EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000012585 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2640 bases
Position: chrKQ557210.1:9904836-9907475
Accession: ZDB-GENE-040718-311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000016688	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000016903	-	777	-	ENSXCOP00000016688	258 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSXCOG00000012585's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXCOG00000012585's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXCOG00000012585	srprb	66	30.409	ENSXCOG00000015162	-	88	30.409
ENSXCOG00000012585	srprb	73	30.319	ENSXCOG00000019704	arf3b	88	30.319
ENSXCOG00000012585	srprb	62	30.000	ENSXCOG00000004139	arf2b	83	30.000
ENSXCOG00000012585	srprb	56	31.034	ENSXCOG00000001487	-	92	30.460

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000012585	srprb	100	89.147	ENSAPOG00000021219	srprb	93	89.147	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000012585	srprb	99	88.235	ENSACIG00000014621	srprb	96	88.235	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.597	ENSAOCG00000017265	srprb	93	87.597	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.597	ENSAPEG00000024541	srprb	82	87.597	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000012585	srprb	99	87.843	ENSATEG00000014016	srprb	93	87.843	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	88.031	ENSACLG00000016748	srprb	94	88.031	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000012585	srprb	98	72.619	ENSAMXG00000044118	srprb	95	72.619	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	84.496	ENSCSEG00000017194	srprb	94	84.496	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000012585	srprb	100	91.473	ENSCVAG00000004221	srprb	97	91.473	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000012585	srprb	98	70.635	ENSDARG00000030949	srprb	95	70.635	Danio_rerio
ENSXCOG00000012585	srprb	99	80.859	ENSELUG00000009740	srprb	94	80.859	Esox_lucius
ENSXCOG00000012585	srprb	100	93.798	ENSFHEG00000006004	srprb	97	93.798	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000012585	srprb	98	85.771	ENSGMOG00000002081	srprb	94	85.771	Gadus_morhua
ENSXCOG00000012585	srprb	100	97.674	ENSGAFG00000012593	srprb	97	97.674	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000012585	srprb	100	86.822	ENSGACG00000009891	srprb	95	86.822	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	88.031	ENSHBUG00000002145	srprb	94	88.031	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000012585	srprb	100	82.890	ENSHCOG00000007732	srprb	99	82.890	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000012585	srprb	98	67.857	ENSIPUG00000004177	srprb	94	67.857	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.209	ENSKMAG00000020736	srprb	97	87.209	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000012585	srprb	99	88.281	ENSLBEG00000021483	srprb	93	88.281	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000012585	srprb	100	71.042	ENSLOCG00000009740	srprb	87	69.498	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	88.372	ENSMAMG00000011876	srprb	94	88.372	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.259	ENSMZEG00005016621	srprb	100	87.259	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.597	ENSMMOG00000012550	srprb	95	87.597	Mola_mola
ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.209	ENSMALG00000012595	srprb	94	87.209	Monopterus_albus
ENSXCOG00000012585	srprb	73	87.302	ENSNBRG00000004699	srprb	88	80.861	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.984	ENSONIG00000003788	srprb	77	87.984	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	82.558	ENSORLG00000006430	srprb	94	82.558	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000012585	srprb	100	82.946	ENSORLG00020003413	srprb	94	82.946	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000012585	srprb	100	82.946	ENSORLG00015000166	srprb	94	82.946	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000012585	srprb	100	84.496	ENSOMEG00000012735	srprb	94	84.496	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000012585	srprb	97	70.916	ENSPKIG00000013147	srprb	95	70.916	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000012585	srprb	98	82.609	ENSPMGG00000014061	srprb	92	82.609	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	97.287	ENSPFOG00000011347	srprb	93	97.287	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000012585	srprb	100	98.062	ENSPLAG00000001156	srprb	100	98.062	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000012585	srprb	100	96.899	ENSPMEG00000012169	srprb	100	96.899	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000012585	srprb	100	96.124	ENSPREG00000001449	srprb	100	96.124	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000012585	srprb	100	88.031	ENSPNYG00000005911	srprb	94	88.031	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000012585	srprb	98	72.619	ENSPNAG00000009983	srprb	95	72.619	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000012585	srprb	98	74.803	ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.803	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	86.047	ENSSMAG00000013202	srprb	94	86.047	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.984	ENSSDUG00000018746	srprb	88	87.984	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000012585	srprb	100	88.372	ENSSLDG00000020560	srprb	94	88.372	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000012585	srprb	100	88.372	ENSSPAG00000008898	srprb	93	88.372	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000012585	srprb	100	86.822	ENSTRUG00000022463	srprb	94	86.822	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000012585	srprb	99	83.594	ENSTNIG00000007725	srprb	98	83.594	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000012585	srprb	100	99.612	ENSXMAG00000028725	srprb	100	99.612	Xiphophorus_maculatus