EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000017309 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8633 bases
Position: chrKQ557208.1:19180521-19189153
Accession: ZDB-GENE-040426-1569
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000023170	GTP_EFTU	PF00009.27	4e-45	1	1
ENSXCOP00000023170	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	3.1e-12	1	1
ENSXCOP00000023170	EFG_IV	PF03764.18	6.5e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000023448	-	2454	-	ENSXCOP00000023170	817 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSXCOG00000017309's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXCOG00000017309's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	37.791	ENSXCOG00000008182	eef2b	95	37.791
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	38.405	ENSXCOG00000009526	-	94	38.405

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSG00000108883	EFTUD2	84	93.495	Homo_sapiens
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.597	ENSAPOG00000002433	eftud2	81	98.597	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	81	93.495	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000017309	eftud2	94	96.340	ENSACIG00000009096	eftud2	79	96.340	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	91.071	ENSAOCG00000023385	eftud2	92	91.071	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.597	ENSAPEG00000003321	eftud2	81	98.597	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.469	ENSATEG00000000457	eftud2	81	98.469	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	89.440	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	81	89.440	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSACAG00000007637	EFTUD2	81	93.622	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSANAG00000025320	EFTUD2	81	93.495	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.087	ENSACLG00000001296	eftud2	81	98.087	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.811	ENSAMXG00000000568	eftud2	80	96.811	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	81	93.495	Bos_taurus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	70.573	WBGene00001166	eftu-2	81	70.573	Caenorhabditis_elegans
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	81	93.495	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	81	93.495	Canis_familiaris
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	81	93.495	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	81	93.495	Capra_hircus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	81	93.495	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	81	93.622	Cavia_aperea
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	81	93.622	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	81	93.495	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCATG00000035809	EFTUD2	81	93.495	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.367	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	81	93.367	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	81	93.495	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000017309	eftud2	94	82.115	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	85	82.115	Choloepus_hoffmanni
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	81	93.622	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	79.924	ENSCING00000009372	-	81	79.924	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	80.051	ENSCSAVG00000004985	-	94	80.051	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCANG00000026557	EFTUD2	81	93.495	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCGRG00001009904	Eftud2	81	93.495	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSCGRG00000003825	Eftud2	81	93.495	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.832	ENSCSEG00000016775	eftud2	81	97.832	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.362	ENSCVAG00000012537	eftud2	81	99.362	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.173	ENSDARG00000012261	eftud2	81	96.173	Danio_rerio
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	92.985	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	81	92.985	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSDORG00000011566	Eftud2	81	93.495	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	76.815	FBgn0039566	CG4849	81	76.815	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000017309	eftud2	86	96.610	ENSETEG00000005678	EFTUD2	73	96.610	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000017309	eftud2	82	96.104	ENSEBUG00000004047	-	90	87.649	Eptatretus_burgeri
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSEASG00005010321	EFTUD2	81	93.495	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSECAG00000019363	EFTUD2	75	93.495	Equus_caballus
ENSXCOG00000017309	eftud2	87	96.154	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	81	96.154	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.173	ENSELUG00000017169	eftud2	81	96.173	Esox_lucius
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	81	93.495	Felis_catus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSFALG00000007551	EFTUD2	81	93.622	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	81	93.622	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.107	ENSFHEG00000013479	eftud2	81	99.107	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.301	ENSGMOG00000014277	eftud2	81	96.301	Gadus_morhua
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.750	ENSGALG00000000988	EFTUD2	84	93.750	Gallus_gallus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.872	ENSGAFG00000002263	eftud2	81	99.872	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.321	ENSGACG00000009163	eftud2	81	97.321	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	81	93.495	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.087	ENSHBUG00000023546	eftud2	82	98.087	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	81	93.495	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	81	93.495	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.066	ENSHCOG00000017689	eftud2	81	97.066	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.429	ENSIPUG00000023182	Eftud2	81	96.429	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	86	93.495	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSJJAG00000018268	Eftud2	84	93.495	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.342	ENSKMAG00000021027	eftud2	81	98.342	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.342	ENSLBEG00000005875	eftud2	93	98.342	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	94.770	ENSLACG00000012918	EFTUD2	81	94.770	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.046	ENSLOCG00000011460	eftud2	81	96.046	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	80	93.495	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	81	93.495	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	81	93.495	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	81	93.495	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	81	93.495	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.832	ENSMAMG00000022190	eftud2	81	97.832	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.087	ENSMZEG00005022885	eftud2	81	98.087	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.384	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	81	93.384	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMAUG00000021178	Eftud2	81	93.495	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMICG00000016592	EFTUD2	81	93.495	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMOCG00000009039	-	81	93.495	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000017309	eftud2	91	79.408	ENSMOCG00000017653	-	77	79.408	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.832	ENSMMOG00000020811	eftud2	92	97.832	Mola_mola
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSMODG00000011347	EFTUD2	81	93.622	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.046	ENSMALG00000014501	eftud2	92	96.046	Monopterus_albus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.367	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	81	93.367	Mus_caroli
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.367	ENSMUSG00000020929	Eftud2	81	93.367	Mus_musculus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.367	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	81	93.367	Mus_pahari
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.367	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	81	93.367	Mus_spretus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	75	93.495	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	80	93.495	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSNGAG00000017834	Eftud2	81	93.495	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.959	ENSNBRG00000020081	eftud2	81	97.959	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	81	93.495	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.742	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	81	93.742	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	83.673	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	81	83.673	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000017309	eftud2	84	74.495	ENSODEG00000003385	-	78	74.495	Octodon_degus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSODEG00000018041	-	81	93.495	Octodon_degus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.087	ENSONIG00000000912	eftud2	81	98.087	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	81	93.495	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.959	ENSORLG00000003109	eftud2	81	97.959	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.959	ENSORLG00020009865	eftud2	81	97.959	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.959	ENSORLG00015002611	eftud2	85	97.959	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	81	93.495	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSOARG00000009078	EFTUD2	79	93.495	Ovis_aries
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	81	93.495	Pan_paniscus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	81	93.495	Panthera_pardus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	81	93.495	Panthera_tigris_altaica
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	81	93.495	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSPANG00000021284	EFTUD2	81	93.495	Papio_anubis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	92.122	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	86	92.122	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	88.010	ENSPMGG00000007281	eftud2	84	87.532	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSPEMG00000005129	Eftud2	81	93.495	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	81	93.622	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.745	ENSPFOG00000008515	eftud2	81	99.745	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.745	ENSPLAG00000010393	eftud2	81	99.745	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.745	ENSPMEG00000005087	eftud2	81	99.745	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000017309	eftud2	95	93.677	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	81	93.677	Pongo_abelii
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.614	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	81	93.614	Procavia_capensis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	81	93.495	Propithecus_coquereli
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	89.668	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	81	89.668	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.959	ENSPNYG00000012448	eftud2	81	97.959	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.556	ENSPNAG00000012490	eftud2	81	96.556	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.367	ENSRNOG00000002818	Eftud2	81	93.367	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	81	93.495	Rhinopithecus_bieti
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSRROG00000042925	EFTUD2	81	93.495	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000017309	eftud2	95	33.771	YKL173W	SNU114	80	34.170	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	81	93.586	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	84	93.622	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.301	ENSSFOG00015023272	eftud2	81	96.301	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.704	ENSSMAG00000010174	eftud2	92	93.750	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.469	ENSSDUG00000022675	eftud2	81	98.469	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.597	ENSSLDG00000001595	eftud2	81	98.597	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	83.546	ENSSARG00000008664	EFTUD2	81	83.546	Sorex_araneus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.240	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	81	93.240	Sphenodon_punctatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.469	ENSSPAG00000016235	eftud2	80	98.469	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	81	93.495	Sus_scrofa
ENSXCOG00000017309	eftud2	90	93.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	89	93.324	Taeniopygia_guttata
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.173	ENSTRUG00000016422	eftud2	81	96.173	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000017309	eftud2	93	92.112	ENSTNIG00000005346	eftud2	82	92.112	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	86.862	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	81	86.862	Tupaia_belangeri
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	89.413	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	81	89.413	Tursiops_truncatus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	92.474	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	81	92.474	Ursus_americanus
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	81	93.495	Ursus_maritimus
ENSXCOG00000017309	eftud2	82	83.033	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	69	83.033	Vicugna_pacos
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	81	93.495	Vulpes_vulpes
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	92.985	ENSXETG00000003394	eftud2	84	92.985	Xenopus_tropicalis
ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.872	ENSXMAG00000008494	eftud2	81	99.872	Xiphophorus_maculatus