.419	Octodon_degus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.849	ENSONIG00000016345	ago1	92	98.849	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	87.771	ENSOANG00000002080	AGO1	91	87.771	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.292	ENSOCUG00000023116	AGO1	91	96.292	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSORLG00000014965	ago1	91	98.977	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSORLG00020018253	ago1	91	98.977	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSORLG00015003287	ago1	91	98.977	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSOMEG00000020528	ago1	91	98.977	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSOGAG00000010279	AGO1	91	96.419	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSOARG00000019591	AGO1	91	96.419	Ovis_aries
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSPPAG00000034838	AGO1	91	96.419	Pan_paniscus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSPPRG00000006475	AGO1	91	96.419	Panthera_pardus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.164	ENSPTIG00000020991	AGO1	91	96.164	Panthera_tigris_altaica
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSPTRG00000000528	AGO1	91	96.419	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSPANG00000009060	AGO1	91	96.419	Papio_anubis
ENSXCOG00000007669	ago1	100	95.408	ENSPSIG00000017482	AGO1	93	95.408	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000007669	ago1	88	97.668	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.668	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSPEMG00000023313	Ago1	91	96.419	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.164	ENSPCIG00000000172	AGO1	91	96.164	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSPFOG00000005867	ago1	91	98.977	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.263	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.263	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	ENSPREG00000006534	ago1	91	98.977	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSPPYG00000001551	AGO1	91	96.419	Pongo_abelii
ENSXCOG00000007669	ago1	53	98.649	ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.649	Procavia_capensis
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ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	ENSPVAG00000005082	AGO1	91	96.419	Pteropus_vampyrus
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