EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000017002 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13635 bases
Position: chrKQ557204.1:16096731-16110365
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000022760	MMR_HSR1	PF01926.23	5.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000023036	-	1341	-	ENSXCOP00000022760	446 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSXCOG00000018094	si:ch211-11k18.4	99	59.645

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.688	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.688	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	58.575	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.575	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.911	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.911	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.688	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.688	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.134	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.134	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	99	57.942	ENSACAG00000028632	-	99	57.942	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.170	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.170	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.823	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.823	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	79.955	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.955	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	77	62.029	ENSCING00000020807	-	91	62.029	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	98	55.227	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.353	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.243	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.243	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	85.142	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.659	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.980	Danio_rerio
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	98	82.727	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.727	Danio_rerio
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	79	55.932	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	55.932	Eptatretus_burgeri
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	99	80.493	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.493	Esox_lucius
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	89	55.112	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.112	Gadus_morhua
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.688	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.688	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	95.982	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	95.982	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	79	67.416	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.194	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.389	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.389	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.134	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	60.134	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	99	83.484	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.484	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	77.852	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.852	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	74	63.253	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	74	63.253	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	96	60.789	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.648	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.243	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.243	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	87.500	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	87.500	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	62.277	ENSLACG00000004899	-	99	62.277	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	99	69.977	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.977	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	99	61.712	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.937	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	99	73.602	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.602	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	96	60.739	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.739	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	58.952	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.952	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Mola_mola
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	98	87.872	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.872	Monopterus_albus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.911	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.911	Monopterus_albus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	96	59.909	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	99	59.773	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	90.807	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	90.807	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	58.862	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.862	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.134	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.134	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	84.152	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	84.152	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	87.054	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	87.054	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	59.911	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.911	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	87.723	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.134	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.134	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.706	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.706	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	88.393	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.393	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	75.278	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.278	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	57.489	ENSPKIG00000023918	-	98	57.489	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	58.022	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	58.901	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	84.375	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	84.375	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.579	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	60.579	Poecilia_formosa
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ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	60.579	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	60.579	Poecilia_latipinna
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