EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000008889 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22178 bases
Position: chrKQ557224.1:8409773-8431950
Accession: ZDB-GENE-070706-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000011764	Xpo1	PF08389.12	4.2e-23	1	1
ENSXCOP00000011764	IBN_N	PF03810.19	2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000011899	-	2760	-	ENSXCOP00000011764	919 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSG00000117408	IPO13	97	78.465	Homo_sapiens
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	94.989	ENSAPOG00000003308	ipo13	98	94.989	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	67.653	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	98	67.548	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.571	ENSAMEG00000001123	IPO13	97	78.571	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000008889	ipo13	98	89.674	ENSACIG00000008146	ipo13	100	89.457	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	66.983	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	67.019	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	66.490	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	97	66.385	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	94.670	ENSAOCG00000004943	ipo13	98	94.670	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	66.596	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	97	66.490	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	94.670	ENSAPEG00000011282	ipo13	98	94.670	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	65.856	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	65.717	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	94.456	ENSATEG00000018367	ipo13	98	94.456	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	79.659	ENSAPLG00000001349	IPO13	97	79.659	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	79.211	ENSACAG00000014300	IPO13	97	79.211	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSANAG00000034183	IPO13	97	78.465	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000008889	ipo13	98	94.360	ENSACLG00000011458	ipo13	100	94.360	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	66.983	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	98	66.808	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	88.486	ENSAMXG00000005200	ipo13	98	88.486	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	61.514	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	98	61.514	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	77.932	ENSBTAG00000018887	IPO13	97	77.932	Bos_taurus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.571	ENSCJAG00000007453	IPO13	97	78.571	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.358	ENSCAFG00000004875	IPO13	97	78.358	Canis_familiaris
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.358	ENSCAFG00020017359	IPO13	97	78.358	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.038	ENSCHIG00000008341	IPO13	97	78.038	Capra_hircus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSTSYG00000035980	IPO13	97	78.465	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000008889	ipo13	100	64.239	ENSCAPG00000001972	IPO13	100	64.309	Cavia_aperea
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.017	ENSCPOG00000012445	IPO13	96	78.017	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.571	ENSCCAG00000022035	IPO13	97	78.571	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSCATG00000041276	IPO13	97	78.465	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.145	ENSCLAG00000002914	IPO13	97	78.145	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSCSAG00000001190	IPO13	97	78.465	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000008889	ipo13	97	79.280	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	79.280	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	36.621	ENSCING00000001863	-	99	36.516	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	36.029	ENSCSAVG00000001368	-	99	35.714	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSCANG00000009091	IPO13	97	78.465	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	77.292	ENSCGRG00001021177	Ipo13	97	77.292	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	77.292	ENSCGRG00000012411	Ipo13	97	77.292	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	60.401	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	97	59.979	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	90.725	ENSCSEG00000007713	ipo13	98	90.725	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	95.949	ENSCVAG00000013039	ipo13	98	95.949	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	97	63.725	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	98	63.725	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	87.633	ENSDARG00000060618	ipo13	98	87.633	Danio_rerio
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	63.220	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	63.220	Danio_rerio
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.145	ENSDNOG00000016583	IPO13	97	78.145	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.358	ENSDORG00000005471	Ipo13	97	78.358	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	65.998	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	64.579	Eptatretus_burgeri
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.358	ENSEASG00005001738	IPO13	97	78.358	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.358	ENSECAG00000015508	IPO13	97	78.358	Equus_caballus
ENSXCOG00000008889	ipo13	67	77.778	ENSEEUG00000011681	IPO13	80	77.778	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	90.299	ENSELUG00000001498	ipo13	98	90.299	Esox_lucius
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	64.301	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	97	64.196	Esox_lucius
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSFCAG00000006488	IPO13	97	78.465	Felis_catus
ENSXCOG00000008889	ipo13	97	79.171	ENSFALG00000005368	IPO13	100	79.171	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.038	ENSFDAG00000015599	IPO13	97	78.038	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	95.522	ENSFHEG00000023271	ipo13	98	95.522	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	64.905	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	98	64.594	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	56.857	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	97	57.325	Gadus_morhua
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	92.652	ENSGMOG00000015856	ipo13	97	92.652	Gadus_morhua
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	79.424	ENSGALG00000010087	IPO13	98	79.424	Gallus_gallus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	95.629	ENSGAFG00000006361	ipo13	98	95.629	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	65.011	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	98	65.011	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	66.631	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	97	66.631	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	92.226	ENSGACG00000014562	ipo13	97	92.226	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	79.659	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	79.659	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSGGOG00000016375	IPO13	97	78.465	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	94.462	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	92.733	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	65.717	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	97	65.539	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	77.932	ENSHGLG00000001822	IPO13	97	77.932	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	77.932	ENSHGLG00100015830	IPO13	97	77.932	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	89.126	ENSHCOG00000018408	ipo13	96	91.253	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	61.194	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	61.194	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	57.325	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	98	57.219	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	87.313	ENSIPUG00000011283	IPO13	97	87.313	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.358	ENSSTOG00000003611	IPO13	97	78.358	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.145	ENSJJAG00000018591	Ipo13	97	78.145	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	94.624	ENSKMAG00000007869	ipo13	97	94.624	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	66.667	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	97	66.737	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	65.079	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	98	65.079	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	92.537	ENSLBEG00000007442	ipo13	97	92.537	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	74.125	ENSLACG00000016657	IPO13	98	74.125	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000008889	ipo13	87	31.844	ENSLACG00000002351	TNPO3	96	32.000	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	81.702	ENSLOCG00000010620	ipo13	98	81.702	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	76.621	ENSLAFG00000017144	IPO13	97	76.621	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSMFAG00000032846	IPO13	97	78.465	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSMMUG00000015142	IPO13	97	78.465	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSMNEG00000041971	IPO13	97	78.465	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	78.465	ENSMLEG00000044330	IPO13	97	78.465	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	94.030	ENSMAMG00000017290	ipo13	98	94.030	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	67.019	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	98	66.878	Mastacembelus_armatus
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ENSXCOG00000008889	ipo13	99	66.878	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	98	66.702	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000008889	ipo13	99	77.932	ENSMGAG00000009898	IPO13	99	77.932	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000008889	ipo13	82	78.682	ENSMAUG00000013018	Ipo13	96	78.682	Mesocricetus_auratus
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ENSXCOG00000008889	ipo13	98	91.640	ENSMALG00000010805	ipo13	100	91.965	Monopterus_albus
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