EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000011889 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9882 bases
Position: chrKQ557220.1:7086876-7096757
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000015736	CRM1_C	PF08767.11	1.2e-130	1	1
ENSXCOP00000015736	Xpo1	PF08389.12	1.6e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000015930	XPO1-201	2808	-	ENSXCOP00000015736	935 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXCOG00000011889	XPO1	89	94.885	ENSXCOG00000006625	-	97	94.885

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSG00000082898	XPO1	88	91.915	Homo_sapiens
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	95.936	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	95.936	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.936	ENSAPOG00000004984	-	93	93.936	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSAMEG00000003460	XPO1	88	92.766	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSACIG00000010818	-	100	93.830	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	97.861	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.861	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.182	ENSAOCG00000018914	xpo1a	88	98.182	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSAOCG00000010121	-	100	91.578	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.182	ENSAPEG00000006583	xpo1a	96	98.182	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSAPEG00000007038	-	99	91.684	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSATEG00000008816	-	93	93.830	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.075	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	98.011	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.872	ENSAPLG00000004008	XPO1	88	92.872	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.872	ENSACAG00000002501	XPO1	88	92.872	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSANAG00000020802	XPO1	88	91.915	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.182	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	98.182	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSACLG00000015192	-	93	93.830	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.326	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.326	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	91.817	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSBTAG00000013254	XPO1	88	92.766	Bos_taurus
ENSXCOG00000011889	XPO1	99	52.898	WBGene00002078	xpo-1	91	51.316	Caenorhabditis_elegans
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSCJAG00000008877	XPO1	88	91.915	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSCAFG00000003050	XPO1	88	92.766	Canis_familiaris
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSCAFG00020026910	XPO1	94	92.766	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSCHIG00000018132	XPO1	88	92.766	Capra_hircus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSTSYG00000004330	XPO1	88	92.766	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000011889	XPO1	60	88.298	ENSCAPG00000006454	-	100	88.298	Cavia_aperea
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.277	ENSCPOG00000034053	XPO1	88	91.277	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	72.334	ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.545	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSCATG00000032674	XPO1	100	91.915	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.553	ENSCLAG00000012953	XPO1	88	92.553	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSCSAG00000014606	XPO1	88	91.915	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000011889	XPO1	80	94.844	ENSCHOG00000012088	XPO1	71	94.844	Choloepus_hoffmanni
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.872	ENSCPBG00000026239	XPO1	94	92.872	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	81.170	ENSCING00000024562	-	88	81.170	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	79.452	ENSCSAVG00000005965	-	88	79.452	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	87.553	ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.489	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.809	ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	91.809	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.809	ENSCGRG00000001520	Xpo1	88	91.809	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.766	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.717	ENSCVAG00000016558	xpo1a	88	98.717	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.723	ENSCVAG00000016788	-	88	93.723	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	94.149	ENSDARG00000078041	xpo1a	88	94.149	Danio_rerio
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	94.043	ENSDARG00000063229	xpo1b	88	94.043	Danio_rerio
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.872	ENSDNOG00000005805	XPO1	88	92.872	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000011889	XPO1	90	89.633	ENSDORG00000013050	Xpo1	86	89.633	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	69.370	FBgn0020497	emb	88	69.370	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000011889	XPO1	93	92.944	ENSETEG00000018045	XPO1	82	92.944	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	78.746	ENSEBUG00000012580	-	100	86.211	Eptatretus_burgeri
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSEASG00005007223	XPO1	88	92.766	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSECAG00000024920	XPO1	94	92.766	Equus_caballus
ENSXCOG00000011889	XPO1	91	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	80	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000011889	XPO1	99	90.364	ENSELUG00000014306	-	99	90.364	Esox_lucius
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	95.000	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.000	Esox_lucius
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSFCAG00000002702	XPO1	88	92.766	Felis_catus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.660	ENSFALG00000010989	XPO1	88	92.660	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000011889	XPO1	99	92.316	ENSFDAG00000014716	XPO1	89	92.316	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.824	ENSFHEG00000002412	xpo1a	88	98.824	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000011889	XPO1	56	95.103	ENSFHEG00000018974	-	100	95.103	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	94.652	ENSGMOG00000004441	xpo1a	88	94.652	Gadus_morhua
ENSXCOG00000011889	XPO1	93	93.135	ENSGMOG00000019063	-	82	93.135	Gadus_morhua
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.872	ENSGALG00000029476	XPO1	88	92.872	Gallus_gallus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	99.893	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	99.893	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSGAFG00000003355	-	95	93.830	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	97.326	ENSGACG00000019736	xpo1a	88	97.326	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.936	ENSGACG00000002743	-	88	93.936	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSGAGG00000017558	XPO1	88	92.766	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSGGOG00000034878	XPO1	88	91.915	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.182	ENSHBUG00000007128	xpo1a	88	98.182	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.936	ENSHBUG00000020037	-	93	93.936	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.447	ENSHGLG00000003115	XPO1	88	92.447	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.447	ENSHGLG00100012227	XPO1	88	92.447	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.553	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	92.553	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	94.574	ENSIPUG00000024394	XPO1	88	94.574	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	94.043	ENSIPUG00000012891	Xpo1	88	94.043	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.553	ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.553	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.553	ENSJJAG00000020468	Xpo1	88	92.553	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	99.251	ENSKMAG00000004830	xpo1a	88	99.251	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.617	ENSKMAG00000016218	-	95	93.617	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSLBEG00000005740	-	89	93.703	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	95.314	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	95.314	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	69.706	ENSLACG00000018213	XPO1	88	69.706	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.936	ENSLOCG00000016095	xpo1b	87	93.936	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.660	ENSLAFG00000014553	XPO1	88	92.660	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSMFAG00000038679	XPO1	88	91.915	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSMMUG00000006941	XPO1	88	91.915	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.915	ENSMNEG00000030909	XPO1	88	91.915	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	89.936	ENSMLEG00000032004	XPO1	88	89.936	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	97.647	ENSMAMG00000023037	xpo1a	93	97.647	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSMAMG00000010568	-	99	93.610	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.830	ENSMZEG00005018158	-	95	93.830	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.182	ENSMZEG00005005105	xpo1a	88	98.182	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000011889	XPO1	77	92.011	ENSMGAG00000001496	-	100	92.011	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.809	ENSMAUG00000006769	Xpo1	92	91.809	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSMICG00000027770	XPO1	88	92.766	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.809	ENSMOCG00000012169	Xpo1	88	91.809	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000011889	XPO1	99	93.810	ENSMMOG00000008001	-	99	93.810	Mola_mola
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.289	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	98.289	Mola_mola
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.702	ENSMODG00000002831	XPO1	88	91.702	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	95.962	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	95.962	Monopterus_albus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.723	ENSMALG00000007085	-	96	93.597	Monopterus_albus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.809	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	80.866	Mus_caroli
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.809	ENSMUSG00000020290	Xpo1	99	80.866	Mus_musculus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.702	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	80.866	Mus_pahari
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.809	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	80.866	Mus_spretus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSMPUG00000005560	XPO1	88	92.766	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.660	ENSMLUG00000010670	XPO1	88	92.660	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.660	ENSNGAG00000022158	Xpo1	88	92.660	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	98.182	ENSNBRG00000003776	xpo1a	88	98.182	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.936	ENSNBRG00000012229	-	100	93.936	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	87.810	ENSNLEG00000009680	XPO1	88	87.810	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000011889	XPO1	58	95.556	ENSMEUG00000013277	-	52	95.556	Notamacropus_eugenii
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ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	ENSVVUG00000012009	XPO1	88	92.766	Vulpes_vulpes
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.128	ENSXETG00000002224	xpo1	88	92.128	Xenopus_tropicalis
ENSXCOG00000011889	XPO1	100	99.893	ENSXMAG00000005790	xpo1a	88	99.893	Xiphophorus_maculatus
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