EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000014460 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO2
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9407 bases
Position: chrKQ557220.1:21309515-21318921
Accession: 19998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000019238	IBN_N	PF03810.19	1.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000019475	TNPO2-201	2649	-	ENSXCOP00000019238	882 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSG00000105576	TNPO2	100	92.448	Homo_sapiens
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	96.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	82	94.345	ENSAPOG00000013185	-	96	94.345	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	87.097	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	87.097	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000014460	TNPO2	87	95.720	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	95.349	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	88	99.611	ENSACIG00000009586	-	100	99.611	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSAOCG00000010152	-	100	96.625	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.463	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	92.463	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSAPEG00000013268	-	100	96.625	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.463	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	92.463	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.513	ENSATEG00000019171	-	100	96.513	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	91.789	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	91.789	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.326	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	89.989	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.539	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	89.539	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.439	ENSACLG00000020672	-	100	90.439	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.238	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	92.238	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.909	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	90.909	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.539	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	89.539	Bos_taurus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	88.654	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	89.764	Canis_familiaris
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	89.764	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	84.983	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	84.872	Capra_hircus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	89.651	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000014460	TNPO2	93	87.158	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	87.158	Cavia_aperea
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.426	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	89.426	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	89.651	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	88.654	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.426	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	89.426	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	89.651	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.551	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	90.326	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000014460	TNPO2	96	89.615	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	89.615	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.765	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	88.765	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	89.764	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	87.964	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	87.964	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	88	96.512	ENSCSEG00000011477	-	100	96.512	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.513	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	96.513	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.225	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	90.225	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.076	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	88.076	Danio_rerio
ENSXCOG00000014460	TNPO2	89	83.418	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	83.418	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	87.472	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.241	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	70.805	FBgn0024921	Tnpo	100	70.694	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000014460	TNPO2	91	81.690	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	81.455	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	89.651	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	89.651	Equus_caballus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	91.676	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	91.676	Esox_lucius
ENSXCOG00000014460	TNPO2	88	87.836	ENSELUG00000016542	-	99	87.836	Esox_lucius
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	88.654	Felis_catus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.426	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	89.426	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.562	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	90.562	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	96	95.814	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	95.814	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	83.445	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	83.445	Gadus_morhua
ENSXCOG00000014460	TNPO2	81	98.148	ENSGMOG00000014237	-	90	98.148	Gadus_morhua
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	91.011	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	91.011	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	96.625	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.551	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	90.326	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.238	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	92.238	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSHBUG00000018317	-	100	96.625	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.314	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	89.314	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	87.764	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	88.321	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.101	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	90.101	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	95.838	ENSHCOG00000020440	-	100	95.838	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	93.933	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	93.933	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.013	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	92.013	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	89.651	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	88.654	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.639	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	88.639	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.400	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	96.400	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.400	ENSLBEG00000005301	-	100	96.400	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.463	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	92.463	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	87.627	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	87.627	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.713	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	92.713	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	88.654	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	88.654	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	89.651	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	89.651	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000014460	TNPO2	97	87.774	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	88.581	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSMAMG00000011862	-	100	96.625	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.233	ENSMAMG00000023658	tnpo2	98	92.866	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.315	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.315	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSMZEG00005007408	-	100	96.625	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.238	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	92.238	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	89.651	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	89.764	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000014460	TNPO2	87	90.052	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	90.052	Mola_mola
ENSXCOG00000014460	TNPO2	88	98.335	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	98.335	Mola_mola
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.878	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	89.878	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.889	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	90.889	Monopterus_albus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.175	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	96.175	Monopterus_albus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	89.764	Mus_caroli
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	91.241	Mus_musculus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	89.764	Mus_pahari
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	89.764	Mus_spretus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	89.764	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000014460	TNPO2	96	89.615	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	89.615	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	89.764	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	96.625	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	86.952	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	86.952	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	79.667	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	79.667	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	84.205	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	84.205	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.426	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	89.426	Octodon_degus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.351	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	92.351	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	95.657	ENSONIG00000017706	-	100	95.657	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.989	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	89.989	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	90	92.442	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	92.442	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.013	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	92.013	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000014460	TNPO2	57	98.600	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.600	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.013	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	92.013	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000014460	TNPO2	57	98.400	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	91.451	ENSORLG00015005489	tnpo2	100	91.451	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000014460	TNPO2	57	98.600	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	98.600	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	91.789	ENSOMEG00000014877	TNPO2	100	91.789	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	95.838	ENSOMEG00000013440	TNPO2	100	95.838	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.976	ENSOARG00000011717	TNPO2	93	91.604	Ovis_aries
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSPPAG00000019494	TNPO2	100	88.654	Pan_paniscus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSPPRG00000003075	TNPO2	100	88.654	Panthera_pardus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	85	86.074	ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.074	Panthera_tigris_altaica
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSPTRG00000010535	TNPO2	100	88.654	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSPANG00000016857	TNPO2	100	88.654	Papio_anubis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	96	89.770	ENSPKIG00000002899	-	99	90.132	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	91.114	ENSPKIG00000004824	tnpo2	100	91.114	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	86.932	ENSPSIG00000010215	TNPO2	100	86.600	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	57	94.400	ENSPMGG00000022850	tnpo2	99	93.400	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	87	98.703	ENSPMGG00000016459	TNPO2	98	98.703	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.765	ENSPEMG00000018702	Tnpo2	100	88.765	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000014460	TNPO2	98	89.180	ENSPCIG00000015327	TNPO2	95	90.665	Phascolarctos_cinereus
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ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.513	ENSPMEG00000014011	-	100	96.513	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.562	ENSPREG00000001121	TNPO2	100	90.562	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000014460	TNPO2	100	96.536	ENSPREG00000000415	TNPO2	100	96.536	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSPPYG00000009602	TNPO2	100	89.651	Pongo_abelii
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	80.488	ENSPCAG00000014916	TNPO2	100	80.377	Procavia_capensis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSPCOG00000018386	TNPO2	100	89.651	Propithecus_coquereli
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	85.382	ENSPVAG00000013411	TNPO2	100	85.382	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.439	ENSPNYG00000001235	-	100	90.439	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.238	ENSPNYG00000013748	tnpo2	100	92.238	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.463	ENSPNAG00000024491	tnpo2	100	92.463	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	94.938	ENSPNAG00000026208	-	100	94.938	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSRNOG00000003970	Tnpo2	97	89.651	Rattus_norvegicus
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ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSRROG00000040402	TNPO2	100	89.651	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.651	ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	89.651	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	96	90.898	ENSSHAG00000015858	TNPO2	99	90.898	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	91.114	ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.114	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	93.251	ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.251	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.576	ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.576	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	95.951	ENSSMAG00000004050	-	100	95.951	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.688	ENSSDUG00000001767	tnpo2	100	92.688	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.625	ENSSDUG00000002607	TNPO2	100	96.625	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.513	ENSSLDG00000013107	-	100	96.513	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.688	ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.688	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	81	88.563	ENSSARG00000003825	TNPO2	86	88.270	Sorex_araneus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.597	ENSSPUG00000000736	TNPO2	100	89.262	Sphenodon_punctatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	94.382	ENSSPAG00000008511	-	100	94.382	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.463	ENSSPAG00000008512	tnpo2	100	92.463	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	89.764	ENSSSCG00000013726	TNPO2	100	89.764	Sus_scrofa
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	95.613	ENSTRUG00000009453	TNPO2	100	95.613	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.146	ENSTRUG00000012698	tnpo2	99	90.146	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	82.452	ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	92.219	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.801	ENSTNIG00000014071	TNPO2	100	92.801	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.765	ENSTTRG00000005443	TNPO2	100	88.765	Tursiops_truncatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	ENSUAMG00000019621	TNPO2	100	88.654	Ursus_americanus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	86.080	ENSUMAG00000006504	TNPO2	99	85.969	Ursus_maritimus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	82.452	ENSVVUG00000023860	TNPO2	100	82.340	Vulpes_vulpes
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.751	ENSXETG00000004771	tnpo2	99	88.526	Xenopus_tropicalis
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	96.738	ENSXMAG00000012793	TNPO2	100	96.738	Xiphophorus_maculatus
ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	90.899	ENSXMAG00000014217	TNPO2	100	90.899	Xiphophorus_maculatus