EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000013878 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: mars
Alias: id:ibd5106
Full Name: methionyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16087 bases
Position: chrKQ557213.1:18651119-18667205
Accession: ZDB-GENE-030219-83
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000018437	tRNA-synt_1g	PF09334.11	7.1e-151	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000018669	-	2697	-	ENSXCOP00000018437	898 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSXCOG00000013878's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXCOG00000013878's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.417	ENSG00000166986	MARS	91	71.698	Homo_sapiens
ENSXCOG00000013878	mars	100	84.641	ENSAPOG00000020238	mars	99	84.641	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.506	ENSAMEG00000004962	MARS	99	63.308	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000013878	mars	100	85.055	ENSACIG00000016271	mars	100	85.867	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000013878	mars	100	84.858	ENSAOCG00000011411	mars	99	84.858	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000013878	mars	100	84.641	ENSAPEG00000008610	mars	99	84.641	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000013878	mars	100	83.496	ENSATEG00000025019	mars	100	83.496	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000013878	mars	93	65.228	ENSAPLG00000014821	MARS	100	65.461	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000013878	mars	99	61.657	ENSACAG00000006698	MARS	99	61.530	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.991	ENSANAG00000027589	MARS	100	62.651	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000013878	mars	100	85.201	ENSACLG00000018937	mars	100	85.201	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000013878	mars	100	73.564	ENSAMXG00000017335	mars	100	69.298	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.198	ENSBTAG00000018405	MARS	99	63.308	Bos_taurus
ENSXCOG00000013878	mars	65	58.206	WBGene00003415	mars-1	86	58.662	Caenorhabditis_elegans
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.089	ENSCJAG00000007249	MARS	99	62.760	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.734	ENSCAFG00000000229	MARS	99	62.541	Canis_familiaris
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.734	ENSCAFG00020023661	MARS	99	62.541	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.198	ENSCHIG00000027023	MARS	99	63.089	Capra_hircus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.089	ENSTSYG00000005193	MARS	99	62.760	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000013878	mars	83	62.317	ENSCAPG00000014448	MARS	99	62.317	Cavia_aperea
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.432	ENSCPOG00000012866	MARS	99	62.212	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.691	ENSCCAG00000032206	MARS	97	64.903	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.866	ENSCATG00000038907	MARS	99	62.609	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000013878	mars	97	63.307	ENSCLAG00000012164	MARS	99	62.967	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.024	ENSCSAG00000004852	MARS	99	62.242	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000013878	mars	100	61.471	ENSCPBG00000017136	MARS	99	61.319	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000013878	mars	75	60.207	ENSCING00000018550	-	99	59.682	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000013878	mars	65	63.293	ENSCSAVG00000006145	-	97	64.550	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.089	ENSCANG00000034583	MARS	99	63.089	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.760	ENSCGRG00001019238	Mars	99	62.541	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.760	ENSCGRG00000017321	Mars	99	62.541	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000013878	mars	99	79.978	ENSCSEG00000010816	mars	99	79.978	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000013878	mars	100	90.252	ENSCVAG00000009314	mars	99	90.142	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000013878	mars	100	72.319	ENSDARG00000034396	mars	97	72.070	Danio_rerio
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.910	ENSDNOG00000017502	MARS	99	62.541	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.541	ENSDORG00000007127	Mars	99	62.541	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000013878	mars	98	49.121	FBgn0034401	MetRS	87	48.394	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000013878	mars	60	67.760	ENSETEG00000007106	MARS	99	67.577	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000013878	mars	61	60.073	ENSEBUG00000010439	mars	87	60.073	Eptatretus_burgeri
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.457	ENSEASG00005007208	MARS	99	63.089	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.457	ENSECAG00000015175	MARS	99	63.089	Equus_caballus
ENSXCOG00000013878	mars	89	60.571	ENSEEUG00000015503	MARS	89	60.571	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000013878	mars	100	75.926	ENSELUG00000010453	mars	100	75.539	Esox_lucius
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.210	ENSFCAG00000002083	MARS	99	62.991	Felis_catus
ENSXCOG00000013878	mars	100	60.898	ENSFDAG00000010217	MARS	99	60.898	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000013878	mars	100	89.313	ENSFHEG00000016374	mars	100	89.313	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000013878	mars	100	76.965	ENSGMOG00000007987	mars	100	76.965	Gadus_morhua
ENSXCOG00000013878	mars	93	61.329	ENSGALG00000039315	MARS	95	61.329	Gallus_gallus
ENSXCOG00000013878	mars	99	96.040	ENSGAFG00000013461	mars	97	96.040	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000013878	mars	100	82.065	ENSGACG00000006474	mars	100	81.937	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000013878	mars	96	65.114	ENSGAGG00000011640	MARS	97	65.455	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.417	ENSGGOG00000001982	MARS	99	63.417	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000013878	mars	100	72.326	ENSHBUG00000009575	mars	97	72.326	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.773	ENSHGLG00000013493	MARS	100	62.555	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000013878	mars	94	54.948	ENSHGLG00000019739	-	92	54.948	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000013878	mars	94	54.016	ENSHGLG00100004906	-	91	54.016	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.773	ENSHGLG00100006885	MARS	100	62.555	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000013878	mars	100	78.999	ENSHCOG00000001090	mars	100	78.735	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000013878	mars	67	79.201	ENSIPUG00000024413	mars	98	78.869	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000013878	mars	92	71.947	ENSIPUG00000024410	mars	98	72.351	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.035	ENSSTOG00000001128	MARS	99	61.707	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.991	ENSJJAG00000018827	Mars	99	62.732	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000013878	mars	100	84.875	ENSKMAG00000012408	mars	99	87.349	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000013878	mars	100	82.807	ENSLBEG00000013609	mars	100	83.115	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000013878	mars	100	64.223	ENSLACG00000018854	MARS	99	63.786	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.801	ENSLAFG00000013525	MARS	99	62.691	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.348	ENSMFAG00000010123	MARS	99	63.198	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.089	ENSMMUG00000011277	MARS	91	71.698	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.322	ENSMNEG00000044464	MARS	99	62.212	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000013878	mars	90	67.677	ENSMLEG00000034638	MARS	99	67.475	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000013878	mars	96	83.540	ENSMAMG00000010012	mars	97	83.427	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000013878	mars	100	84.984	ENSMZEG00005007092	mars	100	84.984	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.225	ENSMAUG00000011482	Mars	99	61.894	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.979	ENSMICG00000032056	MARS	99	62.870	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.979	ENSMOCG00000010941	Mars	99	62.760	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000013878	mars	99	80.351	ENSMMOG00000007461	mars	99	79.693	Mola_mola
ENSXCOG00000013878	mars	100	83.751	ENSMALG00000010005	mars	99	85.645	Monopterus_albus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.732	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.514	Mus_caroli
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.404	ENSMUSG00000040354	Mars	99	62.186	Mus_musculus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.514	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.295	Mus_pahari
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.623	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.404	Mus_spretus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.308	ENSMPUG00000001831	MARS	99	63.198	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.198	ENSMLUG00000001037	MARS	99	63.417	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.514	ENSNGAG00000018824	Mars	99	62.404	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000013878	mars	95	84.876	ENSNBRG00000004105	mars	100	85.267	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.198	ENSNLEG00000017297	MARS	99	63.089	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000013878	mars	89	63.480	ENSMEUG00000007195	MARS	99	63.658	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000013878	mars	100	60.789	ENSOPRG00000006518	MARS	99	60.679	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.089	ENSODEG00000001752	MARS	99	62.870	Octodon_degus
ENSXCOG00000013878	mars	100	83.513	ENSONIG00000005090	mars	100	83.513	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000013878	mars	72	64.384	ENSOANG00000013318	MARS	100	64.384	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.870	ENSOCUG00000007373	MARS	99	62.760	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000013878	mars	100	81.332	ENSORLG00000005405	mars	100	81.441	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000013878	mars	100	81.570	ENSORLG00020017397	mars	100	81.679	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000013878	mars	100	81.441	ENSORLG00015012976	mars	100	81.550	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000013878	mars	100	82.314	ENSOMEG00000018411	mars	100	82.314	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.623	ENSOGAG00000005226	MARS	100	62.514	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.198	ENSOARG00000006477	MARS	99	63.089	Ovis_aries
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.089	ENSPPAG00000025147	MARS	99	63.158	Pan_paniscus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.100	ENSPPRG00000023243	MARS	99	62.882	Panthera_pardus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.210	ENSPTIG00000006721	MARS	99	62.991	Panthera_tigris_altaica
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.417	ENSPTRG00000005135	MARS	99	63.417	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.239	ENSPANG00000009140	MARS	99	63.089	Papio_anubis
ENSXCOG00000013878	mars	100	71.663	ENSPKIG00000002833	mars	100	71.554	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000013878	mars	83	50.000	ENSPSIG00000013607	MARS	99	42.664	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000013878	mars	99	80.022	ENSPMGG00000014847	mars	99	80.022	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.825	ENSPEMG00000000046	Mars	99	63.497	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.295	ENSPCIG00000023765	MARS	99	62.186	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000013878	mars	100	96.820	ENSPFOG00000006998	mars	100	96.820	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000013878	mars	100	96.820	ENSPLAG00000017870	mars	100	96.820	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000013878	mars	100	96.382	ENSPMEG00000008197	mars	100	96.382	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000013878	mars	100	95.614	ENSPREG00000008123	mars	100	95.614	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.308	ENSPPYG00000004691	MARS	99	63.308	Pongo_abelii
ENSXCOG00000013878	mars	85	64.516	ENSPCAG00000016037	MARS	88	64.387	Procavia_capensis
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.870	ENSPCOG00000017598	MARS	99	62.760	Propithecus_coquereli
ENSXCOG00000013878	mars	80	60.458	ENSPVAG00000012112	MARS	73	60.611	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000013878	mars	100	84.440	ENSPNYG00000013809	mars	100	84.440	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000013878	mars	100	75.190	ENSPNAG00000017290	mars	100	75.190	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.623	ENSRNOG00000025459	Mars	99	62.404	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000013878	mars	96	64.384	ENSRBIG00000044782	MARS	96	64.229	Rhinopithecus_bieti
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.487	ENSRROG00000042331	MARS	99	63.557	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000013878	mars	64	52.870	YGR264C	MES1	75	52.870	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXCOG00000013878	mars	100	60.503	ENSSBOG00000022875	MARS	99	60.175	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.388	ENSSHAG00000007182	MARS	99	63.169	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000013878	mars	100	71.382	ENSSFOG00015011038	mars	99	71.491	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000013878	mars	100	82.717	ENSSMAG00000012409	mars	100	82.500	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000013878	mars	100	84.783	ENSSDUG00000019070	mars	100	84.891	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000013878	mars	91	87.288	ENSSLDG00000005561	mars	95	87.288	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000013878	mars	92	68.000	ENSSARG00000002477	MARS	92	68.000	Sorex_araneus
ENSXCOG00000013878	mars	82	65.494	ENSSPUG00000007756	MARS	98	68.182	Sphenodon_punctatus
ENSXCOG00000013878	mars	100	85.201	ENSSPAG00000022691	mars	100	85.201	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.279	ENSSSCG00000023318	MARS	95	63.129	Sus_scrofa
ENSXCOG00000013878	mars	100	77.766	ENSTRUG00000014774	mars	100	78.423	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000013878	mars	100	74.703	ENSTNIG00000007060	mars	100	74.270	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000013878	mars	75	63.500	ENSTBEG00000000303	MARS	88	63.333	Tupaia_belangeri
ENSXCOG00000013878	mars	76	69.578	ENSTTRG00000013088	MARS	75	69.287	Tursiops_truncatus
ENSXCOG00000013878	mars	53	55.647	ENSUAMG00000019284	-	99	55.714	Ursus_americanus
ENSXCOG00000013878	mars	100	63.308	ENSUMAG00000019826	MARS	99	62.991	Ursus_maritimus
ENSXCOG00000013878	mars	64	73.203	ENSVPAG00000008665	MARS	66	73.203	Vicugna_pacos
ENSXCOG00000013878	mars	100	62.845	ENSVVUG00000017940	MARS	99	62.775	Vulpes_vulpes
ENSXCOG00000013878	mars	68	72.142	ENSXETG00000025174	mars	99	71.613	Xenopus_tropicalis
ENSXCOG00000013878	mars	100	97.368	ENSXMAG00000017920	mars	100	97.368	Xiphophorus_maculatus